海藻糖类似物正逐渐成为生物(技术)学和生物医学应用中的重要分子。本文介绍了一种优化的酶法合成与纯化海藻糖类似物的实验方案,该方法简便、高效、快速且环境友好。文中展示了该方法在快速制备和使用一种用于检测分枝杆菌的探针中的应用。
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海藻糖类似物正逐渐成为生物(技术)学和生物医学应用中的重要分子。本文介绍了一种优化的酶法合成与纯化海藻糖类似物的实验方案,该方法简便、高效、快速且环境友好。文中展示了该方法在快速制备和使用一种用于检测分枝杆菌的探针中的应用。
化学修饰的海藻糖或海藻糖类似物在生物学、生物技术、药物科学等领域具有广泛应用。例如,带有可检测标记的海藻糖类似物已被用于检测 结核分枝杆菌 并可作为结核病诊断成像试剂。由于海藻糖的水解稳定型版本具有用作非热量甜味剂和生物保护剂的潜力,相关研究也正在开展。尽管此类化合物在多种应用中颇具吸引力,但因其缺乏高效可靠的合成途径,其潜力尚未得到充分实现。本文报道了一种快速、高效的一步法生物催化合成海藻糖类似物的详细方案,该方法避免了化学合成中存在的问题。通过利用来自 Thermoproteus tenax,海藻糖类似物可通过葡萄糖类似物与尿苷二磷酸葡萄糖在15–60分钟内一步高效生成(转化率可达定量水平)。一种简单快速的非色谱纯化方案,包含离心透析和离子交换步骤,可在短短45分钟内获得多种已知浓度的海藻糖类似物水溶液。若反应后仍有未反应的葡萄糖类似物残留,可对海藻糖类似物产物进行色谱纯化。总体而言,该方法提供了一种 "绿色" 用于快速合成与纯化海藻糖类似物的生物催化平台,具有高效且易于非化学专业人员操作的特点。为展示该方法的适用性,我们描述了一种针对分枝杆菌的海藻糖基点击化学探针的合成、全水相纯化及给药的实验方案,整个过程耗时不足1小时,并实现了分枝杆菌的荧光检测。未来,我们设想该方案可应用于结核病诊断用海藻糖基探针的快速合成。例如,短半衰期放射性核素修饰的海藻糖类似物(例如, 18F修饰的海藻糖)可用于正电子发射断层扫描-计算机断层扫描(PET-CT)等先进的临床成像技术。
海藻糖是一种对称的非还原性二糖,由两个葡萄糖单元通过1,1-α,α-糖苷键连接而成(图1A)。尽管人类及其他哺乳动物体内不存在海藻糖,但它广泛存在于细菌、真菌、植物和无脊椎动物中1。在大多数生物体中,海藻糖的主要功能是抵御环境胁迫,例如干燥1。此外,某些人类病原体的致病性依赖于海藻糖,包括引起结核病的Mycobacterium tuberculosis,该菌利用海藻糖作为细胞包膜生物合成的媒介物,以及构建免疫调节性糖脂的结构单元2。

图 1: 海藻糖及海藻糖类似物。 (A)天然海藻糖与非天然海藻糖类似物的结构,其中 X 为结构修饰位点。(B)文献报道的具有生物保存和生物成像应用潜力的海藻糖类似物示例。
由于其独特的结构和生理功能,海藻糖在生物(技术)学和生物医学应用中受到了广泛关注 3在自然界中观察到的海藻糖的保护特性——例如,其显著的能力有助于维持“复苏植物”在经历极度脱水后的生命存活 4—推动了其在生物保存领域的广泛应用。海藻糖已被用于保存多种生物样本,如核酸、蛋白质、细胞和组织 3例如,海藻糖作为一种稳定添加剂,已被用于市场上多种药品中,包括多种抗癌单克隆抗体。 3此外,海藻糖在食品工业中被用作甜味剂,并广泛应用于食品和化妆品行业的商品保鲜。最初,由于无法从天然来源或通过化学合成获得大量高纯度的海藻糖,其在这些商业领域的应用受到限制。然而,近年来已开发出一种高效的酶法工艺,可经济地从淀粉生产海藻糖,从而推动了海藻糖的广泛应用 5.
海藻糖的化学修饰衍生物(本文中称为海藻糖类似物)因其多种应用而受到越来越多的关注(通式结构见图1A;具体海藻糖类似物示例见图1B)6。例如,乳糖基海藻糖(lacto-trehalose)是一种海藻糖类似物,其中一个葡萄糖单元被半乳糖取代,因此其4位羟基具有相反的立体化学构型。乳糖基海藻糖具有与海藻糖相同的稳定特性,但对肠道酶的降解具有抗性,因此作为非热量食品添加剂具有良好的应用前景6, 7。
本研究团队对海藻糖类似物的兴趣主要源于其作为分枝杆菌特异性探针和抑制剂的价值。Barry 和 Davis 研究组开发了一种荧光素偶联的酮基海藻糖类似物,命名为 FITC-酮基海藻糖,该探针可对活体M. tuberculosis的细胞壁进行代谢标记,从而通过荧光显微镜实现检测8。Bertozzi 实验室则开发了更小的叠氮基海藻糖(TreAz)类似物,这类分子同样可通过代谢标记细胞壁,并利用点击化学结合荧光分析进行后续检测9。这些进展表明,海藻糖类探针有望作为结核病诊断性成像试剂加以应用。此外,由于海藻糖类似物可能干扰结核分枝杆菌中对存活和毒力至关重要的代谢通路,因此也被探索用作M. tuberculosis的抑制剂10,11,12。
迄今为止,开发海藻糖类似物用于生物(技术)学及生物医学应用的主要障碍在于缺乏高效的合成方法。目前制备海藻糖类似物的两种传统途径均依赖于化学合成(图2)。其中一种途径是对天然海藻糖进行去对称化或修饰,另一种则是以适当官能团化的单糖为构建单元,通过化学糖基化反应构建1,1-α,α-糖苷键。这些方法在近期的综述文章中已有讨论13, 14,已被证明可用于多步合成少量复杂的含海藻糖天然产物,例如来自结核分枝杆菌(M. tuberculosis)的硫酸脂-115。然而,这两种方法通常效率较低、耗时较长,非化学专业人员难以操作,且被认为对环境不友好。因此,在合成某些类型的海藻糖类似物时,这些策略并不理想。

图2: 海藻糖类似物合成的策略。 如左侧所示,海藻糖类似物的化学合成方法采用多步反应流程,涉及复杂的保护/去保护、去对称化和/或糖基化步骤。如右侧所示,酶法合成则利用一种或多种酶在水溶液中立体选择性地将简单且未保护的底物转化为海藻糖类似物。本文报道的酶法方案使用一种海藻糖合酶(TreT)将葡萄糖类似物与UDP-葡萄糖一步转化为海藻糖类似物。请点击此处查看该图的放大版本。
一种高效的生物催化途径将有助于这类有前景分子——海藻糖类似物的生产、评估与应用。尽管目前已有商业化酶法用于海藻糖的生产5 由于该方法以淀粉为底物,无法适用于合成类似物,但自然界中存在其他可用于海藻糖类似物合成的生物合成途径。然而,该领域的研究最近已有综述 6,一直有限。有一项研究采用了一种受启发的方法 大肠杆菌 海藻糖生物合成途径可从相应的氟代葡萄糖制备单一氟代海藻糖类似物。然而,该方法需要一个三酶系统,其效率和普适性有限 8另一种已被探索的方法是利用海藻糖磷酸化酶(TreP)的逆向反应,理论上可通过葡萄糖类似物与葡萄糖-1-磷酸一步合成海藻糖类似物。 6, 16, 17尽管这一方法未来可能具有应用前景,但目前翻转型和保留型TrePs在模拟物合成方面均存在缺陷。例如,翻转型TrePs需要使用价格高昂的供体分子(β-D-葡萄糖-1-磷酸),而保留型TrePs则存在酶表达产率低、稳定性差以及底物广谱性有限等问题。显著改进(例如在TreP介导的类似物合成具备实用性之前,还需进行酶工程等方面的改进。
目前,酶法合成海藻糖类似物最实用的方法是使用海藻糖合酶(TreT),该酶可在单步反应中将葡萄糖和尿苷二磷酸葡萄糖(UDP-葡萄糖)转化为海藻糖6。我们近期报道了利用Thermoproteus tenax TreT——一种耐热且单向的酶18——从葡萄糖类似物和UDP-葡萄糖合成海藻糖类似物的方法(图3)19。该酶仅在合成方向发挥作用,避免了TreP系统中存在的海藻糖降解问题。该单步反应可在1小时内完成,并以高收率(通过高效液相色谱法(HPLC)测定,最高可达>99%)获得多种结构多样的海藻糖类似物,起始原料为易得的葡萄糖类似物底物(参见代表性结果部分的表1)。

图3: TreT酶催化的海藻糖类似物一步合成。 来自T. tenax的TreT酶能够立体选择性地将易得的葡萄糖类似物与UDP-葡萄糖结合,一步合成海藻糖类似物。R1-R4 = 可变的结构修饰,例如叠氮基、氟代、脱氧、硫代、立体化学或同位素标记修饰;Y = 可变杂原子,例如氧或硫,或同位素标记的杂原子。
本文提供了TreT合成过程的详细方案,包括从大肠杆菌(E. coli)中表达和纯化TreT、优化的TreT反应条件,以及一种完全在水相中进行的改进型纯化方法。该改进方案可实现多种海藻糖类似物在半制备规模(10–100 mg)下的快速高效合成与纯化。我们还展示了利用该方案在不到1小时内制备并施用基于海藻糖的探针至分枝杆菌,从而实现对分枝杆菌细胞的快速荧光检测。
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1. 从Top10 E. coli 中表达并纯化TreT
注意:请与作者联系以获取表达 TreT 的 E. coli 菌株(pBAD TreT 质粒,含有在 AraC 蛋白调控下的 T. tenax tret 基因,已转化至 Top10 E. coli19)及相关材料转移协议。以下实验方案通常可获得约 4 mg/L 的蛋白质产量。
2. 利用TreT酶一步合成海藻糖类似物
注意:以下方案描述的反应体系体积为 4 mL,根据反应效率和产物的分子量不同,可获得约 15–30 mg 的海藻糖类似物。如需更多或更少产物,可按比例调整反应组分的用量。
3. 从粗酶反应混合物中纯化海藻糖类似物
4. 海藻糖类似物产物的分析
5. 海藻糖类似物在分枝杆菌检测中的应用
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T. tenax TreT 通过标准的蛋白质表达与纯化技术从 E. coli 中获得,产率约为 4 mg/L。仅需一步镍亲和层析即可从 E. coli 裂解液中纯化 TreT(典型的 FPLC 色谱图见图4)。根据我们此前关于 TreT 合成过程的首次报道,重组的 T. tenax TreT 能够高效地将多种葡萄糖类似物(其中许多为市售可得)转化为相应的海藻糖类似物19。表1列出了采用我们最初报道的实验方案时,多种起始葡萄糖类似物经 HPLC 测定的反应产率,展示了 TreT 对底物的广泛兼容性及其在合成应用中的适用性。野生型酶可耐受糖环不同位置上的多种结构修饰,包括氟代、脱氧、叠氮、硫代以及立体化学修饰,主要例外是 4 位的修饰。
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海藻糖类似物在多个领域具有潜在应用价值,从食品和药品的保存到微生物感染的诊断与治疗6。现有的多步化学合成方法可用于制备在多个位点发生修饰的复杂海藻糖类似物(例如,天然存在的复杂分枝杆菌糖脂)。然而,即使用于合成相对简单的单取代海藻糖类似物,这些方法也 invariably 耗时较长且效率低下9, 13, 14。因此,亟需开发替代性的合成策略,以快速、高效地制备各类在上述领域具有应用潜力的海藻糖类似物。利用自然界中海藻糖合成酶的生物催化方法最具前景。尽管自然界中存在多种海藻糖合成途径,但我们认为来自T. tenax18的TreT酶是用于海藻糖类似物合成的理想酶,原因如下。
T. tenax 来源的 TreT 具有热稳定...
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作者无任何利益冲突需要披露。
本工作由美国国立卫生研究院资助(R15 AI117670),资助对象为 B.M.S. 和 P.J.W.,同时由研究公司(Research Corporation)授予 P.J.W. 一项科特雷尔大学学者奖(Cottrell College Scholar Award,编号20185)。L.M.M. 获得了卡内基梅隆大学教务长奖学金的支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| LB 琼脂 | Research Products International | L24021 | |
| 氨苄青霉素钠盐 | Sigma Aldrich | A9518 | |
| LB 肉汤 | Research Products International | L24045 | |
| 优质肉汤(Terrific Broth) | Research Products International | T15050 | |
| L-(+)-阿拉伯糖 | Sigma Aldrich | A3256 | |
| 磷酸盐缓冲液(PBS) | GE Healthcare | SH30256 | |
| 咪唑 | Sigma Aldrich | I5513 | |
| 氯化钠 | BDH | BDH9286 | |
| 磷酸二氢钠 | Fisher Scientific | S374 | |
| 注射器滤器,0.45 µm | Fisher Scientific | 09719D | |
| 蛋白酶抑制剂迷你片剂,不含 EDTA | Thermo Scientific | 88666 | |
| HisTrap HP 镍亲和层析柱,5 mL | GE Healthcare | 17-5248-02 | |
| TRIS 碱,超纯 | Research Products International | T60040 | |
| 透析袋,截留分子量 12–14,000 | Fisher Scientific | 21-152-16 | |
| 葡萄糖类似物 | CarboSynth, Sigma Aldrich, Santa Cruz Biotechnology, American Radiolabeled Chemicals | 提供多种葡萄糖类似物的供应商示例 | |
| 6-叠氮-6-脱氧葡萄糖(6-GlcAz) | CarboSynth | MA02620 | |
| UDP-葡萄糖 | abcam Biochemicals | ab120384 | |
| 六水合氯化镁 | Fisher Scientific | M33 | |
| Amicon Ultra-15 离心过滤装置 | EMD Millipore | UFC901008 | |
| Bio-Rex RG 501-X8 混合床离子交换树脂 | Bio-Rad | 444-9999 | |
| 超细 Bio-Gel P2 层析介质 | Bio-Rad | 150-4118 | |
| 玻璃背衬硅胶薄层层析板 | EMD Millipore | 1056280001 | |
| n-丁醇 | Fisher Scientific | A399 | |
| 乙醇 | Fisher Scientific | S25310A | |
| 硫酸 | Fisher Scientific | A300 | |
| 乙腈 | EMD Millipore | AX0145 | |
| 氘代水,99.8% | Acros Organics | 351430075 | |
| 氨基丙基 HPLC 柱 | Sigma Aldrich | 58338 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | 5470 | |
| 对苯二甲醛 | Ted Pella | 18505 | |
| 炔烃-488 | Sigma Aldrich | 761621 | |
| 抗坏血酸钠 | Sigma Aldrich | A7631 | |
| 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三氮唑-4-基)甲基]胺(TBTA) | Click Chemistry Tools | 1061 | |
| tert-丁醇 | Sigma Aldrich | 360538 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | W387520 | |
| 硫酸铜(II) | Sigma Aldrich | C1297 | |
| Fluoromount-G 封片剂 | Southern Biotechnology | 10001 |
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