本文描述了一种从羊驼中生产单域抗体的方法,包括免疫、采血、B细胞分离和筛选。
本文描述了一种从羊驼中生产单域抗体的方法,包括免疫、采血、B细胞分离和筛选。
本文描述并演示了一种用于羊驼免疫以及利用分子生物学方法制备抗原特异性单域抗体的技术。骆驼科动物(如羊驼和美洲驼)因其能够产生一种新型的仅含重链的抗体,已成为生物医学研究中的宝贵资源,这种抗体可用于制备单域抗体。由于免疫系统具有高度灵活性,因此可以针对多种不同的蛋白质抗原,甚至同一抗原的不同构象,制备出高度特异性的单域抗体。这些特性使单域抗体成为生物医学研究中不可或缺的工具。本文报道了一种从羊驼中制备单域抗体的方法,详细描述了免疫接种、采血及B细胞分离的实验方案。利用分离得到的B细胞构建免疫文库,并通过淘选(panning)方法筛选特异性单域抗体。通过淘选获得的候选单域抗体需经下拉实验(pull-down)、ELISA或凝胶迁移实验(gel-shift assay)进行验证。所获得的单域抗体可直接使用,也可作为工程化试剂的一部分。单域抗体及其基于单域抗体的试剂可用于结构生物学、生物化学、细胞生物学、体内研究以及治疗学等多种应用。单域抗体可在原核表达系统中以重组蛋白形式大量生产,经纯化后可直接使用,也可进一步改造,加入特定的标记物或标签,用于细胞研究或诊断中的报告系统。
羊驼及其他骆驼科动物已成为生物医学研究中抗体生产的一种常用来源1,2,3。骆驼科动物具有独特的免疫系统,能够产生常规抗体以及仅含重链的抗体,后者可进一步生成分子量更小的单域抗体,同时保持高特异性和高亲和力。因此,骆驼科抗体是一种用途广泛的试剂,适用于多种研究目的。本文介绍了一种免疫羊驼并针对多种蛋白抗原产生单域抗体的方法。这些抗体可通过一种相对简单的方法在骆驼科动物体内制备,仅需通过少量注射目标蛋白(抗原)进行免疫,并采集血液样本4。随后,通过构建文库、M13噬菌体展示技术5以及针对重组抗原的淘选过程6,分离并获得具有理想特性的单域抗体。由于该方法充分利用了噬菌体展示技术的优势,每只动物可同时用于五种或更多抗原的制备,从而减少了实验动物的使用数量及相关成本。
典型的哺乳动物抗体或免疫球蛋白是大型分子,由两种链(两条重链和两条轻链)通过二硫键连接而成。这些抗体相对较大,人类、小鼠、山羊和兔子中较常见的IgG类抗体分子量约为~140-190 kDa。由于其多亚基结构、高分子量以及二硫键的存在,免疫球蛋白在大量生产时往往具有较大挑战性,导致其成本较高。20世纪90年代发现,骆驼科动物(包括骆驼、羊驼和小羊驼)除了产生典型的哺乳动物型免疫球蛋白外,还能产生一种结构更简单的新型免疫球蛋白,仅由重链组成7。这些独特的骆驼科抗体具有与典型抗体相同的高亲和力特异性结合外来物质的能力,但仅由一条蛋白链构成8。此外,骆驼科抗体可在实验中被截短为更小的单位——VHH片段,也称为单域抗体9。由于其分子尺寸小,单域抗体在多种生物医学研究应用中具有重要价值,目前可通过多种学术和商业渠道获得1,10。但Western印迹(Western blotting)是一个例外,因为单域抗体通常靶向依赖构象的表位,而这些表位在Western blot所用的变性条件下通常会丧失。
由于单域抗体由一条单一的多肽链构成,因此可筛选出特异性的单域抗体,并作为重组蛋白在细菌中大量、便捷地生产。单域抗体还可通过基因工程改造,使其包含特定的标记物或标签,这些标记物或标签可作为疾病诊断中的"报告基团"11。这种易于操作的特性,加上其应用上的灵活性,使单域抗体成为高校及其他机构研究人员的重要资源。
作为美国国立卫生研究院资助的核心项目的一部分,现有方法已被改进,用于从羊驼中制备单结构域抗体3,4。相较于其他体型更大的骆驼科动物,羊驼在操作便利性和可获取性方面具有显著优势。羊驼被广泛用于毛纤维和肉类生产,因此可从本地羊驼养殖户处就近获得,这些养殖户可通过其网站或各州育种者协会查询到。目前有两种羊驼品种可供选择:苏利羊驼(Suri)和瓦卡亚羊驼(Huacaya)。其中瓦卡亚羊驼更为常见,本实验方案即采用该品种;但本方案同样适用于其他品种,也可更广泛地应用于其他骆驼科动物。
所有羊驼实验操作均依照肯塔基大学机构动物护理和使用委员会(IACUC)批准的协议(2017-2627 和 2018-2925)进行。
1. 抗原特异性羊驼抗体的制备
2. 单域抗体文库构建中淋巴细胞的纯化
3. 单域抗体筛选
本方案用于针对多种蛋白抗原产生单域抗体。每只羊驼使用五种抗原进行免疫。免疫监测结果显示,大多数抗原在三周时即开始出现强烈的免疫反应(图1)。在注射多种抗原的情况下,动物免疫约六周后采血并构建文库,可达到最佳平衡。针对每种抗原均进行两轮淘选,并对分离的菌落进行筛选(图2)。对阳性菌落测序后,鉴定出针对不同抗原的多样化单域抗体序列。例如,针对参考抗原麦芽糖结合蛋白(Maltose Binding Protein, MBP)分离出三个独特的克隆(图3A)。与通常观察到的情况一致,这些单域抗体具有显著的序列多样性以及长度高度可变的CDR3区(图3)。这些特征在单域抗体与抗原的相互作用中尤为重要,这一点已在参考的单域抗体/CX3CL1复合物结构中得到证实17(图3B)。
大多数全长单域抗体序列可在每升培养液中表达并纯化获得1-10 mg的产量(图4A)。由于CDR3区长度存在差异,不同的单域抗体在分子量上表现出轻微差异。确认其直接结合能力及特定应用中的性能表现至关重要。例如,在针对抗原B进行两轮筛选后,鉴定出一组单域抗体(图2)。其中发现多个相同的序列,随后对该单域抗体进行表达与纯化。通过抗原亲和树脂直接下拉实验进行检测,结果显示其具有显著的剂量依赖性结合能力(图4B)。重要的是,该单域抗体对对照树脂无任何结合信号。这些数据表明该抗体具有直接的结合相互作用,且适用于基于下拉实验和ELISA形式的亲和捕获应用。

图 1:两种不同抗原的代表性免疫监测结果,显示同一动物对不同抗原产生显著的特异性免疫应答。 许多抗原在开始免疫后三周内即表现出强烈的免疫反应,大多数抗原在六周后达到最大反应强度。六周的时间也有利于抗体亲和力的成熟,因此建议在此时间点进行生产性采血和B细胞分离。 请点击此处查看该图的放大版本。

图2:基于PCR的阳性克隆验证。 引物跨越pMES4载体的多克隆位点(MCS),阳性纳米抗体克隆产生约500 bp的扩增片段(用*标记)。 请点击此处查看该图的放大版本。

图3:抗原特异性序列揭示羊驼单域抗体的多样性。(A)选取的针对MBP分离出的单域抗体序列与参考单域抗体4XT1的比对结果,下方高亮显示了框架区及互补决定区(Kabat命名法)。(B)羊驼单域抗体4XT1与CX3CL1结合的结构(PDB 4XT1),强调可变CDR环在特异性抗原结合中的关键作用。请点击此处查看该图的放大版本。

图4:单域抗体的纯化与验证。(A)IMAC纯化的单域抗体的SDS-PAGE结果,比较了多种不同的单域抗体。不同的分子量主要归因于CDR3环长度的差异。同时观察到表达水平存在差异,少数单域抗体的纯化蛋白产量较低。(B)利用抗原亲和沉淀法验证直接结合能力。在抗原偶联树脂上观察到明显的剂量依赖性单域抗体结合,而在对照树脂上则无结合。 请点击此处查看该图的放大版本。
如前所述,单域抗体具有高亲和力和特异性,加之其易于表达和稳定性好,使其成为生物医学研究中理想的试剂,可作为关键的生物化学试剂、诊断工具或治疗剂18。在商业应用中,需考虑一些与知识产权相关的问题。此外,单域抗体可被改造以包含特定的标记物或标签,这些标记物或标签可用作细胞检测或诊断中的报告分子。实现这些应用的关键在于能够针对目标抗原产生特异性的单域抗体。本文介绍了一种利用羊驼制备单域抗体的方法,该方法可对多种蛋白质抗原产生强烈的免疫应答。文中还描述了动物操作和法规合规方面的注意事项,这些因素对于该环节的成功至关重要。
还有其他策略可用于产生单域抗体,这些策略无需免疫动物,而是利用半合成文库,并结合不同的系统来筛选并迭代优化亲和力19,20。然而,使用来自免疫动物的文库的优势在于能够可靠地分离出高度富集、多样性丰富且具有高亲和力的单域抗体。此外,不仅可观察到显著的序列变异,而且所分离的大多数特异性单域抗体在CDR3区尤其存在独特的插入和缺失。
此外,单域抗体可通过一个简单的流程进行制备,该流程仅需注射少量抗原,且操作完成后动物可返回畜群。需要注意的是,这些动物仍可自由用于纤维生产,但由于在单域抗体制备过程中使用了试验性抗原及未经美国食品药品监督管理局(FDA)批准的佐剂,因此必须排除其进入肉类食品链(人类食物链)的可能。当操作完成后,应对动物进行为期一周的监测,并接受最终的兽医检查,随后可将其送返原养殖场,或休养六个月后再进行下一轮单域抗体的生产。
Whiteheart 博士和 Hersh 博士就职于肯塔基大学,在分子医学中心运营一个核心实验室,该实验室以收费服务的形式在羊驼中生产单域抗体。
本工作由美国国立卫生研究院(P30GM103486)资助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| GERBU FAMA 佐剂 | Biotechnik, Heidelberg, Germany | 3003,6001 | |
| 血清采集管 | Becton Dickinson | 367983 | |
| 血液采集管 | Becton Dickinson | 366643 | |
| Vacutainer 血液采集套装 | Becton Dickinson | 368652 | |
| Maxisorp 免疫板 | Nunc | 439454 | |
| BSA | Sigma-Aldrich | A7906 | |
| HRP 标记的山羊抗羊驼 IgG 抗体 | Bethyl Labs | A160-100P | |
| TMB 显色过氧化物酶底物试剂 | KPL | 50-76-03 | |
| 酶标仪 | Spectramax | M5 | 任何具备紫外/可见光检测功能的读板仪均可使用 |
| Uni-SepMAXI+ 淋巴细胞分离管 | Novamed | U-17 | |
| RNeasy Mini 试剂盒 | Qiagen | 74104 | |
| QIAshredder 离心柱 | Qiagen | 79654 | |
| Superscript IV 逆转录酶 | Invitrogen | 18064014 | |
| AEBSF 溶液 | Biosynth | A-5440 | |
| TG1 噬菌体展示感受态细胞 | Lucigen | 60502 |