本方法介绍了如何构建和操作一个连续的13C和15N同位素标记室,用于植物组织的均一或差异标记。文中讨论了对柳枝稷(Andropogon gerardii)进行代谢和结构标记的代表性结果。
本方法介绍了如何构建和操作一个连续的13C和15N同位素标记室,用于植物组织的均一或差异标记。文中讨论了对柳枝稷(Andropogon gerardii)进行代谢和结构标记的代表性结果。
通过生态系统追踪植物材料中的稀有稳定同位素,可提供关于生态系统过程最灵敏的信息,涵盖从CO2通量、土壤有机质形成到小尺度稳定同位素生物标志物探针等多个方面。将多种稳定同位素(如13C与15N、18O或 2H)联用,有望揭示生物地球化学转化过程中更复杂的化学计量关系。同位素标记的植物材料已被用于多种关于凋落物分解和土壤有机质形成的研究1-4。然而,从这些及其他研究中已逐渐明确,植物材料的结构组分在微生物利用和长期碳储存方面,其行为与代谢组分(即可溶性低分子量化合物)显著不同5-7。能够分别研究结构组分和代谢组分,为推进生态系统生物地球化学研究前沿提供了强有力的新型工具。本文描述一种制备13C和15N标记植物材料的方法,该材料可为整株均匀标记,也可在结构组分与代谢组分中实现差异性标记。
本文介绍了可针对不同研究需求进行调整的连续13C 和 15N 标记室的构建与操作方法。通过从幼苗到收获的连续标记,可获得均一标记的植物材料;而通过在收获前数周将生长中的植物移出标记室,则可实现差异性标记。以种植Andropogon gerardii Kaw 的代表性结果为例,展示了该系统在目标水平上高效标记植物材料的能力。利用该方法,我们已获得具有 4.4 atom%13C 和 6.7 atom%15N 均一标记的植物材料,或其代谢组分与结构组分(分别为热水可提取组分和热水残留组分)中差异标记高达 1.29 atom%13C 和 0.56 atom%15N 的材料。该技术的关键挑战在于:在密闭的13C-CO2环境中,成功种植植物所需维持的适宜温度、湿度、CO2浓度 以及光照水平。该标记室的描述代表了一种有效的研究工具,可用于制备均一或差异性多同位素标记的植物材料,服务于生态系统生物地球化学循环相关实验。
理解植物-土壤-大气过程的动态变化,对于准确预测全球碳(C)和氮(N)循环在当前及未来环境条件下的运行机制至关重要。稳定同位素是定量研究植物-土壤-大气系统中碳氮循环的有力工具。通过追踪植物材料中稀有稳定同位素在生态系统中的迁移路径,可为生物地球化学循环研究提供高灵敏度的信息,涵盖从CO2通量 和土壤有机质形成到小尺度稳定同位素生物标志物探针分析等各个方面 e.g.4,8,9。将 13C标记与 15N标记或其他稳定同位素(如 2H或 18O)在植物组织中的应用相结合,可为植物与土壤生物化学的耦合研究提供一种高检测灵敏度、可示踪但结构复杂的底物。能够对植物的结构组分和代谢组分进行均一或差异性标记,进一步增强了回答生态系统中碳氮循环复杂科学问题的能力。然而,在碳氮收支的定量研究中使用同位素标记植物材料的优势,取决于能否成功制备出具有均一或差异性标记的13C和15N标记材料。
同位素标记已用于植物碳和氮同化研究10分配11 和根际沉积12均匀地 13C 和 15N标记的植物材料为凋落物分解研究提供了复杂的标记底物1,4,土壤有机质形成2,6,土壤CO2 排放4,土壤食物网研究13以及土壤碳滞留时间的研究2,14. 利用以下方法的研究 13由标记植物材料制备的C标记生物炭正开始揭示以往被忽视的土壤炭库的新信息15。尽管 15N, 2H,和 18O标记通过水和肥料处理相对容易实现,但挑战在于生产出均一的 13通过C标记的植物材料 13C-CO2 固定
从幼苗期到成熟期在密闭室中进行连续同位素标记,可实现植物体内同位素标记的均匀分布。其他方法,如重复脉冲标记16以及叶片施用或毛细管吸附17,18,均无法获得均匀的同位素标记植物材料,也无法实现特定碳化合物的明确差异标记(例如 代谢物与结构物之间)19。在同位素标记过程中,标记效率是一个重要考量因素,因为标记所用的富集稀有同位素化合物成本较高。尽管过去已有连续13C标记的应用报道2-4,20,但据我们所知,目前尚无公开发表的技术细节详细描述一种能够实现高标记效率、并精确控制同位素标记量和均匀性的连续标记室系统。
在凋落物分解和土壤有机质形成研究的前沿,一个核心概念是:代谢性植物物质(即 可溶性、易降解、低分子量化合物)与结构性植物物质(即 木质素、纤维素、半纤维素)在微生物利用效率、土壤有机质形成以及长期土壤碳储存方面具有不同的转化途径5-7。因此,对其结构性和代谢性组分进行差异化标记的植物材料,成为推动凋落物分解和土壤有机质形成研究的有力工具。利用双同位素进行差异化标记,可借助多库同位素技术,分别追踪结构性和代谢性组分在生态系统中的转化过程21。
在密闭培养室中使用13C及其他同位素进行连续同位素标记时,必须仔细控制植物生理条件,以最大化植物生长效率和同位素标记效率。在密闭环境中培养植物时,必须控制白天的温度骤升,以防植物受损。需要保持适宜的湿度和温度范围,以维持植物气孔开放及对CO2的吸收22。过高的湿度会导致培养室壁面起雾,从而降低光照可用性,并可能损害培养室结构。在使用昂贵的重同位素标记化合物时,应充分考虑同位素标记效率,包括彻底清除培养室中天然丰度的同位素(例如 来自含有机质土壤栽培引入的同位素),并防止外部空气进入。
本文介绍一种用于构建和运行连续双13C与15N同位素标记室的方法,用于生产植物材料,这些材料可实现整体均匀标记,或其结构与代谢组分达到不同水平的标记。13C标记在培养室层面进行控制,而施肥与15N标记则在单个花盆层面进行控制。文中展示了代表性结果,以证明该方法在整个生长季节中对温度、湿度和CO2浓度的调控能力。通过该方法培养Andropogon gerardii Kaw的结果也验证了其生产均匀标记或差异性标记植物材料的能力。所述特定的培养室设计与运行方案可进行调整,以适应不同植物物种的培养,也可用于2H或 18O标记。
1. 反应室构建
2. 温度和湿度控制
3. CO2 控制
4. 基于网络的远程监测系统
5. 灌溉系统
6. 植物移栽
7. 密封反应室
8. 施肥与灌溉
9. 均一标记与差异标记
10. 收获
11. 凋落物化学
我们的标记室尺寸为 1.2 m × 2.4 m × 3.6 m,可容纳 40,15 L 的盆图1)。计算机化的红外气体分析仪(IRGA)控制系统维持 CO2 在白天光合作用活跃期间,浓度保持在我们设定的360至400 ppm之间(图 2a). 低 CO2 红外气体分析仪的警报功能触发电磁阀,以允许 CO2 来自 13当浓度降至最低阈值以下时,将富集碳和自然丰度碳的储气罐通入反应室例如 360 ppm)。当浓度达到上限设定值时,死区功能停止了气流。例如 400 ppm)。连接到空调和除湿机的iSeries温湿度监控系统在整个生长季节内将气候条件维持在设定参数范围内(图 2b我们使用了一台一吨(3.5 kW)的空调机组来保持室内温度凉爽。
远程监控系统允许通过标准网络浏览器随时查看记录的数据。网络应用程序对 CO2 浓度、温度和湿度值进行降采样,以 24 小时为增量显示过去 24 至 240 小时的图表。这提供了快速的可视化方式,以确认每日波动在预期范围内。查看网页界面还可了解当前培养室的状态,并对可能的问题(如未接收到最新数据)发出警报。在任何时间,也可通过该网页界面下载完整的数据集。
我们使用量子传感器,在夏季正午时分,分别在光照开启和关闭的条件下,测量了密闭舱室内内外四个位置的光合有效辐射(PAR)。当舱室灯光关闭时,舱内的PAR比外部低31.5%;当灯光开启时,舱内PAR比外部低22%。因此,舱室灯光可显著提高舱内PAR的穿透率,增幅达9.5%(P<0.05)。
我们的连续标记系统共生产出 2759 克 A. gerardii 生物量,其中地上部分生物量占 37%,地下部分生物量占 63%。通过相应调节两个 CO2 气罐的电磁阀,我们在均一生长材料中实现了全植株 4.4 atom%13C 的标记水平(图 1,表 1)。通过在改良霍格兰溶液23 的 KNO3 子溶液中混合 98 atom%15N-KNO3 与 0.37 atom%15N-KNO3,我们在均一生长材料中实现了全植株 6.7 atom%15N 的标记水平(表 1)。在整个生长季节中,我们每周为 A. gerardii 浇灌 750 毫升总液体(水加霍格兰溶液)。根据植株生长情况,每周施用 200–500 毫升 15N 标记的霍格兰溶液进行施肥。
我们采用热水提取法,以检测均匀标记和差异标记的植物材料之间是否存在同位素差异。对于差异标记的植物,在收获时我们移除了完全死亡的叶片,并将其单独处理,因为这些叶片很可能未被有效差异标记。在分析13C含量时,无论是整株植物还是热水提取物,四个标记时间点之间的差异均达到显著水平;但对于热水残渣,第14天和第22天之间无显著差异(表1)。在比较每个时间点内不同植物组织组分时,热水提取物与残渣在全部四个时间点均存在显著差异,到第22天时,整株植物、提取物和残渣三者之间均达到显著差异(表1)。在植物组分中15N的掺入情况方面,不同标记时间点及植物组织组分之间均存在差异。对于热水提取物,四个标记时间点在15N含量上彼此之间均具有显著差异;而对于整株植物和热水残渣,较短标记时间与较长标记时间之间的差异显著(表1)。在均匀标记的植物中,不同植物组织组分间的15N含量无显著差异;但在差异标记的凋落物中,热水提取物与残渣之间的15N含量存在显著差异。
所有同位素值均采用原子百分比(atom %)表示法(公式 1),这种表示法在重同位素富集程度较高时比%更为准确21。例如:
(1)
本研究使用 SAS 9.2 版本进行统计分析。采用配对 t 检验分析培养室内部与外部光照水平的差异。使用 PROC ANOVA 中的单因素方差分析(ANOVA)检验热水提取物与热水残留物中 13C 和 15N 标记的差异。多重比较分析采用邓肯多范围检验(Duncan's multiple range test)。显著性水平设定为 P = 0.05。采用 Wilcoxon 秩和检验验证数据是否满足分析的假设条件。

图1. 40个花盆容量的连续多同位素标记室俯视示意图。虚线表示电线,实线表示气体或水管路。点击此处查看大图

图 2. A) 一个生长季期间 24 小时内的平均 CO2 浓度(ppm)(± 标准误差)。 B) 一个生长季期间 24 小时内的平均温度(ºC,空心圆圈)和湿度(%,实心圆圈)(± 标准误差)。
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| 均一处理 (0) | 差异处理 (7) | 差异处理 (14) | 差异处理 (22) | ||
| 整窝样本 | 13C 原子百分比 | 4.46±0.02 Aab | 3.93±0.05 Ba | 3.64±0.03 Ca | 3.35±0.06 Db |
| 15N 原子百分比 | 6.69±0.07 Aa | 6.72±0.01 Aa | 6.33±0.06 Ba | 6.41±0.07 Ba | |
| 热水提取物 | 13C 原子百分比 | 4.59±0.04 Aa | 3.35±0.06 Bb | 2.79±0.06 Cb | 2.37±0.03 Dc |
| 15N 原子百分比 | 6.69±0.03 Aa | 6.43±0.01 Bb | 5.89±0.07 Db | 6.16±0.05 Cb | |
| 热水残渣 | 13C 原子百分比 | 4.37±0.06 Ab | 4.1±0.03 Ba | 3.79±0.10 Ca | 3.66±0.05 Ca |
| 15N 原子百分比 | 6.57±0.04 Ba | 6.71±0.02 Aa | 6.45±0.02 Ca | 6.44±0.03 Ca |
表1. 均一标记与差异标记凋落物的同位素组成及化学性质。 括号内为在培养室外进行差异标记的天数。每项变量中,标记天数之间的比较以大写字母表示(横向),凋落物组分之间的比较以小写字母表示(纵向)。
用于连续同位素标记的装置设计被用来生成均匀且差异化的 13C 和 15N标记 A. gerardii 用于后续的田间和实验室实验。在连续三个生长季的运行中,该培养室已成功维持了温度、湿度和CO2 设定参数范围内的浓度(图2)。在夏季高温期,强烈的太阳辐射可能导致密闭室过热,此时温度控制系统的工作可靠性至关重要。消除植物蒸腾作用产生的多余湿度,可确保植物气孔保持开放,以利于光合作用的气体吸收。22 且确保水凝结不会阻碍光线穿透或损坏腔室结构。
近连续的 CO 监测2 由红外气体分析仪软件维持的浓度保持连续 13C标记植物,同时植物在培养室中生长。由于植物具有较高的光合作用活性, A. gerardii 在此腔室中生长,CO2 在生长旺季的白天,光合作用活跃,当CO₂被大量吸收时,频繁向系统中注入2 浓度低至 360 ppm,约每 15–20 分钟一次。富集与天然丰度的计量 13C-CO2 储罐实现了对4.4 atom%的精确控制13生长季节期间通过C大气实现植物组织标记的均一化。 13C-CO2 生产也可以通过混合实现 13C-碳酸氢钠或 13C-碳酸钠和盐酸,然而此类系统更为复杂,需要更多的监测与维护,因此我们建议使用 13C-CO2 气体。监测CO时需要考虑的一个重要因素2 使用红外气体分析仪(IRGA)测量浓度时存在的问题是,红外分析仪在测量时会损失三分之二的灵敏度 13C-CO2. 我们对4.4%样品的低估约为2.9% ppm13C-CO2 混合物对我们而言并非主要关注问题,但在进行更高程度标记时可能成为更显著的问题 13C 水平27.
A. gerardii 是一种暖季型多年生高草草原禾本科植物。本实验装置的设计针对 A. gerardii 的生长特性进行了优化(图1)。装置的尺寸和高度综合考虑了 A. gerardii 在野外条件下的最大生长高度,以及后续实验对植物生物量的需求。已知 A. gerardii 在野外生长受光照限制24,25。与室外相比,温室内的光合有效辐射(PAR)可能降低30–47%26。由于本实验中的植物种植于温室内的丙烯酸玻璃装置中,因此需关注 PAR 不足的问题。开启荧光灯后,装置内的 PAR 增加了9.5%,这可能有助于提高该光敏感物种的生产力。若采用此装置设计种植其他植物,应根据具体植物的生理需求,如植株大小、光照需求、养分需求、温度敏感性和土壤湿度等,仔细调整条件,以维持其最佳生长环境。
在使用昂贵的同位素标记化合物时,例如10 atom%13C-CO2 和 98 atom%15N-KNO3,标记效率是一个重要的考量因素。该培养室设计通过尽可能密封培养室并最大限度减少空气进出,从而优化 13C标记效果。若在整个生长季节中培养室始终不开启,则培养室内 13C标记的CO2不会泄漏到大气中。夜间呼吸作用积累的CO2并未对植物生长造成损害,并在日出后迅速被植物吸收(图2)。在进行差异标记时,曾短暂打开培养室以取出差异标记的盆栽,但这似乎并未稀释持续标记植株所目标达到的4.4 atom%13C标记水平(表1)。 13C标记效率还通过在密封培养室时清除初始滞留的大气空气而进一步优化。在初步测试中,若未在封闭前清除培养室内的大气CO2,测得植物最初产生的叶片中 13C丰度低于后期叶片。在关闭培养室时对大气CO2进行初始清除,可有效解决此问题,实现从幼苗到成熟期的连续 13C标记。采用无土壤的栽培基质(如沙子、蛭石和黏土的混合物)还可避免土壤呼吸带来的天然丰度CO2污染。然而,系统中去除土壤后,需特别注意施肥和接种条件,这些条件可能因不同植物种类而异。 15N标记通过目标为7 atom%15N的霍格兰营养液实现,最终获得的植物材料达到6.7 atom%15N的高标记水平(表1)。标记值略低于目标 15N丰度,可能是由于栽培基质中残留的天然丰度氮或接种所用原位土壤中的氮所致。
在化合物生物合成过程中,天然的区分 13C(或 15N)是由于动力学分馏以及合成化合物中同位素的非统计分布而产生的。因此,在碳(C)的情况下,次级产物(例如 脂质、酚类化合物)通常会减少 13C 与初级产物(碳水化合物)相比。这种天然 13C歧视现象在植物生长于富集环境中时似乎仍然存在 13C气氛下,这可从原子百分比的微小差异中看出13C 的热水提取物及热水残留物的测定表1)。这种自然的动力学分馏效应相较于富集作用非常微弱,不会影响标记的均匀性。
对植物结构组织和代谢组织进行差异标记是一种新兴技术,有望推动凋落物分解、微生物生态学及土壤有机质形成等领域的深入研究。其差异在于 13C 和 15热水提取物和热水残留物的N表明存在显著稀释 13C 和 15N 在植物结构材料(热水残渣)中可浸提的低分子量化合物(热水提取物)中的含量,在差异标记 7、14 和 22 天后(P<0.005)。这种对植物组织的差异性标记可用于在生态系统中分别追踪结构组分和代谢组分的去向。 13C差异标记更为显著 15N 差异标记。这可能是由于其即时性 13C稀释度,当将植物从 13C-CO2 标记的大气环境中,而 15氮标签在盆栽混合物中仍会保留一段时间 15N稀释发生得更慢。对于更显著的差异标记 15N,在植株移出培养室前的最后几周,可考虑在进行自然丰度施肥前用水冲洗培养容器。
该连续 13C 和 15N 标记系统的设计与运行,可用于均一或差异性的代谢与结构植物组织标记,为生产同位素标记的植物材料以开展前沿研究提供了一种新颖的方法。本装置的设计与操作细节针对 A. gerardii 实现 4.4 原子%13C 和 7 原子%15N 的标记水平而设定,但也可根据其他植物种类及同位素标记水平的需求进行调整。此处描述的生长条件应根据目标植物物种在尺寸、温度、湿度、光照、水分和营养方面的需求进行相应优化。通过标记灌溉系统所用水,还可实现 18O 或 2H 的标记。本文所述系统解决了植物材料均一及差异性 13C 标记中的诸多挑战。其他研究团队亦可采用这一基础室体设计,制备高标记水平的植物材料,用于生态系统生物地球化学领域的深入研究。
特别感谢科罗拉多州立大学的植物生长设施和EcoCore分析设施,以及众多参与本项目的学生和教师。本研究由美国国家科学基金会(NSF)DEB资助项目 #0918482、美国农业部(USDA)国家需求奖学金以及Cotrufo-Hoppess土壤生态学研究基金资助。
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