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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
应力颗粒剂(SGS)是含有受阻核糖核蛋白颗粒(的RNP),并且在对各种逆境的细胞应答重要的细胞质RNA的颗粒。超导重力仪的动态特性可以遵循的活细胞通过可视化的SG在应激后转染的原代细胞标记一个组件的国产化。
SGS能按特定的蛋白质成分或聚腺苷酸+ mRNA的免疫染色进行可视化的细胞。超导重力仪是高度动态的,其装配和命运的研究是重要的,了解应激的细胞反应。在超导重力仪的关键因素,如G3BP(RasGAP SH3结构域结合蛋白)的缺乏导致小鼠和中枢神经系统的改变发育缺陷。若要从一个有机体,人们可以培养的原代细胞研究超导重力仪的动态细胞和遵循的SG的转染标记组件的国产化。我们描述时间推移实验,观察含G3BP1-SGS在小鼠胚胎成纤维细胞(MEF中)。这种技术也可以用来研究含G3BP-SGS在活神经元,这是至关重要的,因为它是最近表明,这些超导重力形成在神经变性疾病如阿尔茨海默病的发作。这种方法可以适用于任何其他的蜂窝体和颗粒的蛋白质成分,以及执行以转基因动物,从而允许例如颗粒动力学在没有这些颗粒的具体因子的活研究。
应力颗粒剂(SGS)是形成为对环境胁迫,如升高的温度下,氧化应激,缺氧,渗透压休克,紫外线照射,葡萄糖剥夺,或病毒感染1的蜂窝式保护性反应的非膜质细胞质灶。它们可以化学诱导治疗与像亚砷酸钠,触发氧化应激的化合物。超导重力积累停滞翻译被捕信使核糖核蛋白(mRNPs)配合物2中,从机械翻译的mRNA螯合剂,和它们的组件可以通过eIF2α蛋白的磷酸化(真核起始因子2α)来触发。超导重力仪是它与核糖体和其他颗粒,如P小体交换组件的动态结构。它们构成了一个"分流中心",其中的mRNA进行分类和处理要么翻译,再引发,降低或包装成稳定的非多核糖体mRNPs 3。超导重力仪的组装速度快bUT它是一个渐进的过程,最初众多的小聚集体,其凝聚成较大的颗粒。使用该中断或稳定微管的化学抑制剂表明,微管网络是必需的法国兴业动态,包括组装,聚结和拆卸过程。
超导重力的动态组件也促进特定RNA结合蛋白(RNA-BP),如TIA-1(T细胞内抗原-1)和聚集TIAR(TIA-1相关蛋白),其能够二聚化促进多聚核糖体拆卸和mRNA的路由到的SG 4。 G3BP(RasGAP SH3结构域结合蛋白)是这样的RNA-BP的本地化的SGS当细胞被强调用砷或高的温度,并去磷酸化G3BP的过表达可诱导的SG组件5。
G3BP是一个进化上保守的RNA-BP,最初表征通过其与一个RAS-GTP酶激活蛋白相互作用(RasGAP p120 6);但此相互作用是最近重新7。该G3BP家族包括哺乳动物中两个成员,G3BP1(简称G3BP)和G3BP2 8。这两个蛋白共定位于SGS,当细胞受到应力9。典型的RNA识别基序(RRM)与保守RNP1和RNP2基序:G3BPs包括一个N-末端结构域NTF2建议以影响其定位和低聚,接着富含脯氨酸(PxxP基)基序,则C-末端基序与RNA结合相关,其次是精氨酸 - 甘氨酸丰富(RGG)框。有趣的是,通过构建融合到EGFP的不同结构域的蛋白质的不同部分的分析表明,NTF2样结构域和RNA结合结构域是最有效地募集到的SG,表明二聚化的性质的重要性和RNA的结合超导重力仪的组装。多样化的车型已经在体外 10-13透露G3BP蛋白的不同功能。G3BP在小鼠干扰已经表明这种蛋白在发育的生长和存活14,以及用于G3BP在中枢神经系统(CNS),在空间工作记忆15特征在于,共济失调和缺陷中起重要作用的重要性。 G3BP缺乏导致改变神经元的可塑性和钙稳态,建立SG的形成和神经退行性疾病15之间的直接联系。能够学习的SG的动力学在初级细胞如神经元因此,这是很重要的。
该协议提供了一种简单的方法来观察下砷治疗的原代细胞含G3BP1-SGS的组装。它可以被用来研究的SG组件在不同条件下,例如不同类型的应力。它也可以适用于其它颗粒的SG的或其他成分。事实上,这个协议的重点G3BP1,但也有其他应力的颗粒标记物像TIA-1 / R,TTP(tristetraprolin)2,FMRP(脆性X智力低下综合征蛋白)16,TDP-43(有中介的响应DNA结合蛋白43),17或18诗道芬。特别是,像TIA-1 / R蛋白是一样G3BP,成核RNA结合蛋白,可诱导的SG组件过度表达时,即使不同形成的SG可以在功能,调节和相关的转录物不同。的任意这些关键部件或成核剂的SG的荧光团标记的版本转染可以执行图像特定的SG组件和动态。
在这个协议的所有动物的程序都在严格遵守与1986年11月24日(86-609/EEC)的欧共体理事会指令的指引。房子的小鼠组,从而允许食物和水随意 。他们保持在受控环境中(22±1℃,55±5%相对湿度)与12小时:12小时光照:黑暗周期(灯亮在7:00上午)。
1小鼠原代细胞培养:小鼠胚胎成纤维细胞(MEF中)
2,文化中的一种在神经元的案例daptations
的EGFP-G3BP1构造3。转染
转染的细胞用含有您感兴趣的蛋白的基因(SGS的任何成分)稠合到荧光标记(GFP,YFP,等)的载体,用3微克纯化的质粒的每35mm培养皿。
G3BP 4。含可视超导重力大会和动态
应力颗粒的形成是重要的细胞对应激的反应,允许一个细胞适应与停滞翻译,直到压力已被清除,相关的预防凋亡。此法允许以研究在原代细胞的SGS,通过以下关键蛋白质的SG部件国产化( 图1)。 G3BP,SGS组件的一个重要因素,是存在而漫射在MEF中培养的或神经元( 图2A中a和 c)的细胞质中,并且显然存在于离散的颗粒下在MEF中砷治疗以及神经元( 图2A b和D)。主细胞可以从转基因小鼠模型来获得,例如允许应力颗粒在没有它们的组分之一的研究。有趣的是,G3BP1在小鼠的缺乏导致中枢神经系统的严重缺陷,特别是共济失调phenotype其特征在于,没有能力正确地协调的运动和空间工作记忆的改变(如在一个肢抱拢式测试, 图2B中所示)。 G3BP1存在于应力颗粒神经元中,这是更有趣的是,超导重力已经示出,形成在神经变性疾病如阿尔茨海默病的发作。
该测定中( 图1),从而允许以研究的SG在原代细胞,不可缺少来研究其组成和装配体内 。此外,它允许活细胞的研究,并因此可以用于跟踪的SG的动态,通过可视化的一个或多个实时其过表达的元件, 图3示出了代表时间推移图像允许跟随装配和动力学G3BP1含SGS实验室砷处理后的MEF。在图4A中,相同的实验是在崇拜执行与鼠海马神经元URE。 EGFP-G3BP1本地化去从大亚细胞颗粒结构,以更明确和更小的颗粒,经SGS,砷治疗后。的SG是越来越定义,如果收购被持续(未示出),但其细胞形态开始变化,可能是由于诱导的激光激发的热量和毒性。
时间流逝允许视频的捕捉,直接观察了SGS动态。此外,使用共聚焦显微镜的允许重建的图像在Z轴堆叠,从而跟随整个3维细胞中的机构的完全的动力学(如在图4B中所定义的时间示出了神经元)。

图1描述的协议的主要步骤 。主细胞进行培养从胚胎(18.5 DPC(天后coitum)(或新生儿幼仔)的神经元(一),13.5 DPC为的MEF(b)条)。含EGFP-G3BP1基因的质粒转染后,细胞被强调和成像与激光扫描共聚焦显微镜。含G3BP1-SGS的动态观察。 神经元是由微管相关蛋白(微管相关蛋白2)染色(a)中,G3BP1染色的MEF(b)中显示。它们被给定为说明性的图片,以及EGFP-G3BP1转染的鼠神经元(c)和成纤维细胞(d)中,它是独立的图片和不对应于在(a)和给定的细胞(b)所示。

图2(A)。 G3BP定位在培养的MEF和海马神经元,未经处理或与亚砷酸钠强调。 G3BP主要是细胞质,与弥漫性染色的MEF(a)或在大颗粒结构中的神经元(三)当细胞没有强调的躯体。 1小时的亚砷酸钠治疗后,G3BP变得以离散的胞质颗粒局部(MEFs细胞,b和神经元,d)所示。这里,固定细胞并进行免疫染色用抗G3BP1抗体。 MAP2染色许可证,以确定在C神经元)和d)。 DNA的复染为蓝色用Hoechst。标尺代表2微米(a和b)和10微米(c和d)(B)。当向地板 (肢紧握测试) 的尾部抬起 ,野生型小鼠延长他们的腿(左),而G3BP1基因敲除小鼠表现出异常的爪子紧紧抱住反射接近蝙蝠一样的姿势。 请点击此处查看大图这个数字。
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图3中的时间推移实验逐次采集与MEFs细胞转染EGFP-G3BP1获得,使用Leica SP5激光扫描共聚焦显微镜 (激发波长为488纳米的波长)。收购已经开始10分钟内添加亚砷酸钠后,并在10分钟内以20秒的间隔获得。六个代表性的图片给出,与T增加了亚砷酸钠(0.5毫米)后的时间以秒为单位。箭头显示了两个方面,我们可以看到的SG的组装。比例尺= 2微米。

图4(A)。在时间推移实验连续采集与转染EGFP-G3BP1小鼠海马神经元获得的,使用的是徕卡SP5激光扫描共聚焦显微镜 (激发在488纳米的波长)。收购已经开始5分钟加入的亚砷酸钠后,并在40分钟内以20秒的间隔获得。六个代表性的图片给出,与T增加了亚砷酸钠(0.5毫米)后的时间以秒为单位。箭头显示了两个方面,我们可以看到的SG的组装。标尺为5微米D:。枝晶;一:轴突 。 (B)。来自Z堆栈转染EGFP-G3BP1并与亚砷酸钠治疗的神经元(5收购Z轴合共逾10微米)3维重建 N:神经突起(树突或轴突)。 请点击此处查看大图版本这个数字。
作者宣称,他们有没有竞争的财务权益。
应力颗粒剂(SGS)是含有受阻核糖核蛋白颗粒(的RNP),并且在对各种逆境的细胞应答重要的细胞质RNA的颗粒。超导重力仪的动态特性可以遵循的活细胞通过可视化的SG在应激后转染的原代细胞标记一个组件的国产化。
作者要感谢在那里进行了收购的蒙彼利埃力成像(MRI)平台。他们感谢伊莎贝尔克里斯蒂娜·洛佩兹·梅希亚,亚历山德拉梅斯,伊琳娜Lassot,索朗Desagher,法比安斯基Loustalot和维尔Georget他们在协议中的不同部分的帮助。这项工作是支持的基金会倒拉RECHERCHEMédicale(FRM)(队报FRM 2011-N°DEQ20111223745)。
| DMEM/F12 | Gibco | 21331 | 在 37 °C 下预热;C |
| 丙酮酸钠 | Gibco | 11360 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140 | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | 25030 | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | 15096 | |
| 玻璃底 B-35 | Greiner | 627860/627861 | 处理与否(处理:增加贴壁细胞的附着) |
| 聚-L-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P2636 | |
| DMEM | Gibco | 31966 | 在 37 °C 下预热;C |
| HeBS | Sigma-Aldrich | 51558 | |
| Neurobasal | Gibco | 21103 | 在 37 °C 下预热;C |
| 2-巯基乙醇 | Gibco | 31350 | |
| 镊子 | Biotek | DU-110-A | 非常薄,尖端 0.1 mm(用于去除脑膜) |
| 弯曲镊子 | Biotek | P-110-BUF | 非常薄,尖端 0.1 mm |
| 小剪刀 | Biotek | CM-85-BS | 可用于去除海马 |
| Polyplus 转染 JetPEI 试剂 | Ozyme | 101-10 | MEFs 转染,遵循正向方案 |
| 倒置激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | SP5 |