我们描述了一种用于原代多发性骨髓瘤细胞的高通量药物敏感性检测方法。该方法包括在多孔板中重建骨髓微环境(包含细胞外基质和基质细胞),以及一种对细胞活力进行纵向定量的非侵入性方法。
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我们描述了一种用于原代多发性骨髓瘤细胞的高通量药物敏感性检测方法。该方法包括在多孔板中重建骨髓微环境(包含细胞外基质和基质细胞),以及一种对细胞活力进行纵向定量的非侵入性方法。
在本研究中,我们描述了一种结合了新型方法的策略 离体 药物敏感性检测与数字图像分析用于评估患者来源的多发性骨髓瘤(MM)细胞的化疗敏感性及异质性。该方法将直接从骨髓穿刺液中分离的原代MM细胞接种于多孔板中集成的微流控腔室,每个腔室均重建了骨髓微环境,包含细胞外基质(胶原或基底膜基质)以及基质成分(患者来源的间充质干细胞)或人源性内皮细胞(HUVECs)。腔室中加入不同药物及浓度处理,并在配备数码相机的电动显微镜下,通过明场显微镜连续成像96小时。数字图像分析软件通过细胞膜运动的有无识别活细胞与死细胞,生成细胞存活率随药物浓度和作用时间变化的曲线。我们采用计算模型确定肿瘤群体对每种药物的化疗敏感性参数,以及亚群数量作为肿瘤异质性的度量。这些针对患者的个体化模型可用于模拟治疗方案并预测临床疗效。
本方法旨在表征多发性骨髓瘤(MM)原代细胞对一系列药物的敏感性 离体尽可能接近生理条件,并具有足够的精确度,以利用这些结果识别肿瘤负荷中具有化疗耐药性的亚群,并最终为旨在预测临床反应的计算模型提供参数。
计算模型是分析复杂系统(如癌症-宿主-治疗相互作用)的有力工具。然而,模型的准确性取决于用于参数化的数据质量。遗憾的是,文献中大多数现有数据由于通常是在互斥的实验条件下获得的,因此无法直接用于此类模型的参数化。因此,通常需要设计新的实验,以获取所需的一组实验参数。然而,大多数细胞活力检测方法具有破坏性,因而只能在少量时间点进行检测,通常仅有一个时间点。这严重限制了化学敏感性检测在计算模型参数化中的应用,因为这类实验无法提供系统时间动态变化的信息。对于原代癌细胞而言,这一问题尤为突出:每份样本通常仅有数百万个细胞,且在活检后存活时间较短,从而限制了可实施的实验条件数量。此外,大多数细胞活力检测在定量时需要将癌细胞与非癌细胞(基质细胞)分离,这不仅增加了实验操作步骤,进一步干扰了细胞状态,也限制了可开展的实验数量。
40年前,Salmon 及其合作者1 提出了他们著名的 体外 用于评估肿瘤细胞化疗敏感性的集落形成实验。遗憾的是,由于在对照条件下能够形成集落的多发性骨髓瘤(MM)患者样本数量较少,该实验的应用效果有限:据估计,仅有极小亚群(0.001%至0.1%)的MM细胞具有复制能力,这类细胞被称为多发性骨髓瘤干细胞2这极大地限制了该检测方法的成功率以及单次可测试的药物数量,即使在较新的模型中也是如此。3如今,多发性骨髓瘤的治疗药物(标准或试验性)比四十年前多得多,这一问题显得尤为重要。
这些早期检测方法的一个主要局限性在于其二分法的输出结果:即患者对某种特定药物被判定为“敏感”或“耐药”。该方法并未提供关于肿瘤细胞群体敏感程度及其异质性的任何信息。因此,对于存在少量快速生长耐药细胞亚群的患者,可能被归类为对治疗“敏感”,但会很快出现复发,因而无法从治疗中获益。鉴于治疗反应持续时间对癌症患者总生存期(OS)的重要性4,5,显然这些检测方法无法持续准确地估计总生存期。
为了克服这些局限性,并能够生成可预测患者对一系列药物个性化临床反应的特异性计算模型,我们开发了一种方法,可在骨髓微环境(包括细胞外基质和基质)的ex vivo重建体系中,非破坏性地检测多发性骨髓瘤(MM)细胞系及原代MM细胞对药物的敏感性6。然而,该检测方法的局限性在于依赖于一种特定的商用微流控载片,其尺寸和成本限制了在特定设备上可同时开展的实验数量或药物种类。
本文所述系统将这一原始检测方法扩展为一种高通量的类器官剂量-反应平台,用于基于数字图像分析算法对药物进行体外筛选,以无损方式定量细胞活力。384孔或1,536孔板中的每个孔均为骨髓微环境的三维重建结构,包含原代多发性骨髓瘤(MM)细胞、细胞外基质以及患者来源的基质和生长因子。通过活细胞显微镜和数字图像分析,检测不同药物浓度下的细胞死亡事件,进而生成剂量-反应曲面。根据体外实验数据,数学模型可识别患者肿瘤负荷中不同亚群的大小及其化学敏感性,并可用于模拟肿瘤在生理条件下对药物治疗方案的反应6(图1)。
该平台的主要创新之处在于:(a)所需癌细胞数量少(每种药物浓度仅需 1,000–10,000 个细胞);(b)可在生理条件下评估药物疗效(包括细胞外基质、间质、患者来源的生长因子);(c)活力标记物无毒性7 由于仅使用明场成像,因此无需用荧光标记转染细胞8 或生物发光9;(d)连续成像可提供药物效应随浓度和暴露时间变化的关系(药效学);以及(e)整合性 体外 以及计算进化模型,用于评估临床结局6 (席尔瓦 等人, (正在准备中)
数字图像分析算法能够区分癌细胞与间质细胞的关键因素在于它们对孔板底部的亲和力不同:多发性骨髓瘤细胞不贴壁,保持悬浮在基质中,而间质细胞则贴附于孔板底部并随后伸展。
尽管多发性骨髓瘤细胞(MM)和基质细胞是同时接种的,但这种分离现象仍会在过夜(O/N)培养过程中发生。接种后通过离心进一步加速了该过程。因此,在图像中,MM细胞呈现为周围带有暗环的圆形亮盘状结构,而基质细胞则保持较低的轮廓和较暗的色调(图2)。因此,当前形式的检测方法最适合用于非黏附性癌细胞;不过,可通过调整算法,根据其他形态学特征(如大小和形状)来实现癌细胞与基质细胞的区分。在本实验方案中,我们描述了两种类型的细胞外基质(胶原蛋白和基底膜基质),以及两种共培养体系:分别使用骨髓来源的间充质干细胞(BMSC)和人脐静脉内皮细胞(HUVECs),代表骨髓中的间质微环境和血管周围微环境。
使用384孔板,每种药物设置5个浓度,每个浓度2个复孔,可利用单个患者的样本最多测试31种不同的药物。在1,536孔板中,该数量可达127种。图3展示了目前手动接种细胞所采用的布局,而补充图1则表示使用自动化移液器时的最佳分布方式。在图3所示的设计中,每块384孔板可容纳3个患者样本,每个样本测试7种不同药物;或单个患者样本测试21种药物。每种药物包含5个浓度,每种条件设2个复孔。每组7种药物设有4个对照孔(不加药物)(例如,36–39孔、126–129孔和200–203孔)。为确保所用药物的有效性,同时接种一个人类骨髓瘤细胞系(例如 H929 或 MM1.S),并在每种药物的最高浓度下设两个复孔进行处理(76–89孔)。阳性细胞系对照可确保所用药物具备足够的活性,因为其剂量反应曲线在不同实验间具有可比性。另设两个孔接种骨髓瘤细胞系,作为环境条件的对照,即用于检测成像过程中台式培养箱可能出现的问题(75孔和90孔)。孔位编号采用之字形排列,以减少显微镜电动载物台移动的距离,从而缩短采集时间并降低设备磨损。
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以下所述使用来自活检的人类细胞的研究已获得莫菲特癌症中心机构审查委员会的批准,并在位于H. Lee Moffitt癌症中心和研究机构进行的临床试验MCC# 14745下开展。
1. 从骨髓穿刺液中分选多发性骨髓瘤细胞
2. 在培养板中接种细胞(使用手动多通道移液器)
3. 在培养板中接种细胞(使用机器人移液器)
注意:本系列步骤使用机器人移液器在384孔板中接种细胞。补充图1展示了该板的设计,其中将原代多发性骨髓瘤(MM)细胞与31种不同药物在五个不同浓度下进行测试,每种条件设两个重复,并包含阴性对照。同时接种一个细胞系作为药物疗效评估的阳性对照,并在最高浓度下对全部31种药物进行测试,每种设两个重复。所提供的文件适用于特定品牌和型号(见材料表),但该操作程序可适配于任何类型的机器人移液器。
4. 药物制备与加药(使用手动多通道移液器)
5. 药物配制与加药(使用机器人移液器)
6. 培养板中细胞的成像
注意:以下步骤适用于 Evos Auto FL 显微镜,但也可轻松适配于其他带有台式培养箱或内置培养箱的电动载物台显微镜。
7. 药物敏感性的定量分析
注意:由于在个人计算机上分析多孔板极为耗时,以下说明将指导如何使用计算机集群进行图像分析。
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实验流程简要描述如下 图1如果所有步骤均成功完成,显微镜下获得的图像应相当于 图2:活的MM细胞应清晰地显示为明亮的圆盘状,而BMSCs或HUVECs在背景中几乎不可见且分布良好。如图所示 图2A,MM细胞的大小因患者而异,但总体上小于细胞系。由于它们几乎不进行复制 离体 在实验间隔期(96 小时)内,可接种较高浓度的细胞(1–3×10⁶ 个细胞/ml)。基质应几乎不可见,因为骨髓间充质干细胞(BMSC)会贴附于孔板底部并伸展,呈现较低的形态特征。人骨髓瘤细胞系 H929 显著大于患者来源的多发性骨髓瘤(MM)细胞。图2B),并在24小时内进行重复实验。为避免图像过于密集,MM细胞系以较低密度接种,即0.3×10⁶个细胞/ml。 图2C 和 二维 分别代表患者来源的多发性骨髓瘤(MM)细胞和人骨髓瘤细胞系H929,与人脐静脉内皮细胞(HUVECs)共培养。HUVECs首先贴附于孔板底部,随后开始相互接触并形成网络结构,...
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总之,这是一种强大且高通量的方法,可用于定量评估原代多发性骨髓瘤细胞的化学敏感性 离体 骨髓重建中药物的药效动力学。本方案中的关键步骤是正确接种孔板和适当的聚焦(参见 图2 为获得预期结果,请确保骨髓瘤细胞和基质细胞均匀分布,基质细胞贴壁于孔底,所有骨髓瘤细胞处于同一焦平面,且骨髓瘤细胞呈现为周围环绕暗环的明亮圆盘状形态。
如果接种不当(参见图5),请勿继续实验,而应重新接种第二块培养板。若发现基质细胞(MM)或间质细胞密度过低或过高,应在接种前检查细胞悬液的浓度,并在接种过程中定期重悬,以确保细胞在培养基中均匀分布。使用带重复功能的多通道移液器或自动化分液仪可显著减少此类问题。本实验所用细胞/基质与培养基的比例(1:10)旨在最大化可接种的孔数,从而增加可研究的实验条件。然而,若需研究癌细胞或间质细胞产生或消耗的可溶性因子,建议将细胞/基质与培养基的比例调整为1:1。
目前,该系统仅能定量非黏附细胞。为了定量间质细胞数量的变化,需要对该软件...
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作者声明无利益冲突。
本研究由佛罗里达州Bankhead-Coley团队科学基金(2BT03)、美国国立卫生研究院/国家癌症研究所(1R21CA164322-01)以及莫菲特癌症中心团队科学基金资助。部分工作得到了转化研究的支持 美国H.李·莫菲特癌症中心核心设施 & 研究所,一个经美国国家癌症研究所(NCI)指定的综合性癌症中心(P30-CA076292)。通过莫菲特癌症中心的“全面癌症治疗计划”(Total Cancer Care Protocol),得以获取原代细胞。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| EVOS FL AUTO | AMG | AMAFD1000 + AMC1000 | 配备电动载物台和台式培养箱的数字显微镜。 |
| 384孔 CellBind 板 | CORNING | CLS3683 SIGMA | Corning CellBIND 384 孔板 384 孔板,聚苯乙烯材质,CellBIND 表面处理,无菌,透明平底,黑色,带盖 |
| 1,536 孔 CellBind 板 | CORNING | CLS3832 ALDRICH | Corning 1,536 孔板,低底,CellBIND 表面处理,无菌 |
| Ficoll-Paque Plus | GE Healthcare | GE17-1440-02 SIGMA | 用于体外分离人外周血淋巴细胞。 |
| CD138 磁珠 | Miltenyi | 130-051-301 | 用于富集 CD138+ 细胞的抗体偶联磁珠。 |
| LS 柱 | Miltenyi | 130-042-401 | 用于细胞分离的层析柱。 |
| MidiMACS 分离器 | Miltenyi | 130-042-302 | 用于分离柱的磁铁装置。 |
| Matrigel | Sigma-Aldrich | E6909 SIGMA | 源自 Engelbreth-Holm-Swarm 小鼠肉瘤的细胞外基质凝胶(ECM Gel) |
| Getrex | Life Technologies | A1413201 | 无LDEV、低生长因子的基底膜基质 |
| HUVEC | Life Technologies | C-003-25P-B | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC) |
| RPMI-1640 培养基 | GIBCO | 11875-093 | RPMI 1640 培养基 + L-谷氨酰胺 + 酚红 |
| 经热灭活的 FBS | GIBCO | 10082-147 | 胎牛血清,经认证,热灭活,源自美国 |
| 3.1 mg/ml 牛 I 型胶原蛋白 | Advanced Biomatrix | 5005-B | 牛 I 型胶原蛋白溶液,3 mg/ml,100 ml |
| Precision XS | BIOTEK | PRC3841 | 自动化移液工作站系统 |
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