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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
淀粉样蛋白沉积是不同疾病的标志, 并影响许多不同的器官。本文介绍了荧光结合吩荧光染色技术在光学显微镜下的应用。这种染色方法是一种强有力的工具, 用于检测和探索蛋白质集在临床和科学的设置。
在全身的组织中沉积为淀粉样蛋白的蛋白质可能是大量疾病的起因或后果。其中, 我们发现神经退行性疾病, 如阿尔茨海默氏症和帕金森病, 主要困扰中枢神经系统, 和系统性淀粉样变性, 血清淀粉样蛋白 A, 蛋白和 IgG 光链作为淀粉样蛋白在肝脏, 腕隧道, 脾脏, 肾脏, 心脏, 和其他周围组织。淀粉样蛋白已被称为和研究了一个多世纪, 通常使用淀粉样蛋白的特定染料, 如刚果红和 Thioflavin 吨或 Thioflavin (这)。本文以 heptamer-甲酰基噻吩乙酸 (hFTAA) 为例, 对这些染料进行了新的补充, 称为发光共轭吩。hFTAA 易于使用, 并与 co-staining 免疫荧光或其他细胞标记相容。广泛的研究已经证明, hFTAA 检测的疾病相关的蛋白质总量比传统的淀粉样染料的范围更广。此外, hFTAA 也可用于光学分配的不同的聚合 morphotypes, 以允许研究淀粉样纤维多态性。虽然应用的成像方法是可选的, 我们这里演示高光谱成像 (他), 激光扫描共聚焦显微镜和荧光寿命成像 (电影)。这些例子显示了一些成像技术, 在那里, 可利用 amyloids 作为工具, 以获得更详细的知识的形成和结构的性质的。对该技术的一个重要限制是, 就所有传统光学显微镜技术而言, 对集料的微观尺寸的要求, 以允许检测。此外, 骨料应包括一个重复的β表结构, 以允许 hFTAA 约束力。过多的固定和/或表位接触, 修改的聚合结构或构象, 可以呈现较差的 hFTAA 结合, 因此对精确成像的限制。
淀粉样蛋白在组织中的沉积是一些疾病的病理特征, 如阿尔茨海默氏病、帕金森氏病、系统性淀粉样变性和朊病毒病。尽管与淀粉样蛋白相关的疾病普遍存在, 而且到目前为止, 近40种不同的蛋白质被归类为人类1中的淀粉样前体, 但对淀粉样蛋白沉积与疾病表型之间的关系知之甚少。从人类病人的标本组织学已经被用于诊断和科学目的。已经建立了大量的动物模型来研究淀粉样蛋白负荷与行为、寿命和其他一些疾病进展的表型读出之间的相关性2,3。在药物发现和设计方面也作出了巨大的努力, 以抗击我们最害怕的广泛疾病。然而, 对基因型、表型、淀粉样斑块负荷与药物管理之间的关系的评价并不直接。用于组织中淀粉样蛋白染色和成像的工具通常是钝性的, 并提供低分辨率的淀粉样蛋白的形成和结构信息。
刚果红双折射, 和荧光是典型的方法, 检测和分析组织样本中的淀粉样的负担, 从病人活检和验尸样本, 和动物模型的疾病4。这些技术已经使用了几十年 (自二十世纪二十年代以来的刚果红和自二十世纪六十年代以来的衍生品和衍生物), 虽然仪器已被提炼, 并允许详细分析, 染色程序和分析仍在执行在几乎一个世纪前的同样的方式。
在本文中, 我们描述了一种高度敏感的新的淀粉样蛋白染料的利用, hFTAA5, 这使得检测小未成熟蛋白质沉积高准确度, 以及检测成熟淀粉样。与传统染料相比, hFTAA 已被证明可以检测到更广泛的疾病相关蛋白聚集5,6,7。此外, hFTAA 还可以应用于不同的聚合 morphotypes8的光学分配。在这里, 我们描述 hFTAA 染色和分析的组织从建立的朊病毒疾病和淀粉样β前体蛋白 (APP) 转基因小鼠的设计, 以模拟斑块发育阿尔茨海默病的研究9,10.我们还展示了对系统性淀粉样变性患者的诊断和尸检样本的分析。这些有内在属性, 使他们能够报告在一个牌匾的构象差异;并结合两个不同的属性与绑定和荧光的性质, 差异更显着11。一种荧光显微镜, 装有长通滤波器和高光谱相机头, 用于实现光谱特性的客观分类和显微谱分析的记录。以可调谐激光为激发源的共焦荧光显微镜对淀粉样蛋白的三维性质进行了更详细的评价。可调谐激光可以收集的激励频谱和一步少选择发射波长的显微镜下, 使 co-imaging 的柴油荧光和免疫荧光, 以确定共存的目标蛋白和淀粉样。电影提供了前所未有的敏感性, 对构象差异强加给了污染和揭示的差异, 可能无法检测的荧光发射光谱。
所述染色方法的主要目的是促进对小淀粉样沉积物的灵敏检测, 并在淀粉样沉积物中表征构象多态性。这些知识对于蛋白质聚集疾病的基本理解是非常重要的。
注意: 柴油合成已经在我们的实验室进行了十多年。通过对亲芳香取代、钯催化交叉、酰胺偶联和酯水解的协议的基本应用, 我们为不同用途而综合定制探头 5 , 12 . 经过合成、表征和纯化后, 柴油产品在室温下冻干并贮存。一些探测器 (其中 hFTAA) 现在是商用的 (请参见 材料表 ).
1. 柴油染色液
注意: 如果 hFTAA 是从商业供应商购买的, 请按照供应商和 #39 的说明操作, 而不是1节.
2。组织标本的制备
注意: 许多组织类型可以用 hFTAA 作为淀粉样标记来成像。有关示例, 请参见 图 1 。hFTAA 对骨料构象敏感。因此, 染色最好是对不的聚合体进行, 没有表位暴露。如果将组织固定保持在最低限度, 就能获得最佳的频谱质量。因此, 新鲜冰冻的材料, 轻轻地固定在酒精染色时, 是首选。然而, 有可能检测淀粉样沉积也在组织中已固定与 如 , 福尔马林。hFTAA 通常穿透组织好。选择与预期成像技术兼容的试样厚度.
3。显微镜
注意: 使用带有长通滤波器的荧光显微镜。下面的所有设置都用于在 图 4 中生成图像。可能需要根据淀粉样蛋白类型和组织样本进行调整。虽然 hFTAA 与淀粉样蛋白的结合是稳定的漂白, 它是可取的关闭光源时, 标本是不检查或成像.
从人类患者和实验动物的许多不同组织类型的大量蛋白质中, 对淀粉样蛋白的敏感和选择性染色对临床诊断和科学研究至关重要。在本文中, 我们展示了如何可以实现这一点, 通过 hFTAA 的例子, 为染色和多模态成像的淀粉样蛋白从选择的组织类型。自从十年前的 thiophene-based 淀粉样体配体第一次发表13, 在各种组织中由多种蛋白质组成的淀粉样沉积物已被图像使用了6、7、11, 14,15,16 (图 1)。与抗体或其他组织学标记相结合, 该方法为诊断和科学目的提供了优秀的工具 (图 1a,图 2)。通过适当选择荧光标记, 可以在同一剖面 (图 1a、hFTAA 和 DAPI、图 2a hFTAA 在免疫荧光设置中) 对多个荧光进行成像。还可以使用明和荧光 (图 2b, hFTAA 和抗体染色) 连续的部分染色。最近, hFTAA 已被证明是一个非常有前途的补充刚果红染色在临床诊断7,15 (图 3)。
在过去的几十年中, 成像技术的发展增加了对淀粉样蛋白的需求, 这些染料可以在一分钟内辨别, 但同时在数量上对淀粉样沉积物的深度差异。柴油内的共轭系统为它提供了一种独特的能力来报告其装订方式的变化。分子的扭曲会导致共轭系统中的结合角失真, 并阻碍电子的传输 (图 4a)。这反过来又反映了柴油的荧光性质, 无论是在激发和发射波长和发射寿命。我们使用他在一个直立的荧光显微镜, 装有长通滤波器的排放。对于共焦显微镜和电影中的激发和发射谱, 我们使用脉冲激光 LSM780。为了举例说明不同的技术, 我们成像一个对象 (β淀粉样蛋白 (a) 斑块在 APP 转基因鼠标) (图 4b-e)。高光谱荧光光谱 (图 4b) 允许对斑块不同区域内的光谱位移和强度变化进行评估。共聚焦显微镜 (图 4c) 的激发谱可用于确定下游实验的最佳激发波长,如, 组合染色与几种荧光。这种方法也可以被证明是有用的, 以检测的构象差异的结合模式的柴油。共焦模式的发射光谱可用于测定 hFTAA 或多种荧光组合实验中定位的荧光发射特性, 并结合几种柴油和免疫荧光组合.hFTAA 的荧光寿命受到 hFTAA 结合方式的微小变化的影响。因此, 电影是区分绑定目标 (图 4d) 对 hFTAA 施加的差异的强大工具。这可以用于例如不同的朊病毒菌株之间的区别8。共聚焦成像和处理 Z 栈成三维图像是一个有用的工具, 探索的整体形状的淀粉样蛋白聚合 (图 4e)。再次, 使用额外的荧光可以帮助理解存款的组成。

图 1: 各种组织类型和蛋白质聚集物显示 h 自由贸易区染色: (a) 马洛里-Denk 体组成的角蛋白聚集在肝脏 (1-4 与 DAPI), (b) p62-positive r 夹杂物在散发包涵体肌炎 (s-IBM) 肌肉组织, (c) 胰岛淀粉样多肽在人的胰腺, (d) 的免疫球蛋白轻链淀粉样蛋白在人的肠道, (e) 绵羊病 (朊) 在小鼠的大脑中, (f) 慢性消瘦症 (朊) 在老鼠脑中, (g) a 斑在 APP23 鼠脑, (h) a 病理在 APP/PS1 鼠脑, 和 (i) 脂肪活检涂片从诊断样本的蛋白淀粉样蛋白在人类患者等级 1-4 根据标准刚果红 (CR) 评分。黄色区域显示 hFTAA 染色的淀粉样沉积物和蓝色是来自脂肪组织的自发荧光。在每个面板中指定刻度线长度。请单击此处查看此图的较大版本.

图 2: 带有抗体的 co-staining 的示例.(a) 用抗淀粉样蛋白 a (aa) 免疫荧光和 hFTAA 人 aa 淀粉样在同一切片上进行联合染色。上部左: AA 抗体放射640毫微米;右上 hFTAA 在 488 nm;底部面板覆盖图像显示定位在黄色。(b) 抗体染色和 hFTAA 荧光连续切片。顶部面板: AA 抗体民建联染色, 底部面板: hFTAA 成像与 longpass 发射过滤器。缩放栏: 100 µm.请单击此处查看此图的较大版本.

图 3:荧光与短通滤波器对人心脏蛋白淀粉样蛋白的比较染色与迈尔的苏木精/刚果红色 (a-d) 和迈尔的苏木精/hFTAA (e)。(a) 明图像, (b) 明 + 荧光, (c) 明 + 交叉偏振, (d) 明 + 荧光 + 交叉偏振, (e) hFTAA 荧光405nm + 480 nm 励磁 (连续的部分到a-d)。缩放栏: 100 µm.请单击此处查看此图的较大版本.

图 4: 用 hFTAA 和几项技术成像的同一个物体用一个 a 的 APP23 老鼠的斑块来演示.(a) hFTAA 的荧光性质取决于其构象状态。给出了 hFTAA 在平面和扭转状态下的结构。(b) 用于评估连续发射谱的高光谱成像。下面板中的光谱是根据图像中有兴趣的盒装区域进行颜色编码的。(c) (i) 用于励磁成像的共焦成像和 (ii 和 iii) 光谱和发射成像在过滤模式或 (iv) 谱模式。(d) 荧光寿命成像检测淀粉样蛋白的构象差异, 在 a 斑块的外围发现较短的生存期, 而在斑块的中心处的寿命更长。下面板中的直方图显示整个斑块的生命时间分布。图像根据直方图下的刻度进行着色。(e) 在筛选模式中收集的共焦 Z 堆栈, 以显示对象的三维结构。在每个面板中指定刻度线长度。请单击此处查看此图的较大版本.
PH PN MB SN 是埃生物技术的小股东, 市场化 hFTAA 在品牌名称 Amytracker545。
淀粉样蛋白沉积是不同疾病的标志, 并影响许多不同的器官。本文介绍了荧光结合吩荧光染色技术在光学显微镜下的应用。这种染色方法是一种强有力的工具, 用于检测和探索蛋白质集在临床和科学的设置。
作者希望感谢迈克尔林格伦和南 Sluzny 关于荧光显微镜的建议, 和阿德里亚诺 aguzzi-dur, 约翰 Bijzet, Bouke Hazenberg, 弗兰克赫普纳, Jucker, 苔蕾丝 Klingstedt, 卡琳马格努森, 克里斯蒂娜 Sigurdson, 丹尼尔 Sjölander,克里斯托弗 Röcken, 古尼拉 Westermark, 每 Westermark, 和库尔特 Zatloukal 的贡献组织部分或显微显示在本出版物。本文所收集的数据由瑞典脑基金会 (Hjärnfonden)、瑞典阿尔茨海默病协会 (Alzheimerfonden)、瑞典研究理事会 (VR)、约兰·佩尔松 Gustafsson 协会、乔治和 #38 的捐款提供资金。奥尔森, 欧盟 FP7 健康项目 LUPAS, 林雪平大学。
| hFTAA/Amytracker545 | Ebba Biotech | ||
| Dako 荧光封片剂 | Agilent technologies | GM304 | |
| LeicaDM6000 | Leica | ||
| Lumen 200 | Prior | ||
| Spectraview 系统 | ASI 光谱成像 | ||
| Spectraview 软件 | ASI 光谱成像 | ||
| LSM780 | 蔡司 | ||
| Zen 2010b v6.0 软件 | 蔡司 | ||
| FLIM 系统 | 贝克尔 &Hickl | ||
| Ar/ML 458/488/514 | 蔡司 | ||
| 可调谐激光器 In Tune | 蔡司 |