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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
代谢重编程是 M1 和 M2 巨噬细胞极化的特征和先决条件。本手稿描述了一种用于测量小鼠骨髓来源的巨噬细胞中糖酵解和线粒体功能基本参数的测定法。该工具可用于研究特定因素如何影响巨噬细胞的代谢和表型。
特异性代谢通路越来越被认为是巨噬细胞亚群的关键标志。虽然 LPS 诱导的经典激活的 M1 或 M(LPS) 巨噬细胞具有促炎作用,但 IL-4 诱导替代巨噬细胞激活,这些所谓的 M2 或 M(IL-4) 支持炎症消退和伤口愈合。最近的证据表明,代谢重编程在调节 M1 和 M2 巨噬细胞极化中起着关键作用。
在本手稿中,应用细胞外通量分析仪来评估幼稚、M1 和 M2 极化小鼠骨髓来源的巨噬细胞的代谢特性。该仪器使用 pH 和氧传感器来测量细胞外酸化率 (ECAR) 和耗氧率 (OCR),这可能与糖酵解和线粒体氧化代谢有关。因此,糖酵解和线粒体氧化代谢都可以在一次检测中实时测量。
使用这种技术,我们在这里证明炎性 M1 巨噬细胞表现出增强的糖酵解代谢和降低的线粒体活性。相反,抗炎 M2 巨噬细胞表现出高线粒体氧化磷酸化 (OXPHOS),其特征是备用呼吸能力 (SRC) 增强。
所提出的功能测定用作研究特定细胞因子、药理化合物、基因敲除或其他干预措施如何影响巨噬细胞代谢表型和炎症状态的框架。
虽然巨噬细胞发挥在几乎所有的疾病中发挥核心作用,调节其表型的分子机制还没有完全拆开的。巨噬细胞显示出高的异质性,并响应于微环境采用不同的表型1。 LPS(+IFNγ)诱导激活经典的M1或M(LPS),巨噬细胞促进炎症,并防止不同类型的微生物威胁2的主机。其他使用IFNγ单独或与肿瘤坏死因子的刺激诱发M1两极分化。 IL-4和/或IL-13诱导的替代巨噬细胞活化和这些M 2 或M(IL-4)细胞是有效的抑制剂和正在进行的免疫反应3控制器。偏光巨噬细胞显示细胞代谢的独特调控脂多糖激活的巨噬细胞M1进行代谢开关增强糖酵解4-6。相反,增强脂肪酸氧化(FAO)和线粒体oxidativë磷酸化(OXPHOS)提供持续的能量中的IL-4诱导的巨噬细胞的M2 7-9。因此,改变的代谢不仅是偏振光巨噬细胞子集的特性的同时,还进行适当的极化和炎症调节的先决条件。重要的是,糖酵解或OXPHOS的抑制/ FAO已经证明削弱M1或M2激活,分别8,10。这样,在巨噬细胞识别代谢变化可作为一种工具,以评估它们的极化状态和炎性电位施加。
一致的测定法,其测量细胞巨噬细胞代谢因此可以用于预测药物,基因是否击倒或其他处理的影响巨噬细胞极化和功能。在此视频,一个细胞外通量分析仪用于表征幼稚,M1和M2巨噬细胞的生物能学概况。
这份手稿详细介绍了优化的协议,允许测量所有相关的参数酵解(糖酵解,最大糖酵解和糖的储备)和线粒体功能特点(共呼吸,基础线粒体呼吸,ATP的产生,质子漏,最大呼吸和备用呼吸能力)在一个单一的检测。使用该实验装置,生物能可以控制和'改变'之间进行比较( 如基因敲除,转基因过表达或药物治疗)的细胞。
1.培养和偏光骨髓来源的巨噬细胞
2.准备胞外通量测定法
| 混合/注塑 | 化合物 | 添加量来获得10倍的混合物(微升) | 体积测定培养基(毫升) | 卷运行过程中注入(微升) | 最终浓度在测定 |
| 一个 | 2.5M的(45%)的葡萄糖 | 300 | 2.7 | 20 | 25毫米 |
| 乙 | 5毫米寡A(OM) | 9 | 3.0 | 22 | 1.5微米 |
| C | 5毫米FCCP | 9 | 2.7 | 25 | 1.5微米 |
| 100丙酮酸钠溶液 | 300 | 1毫米 | |||
| ð | 5毫米抗霉素A(AA) | 153.0 | 28 | 2.5μM | |
| 5毫米鱼藤酮(ROT) | 7.5 | 1.25μM |
表1.注射液的混合物。
偏光M1和M2的BMDM使用外流量分析仪3.生物能表征
在完成细胞外通量测定法和细胞定量后,数据可以标准化用于细胞计数和分析。这通常产生ECAR和OCR曲线,如图1A和图1B。
注射葡萄糖(A)后,增加ECAR代表糖酵解率。 ATP合酶抑制与寡(B)的后ECAR额外增加提供有关糖酵解储备和能力(图1A)的信息。在分析OCR值,寡注射液(B)可用于线粒体ATP合成耗氧量的计算。 FCCP(C)脱开线粒体呼吸和相应的OCR测量产生有关的最大和备用呼吸容量的数据。最后,注射鱼藤酮(ROT)和抗霉素A(AA)的方框线粒体复合物I和III和残留的OCR表示非线粒体氧利弊umption(图1B)。

图1:来自胞外XF通量测定法衍生的代谢参数 。 ( 一)细胞糖酵解以下参数从ECAR值计算(在MPH /分钟):糖酵解,最大糖酵解能力和糖酵解储备。 (B)中的OCR测量(在皮摩尔/分钟)来计算线粒体功能的下一个基本参数:基础呼吸,ATP产生,质子泄漏,最大呼吸和备用呼吸容量。胰高血糖=葡萄糖; OM =寡A; FCCP =羰基氰化物4-(三氟甲氧基)苯腙; AA =抗霉素A;腐=鱼藤酮请点击此处查看该图的放大版本。
运行后,ECAR和OCR测量1直到升15为每个孔可以被导出到Excel和下面的糖酵解参数可以计算从ECAR测量如下:
非糖酵解酸化=平均。 ECAR(1,2,3)
糖酵解=平均。 ECAR(4,5,6) -魅力。 ECAR(1,2,3)
最大糖酵解能力=平均。 ECAR(7,8,9) -魅力。 ECAR(1,2,3)
糖酵解储备=平均。 ECAR(7,8,9) -魅力。 ECAR(4,5,6)
从OCR率,下代谢特征可以被确定:
非线粒体呼吸=平均。 OCR(13,14,15)
基础呼吸=平均。 OCR(4,5,6) -魅力。 OCR(13,14,15)
ATP的产生=平均。 OCR(4,5,6) -魅力。 OCR(7,8,9)
质子漏=平均。 OCR(7,8,9) -魅力。 OCR(13,14,15)
最大呼吸=平均。 OCR(10,11,12) -魅力。 OCR(13,14,15)
备用呼吸能力(SRC)=平均。 OCR(10,11,12) -魅力。 OCR(4,5,6)

图2:对幼稚代谢特性(M0),LPS-(M1)和IL-4-(M2),巨噬细胞偏振光对于每次测量的8各个孔的平均值(SEM)的,平均值和标准误差呈现。 (A)的细胞外酸化速率(ECAR,在MPH /分钟)和(B)的氧消耗速率(OCR,在皮摩尔/分钟),测量用于差动极化(M1和M2)和幼稚的巨噬细胞(M0)。所有测量均标准化为细胞计数(与CyQUANT测量),幼稚的巨噬细胞的平均细胞数设定为1。jection A =葡萄糖; B =寡; C = FCCP; D =抗霉素A +鱼藤酮。 请点击此处查看该图的放大版本。
如图2A所示,巨噬细胞活化与LPS诱导提高糖酵解代谢。当看耗氧率(OCR) 在图2B中的LPS和IL-4处理的巨噬细胞之间的差异更加明显。实际上,虽然最大氧化代谢是高度抑制在M(LPS),IL-4诱导基底和尤其最大呼吸中的M2巨噬细胞。应该注意的是增加糖酵解是相当独特的,以M(LPS)的巨噬细胞,而且也不一定M1型巨噬的特征,因为M(IFNγ)的巨噬细胞不显示提高糖酵解。
总体来说,这款外流量分析显示,塔吨的IL-4诱导的巨噬细胞的M2的特征在于增强的氧化代谢和特别高的备用呼吸容量(SRC),而脂多糖活化巨噬细胞显示增强的糖酵解代谢和不具有任何备用呼吸容量。
免费使用这篇文章是由海马生物科学赞助。
代谢重编程是 M1 和 M2 巨噬细胞极化的特征和先决条件。本手稿描述了一种用于测量小鼠骨髓来源的巨噬细胞中糖酵解和线粒体功能基本参数的测定法。该工具可用于研究特定因素如何影响巨噬细胞的代谢和表型。
Jan Van den Bossche 获得了荷兰心脏基金会的初级博士后资助 (2013T003) 和 ZonMW 的 VENI 资助 (91615052)。Menno de Winther 是荷兰心脏基金会 (2007T067) 的知名研究员,得到荷兰心脏基金会赠款 (2010B022) 的支持,并拥有 AMC 奖学金。我们还感谢荷兰心血管研究计划、荷兰大学医学中心联合会、荷兰卫生研究与发展组织和荷兰皇家科学院对 GENIUS 项目"为动脉粥样硬化生成最佳循证药物靶点"(CVON2011-19) 的支持。我们感谢 Seahorse Bioscience 使开放获取出版物成为可能。作者感谢 Riekelt Houtkooper 和 Vincent de Boer(荷兰阿姆斯特丹学术医学中心遗传代谢疾病实验室)之前对 Seahorse 分析仪的所有帮助。
| 23G 和 25G 针头 | Becton Dickinson | #300800 和 #300600 | 冲洗骨髓 |
| 10 ml 注射器 | Becton Dickinson | #307736 | 冲洗骨髓 |
| 培养 | 皿Greiner | #639161 | 培养骨髓细胞 |
| CyQUANT 细胞增殖测定试剂盒 | Molecular Probes | #C7026 | 用于稍后时间点的细胞定量(仅适用于贴壁细胞) |
| CyQUANT 直接细胞增殖检测试剂盒 | Molecular Probes | #35011 | 用于检测后立即进行细胞定量(非贴壁细胞) |
| XFe96 细胞培养微孔板 | Seahorse Bioscience | #101085-004 | 96 孔板,其中培养细胞并进行检测 |
| 重组小鼠白细胞介素-4 (IL-4) | Peprotech | #214-14-B | 用于诱导替代巨噬细胞活化 |
| 脂多糖 (LPS) | Sigma | #L2637 | 促炎刺激 |
| Seahorse 传感器探针式磁带 | Seahorse Bioscience | #102416-100 | 包含用于 pH 和 O2 测量的探头 |
| Seahorse XF 校准品 | Seahorse Bioscience | #100840-000 | 需要对探针进行过夜水合 |
| XF 基础培养基 | Seahorse Bioscience | #102353-100 | 无缓冲培养基,可有效测量 pH 值变化 |
| L-谷氨酰胺 | Life Technologies | #25030-081 | |
| D-(+)-葡萄糖 | Sigma | #G8769 | 一旦添加到细胞中,即可促进糖酵解寡 |
| 霉素 A | Sigma | #75351 | 抑制线粒体 ATP 合酶 |
| FCCP( 羰基氰化物 4-(三氟甲氧基)苯腙) | Sigma | #C2920 | 解耦线粒体呼吸 |
| 100 mM 丙酮酸钠溶液 | Lonza | #BE13-115E | 允许最大线粒体呼吸,无需糖酵解 |
| 抗霉素 A | Sigma | #BE13-115EA8674 | 抑制线粒体鱼藤酮的复合物 III |
| #BE13-115EA8674R8875 | 抑制线粒体的复合物 I线粒体 | ||
| Casy 细胞计数器 | Roche Diagnostics | #05 651 697 001 | 细胞计数仪 |
| 抗 CD16/CD32 | eBioscience | #14-0161 | Fc 受体阻断流式细胞术 |
| 抗 F4/80-APC-eFluor780 | eBioscience | #47-4801 | 巨噬细胞染色抗体 |
| 抗 CD11b-FITC | eBioscience | #11-0112 | 巨噬细胞染色抗体 |