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方法文章

利用酶级联反应由L-赖氨酸合成手性氨基醇

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DOI:

10.3791/56926

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2018年2月16日

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本文内容

摘要

手性氨基醇是有机合成中可用作骨架的多功能分子。以L-赖氨酸为起始原料,我们通过酶级联反应合成氨基醇:该反应首先由双加氧酶催化实现非对映选择性的C-H氧化,随后由脱羧酶裂解相应羟基氨基酸的羧酸部分。

摘要

氨基醇是一类用途广泛的化合物,具有多种应用。例如,它们已被用作有机合成中的手性骨架。通过传统有机化学方法合成氨基醇通常需要繁琐的多步反应过程,且难以控制其立体化学结果。本文介绍一种利用易得的L-赖氨酸为起始原料,通过酶促方法在48小时内合成氨基醇的实验方案。该方案结合了两个传统有机合成中极难实现的化学反应。第一步由双加氧酶催化赖氨酸侧链上未活化C-H键的区域和非对映选择性氧化;第二步由具有区域选择性差异的双加氧酶进一步催化,生成1,2-二醇。最后一步通过磷酸吡哆醛(PLP)依赖的脱羧酶(DC)切除α-氨基酸的羧基。该脱羧反应仅作用于氨基酸的α-碳,从而保留了位于β/γ位的羟基取代手性中心,因此所得氨基醇具有较高的光学纯度。该方法已成功应用于四种氨基醇的半制备规模合成。反应进程通过高效液相色谱法(HPLC)进行监测,样品经1-氟-2,4-二硝基苯衍生产生信号。通过固相萃取(SPE)进行简单纯化后,氨基醇的收率优异(93%至>95%)。

引言

尽管生物催化具有诸多优势,但将生物催化步骤整合到合成路线或完全生物催化路线中,目前仍主要局限于酶促动力学拆分。这类方法在不对称化学-酶法合成中常被用作初始步骤,但生物催化在官能团转化方面还具有更多潜力,可实现高立体选择性的转化1,2,3。此外,由于生物催化反应通常在相似条件下进行,因此有可能在同一个反应容器中实现级联反应4,5。

手性氨基醇是有机合成中常用的助剂或骨架分子6。氨基醇结构单元常见于次级代谢产物和活性药物成分(API)中。通过传统的化学合成方法,可由相应的α-氨基酸 readily 获得伯β-氨基醇,但获取手性γ-氨基醇或仲氨基醇通常需要繁琐的合成路线,并且对立体化学的控制要求较高7,8,9,10。由于生物催化具有高度的立体选择性,因此可能为这些手性构建单元的合成....

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方案

1. 酶的制备

  1. 如前所述表达并纯化蛋白质26。
    注意:重组蛋白的最终浓度如下:来自Catenulispora acidiphila的αKAO,UniProtKB编号:C7QJ42(KDO1),1.35 mg/mL;来自C. pinensis的αKAO,UniProtKB编号:C7PLM6(KDO2),2.29 mg/mL;来自S. rumirantium的PLP-DCs,UniProtKB编号:O50657(LDCSrum),无细胞提取物中总酶浓度为12.44 mg/mL;来自C. pinensis的PLP-DC,UniProtKB编号:C7PLM7(DCCpin),2.62 mg/mL。

2. 溶液的配制

注意:以下所有溶液均使用去离子水配制。

  1. 配制1 M HEPES缓冲液,pH 7.5;用5 M NaOH调节pH。
    注意:在调节pH的过程中,需佩戴防护手套、防护服、眼部保护装置和面部保护装置(P280)。若接触眼睛(P305、P351、P338),应小心用水冲洗数分钟。如可能,摘除隐形眼镜,并持续冲洗,立即联系中毒控制中心或医生(P310)。P代码指预防措施说明(危险....

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结果

我们此前已报道过通过铁(II)/αKAO家族双加氧酶催化的非对映选择性酶促羟基化反应合成单羟基-L-赖氨酸和二羟基-L-赖氨酸的方法(图1)16。为了优化本文所展示的整个级联反应方案(该方案包含由αKAO催化的一步或两步羟基化反应,随后是由PLP-DC催化的脱羧反应),我们调整了反应条件,以同时满足两种酶促反应的需求。我们首先研究了两种脱羧酶LDCSrum和DCCpin对市售的(5R)-羟基-L-赖氨酸的催化活性。随后,我们将这两种脱羧酶与相应的αKAO催化的氧化步骤组成级联反应,检测其对单羟基衍生物3-羟基-L-赖氨酸(1)和4-羟基-L-赖氨酸(2)的脱羧活性。表1列出了单羟基-L-赖氨酸生物催化脱羧反应的结果。通过DNFB对反应混合物进行衍生化,生成相应的DNB标记底物和产物,再经HPLC测定转化率.......

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讨论

手性氨基醇及其衍生物具有广泛的应用,从有机合成中的手性助剂到药物治疗均有涉及。传统有机合成中制备氨基醇的多步合成方法众多,但由于繁琐的保护/脱保护步骤以及对立体化学控制的敏感性,这些方法并不总是高效16。而生物催化方法无需保护/脱保护步骤,且通常具有高度的立体选择性,因此是一种理想的替代途径。

先前的研究报道了通过动态动力学不对称转化(DYKAT)方法合成多种具有2-苯乙胺骨架的β-氨基醇。在此路线中,由苏氨酸醛缩酶催化苯甲醛及其衍生物的羟醛缩合反应,引入羟基取代的手性中心。该第一步反应的非对映选择性较低且收率中等,但随后通过L-酪氨酸脱羧酶(L-tyrosine DC)催化的立体专一性脱羧反应得以克服,从而得到对映体富集的芳香族β-氨基醇11,12。

本文报道了一种以易得的L-赖氨酸为起始原料,直接合成多种氨基醇的简便方法。尽管该方法效率较高,但由于αKAO和P.......

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

作者感谢 Véronique de Berardinis 的有益讨论,以及 Alain Perret、Christine Pellé 和 Peggy Sirvain 提供的技术支持。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
HEPESSigma AldrichH3375
L-赖氨酸盐酸盐Sigma AldrichL5626
(5S)-羟基-L-赖氨酸Sigma AldrichGPS NONH外包
α-酮戊二酸Sigma Aldrich75892
抗坏血酸钠Sigma AldrichA7631
硫酸亚铁铵六水合物Acros201370250
磷酸吡哆醛(PLP)Sigma Aldrich82870
3,4-二巯基丁烷-1,2-二醇(DTT)Sigma AldrichD0632
1-氟-2,4-二硝基苯(DNFB)Sigma AldrichD1529
乙醇VWR20825.290
碳酸氢钠Sigma Aldrich71631
HCl 37%Sigma Aldrich435570
HCl 0.1MFluka35335
乙腈 HiPerSolv CHROMANORM 用于 LC-MSVWR83640.320
2,2,2-三氟乙酸VWR153112E
氨水 28%VWR21182.294
甲醇 HiPerSolv CHROMANORM 用于 LC-MSVWR83638.32
甲酸Acros270480010
磷酸 85%Acros201145000
重水Acros320,710,075
NaOHSigma AldrichS5881
C18 HPLC 色谱柱Phenomenex00F-4601-Y0
Accela UHPLC 系统ThermoFisher Scientific
Accela PDA 检测器ThermoFisher Scientific
一次性 4 mm 注射器滤器 - 0.22µm - PVDFMerckSLGVR04NL
带毫升刻度、鲁尔接头的一次性结核菌素注射器VWRHSWA5010.200V0
阳离子交换树脂 100-200 目Sigma Aldrich217506
混合模式阳离子交换固相萃取小柱 6 mLWaters186000776
固相萃取装置WatersWAT200609
旋转蒸发仪Büchi531-0103
冷冻干燥机 alpha 1-2 LDplusChristL083302
微量移液器 20 µLEppendorf3121000031
微量移液器 100 µLEppendorf3121000074
微量移液器 500 µLEppendorf3121000112
微量移液器 1000 µLEppendorf3121000120
300 MHz 核磁共振波谱仪Bruker
2 mL 微量离心管CLEARLineCL20.002.0500
50 mL 圆锥底离心管Fischer Scientific05-539-8
25 mL 圆底烧瓶 14/23Fischer Scientific10353331
100 mL 圆底烧瓶 29/32Fischer Scientific11786183
250 mL 圆底烧瓶 29/32Fischer Scientific11786183
250 mL 锥形瓶Fischerbrand15496143

参考文献

  1. Nestl, B. M., Hammer, S. C., Nebel, B. A., Hauer, B. New Generation of Biocatalysts for Organic Synthesis. Ang. Chem. Int. Ed. 53 (12), 3070-3095 (2014).
  2. Reetz, M. T. Biocatalysis in Organic Chemistry and Biotechnology: Past, Present, and Future. J. Am. Chem. Soc....

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