BLISS 是一种用于研究木质素沉积动态的双标记方法。该方法利用合成的单体木质素报告分子,结合SPAAC和CuAAC生物正交点击反应的顺序联用,为深入分析调控木质素生物合成的因素提供了途径 在植株中.
方法文章
BLISS 是一种用于研究木质素沉积动态的双标记方法。该方法利用合成的单体木质素报告分子,结合SPAAC和CuAAC生物正交点击反应的顺序联用,为深入分析调控木质素生物合成的因素提供了途径 在植株中.
木质素是地球上最丰富的生物聚合物之一,也是木质纤维素生物质的主要组分。这种酚类聚合物在高等植物的生长发育和生命活动中发挥着重要的结构支撑与保护作用。尽管调控木质化过程的复杂机制 体内 对许多植物源产品的工业价值具有重要影响,科学界在解析这些过程方面仍有很长的路要走。本文介绍的双重标记方案通过一个简单的三步工作流程,实现了对植物组织中活跃木质化区域的生物成像研究。第一步是将两种独立的化学探针作为天然单体木质醇的替代物,代谢整合到植物体内,这两种单体分别对应木质素中的H单元和G单元。在整合到生长中的木质素聚合物后,每种探针通过连续的生物正交SPAAC/CuAAC点击反应,分别与特异的荧光探针结合。结合木质素的自发荧光,该方法可通过共聚焦荧光显微镜生成植物细胞壁中木质素的三色定位图,从而在组织、细胞以及不同细胞壁层次上,精确提供活性木质化机制存在与否的空间信息。
在过去的二十年中,化学报告分子策略已发展成为一种强大的两步法,用于研究非遗传编码生物分子的动态变化及其功能。1,2,3 在该策略中,首先由活体生物代谢一种带有微小修饰的、目标生物分子的合成类似物——即化学报告分子;随后,通过生物正交“点击化学”反应,将一个化学探针(例如,用于荧光共聚焦显微成像的荧光团)共价连接到已整合的报告分子上。该探针必须能够快速且特异性地与引入的化学修饰发生反应,同时对生物体内存在的各类生物分子保持惰性。在许多方面,该方法通过采用高度特异性的点击化学连接反应,克服了传统生物偶联技术的局限性,从而为在活体系统中追踪此前难以观测的代谢物或生物大分子提供了可能。4,5,6
尽管这种强大方法在细菌和动物细胞中的应用日益广泛,但在植物生物学中描述其应用的报道却出人意料地稀少7,8,9,10,11,12。我们特别感兴趣的是将这一策略应用于植物,以研究木质素的形成过程。木质素是地球上最丰富的生物聚合物之一,也是木质纤维素生物质的主要组分13,14。木质素是一种酚类聚合物,在高等植物的发育和生命过程中发挥着重要的结构支撑和保护作用。
木质素通常由三种4-羟基苯基丙烷基单元组成:H单元(p-羟苯基)、G单元(愈创木基)和S单元(紫丁香基),它们分别来源于三种“单木质醇”——p-香豆醇、松柏醇和芥子醇,这些单木质醇通过细胞质中的苯丙烷代谢途径合成(图1)。单木质醇被转运至细胞壁后,在过氧化物酶或漆酶的作用下被氧化为自由基,随后通过纯粹的化学自由基偶联反应聚合形成木质素聚合物,该过程称为木质化。15,16 尽管木质素对多种植物源性产品的工业利用具有重要影响,但科学界在解析调控木质化过程的复杂机制方面仍任重道远。

图1:植物细胞中的木质化过程。 单木质醇在细胞质中由苯丙氨酸生物合成。单木质醇被转运至细胞壁后,由过氧化物酶或漆酶氧化为自由基,随后通过纯粹的化学自由基偶联反应聚合形成木质素聚合物,该过程称为木质化。 请点击此处查看该图的放大版本。
尽管关于利用生物正交反应进行聚糖分析的报道很多,2,3,17 它们在其他类型生物分子中的应用实例较少。利用生物正交化学进行木质素生物成像的研究直至最近才由 Tobimatsu 首次开创 等8 在 拟南芥 以提供有关松柏醇替代物在木质素聚合物中形成G单元的整合信息,8,9 从而证明了化学报告策略在此背景下具有可行性。几个月后,Bukowski 使用另一种松柏醇衍生物,进一步展示了 CuAAC 的应用。 等.9 然而,木质素还含有H单元和S单元,要更深入地理解木质化过程,还需进一步了解所有单体木脂醇如何被整合到聚合物中,以及可能控制其组成的各种因素。目前,该领域的最新进展依赖于开发出能够在活体系统中同时追踪多种化学示踪剂的有效方法。尽管近年来已有少数关于多糖的研究奠定了基础18,19,20,21,22,双标记方法在生物正交化学中仍然是一个主要挑战。如果一种可重复的单标记点击化学方案都难以开发,那么需要同时优化两种相互兼容的生物正交反应、并作用于两个独立化学报告分子的双标记方法则更加困难。在此方面为数不多的先行研究中,采用的是环张力促进的叠氮-炔烃环加成反应(SPAAC)与烯烃-四嗪逆电子需求狄尔斯-阿尔德反应(DA)相结合的策略。侵袭相关蛋白(inv))反应用于动物细胞中糖类的研究。然而,我们认为,由于木质素的结构特征(由富电子取代的肉桂醇类单体组成,可与缺电子二烯烃发生反应,例如DAinv反应中使用的四嗪探针),DAinv反应在此应用中的生物正交性可能无法得到保证,可能导致非特异性标记。此外,DA侵袭相关蛋白(inv) 反应需要化学修饰基团,而这些基团在合成上难以获得,且具有体积大和亲脂性强的特点,因此可能影响化学报告分子的掺入速率、转运和/或定位 体内 可能会受到影响。鉴于我们认为后一方面在使用点击化学方法研究木质化时尤为关键,我们选择了另一条技术路径,并开发了一种生物正交连接成像顺序策略(Bioorthogonal Ligation Imaging Sequential Strategy,BLISS) 使用应变促进的叠氮-炔烃环加成(SPAAC)与铜催化的叠氮-炔烃环加成(CuAAC)相结合的方法 在体内23
这两种反应确实是迄今为止所使用的两种主要生物正交点击反应,尤其在最近发表的少数木质素成像研究实例中得到了应用。8,9 我们的双重标记策略可在一种单木质醇探针上引入叠氮基团,在另一种探针上引入端炔基团。这两种化学标记基团具有以下特点:i)对生物体系中的相关结构不发生反应;ii)体积非常小(图2)。因此,这些合成修饰对所研究生物分子理化性质的影响被降至最低,从而在代谢掺入过程中,减少了非天然单木质醇底物与天然底物在转运和代谢速率方面可能出现的差异。尽管SPAAC与CuAAC的联用策略初看之下非常直观,但据我们所知,这仅是该策略的第二个双重标记应用实例,也是首次应用于聚糖以外的结构。12,23

图2:BLISS双标记策略。 化学探针HAZ和GALK是天然H型和G型单木质醇的标记类似物。它们首先通过外源添加的方式被整合到细胞壁中正在合成的木质素聚合物中(步骤1)。随后,环辛炔和叠氮功能化的荧光探针通过生物正交点击化学反应依次与已整合的探针连接:SPAAC反应(步骤2)对HAZ单元具有高度特异性,随后进行CuAAC反应(步骤3),该反应特异性识别GALK单元(步骤3),从而实现在同一样本中对两种探针的独立特异性定位。请点击此处查看该图的放大版本。
我们首先设计并验证了叠氮标记的单体木脂素探针 HAZ (替代物) p松柏醇(松柏醇是木质素H单元的前体),随后设计了BLISS双标记策略,该策略将其与先前报道的炔基标记物联用 GALK,9 (松柏醇的替代物及木质素G单元的前体)。在亚麻这一具有重要经济价值的植物物种中开发并验证的这一可重复实验方案,实现了双重代谢整合 HAZ 和 GALK 进入木质素的标记首先在连续的SPAAC/CuAAC标记之前完成。此处,已标记的 HAZ 单位首先被特异性标记 通过 通过SPAAC反应连接环辛炔功能化的荧光染料,随后通过CuAAC介导的连接反应将第二种荧光探针连接至标记位点 GALK 单位。该方法可用于研究植物细胞壁中木质化过程的动力学,且可被应用于 体内 茎的横切面、活体茎以及不同植物物种的幼苗。
注意:液体和固体½ MS培养基必须按照补充表1中所述预先配制。
1. 植物培养
2. 化学报告分子的代谢整合
注意:以下展示了三种实验模型:i)茎横切面的代谢标记,ii)完整茎段,以及 iii)植物幼苗。每种方案均以一个生物学重复为例进行描述,所需生物学重复的数量可根据实际情况调整试剂用量。单木质醇溶液由实验前按照表2所述方法配制的储备液制备。储备液可在 -20 °C 下保存数月。HAZ:GALK 或 H:G 的比例可根据自定义实验设计进行调整。
3. 通过 SPAAC 和 CuAAC 对植物横截面样本进行双重荧光标记
注意:BLISS 标记方案在所有 3 种实验模型中均相同(第 2 节)。
4. 将样品装载到显微镜载玻片上
5. 荧光共聚焦显微镜图像采集
通过使用本研究所提出的BLISS方案,结合合成的单木质醇类似物与生物正交点击化学反应,可在活体植物中可视化木质化过程的动态变化。与现有的木质素可视化技术(如组织化学染色、免疫定位或自发荧光)不同,该“双点击”方案仅特异性标记新合成的木质素 从头合成 在代谢标记步骤中,通过共聚焦荧光显微镜的三通道细胞成像,将其与样品中预先存在的木质素区分开来(图3). HAZ- 使用 DBCO-PEG 的激发和发射波长检测信号单位4-5/6-羧基罗丹明110,特异性点击连接至掺入的叠氮基团 HAZ SPAAC 步骤中的分子(λex 501 nm /λem 526 nm,绿色通道),而 GALK-单位在叠氮荧光探针 azidefluor 545 的特征波长处被类似地检测到,该探针特异性地与整合到末端炔烃标签上的基团发生点击反应 GALK 在CuAAC步骤期间(λex 546 nm /λem 565 nm,红色通道);第三通道对应于预先存在的木质素,通过其在405 nm处的固有自发荧光(蓝色通道)进行检测。该方法可生成植物细胞壁中木质素的三色定位图谱,提供器官不同组织间活性木质化机制存在与否的精确空间信息图3A),同一组织内不同细胞类型之间的差异(图3B- C)以及同一细胞不同壁层之间(图3D换句话说,该方法能够突出并特异性定位“活跃的”木质化位点(HAZ 和 GALK 通道),从而将其与植物发育早期阶段形成木质素的区域(自发荧光通道)区分开来。此外,与自发荧光相比,该技术的灵敏度显著提高,能够检测到更微量的新合成木质素(图3B).

图3:亚麻茎中掺入的单体木质素化学探针成像。(A)亚麻茎手工制作的横切面一半,重建图像。(B)分化中木质部最外层的放大图。左图:木质素自发荧光(蓝色,405 nm),中图:木质素自发荧光(蓝色)与HAZ 荧光(绿色,526 nm)通道合并,右图:木质素自发荧光(蓝色)与GALK荧光(红色,565 nm)通道合并。箭头指示从形成层开始第一个被标记的细胞壁,说明BLISS技术相比自发荧光具有更高的灵敏度。(C)次生木质部不同细胞类型的标记情况,以及(D)次生木质部细胞的放大图,展示同一细胞壁不同层次中的标记差异。左图:木质素自发荧光(蓝色)与HAZ荧光(绿色,526 nm)通道合并,中图:木质素自发荧光(蓝色)与GALK荧光(红色,565 nm)通道合并,右图:木质素自发荧光(蓝色)、HAZ(绿色)和GALK(红色)荧光通道合并。HAZ 与GALK共定位显示为黄色。请点击此处查看该图的放大版本。
因此,化学报告分子策略(例如本文介绍的BLISS方法,或Tobimatsu et al.8 之前发表的单标记方法)相较于以往的免疫染色或组织化学染色等方法,能够在实验操作极为简便的前提下实现更为精细的研究。例如,图4 显示,在亚麻次生木质部的纤维管胞/导管(FT)中,HAZ/GALK 的掺入信号强度在形成层附近的最初几层细胞壁中非常高,但在更老的细胞中则逐渐减弱。该分布模式与自发荧光的模式相反,表明在距形成层最近的两到三层FT细胞中,木质化程度能够极快地达到峰值。相比之下,射线(R)细胞似乎在其发育的较晚阶段仍持续进行木质化,因为从形成层到髓心的所有射线细胞壁中,HAZ/GALK 的掺入信号更为恒定。FT和R两类细胞表现出不同的木质化动态并不令人意外,因为这两类细胞具有不同的生物学功能,其发育程序也相应存在差异。事实上,FT是细长的管状结构,成熟后迅速死亡,留下具有厚木质化细胞壁的死细胞,在机械支撑以及水分和矿物质的纵向运输中发挥关键作用;而构成木质部射线的狭行长排R细胞在其成熟且具有功能的状态下仍保持存活,且不具有厚的木质化细胞壁。

图 4:亚麻木质部中细胞特异性单木质素单元报告分子的掺入。 亚麻茎手工横切片部分的明场共聚焦显微图像(A)。粉红色(射线薄壁细胞,R)和黄色(纤维管胞细胞,FT)箭头指示从形成层区域指向髓心的矢量方向,并用于在 405 nm 处扫描木质素自发荧光(B),在 526 nm 处扫描 HAZ 荧光(C),以及在 565 nm 处扫描 GALK 荧光(D)。(E) 次生木质部视图。左侧面板:木质素自发荧光(蓝色)、HAZ(绿色)和 GALK(红色)荧光通道的合并图像。HAZ 与 GALK 的共定位显示为黄色。右侧面板:亚麻茎中次生木质部结构的示意图。V,导管;FT,纤维管胞;R,射线薄壁细胞。本图经 Lion et al.23 修改而来 请点击此处查看此图的放大版本。
此外,在 BLISS 方案中使用分别对应 H 单元和 G 单元的两种不同化学探针,并结合两种生物正交反应,能够获得更定量的结果。诸如 BLISS 的多重标记策略,可为进一步理解不同条件下对单木质醇单元掺入比例的调控机制提供新的视角,并有助于解析尚不明确的木质化过程。尽管木质素中 H、G 和 S 单木质醇的相对百分比确实会因植物的物种、组织、发育时期或环境条件而发生显著变化,但调控这种组分变化的复杂机制仍未被完全阐明。双标记技术为研究调控木质素组分的若干参数提供了一种强有力的手段。例如,通过 BLISS 技术调节 HAZ:GALK 比例,我们得以证明次生木质部组织中木质素的组分直接取决于细胞壁内单木质醇的可利用性,而非依赖于过氧化物酶/漆酶的特异性(图 5)。

图 5:不同 HAZ:GALK 百分比比例处理亚麻茎切片的影响。 各图列上方标示了 HAZ:GALK% 的比例。顶部:HAZ 与 GALK 通道的合并图像。底部:不同百分比比例下 HAZ 和 GALK 平均荧光强度的直方图。数值以灰度级表示,为平均荧光强度的均值 ± 标准差(SD)。比例尺 = 100 µm。 本图改编自 Lion et al.23 请点击此处查看此图的放大版本。
亚麻因其韧皮纤维(BF)而被种植,这些纤维可用于制造纺织品、高档纸张或环境友好型复合材料。其工业价值的一个重要方面在于,其细胞壁中木质素含量极低,并具有异常增厚的S2/G次生层19,24。BLISS技术能够揭示同一细胞壁不同层次之间木质化动态的差异。图6A显示,HAZ 和 GALK 报告分子仅掺入部分而非全部韧皮纤维的细胞角隅以及中胶层/初生细胞壁中。即使外源提供单木质醇化学报告分子,厚壁韧皮纤维的次生细胞壁层也完全不发生木质化,这表明其低木质化状态源于缺乏适合单木质醇通过酶促氧化并掺入生长中聚合物链的分子环境,而不仅仅如先前报道所述是由于单木质醇生物合成基因的转录调控所致25。这一观察结果也与以下事实高度一致:在具有木质化韧皮纤维的亚麻化学突变体 lbf1 中,亚麻过氧化物酶基因在外层茎组织中呈上调表达26。

图6:BLISS技术突出显示细胞壁亚结构或特定层之间的差异。(A)左图:亚麻茎切片的明场图像。圆圈指示一个纤维束。右图:韧皮纤维的放大图。合并的HAZ与GALK通道图像(含或不含明场)显示,木质化仅限于细胞角(
)以及部分韧皮纤维的中层/初生细胞壁。BF,韧皮纤维;Par,薄壁细胞;M,中层;P,初生细胞壁;S1,次生细胞壁第一层;S2/G,次生细胞壁的次生层/胶质层。(B)亚麻根内皮层区域共聚焦z轴扫描的二维切片与三维重建图。凯氏带(
)仅显示自发荧光,不掺入HAZ或GALK信号。相应的荧光图谱显示GALK/HAZ呈负相关:高绿色荧光对应低红色信号(皮层),反之亦然(内皮层)。Pericycle(P),内皮层(E),皮层(C)。请点击此处查看该图的放大版本。
最后,这种双色标记方法还可为不同发育阶段及非茎部植物器官中细胞壁亚结构的“木质化状态”提供有价值的信息。例如,亚麻根的内皮层在发育早期,其径向和横向细胞壁中存在凯氏带。这种由木栓质和/或木质素构成的疏水性生物聚合物带可阻止根部吸收的水分和溶质通过质外体途径被动进入,迫使它们必须穿过质膜,经由共质体途径运输,从而增强植物根系对物质的选择性吸收能力。当该方法应用于亚麻根时,我们的研究策略显示,HAZ 和 GALK 被整合至内皮层细胞的切向壁以及凯氏带不存在的径向壁部分(图6B)。然而,凯氏带本身完全缺乏单木质醇探针的掺入,表明在此发育阶段该结构已成熟,而其他细胞壁仍处于持续的生物聚合物沉积过程中。z轴堆叠图像的三维重建清晰地揭示了凯氏带的结构。有趣的是,一些紧邻内皮层的皮层细胞壁也被证实能够优先掺入 HAZ(表明亚麻根皮层中存在木质素/木栓质),但不能掺入 GALK。共定位分析显示 HAZ 与 GALK 之间存在负相关性,提示这两种相邻细胞类型可能具有细胞特异性的细胞壁结构或酶系统。
补充表 1:固体 ½ MS 培养基的制备 请点击此处下载该文件。
补充表 2:化学探针储备液的配制 请点击此处下载该文件。
如前所述,本文介绍的双重标记BLISS方案是SPAAC/CuAAC组合应用的首批实例之一 体内12,23每一步均经过充分优化和验证,必须严格遵守两种点击化学标记反应的依次操作顺序(即先进行SPAAC反应,再进行CuAAC反应)。所有交叉对照结果表明,在应用BLISS方案时,每个标记步骤均具有特异性。23 :先进行SPAAC步骤可实现高度化学选择性的标记 HAZ 叠氮基团通过与环辛炔功能化的荧光染料发生具有快速动力学的[3+2]环加成反应而发挥作用。一旦 HAZ 单位被标记后,需要通过铜(I)催化的活化进行CuAAC步骤 GALK 末端炔烃可通过与叠氮-Fluor 545 探针反应生成三唑键。相比之下,不应采用相反的顺序(即先进行铜催化的叠氮-炔环加成反应,再进行应变促进的叠氮-炔环加成反应),因为这会导致 GALK 和 HAZ 单元交叉偶联会与荧光团连接反应竞争,并导致信号显著降低。还需强调中间洗涤步骤的必要性,以避免非特异性染色。
我们已证明,该方法可应用于多种生物学实验设计。BLISS标记方案最初应用于亚麻茎的徒手切片(厚度约为150–250 µm),这些切片在切割后已预先与可点击的单木质醇单体孵育。尽管这种设计具有减少化学探针用量(因孵育体积较小)并便于进行统计重复实验的优点,但严格来说,它并非一种体内系统,在某些情况下可能无法完全反映真实的时空木质化动态过程。在第二种实验设计中,我们因此将BLISS方案改进,采用了一种先前用于研究放射性标记单木质醇在松树和银杏中掺入情况的方法27。该方法将植物的根系与茎干进行物理分离,将整段茎的基部浸入单木质醇溶液中,可称之为“花瓶法”。在茎段完成所需(孵育)时间后,切取横截面并执行BLISS方案。该实验使我们得以证明:(i)修饰后的单木质醇能够通过活体茎干运输,并掺入细胞壁中正在形成的木质素聚合物内;(ii)其定位模式与横截面方法基本一致。此类实验的优势在于可在真正的活体植物/活细胞体系中进行,支持更长时间的实验和更深入的研究,但需要消耗更多的化学探针。最后,BLISS方案还被应用于亚麻幼苗,这是一种真正的活体植物模型,其中化学探针需经由根部吸收后向上运输至茎部。尽管该模型明显具有在活体植物中进行实验的优势,但在实际操作中,它仅适用于幼嫩的幼苗,且由于实际原因(孵育时间长、所需化学探针用量大),并不适合研究较老植株的木质化动态过程。尽管如此,这三种实验设计互为补充,各自在实际操作性和生物学意义方面均具有优缺点,具体选择应根据所要回答的生物学问题而定。
本方案最初为研究亚麻的木质化动态而开发,具有高度的可适应性,不仅在生物学实验设计方面,而且在应用于其他植物物种及器官/组织方面均表现出良好的通用性。例如,BLISS 方法可轻松拓展至更适合利用基因敲除或基因沉默突变体进行研究的拟南芥(Arabidopsis)或杨属(Populus)植物。原则上,通过使用两种不同的植物细胞壁聚合物修饰前体,该方法还可进一步扩展至其他生物分子的双标记研究——包括全部三种主要的单木质醇及其代谢前体,以及构成多糖基质的各种单糖。自诞生以来,生物正交化学主要被用于通过代谢寡糖工程(MOE)来研究聚糖/多糖4,5,17,28,但令人意外的是,迄今为止其在植物生物学中的应用仍极为有限7,8,9,10,11,12。从反应兼容性的角度来看,木质素的研究确实是一个较为复杂的问题,因为两种化学探针均被整合进同一种交联聚合物中。未标记的HAZ-GALK交联结构的形成是需要克服的主要难题,这是由于在木质素的三维结构中,GALK和HAZ单元在空间上彼此靠近23;而如果两种化学探针未被整合到同一类型的生物聚合物中,或未位于细胞特定区域的相同空间位置,则该限制可能不存在。
从更广泛的角度来看,BLISS方法原则上可应用于任何基于细菌或动物模型的双色荧光成像研究,只要该研究使用两种不同的化学报告分子,分别带有叠氮和末端炔基标记。
作者声明不存在任何竞争性经济利益。
我们感谢FRABio研究联合会和TisBio成像平台(里尔大学,CNRS,FR 3688,FRABio,生物大分子组装的结构与功能生物化学)为完成本工作提供了有利的技术环境。
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