本文介绍了一种在微型生物反应器系统中同时进行48个平行细胞培养并在不同条件下操作的详细方案。描述了细胞培养过程、收获以及后续的抗体滴度分析。
方法文章
本文介绍了一种在微型生物反应器系统中同时进行48个平行细胞培养并在不同条件下操作的详细方案。描述了细胞培养过程、收获以及后续的抗体滴度分析。
自动化微型生物反应器(15 mL)可作为细胞培养工程师的有力工具。它们能够在最小化潜在工艺变异的同时,实现多种实验条件的并行操作。该方法的应用包括:克隆筛选、温度和pH值变化、 培养基和添加剂优化。此外,较小的反应器体积有利于开展大规模实验设计(Design of Experiments),以考察广泛的不同条件。这使得上游工艺可在放大前得到显著优化,而在放大阶段,由于时间和经济成本的限制,实验的范围通常更为有限。与传统的低规模细胞培养装置(如摇瓶或旋转瓶)相比,自动化微型生物反应器系统具有多种优势。然而,在中试规模的工艺开发过程中 必须格外谨慎,以确保这些优势得以实现。若操作得当,该系统可实现高度自动化,能够编程运行包含更多变量的实验设计(DOE) ,并在与营养分析仪或细胞计数器联用时减少取样时间。将本文所提出的专家经验性指导原则与当前的自动化微型生物反应器实验相结合,可最大限度地避免影响结果有效性的常见问题。在极端情况下,若未能遵循本文所述原则,可能导致设备损坏,进而需要昂贵的维修。此外,微型生物反应器系统的培养体积较小 ,使得细胞培养条件的表征变得困难。在分批培养模式中,过程中的取样次数和取样量受到限制,因为操作体积不能低于10 mL。本文将讨论微型生物反应器系统的优点与局限性。
单克隆抗体(mAbs)最早于1975年在小鼠杂交瘤细胞中制备而成1自那时以来,为了人源化单克隆抗体以增强其性能,重组蛋白生产的研发已显著增加 体内 安全性和有效性2,3,4大多数重组蛋白生产过程采用中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,因其易于适应无血清培养基,并能够产生在翻译后修饰方面与天然人源蛋白相似的蛋白质。 及其作为宿主细胞的可靠性5,6.
人们对更快地为更大患者群体提供高质量产品的需求日益增长。除了经济效益外,单克隆抗体(mAbs)可治疗的疾病谱也在不断扩大,目前已包括自身免疫性疾病、移植后并发症、关节炎以及癌症7。 现代商业化单克隆抗体生产系统的平均产量通常在5–6 g/L范围内,并且仍在持续提高5。这一进展部分得益于CHO细胞的工程化改造以及利用高通量生物反应器改进生产流程筛选8。然而,蛋白质产量的大多数提升主要归因于工艺改进,包括培养基优化、细胞培养条件改善以及强化补料策略的进步7,9,10。营养补充不仅对细胞正常生长至关重要,也对高效生产高质量蛋白具有关键作用。此外,细胞需要按化学计量比例添加特定营养物质,这就要求对补料策略的优化有更深入的理解6,11。传统的优化方法包括单一培养基组分滴定以及采用混料设计进行培养基混合。然而,这些方法耗时较长、劳动强度大,并且存在人为误差带来的风险12,13。
以往的培养基优化研究主要依赖摇瓶和1-2 L的生物反应器 ,但这些方法在原材料和人力成本方面可能过于昂贵。微孔板也曾被用于此类研究 ,但这些方法的可放大性有限。此外,这些方法仍可能需要进行多次耗时的实验,从而引入批间差异 ,掩盖了由培养基成分和补料策略引起的CQA(关键质量属性)变异14,15,16。因此,对高通量且高度一致的平行生物反应器系统的需求应运而生17,18,19,20。
由于传统台式生物反应器(0.5–5 L)运行成本高昂,微型生物反应器为评估生物来源药物的生产提供了一种降低成本的替代方案。21 台式搅拌罐生物反应器性能可靠,并可通过传感器阵列提供高密度数据。反馈控制系统便于操作过程的监控。然而,其组装、校准、清洗、人工成本、底物成本以及灭菌要求均使其运行费用昂贵且劳动密集。摇瓶和微孔板虽可部分缓解大规模生物反应器带来的成本和人工问题,但这些替代方案对工艺条件的控制能力较弱,且产生的数据密度低,通常仅能提供终点测量结果。22
此外,微生物反应器利用较小的工作体积,为细胞系和上游工艺开发提供了一种缩小规模的研究方法。由于微生物反应器实验规模较小,可显著降低能源、底物、人力、空间和公用设施的消耗,从而大幅减少运行成本。23 微生物反应器与摇瓶类似,因其体积小而易于操作,但同时通过在线反馈控制pH、温度、溶解氧以及酸/碱消耗量 ,并实时输出包括尾气成分在内的质量参数数据,保留了传统台式生物反应器的优势。微生物反应器的规模支持高通量筛选,有助于克隆筛选和工艺开发。24
高级微尺度生物反应器已被证明是CHO细胞培养工艺表征与开发的有效工具18. 此处介绍一种自动化的ambr15系统,该系统并行配备48个微型生物反应器, 在放大研究中已显示出与传统的搅拌罐反应器相当的性能,25 采用与先前研究类似的方法,优化了用于表达模型嵌合IgG1的CHO-DG44细胞系的培养基成分6比较并分析了不同培养基条件对生长和滴度的影响。本文提供了一套运行微型生物反应器系统及对粗制培养基样品进行分析的通用指南。
1. 种子扩增培养
注意:本实验方案使用储存密度约为 3 × 107 个细胞/mL 的1 mL重组DG44 CHO细胞冻存液。不同CHO细胞系的稀释比例和培养时间可能有所不同。在实验前应预先测定所用细胞系的生长曲线,并据此进行相应调整。细胞最初复苏至摇瓶中,随后转移至旋转培养瓶中。根据将要运行的微型生物反应器数量及目标接种密度,确定所需摇瓶和旋转培养瓶的数量。
2. 运行自动化微型生物反应器系统
先决条件:用户必须接受过制造商提供的适当培训,并且必须熟悉该系统的安全和操作条件。
3. 细胞培养收获
4. 测定IgG滴度
注意:这是使用 proteinA 生物传感器系统运行和分析样本的简要概述。所有检测参数(例如温度、读数时间、转速(rpm)、等)必须针对每种样本类型通过实验确定。
在整个细胞培养过程的操作期间监测关键工艺参数及其他细胞培养参数是生物工艺中的一个重要方面。采用细胞计数仪和营养分析仪对表征细胞生长、营养物质消耗和副产物生成的五项指标进行定量分析。所有培养条件下的细胞计数均每日获取。平均活细胞密度及其活力,以及相应的±1标准差(SD)区间,如图3所示。营养物质和副产物的变化趋势也展示了在培养的稳定期期间的±1 SD区间。该趋势曲线的斜率代表了葡萄糖和谷氨酰胺的平均消耗速率以及乳酸的生成速率。总体而言,这些结果表明,在微型生物反应器系统中对这些指标进行监测是可行的;同时也证明了该微型生物反应器系统能够将这些参数维持在较窄的范围内。
收获的细胞培养基经0.22微米PVDF滤膜过滤后,采用蛋白A生物传感器系统对细胞培养物的总生产率进行定量。每个细胞的特异性生产率范围为0.87 pg/cell-d至1.15 pg/cell-d,如图4所示。根据这些结果,可对多种条件进行考察,以选择最佳的培养基成分和补料策略,在实验操作投入最小的情况下最大化蛋白产量。

图1: 微型生物反应器系统的布局,包含4个培养站(CS),每个培养站有12个反应容器。 请点击此处查看此图的放大版本。

图 2: 在ProteinA生物传感器系统上进行带有再生步骤的基本定量实验的示例样品板设置。 第1行(红色“R”)保留用于参考样品(即不含分析物的基质);第2行(蓝绿色)为一系列标准品(浓度单位为 µg/mL);第3和第4行(橙色)分别为低值阳性对照(“PL”)和高值阳性对照(“PH”);第5至第10行(紫色)包含待测样品;第11和第12行(灰色)为程序默认的再生缓冲液(“R”)和中和缓冲液(“N”)位置。 请点击此处查看该图的放大版本。

图3: a) 分批培养过程中平均活细胞密度和细胞活力变化曲线。误差线表示±1个标准差(SD),以体现微型生物反应器系统对细胞生长的精确控制。b) 葡萄糖和谷氨酰胺的平均营养物浓度变化,以及乳酸的平均代谢副产物生成曲线。误差线同样表示±1个标准差(SD),以体现微型生物反应器系统对培养基成分的严格控制。(N=3,所有条件均设三个重复)。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 4: 不同培养基条件下平均比生产率的代表性箱线图。(N=3,所有条件均设三个重复) 请点击此处查看该图的放大版本。
正确且高效地运行自动化微型生物反应器系统,需要及时执行多个自动化步骤。其中最重要的环节之一是软件编程。如果在编写程序时出现任何错误,实验中就可能发生严重问题,导致工艺过程、补料策略、取样策略或最终产品质量出现意外变化,从而影响研究结果的有效性。运行系统的另一个重要方面是正确安装并均匀拧紧夹紧板,以确保溶解氧(DO)控制正常。夹紧板未均匀拧紧最常见的表现是1、6、7和12号反应器(角落反应器)的DO测量值出现异常波动。整体DO不稳定则通常表明夹紧板上的气体进气管路密封垫圈已松动,这种情况可能阻碍系统达到设定的DO目标值。在启动实验时另一个常见的误区是,在接种步骤中让细胞静置时间过长,导致细胞沉降。细胞静置时间越短,就越能减少按时间顺序向各反应器加入的接种细胞数量逐渐降低的风险,这种偏差可能无意中严重影响实验结果。因此,建议采用分阶段接种方式,即 依次对每个培养站进行接种,并在各次接种之间设置暂停步骤,确保细胞在接种板中停留时间不超过15分钟。
在日常使用中,保持无菌至关重要。尽管系统位于生物安全柜内,但由于频繁地将物品移入和移出操作台,无菌状态并不能得到保证。因此,所有进入操作台的物品都必须用70%异丙醇喷洒消毒。其次,必须确保培养过程中产生尽可能少的泡沫;培养基可能堵塞通气管路和排气管路,导致夹板甚至下方核心组件的损坏。在任何微型生物反应器的程序设计中,预防性添加消泡剂的步骤都极为关键。一旦发生"泡沫溢出"情况,遵循制造商提供的清洁规程将有助于避免夹板的永久性损坏。此外,在细胞密度较低或进行批次培养时,使用非鼓泡式反应器可能更为有利,因为其较高的表面积与体积比可在无鼓泡器的情况下实现有效的氧气交换。然而,对于高细胞密度培养或灌流培养,非鼓泡式反应器可能并不适用,因为其顶空体积不足以满足细胞不断增长的氧气消耗需求。
微生物反应器系统具有多种优势,它能够在小规模条件下并行运行多个受控培养,其控制能力优于摇瓶。17 因此,该系统有助于开展筛选研究、实验设计(DoE)、高通量克隆研究以及转染研究。自动化的液体处理还可减少操作人员之间的差异,同时最大限度降低对专业人员而言繁琐且耗时的操作负担。尽管该系统具备诸多优势,但仍存在一些需要考虑的关键缺点。首先,15 mL的培养体积显著限制了过程取样和最终收获物的量,而目前已有多种其他可选的小型生物反应器(最大可达500 mL)上市。该系统的一项最新改进是将自动化的微尺度生物反应器与Nova Biomedical公司的BioProfile FLEX 2分析仪整合,从而通过减少细胞密度和营养物质分析所需的样品体积,缓解了过程取样受限的问题。该系统的优势还包括快速设置以及几乎无需清洗,从而带来操作成本的节约;然而,在长期项目中应考虑一次性使用单元的成本,因为其采购成本可能高于可重复使用的传统系统。
本文讨论的方法主要适用于批次模式的细胞培养,但可根据用户需求进行修改。每个培养站均可独立控制温度,而溶氧(DO)和pH则可在单个反应器容器的水平上进行调节。Sartorius还提供专门设计的实验设计(DoE)规划软件,可用于针对微型生物反应器系统定制实验方案。利用制造商提供的新型DoE软件开展大规模的实验设计研究,有助于培养基和添加剂的优化。尽管本文未使用,该微型生物反应器系统也支持补料分批培养研究。目前该系统尚未针对灌注式细胞培养进行优化。然而,已有少量研究和试验尝试在现有的微型生物反应器系统中模拟灌注式细胞培养操作。26 通过细胞沉降的方式,可对该方法进行修改以模拟高密度灌注培养。通过调节移液管插入反应器的深度并优化沉降时间,可实现培养基的去除与补充,从而模拟灌注模式的培养。在这一快速发展领域中,已有新型产品问世,若需进行灌注模式培养,这些产品可能比本文所述系统表现更优。
综上所述,本研究展示了利用自动化微型生物反应器及相关分析方法进行中国仓鼠卵巢(CHO)细胞培养,以生产并表征一种模型IgG1单克隆抗体。研究强调了小规模微型生物反应器在生物工艺制造中的作用,及其对细胞培养工艺开发和培养基筛选的影响。尽管使用自动化小规模系统具有诸多优势,但要充分实现其效益,必须深入理解工艺过程并进行充分的分析表征。本研究为使用者提供了使用自动化微尺度反应器系统的操作指南,该系统可根据具体研究需求进一步开发和完善。
免责声明:本出版物反映的是作者的观点,不应被解释为代表美国食品药品监督管理局(FDA)的观点或政策。
作者谨此感谢 Scott Lute 提供的分析支持。本研究的部分内部资金和支持由 CDER 关键路径计划(合同编号:CA #1-13)提供。本项目部分得益于美国食品药品监督管理局生物技术产品办公室实习/研究参与计划的资助,该计划由橡树岭科学与教育研究所通过美国能源部与 FDA 之间的机构间协议进行管理。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| CHO DG44 细胞系 | Invitrogen | A1100001 | |
| ambr 15 自动化微型生物反应系统 | Sartorius | 001-2804 | 自动化微型生物反应器 |
| ambr 15 细胞培养 24 孔一次性生物反应器 - 鼓泡式 | Sartorius | 001-2B80 | |
| 1 mL 一次性移液枪头,已灭菌 | Sartorius | A-0040 | |
| 5 mL 一次性移液枪头,已灭菌 | Sartorius | A-0039 | |
| 24 孔深孔板 | Sartorius | A-0038 | |
| 1 孔板 | Sartorius | A-0068 | |
| Vi-Cell XR 细胞计数仪 | Beckman Coulter | 731050 | 自动细胞计数仪 |
| EX-CELL 抗泡剂(γ射线灭菌) | Sigma-Aldrich | 59920C-1B | |
| CD OptiCHO AGT 培养基 | Thermo Fisher Scientific | A1122205 | |
| 200 mM L-谷氨酰胺 | Corning | 25-005-CV | |
| 100X 青霉素/链霉素 | Corning | 30-001-CI | |
| 125 mL F 型底摇瓶(无菌,通气) | Fisher Scientific | PBV12-5 | |
| 125 mL 玻璃旋转瓶 | Corning Life Sciences Glass | 4500-125 | |
| 250 mL 聚丙烯锥形离心管(无菌) | Nalgene (Thermo Scientific) | 376814 | |
| TC20 自动细胞计数仪 | BioRad Laboratories, Inc. | 1450103 | |
| 台盼蓝 | Sigma-Aldrich | T8154 | |
| 10x PBS | Corning | 46-013-CM | |
| BioProfile FLEX 分析仪 | Nova Biomedical | 49418 | 营养成分分析仪 |
| Octet Red 96 | Pall FortéBio | 99-0042 | Protein A 生物传感器 |
| Protein A 浸入式即读生物传感器 | Pall FortéBio | 18-5010 | |
| 聚丙烯 96 孔微孔板,F 型底,烟囱式,黑色 | Greiner Bio-One | 655209 |
申请许可以重复使用本 JoVE 文章的文本或图表
申请许可