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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里, 我们提出了一个详细的协议, 以区分人类多能干细胞 (Hpsc) 到胰十二指肠蛋白 1+ (pdx1+) 细胞的产生的非群体类型单层生长的基础上, 胰腺谱系离解的单细胞。该方法适用于同源 hPSC-derived 衍生细胞的产生、遗传操作和筛选。
人多能干细胞 (hPSC) 衍生胰腺细胞是再生医学中一种很有前途的细胞来源, 也是研究人类发育过程的平台。分步定向分化, 重述发育过程是产生胰腺细胞的主要方法之一, 包括胰十二指肠蛋白同源蛋白 1+ (pdx1+) 胰腺祖细胞。传统的协议在通过后不久就开始与小菌落进行分化。然而, 在菌落或聚集的状态下, 细胞容易发生异质性, 这可能会阻碍对 PDX1+细胞的分化。在这里, 我们提出了一个详细的协议, 以区分 Hpsc 到 PDX1+细胞。该方案由四个步骤组成, 通过播种离解的单细胞启动分化。在诱导 SOX17+确定内皮细胞后, 将两个原始肠道管标记 HNF1Β和 hnf4α表达, 并最终分化为 pdx1+细胞。本协议提供了简单的处理, 并可能提高和稳定一些 hPSC 线的分化效率, 以前发现, 这些线路不有效地分化为内皮谱系或 PDX1+细胞。
胰腺主要由外分泌细胞和内分泌细胞组成, 其功能障碍或超载导致胰腺炎、糖尿病和胰腺癌等多种疾病。为了阐明胰腺病的病因, 有必要对胰腺细胞的发育过程和功能进行分析。此外, 建立细胞组织补充治疗需要稳定的细胞供应和强大的质量。人类多能干细胞 (hpsc) 衍生的胰腺细胞是一个很有前途的细胞来源, 这是一个很有前途的细胞源, 和分化协议的胰腺细胞已深入研究1,2, 3, 4. 我的工作是什么?胰腺β细胞体外生成的新进展模仿了成人人β细胞的生成, 这些细胞在糖尿病模型小鼠2,3植入时显示出治疗效果。此外, 对健康和1型糖尿病患者捐献者诱导多能干细胞 (Ipsc) 产生的β细胞的分析显示, 包括在压力下 5, 没有功能差异.此外, 在与 6,7 患者相同的地点, 患者衍生的 ipsc 或 hpsc 存在基因突变, 导致胰腺细胞的疾病表型部分被复制。
为了从 Hpsc 中产生胰腺细胞, 采用了分步定向分化, 重述了发育过程。胰腺来源于早期胚胎的内皮层, 表达了性别决定性区域 y-盒 17 (SOX17) 和叉头盒 A2 (FOXA2)8。在小鼠研究的基础上, 内皮层形成原始的肠道管, 其特征是肝细胞核因子 1-beta (Hnf1β) 和肝细胞核因子 4-alpha (hnf4α) 的表达。原始的肠道管伸长并发展成呼吸系统、消化道和器官。伸长后, 后前部区成为推定胰腺区, 其特征是转录因子胰腺/十二指肠蛋白 1 (pdx1)8,9,10的表达。pdx1+肠道管的背侧和腹侧部分变厚形成胰芽, 其特征是胰腺转录因子1亚基α (ptf1a) 和 nk6 同源 box 1 (nkx6.1)8,11的共表达。这一表达标志着胰腺器官发生的形态开始。胰腺内真皮细胞是胰芽的组成部分, 形成一个分支管状的上皮结构网络 12,并最终分化为外分泌和内分泌细胞, 包括胰岛素分泌β细胞和葡萄糖分泌的α细胞。pdx1 的表达首先在推定胰腺区检测, 然后在整个胰腺发育过程中观察到, 并显示出β-和细胞9、13、14 的定位。虽然 Pdx1 + 细胞区不表达 Ptf1a或Nkx6.1 分化为胃狭窄, 十二指肠, 肝外胆管和一些肠道细胞在发育的中后期阶段在小鼠 9, pdx1+ 细胞在人类早期发育阶段被认为是胰腺的祖细胞。
在这里, 我们提出了一个详细的协议, 以区分 Hpsc 到 PDX1+细胞的胰腺谱系的生成。该方案通过播种离解的单细胞15、16、17来引发分化。一般情况下, 未分化的 Hpsc 在悬浮液或粘附中保持为菌落或细胞集体。因此, 大多数协议在传代后不久就开始分化。然而, 在菌落或聚集体的状态下, 细胞容易出现空间和转录异质性18、19、20、21、22, 这可能会阻碍向最终内皮的第一步分化, 然后是低效率的分化到 PDX1+细胞。本协议可以提供易于操作, 以提高和稳定一些 hPSC 线的分化效率, 这些线路以前被发现对内皮谱系和 PDX1+细胞23的分化效率很低,24,25岁
京都大学医学系和医学研究生院伦理委员会批准了使用 Hpsc 的实验。
1. 材料的制备
请注意:准备所有培养基和试剂, 以便在无菌环境中进行细胞培养。使用前将基础培养基加热至室温 (RT)。在 RT 使用培养基, 在6小时内使用. 试剂的详情列于物料表。
2. hPSC 分化为后后后细胞胰腺祖细胞 (PDX1+细胞)
请注意:使用无菌技术执行所有程序。根据制造商的说明17、26, hpsc 在6孔板上进行维护, 该板材由带有 hpsc 维护介质的合成表面材料包覆。当细胞达到50-80 融合 (第0阶段) 时, 使用它们进行分化。
3. 流式细胞仪 (FCM)
4. 免疫染色
传播的 hpsc (585a129,30) 被浓缩并形成一个适合分化的均匀单层 (图 1b)。未分化的 Hpsc (第0阶段) 在低细胞密度 (1-1. 1.5 x10 5 细胞 2) 时分离并重新播种为单细胞.在1小时内, 细胞连接到板上, 开始显示突起。在第一天, 细胞增殖, 分布良好, 覆盖80% 至90% 的表面积。在第一阶段 b, 由于死细胞, 介质出现多云。去除死细胞对于高效分化至关重要, 因为死细胞可能会干扰下面细胞的存活和分化。在 3-4天, 细胞形成一个均匀的单层片, 可以被描述为鹅卵石外观。此时, 大多数细胞停止表达确定性别的区域 y-盒 2 (SOX2), 这是未分化细胞的标记, 而是以90% 以上的速度表达明确的内皮标记 SOX17 (图 2a 和 b)。大多数 SOX17+细胞表示 Foxa2 (图 2a)。以不适当的细胞密度开始分化会影响此步骤的分化效率 (图 3)。在第2阶段和第3阶段, 细胞死亡放松, 使用的培养基不像第1 b 阶段那样多云。细胞以90% 以上的速度表达原始肠道管标记 HNF1Β和 hnf4α (图 2c), 并最终表达后前胰腺祖细胞标记 PDX1 (图 2D 和 e)。PDX1+细胞诱导可在另一条 hiPSC 线 (1231a3 31)和 hesc 线 Khes-3 32 ( 图 4) 中重现。级标记物 mRNA 表达的 qRT-PCR 结果与免疫染色结果一致 (图 5a)。PDX1 的 mRNA 表达在第3阶段表现得很明显, 并显著增加了后记。
PDX1+细胞在早期发育阶段不仅有可能分化为胰腺细胞, 还有可能分化为胃内、十二指肠、肝外胆管和部分肠道 9. 体外生成的 pdx1+细胞对胰腺细胞的分化潜力可以通过延长培养评估, 并报告胰腺内皮和胰腺内分泌细胞的协议 3,16, 26. 第19天 (第4阶段) 和第31天 (第5阶段) 分别观察到胰腺内皮标志物 Nkx6.1 和两个胰腺内分泌标记 Insulin 和glucacon的表达 (图 5).

图 1: 细胞在逐步分化下的代表性外观.(a) 一种从 Hpsc 到胰腺谱系的定向分化方案。括号中的数字表示浓度 (单位写在下面)。(b) 在分化培养的关键步骤中, 具有代表性的高职等私营保安公司明亮场显微镜。585A1 Hpsc 作为单细胞离解并诱导分化为最终的内皮、原始的肠道管和后前肢胰腺祖细胞。下面的面板是上面板的放大视图。RPMI, RPMI 1640;AA, 活性 a (Ng/ml);CH, 口径 99021 (μM);KGF (Ng/ml);NOG, NOGGIN (Ng/ml);CYC, 3-酮-n-氨基乙基-n '-氨基己基二氢肉桂酰环胺 (μM);TTNPB, 4-[(E)-2-(5, 6, 7, 8-四氢-5, 5, 8, 8-四甲基-2-萘基)-1-苯甲酸 (nM)。刻度柱 = 300μm。请点击这里查看此图的较大版本.

图 2: 来自 Hpsc 的胰腺谱系的代表性诱导.(a) 分化前 (第0阶段) 和第4天 (第1 b阶段) 经流式细胞仪分析的 sox2-sox17 + 细胞的比例.未分化的高 Psc (SOX2+sox17-) 被分化为最终内皮 (sox2-sox17+).大多数 SOX17+细胞共同表达 FOXA2。(b) 第4天 (第1 b 阶段) 有代表性的免疫荧光显微镜。固定细胞被染色为 SOX17 (绿色)、SOX2 (红色) 和细胞核 (蓝色)。(c) 第4天 (第1 b 阶段) 和第8天 (第2阶段) 具有代表性的免疫荧光显微镜。固定细胞被染色 HNF1 β (绿色), hnf4α (红色) 和细胞核 (蓝色)。(d) 第4天 (第1 b 阶段) 和第11天 (第3阶段) 用流式细胞术分析 PDX1 阳性细胞的比例。(e) 第11天 (第3阶段) PDX1 (绿色) 和原子核 (蓝色) 的代表性免疫荧光显微镜图。刻度柱 = 100μm。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 3: 从不同细胞密度开始的对最终内皮的代表性诱导.(a) 分化1小时后细胞的代表性明亮场显微图像。高 Psc 作为单个细胞离解, 并诱导在不同的细胞密度 (1-50x 10 4/cm 2)下分化为最终的内皮。下面的面板是上面板的放大视图。(b) 分化前 (第0阶段) 和第4天 (第1 b阶段) 经流式细胞仪分析的 sox2-sox17 + 细胞的比例.(c) 流式细胞术分析 PDX1+细胞在第8天 (第2阶段) 和第11天 (第3阶段) 的比例。刻度柱 = 300μm。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 4: 对 HESCs 和 hESCs 中 PDX1+细胞的代表性诱导.将 hiPSC 线、1231A3 (a) 和 hESC 线 Khes-3 (b) 分化为最终内皮细胞和 pdx1+细胞。流式细胞仪对细胞组成进行了分析。在分化前 (第0阶段) 和第4天 (第1 b 阶段) 分析了 SOX2-SOX17 + 细胞的比例.在第8天 (第2阶段) 和第11天 (第3阶段) 分析了 PDX1+细胞的比例。 请点击这里查看此图的较大版本.

图 5: 对胰腺内皮细胞和内分泌细胞的代表性诱导.Hpsc (585A1) 被分化为 PDX1+细胞。这些细胞进一步分化为胰腺内皮和胰腺内分泌细胞, 报告的寿命为 3、16、26.(a) 用定量实时聚合酶链反应 (qrt-pcr) 测定了阶段标记物的 mrna 表达。将这些数据归一化为Gapdh的表达, 并将其呈现为基因表达相对于峰值的折叠变化。请注意, Pdx1表达式从第8天 (第2阶段) 增加到11天 (第3阶段), 增加了 gt;20 倍, 从第11天 (第3阶段) 增加到19天 (第4阶段), 增加了 gt;100 倍。成人胰腺中的表达显示为 Panc。sox2, 黑色;Sox17, 紫色;hnf1β, 棕色;hnf4α, 橙色;pdx1, 浅绿色;Nkx6.1, 绿色;胰岛素, 蓝色;格隆, 红的(b) 第11天 (第3阶段) 和第19天 (第4阶段) 胰腺内皮标记 NKX6.1 (红色) 的典型免疫荧光显微镜图。PDX1 (绿色) 和原子核 (蓝色) 进行了共染。(c) 两个胰腺内分泌剂胰岛素 (ins, 绿色) 和胰高血糖素 (gcg, 红色) 的代表性免疫荧光显微镜图, 第19天 (第4阶段) 和第31天 (第5阶段)。核 (蓝色) 被共染色。 请点击这里查看此图的较大版本.
| 基因名称 | 基因符号 | 正向底漆 | 反向底漆 |
| 甘油-3-磷 脱氢酶 |
GAPDH | GAGGAGGGGAGTC | GAGAGGGATGGATTTC |
| sry 盒2 | SOX2 | AGCCCCACGAGAAAAA | TTTCACTTTGCACTCC |
| SRY-box 17 | SOX17 | CGACAGGAATGACAGTA | TAGCTCCCGAGGTGG |
| HNF1 同源 b | HNF1 β | CCTCCCCCACACACAGCTG | TTGTGCAGGGATTAGTT |
| 肝细胞核因子4α | HNF4Α | GAGCGCAGCCAGGACGACGAA | TACGGGGGGTGTGGATGTA |
| 胰腺和十二指肠同源1 | PDX1 | AGCAGGAGGCCTGT | CACCCTCCTTCGGAAC |
| NK6 同源1 | NKX6。1 | ATTCTGGGGATGACAGAG | TGGATCAGGCTTG |
| 胰 高 血糖 素 | GCG | GATTGATTTGTGTGTGT | CGCACATTTCACAAT |
| 胰岛素 | INS | CTACTAGGGGGAAC | GGGGGAGGGAGGAGGAGGAGGG |
表 1: qPCR 引物。
作者没有什么可透露的。
在这里, 我们提出了一个详细的协议, 以区分人类多能干细胞 (Hpsc) 到胰十二指肠蛋白 1+ (pdx1+) 细胞的产生的非群体类型单层生长的基础上, 胰腺谱系离解的单细胞。该方法适用于同源 hPSC-derived 衍生细胞的产生、遗传操作和筛选。
这项工作得到了日本科学促进会 (JSPS) 通过科学研究 (C) (JPS KAKENHI Grant Number15K09385 和 18K08510) 至 t. t. 和 Jps 研究研究员补助金 (JPS KAKENGRANT 编号) 的资助。17J07622) 至 a. k. 和日本医学研究与发展机构 (AMED), 通过向 k. o 提供 "研究所细胞研究核心中心、再生医学实现研究中心网络" 的研究赠款。作者感谢彼得·卡拉吉安尼斯博士阅读了手稿。
| 3-酮-N-氨基乙基-N′-氨基己酰二氢肉桂酰环帕胺 | 多伦多研究化学品 | K171000 | CYC |
| 4-[(E)-2-(5,6,7,8-四氢-5,5,8,8-四甲基-2-萘基)-1-丙烯基]-苯甲酸 | 圣克鲁斯生物技术 | SC-203303 | TTNPB |
| 50 mL 锥形无菌聚丙烯离心管 | Thermo Fisher Scientific | 339652 | |
| 抗 CDX2 抗体 [EPR2764Y] | Abcam | Ab76541 | 抗 CDX2 × 1/1000 稀释 |
| B-27 补充剂(50 ×) | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | 无血清补充剂 |
| BD FACSAria II 细胞分选仪 | BD Biosciences | 用于流式细胞术 | |
| 生物医学冷冻机 | SANYO | MDF-U538 | 用于 -30 °C 储存 |
| 用于 TC10/TC20 细胞计数仪的细胞计数玻片,双腔 | BIO-RAD | 1450011 | 计数玻片 |
| 细胞培养多孔板,6 孔,PS,透明 | Greiner BIO-ONE | 657165 | 用于分化培养/6 孔板 |
| 离心 | 机TOMY | AX-310 | 用于细胞培养 |
| TOMY | MX-305 | 用于 RT-qPCR | |
| CHIR99021 | Axon Medchem | Axon 1386 | |
| CLEAN BENCH | SHOWA KAGAKU | S-1601PRV | 超净工作台 |
| 康宁 CellBIND 6孔板 | 康宁 | 3335 | 用于hPSCs/6孔板的无饲养层培养 |
| 康宁基质胶基底膜基质生长因子降低 | 康宁 | 354230 | 基底膜基质 |
| 康宁Synthemax II-SC底物 | 康宁 | 3535 | 用于hPSCs/hPSC合成表面材料的无饲养层培养 |
| 低温恒温器 | Leica | Leica CM1510 S | 用于聚集体的免疫染色。 |
| Cytofix/Cytoperm 试剂盒 | Becton Dickinson | 554714 | Perm/Wash 缓冲液是 透化/洗涤缓冲液。Cytofix/Cytoperm 缓冲液是固定和透化缓冲液。 |
| Dako 笔 | Dako | S2002 | 用于聚集体的免疫染色 |
| dNTP 混合物 (10 mM) | Thermo Fisher Scientific | 18427-088 | 用于 RT-qPCR |
| 驴抗山羊 IgG (H+L) 交叉吸附二抗,Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11055 | 二抗,& 1/500 稀释 |
| 驴抗小鼠 IgG (H+L) 高度交叉吸附二抗,AlexaFluor 546 | Thermo Fisher Scientific | A10036 | 二抗,& 1/500 稀释 |
| 驴抗兔 IgG (H+L) 高度交叉吸附二抗,Alexa Fluor 546 | Thermo Fisher Scientific | A10040 | 二抗,& 1/500 稀释 |
| 驴血清 | Merck Millipore | S30 | 驴血清 |
| D-PBS(-),不含 Ca 或 Mg | Nacalai tesque | 14249-95 | DPBS |
| Essential 8 培养基 | Thermo Fisher Scientific | A1517001 | 用于 hPSC/hPSC 维持培养基的无饲养层培养 |
| Falcon 5 mL 圆底聚苯乙烯试管,带细胞过滤器卡口盖 | 康宁 | 352235 | 5 mL 圆底聚苯乙烯管,带细胞过滤器 |
| 滤芯吸头,1,000 个和微量;L | Watoson | 124-1000S | 与移液器配合使用 |
| 滤芯吸头,20 &L | Watoson | 124-P20S | 与移液器配合使用 |
| 滤芯吸头, 200 &L | Watoson | 124-P200S | 与移液器一起使用 |
| 荧光显微镜 | Keyence | BZ-X700 | 用于免疫染色 |
| Forma Steri-Cycle CO2 培养箱 | Thermo Fisher Scientific | 370A | 培养箱 |
| HNF-1β抗体 (C-20) | Santa Cruz Biotechnology | sc-7411 | 抗 HNF1β,&次; 1/200 稀释 |
| HNF-4α抗体 (H-171) | Santa Cruz Biotechnology | sc-8987 | 抗 HNF4α,& 次; 1/200 稀释 |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3570 | 用于细胞核染色,& 1/200 稀释 |
| 人胰腺总 RNA | Ambion | AM7954 | 用于 RT-qPCR |
| 人 PDX-1/IPF1 抗体 | R&D Systems | AF2419 | 抗 PDX1、山羊 IgG 和 1/200 稀释人 |
| SOX17 抗体 | R&D Systems | AF1924 | 抗 SOX17 和次; 1/200 稀释 |
| 改进的 MEM 锌选项 培养基 | Thermo Fisher Scientific | 10373-017 | iMEM |
| 孵育室 | Cosmo Bio | 10DO | 用于聚集体的免疫染色 |
| 乳胶检查手套 | Adachi | ||
| MAS 涂层载玻片 | Matsunami Glass | 83-1881 | 用于聚集体免疫染色 |
| MicroAmp Fast 96 孔反应板 | Applied Biosystems/Thermo Fisher Scientific | 4346907 | 用于 RT-qPCR |
| 显微镜 | Olympus | CKX41N-31PHP | 用于细胞培养 |
| Microtube | Watoson | 131-515CS | |
| 单克隆抗 α;-胎蛋白 | SIGMA | A8452 | 抗 AFP,& 1/200 稀释倍 |
| Nanodrop 8000 | Thermo Fisher Scientific | 用于 RT-qPCR | |
| 寡核苷酸 dT | FASMAC | 定制寡核苷酸 | 对于 RT-qPCR 的序列为"TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT" |
| 多聚甲醛,粉末 | Nacalai tesque | 26126-54 | PFA,固定剂,在 DPBS |
| 中稀释 制药冰箱 | SANYO | MPR-514 | 用于 4 °C 存放 |
| PIPETMAN P | GILSON | 移液器 | |
| 人 KGF/FGF-7 | R&D Systems | 251-KG | KGF |
| 重组人 Noggin | PeproTech | 120-10C | NOGGIN |
| 重组人/小鼠/大鼠激活素 A | R&D Systems | 338-AC | 激活素 A |
| ReverTra Ace (100 U/μL) | TOYOBO | TRT-101 | 用于 RT-qPCR |
| 不含 RNase 的 DNase 套装 (50) | QIAGEN | 79254 | 用于 RT-qPCR |
| RNeasy 迷你试剂盒 | QIAGEN | 74104 | 用于 RT-qPCR |
| RPMI 1640 含 L-Gln | Nacalai tesque | 30264-85 | RPMI 1640 |
| 用于实时密封膜 | Takara | NJ500 | 用于 RT-qPCR |
| 血清移液管 10 mL | Costar/Corning | 4488 | 用于细胞培养 |
| 移液管 25 mL | Costar/Corning | 4489 | 用于细胞培养 |
| 移液管 5 mL | Costar/Corning | 4487 | 用于细胞培养 |
| Sox2 (D6D9) XP 兔单克隆抗体 | 细胞信号转导 | 3579S | 抗 SOX2 和倍 |
| StepOnePlus | Applied Biosystems/Thermo Fisher科学 | 用于 RT-qPCR | |
| 蔗糖 | Nacalai tesque | 30406-25 | 用于聚集体的免疫染色 |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820B | 用于 RT-qPCR |
| TC20 自动细胞计数仪 | BIO-RAD | 1450101J1 | 自动细胞计数仪 |
| Tissue-Tek OCT 化合物 4583 | Sakura Finetechnical | 4583 | 用于聚集体的免疫染色 |
| Tissue-Tek Cryomold 模具/适配器 | Sakura Finetechnical | 4566 | 用于聚集体的免疫染色 |
| Triton X-100 | Nacalai tesque | 35501-15 | |
| 台盼蓝 | BIO-RAD | 1450021 | |
| 超低温冰箱 | SANYO | MDF-U33V | 用于 -80 °C 储存 |
| UltraPure 0.5M EDTA,pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific | 15575-038 | 用 DPBS 稀释以制备 0.5 mM EDTA |
| Veriti 热循环仪 | Applied Biosystems/Thermo Fisher Scientific | 用于 RT-qPCR | |
| Y-27632 | Wako | 251-00514 |