我们介绍一种使用硅橡胶(PDMS)制备的高通量牵引力检测方法。该新型检测方法适用于研究细胞收缩力在多种生物学、生物医学过程及疾病中的物理变化。我们通过检测上皮-间质转化过程中TGF-β依赖性的收缩力增强,展示了该方法的应用价值。
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我们介绍一种使用硅橡胶(PDMS)制备的高通量牵引力检测方法。该新型检测方法适用于研究细胞收缩力在多种生物学、生物医学过程及疾病中的物理变化。我们通过检测上皮-间质转化过程中TGF-β依赖性的收缩力增强,展示了该方法的应用价值。
细胞收缩力在生物学的诸多方面至关重要,驱动着从运动、分裂到组织收缩和机械稳定性的各种过程,是多细胞动物生命的核心要素之一。在贴壁细胞中,肌动球蛋白收缩表现为细胞对其基质施加的牵引力。细胞收缩力的失调出现在多种病理状态中,使得收缩力成为利用生物物理指标进行诊断的有前景靶点。此外,新的治疗策略可基于纠正细胞收缩力的明显功能障碍而建立。这些应用, 然而,需要对这些力进行直接量化。
我们开发了基于硅胶弹性体的并行多孔板格式牵引力显微镜技术(TFM)。与常用的水凝胶聚丙烯酰胺(PAA)不同,我们采用硅橡胶材料,特别是聚二甲基硅氧烷(PDMS),从而制备出稳定且惰性的基底,其储存期无限,无需特殊储存条件。与基于微柱PDMS、模量处于GPa范围的方法不同,此处使用的PDMS具有高度顺应性,模量范围约为0.4 kPa至100 kPa。我们通过在空间上将这些大尺寸整体基底划分为生化上相互独立的孔,构建了一个高通量TFM平台,形成一种可与现有多种多孔板系统兼容的多孔板牵引力筛选平台。
在本论文中,我们利用这种多孔牵引力系统研究上皮细胞向间充质细胞的转变(EMT);通过将 NMuMG 细胞暴露于 TGF-β 以诱导 EMT,并量化 EMT 过程中的生物物理变化。我们测量了细胞收缩力随 TGF-β 处理浓度和时间的变化。我们的研究结果展示了并行化牵引力显微技术在疾病生物物理学研究中的应用价值。
肌动蛋白-肌球蛋白收缩力是细胞主动力学的核心要素,影响着细胞从运动、增殖到干细胞分化的多种行为。在组织中,收缩力驱动了从胚胎发育过程中的极性分离,到气道收缩以及心脏活动等多种生理过程。关键的是,细胞要产生张力,必须首先黏附于其细胞外环境。通过这种黏附,细胞的收缩力会对其周围环境产生牵引力。牵引力显微镜技术(Traction Force Microscopy, TFM)已发展出多种形式,成为在不同条件下定量测量各类细胞产生牵引力的重要方法。
牵引力显微技术(TFM)领域在创新和应用方面取得了广泛进展,其成果为生物学研究开辟了融入力学和物理力作用的新视角。从早期使用产生皱褶的硅胶基底1开始,研究人员已采用多种技术来测量细胞牵引力。这些方法不断得到改进,目前分辨率已达到数微米级别2。然而,一个主要问题逐渐显现,即使用现有的硅胶材料难以制备出具有合适低模量的基底。为解决这一问题,聚丙烯酰胺被引入作为替代材料,因其易于制备模量在1–20 kPa范围内的基底3。我们近期在TFM中采用了高度顺应性的硅胶材料4,使我们能够实现与聚丙烯酰胺相当的模量范围,同时兼具硅胶材料惰性强、机械稳定性好的优势。
TFM 方法已实现了重要的力学生物学发现,然而其复杂性始终是一个持续存在的缺陷,通常限制了这些方法仅被工程学或物理科学领域的研究人员使用。这归因于 在很大程度上 由于量化收缩力需要进行详细的校准和复杂的计算,因此存在较大难度。另一个重要挑战在于,TFM 方法通量普遍较低,因而难以同时研究多种不同条件或群体。5这已成为一个瓶颈,阻碍了薄膜显微镜技术从专业的生物物理领域向更广泛的生物学和药理学领域的推广应用。 应用。
我们近期开发了一种多孔格式的牵引力显微镜(TFM)板,可使研究人员并行开展TFM测量,从而更快地量化收缩性指标,同时探索不同化合物的影响,并减少试剂用量4。该方法在多种力学生物学研究中具有广泛的应用价值,从评估化合物对细胞活性的影响,到量化分化或疾病过程中的收缩性变化均可适用。
生物医学研究中将极大受益于牵引力显微镜(TFM)的一个领域,是物理信号如何影响癌细胞恶性表型的研究。转移是导致90%癌症相关死亡的原因,其特征是癌细胞离开原发肿瘤部位并定植于继发部位。细胞要穿过组织并在血管系统内外迁移,必须发生显著的形态改变,以挤过这些物理屏障,同时产生足够的力,沿细胞外基质拉动自身或在其他细胞间移动。这些力通过局灶性黏附相互作用传递到基底2,3,并可利用TFM进行量化。尽管癌症在生物化学上具有高度异质性,已知的突变和蛋白质变化种类不断增多,但仍观察到一些共通的物理特性改变;在包括乳腺癌、前列腺癌和肺癌在内的多种癌症中,转移性细胞施加的牵引力已被证实是非转移性细胞的2-3倍6,7,8。这些结果提示,转移进展与细胞施加的牵引力之间可能存在强烈相关性;然而,细胞收缩力随时间变化的详细动态仍难以观测。
上皮-间质转化(EMT)是一种细胞通过减少黏附连接和紧密连接介导的细胞间黏附,从而获得更强迁移性和侵袭性的过程。除了参与伤口愈合和发育过程等生理功能外,EMT 还在肿瘤转移过程中被癌细胞所利用,因此成为研究该过程的一个有用模型系统。利用 TGF-β,我们可在 小鼠乳腺上皮细胞(NMuMG)9中诱导 EMT,直接量化转化过程中的物理变化,并表征 TGF-β 对 EMT 及细胞收缩力的时间和剂量依赖性效应。本文通过测量诱导 EMT 过程中细胞收缩力的变化,展示了该方法的应用价值。
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注意:以下方案将指导研究人员制备和使用如图1所示的多孔牵引力显微镜(TFM)培养皿。
1. PDMS硅胶基底的制备
2. 表面功能化
3. 紫外线灭菌
4. 细胞培养
5. 数据采集
6. 图像分析
7. 微珠合成
注意:以下实验方案基于 Klein 等人10所描述的合成方法。
8. 流变学测量方案
注意:流变学测试并非每位研究人员或实验所必需,但对于量化新型PDMS配方的模量而言是必要的。在本方案中,我们采用剪切流变仪来测量交联剂、频率和应变对PDMS样品模量的影响。根据可用的工具和专业知识,也可使用其他多种力学分析方法来测定模量。此外,使用本方案的研究人员可选择采用我们已发表的模量数据,详见表1、图3和图4。
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在添加TGF-β之前,汇合的单层细胞呈鹅卵石样形态,排列紧密。经TGF-β处理后,细胞形态变得更加细长,细胞面积增大,并获得更明显的间充质样表型。利用由柔软PDMS弹性体制造的多孔装置,研究了共17种不同条件下细胞的物理特性。细胞分别接受四种不同浓度的TGF-β(0.5、1、2和4 ng/mL)以及四种不同孵育时间(12、24、48、96 h)处理,结果总结于图5中。经TGF-β处理的细胞所产生的牵引应力和应变能均大于未添加TGF-β培养的细胞。孵育96小时的TGF-β处理组细胞表现出最大的牵引应力和应变能。随着TGF-β浓度的升高,细胞施加的应力和应变能也随之增大。在较长的孵育时间下,牵引力和应变能的差异更为显著。
基底表面必须光滑,并均匀涂覆配体(如纤连蛋白或胶原蛋白)。表面划痕和/或配体涂层不均匀可能导致细胞贴附异常,从而造成牵引力测量不准确。图...
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该方法成功的关键在于制备出厚度均匀且恒定的样品,厚度约为 100 µm。应谨慎选择模量,以准确考察目标生物系统的物理意义。在制备顶层时,应优化示踪荧光微粒的浓度,以实现对位移和牵引力应力的精确分析。分析单个孤立细胞时,所需的示踪层密度高于测量汇合单层细胞时的需求。此外,基底表面应稳定且均匀地包被黏附分子(如胶原蛋白、纤连蛋白和层粘连蛋白),以确保细胞能够正常附着于基底表面。安装多孔分隔器时需格外小心,应避免滑动放置,以防密封用的 PDMS 胶被涂抹到培养表面;同时,其外边缘必须与玻璃尺寸精确对齐,以防止边缘孔位发生泄漏。
为防止小室发生泄漏,需在小室分隔处涂抹适量的PDMS胶以固定其位置。但若使用过量,则会覆盖细胞培养表面。
在旋涂过程中需要加入足量的PDMS。固化时,烘箱和支架必须保持水平。PDMS不足或烘箱不水平可能导致PDMS厚度不均。
微珠密度需要优化以确保准确分析。当微珠密度不足时,需增加微珠在基准PDMS混合物中的浓度。此外,还需加入足量的混合物用于旋涂。为确...
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AJE 和 RK 对 Live Cell Technologies 公司拥有利益关系,该公司生产本文所述的材料。
作者感谢 Tom Kodger、Michael Landry 和 Christopher J. Barrett 在微珠合成方面的协助。A.J.E. 感谢自然科学与工程研究理事会资助项目 RGPIN/05843-2014 和 EQPEQ/472339-2015、加拿大卫生研究院资助项目编号 143327、加拿大癌症协会资助项目编号 703930 以及加拿大创新基金会项目 #32749。R. Krishnan 感谢美国国立卫生研究院资助项目编号 R21HL123522 和 R01HL136209。H.Y. 得到魁北克健康研究基金会以及魁北克自然与技术研究基金会的支持。作者感谢 Johanan Idicula 在视频制作和稿件撰写方面的协助,以及 Zixin He 在视频准备过程中的帮助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 平板 | |||
| GEL-8100 | Nusil Technology | GEL-8100 | 高纯度介电性软硅胶凝胶套件 |
| Dow Corning Sylgard 184 硅胶封装剂透明 0.5 kg 套件 | Ellsworth Adhesives | 184 SIL ELAST KIT 0.5KG | 固化剂 |
| 定制切割玻璃 | Hausser Scientific Company | 109.6 mm± × 72.8 mm± × 1 mm 厚度 | |
| Target 2TM 尼龙注射器滤器 | ThermoFisher Scientific | F2513-4 | |
| 96 孔条板蛋格式条带支架 | Corning | 2572 | |
| 带角切口的聚苯乙烯通用微孔板盖 | Corning | 3099 | |
| 乙醇 | Greenfield Global | P016EA95 | 0.95 |
| 2-丙醇 | Sigma-Aldrich | 190764 | ACS 试剂,≥99.5% |
| 表面涂层 | |||
| Sulfo-SANPAH 交联剂 | Proteochem | c1111-100mg | |
| 牛血浆纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | F1141-1MG | 溶液,经无菌过滤,BioReagent,适用于细胞培养 |
| PBS,1× | Wisent | 319-005-CL | pH 7.4,不含钙和镁 |
| DMSO | Sigma-Aldrich | 472301 | |
| 细胞培养 | |||
| DMEM,1× | Wisent | 319-005-CL | 含 4.5 g/L 葡萄糖、L-谷氨酰胺、丙酮酸钠和酚红 |
| FBS(胎牛血清) | Wisent | 080-150 | 优质,内毒素 <1,血红蛋白 <25 |
| HEPES | Wisent | 330-050-EL | 1 M,游离酸 |
| 重组人胰岛素 | Wisent | 511-016-CM | USP 级 |
| 青霉素-链霉素溶液 | Wisent | 450-201-EL | 100×,经无菌过滤,适用于细胞培养 |
| L-谷氨酰胺溶液 | Wisent | 609-065-EL | 200 mM 溶液,经无菌过滤,适用于细胞培养 |
| 两性霉素 B | Wisent | 450-105-QL | 250μg/mL,经无菌过滤,适用于细胞培养 |
| 重组人 TGF-β1 | Peprotech | 100-21 | HEK293 表达来源 |
| 乙酸 | Sigma-Aldrich | 537020 | 冰醋酸,≥99.85% |
| 柠檬酸 | Sigma-Aldrich | 251275 | ACS 试剂,≥99.5% |
| NMuMG | ATCC | CRL-1636 | 小鼠乳腺细胞系 |
| 叠氮化钠 | Fisher Scientific | AC190385000 | 99%,超纯,ACROS Organics |
| 氢氧化钾 | Sigma-Aldrich | 221473 | ACS 试剂,≥85%,颗粒状 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | 实验室级 |
| 微珠合成 | |||
| 1,1′-二十八烷基-3,3,3′,3′-四甲基吲哚羰花青高氯酸盐(DiI) | Sigma-Aldrich | 468495-100MG | 97% |
| 甲基丙烯酸甲酯 | Sigma-Aldrich | M55909-500ML | 含 ≤30 ppm MEHQ 作为抑制剂,99% |
| 抑制剂去除柱 | Sigma-Aldrich | 306312-1EA | 预装柱,用于去除氢醌和单甲醚氢醌 |
| 甲基丙烯酰氧基丙基封端聚二甲基硅氧烷 | Gelest | DMS-R31 (25,000 g/mol) | 聚二甲基硅氧烷稳定剂,25,000 g/mol,1,000 cSt |
| 2,2′-偶氮双(2-甲基丙腈)(AIBN) | Sigma-Aldrich | 441090-25G | 98% |
| 正己烷 | Sigma-Aldrich | 296090-2L | 无水,95% |
| 己烷,异构体混合物 | Sigma-Aldrich | 227064-1L | 无水,≥99% |
| Whatman 定性滤纸,1 号 | Sigma-Aldrich | WHA1001055 | 圆形,直径 55 mm |
| 设备 | |||
| Laurell WS-650Mz-23NPPB | Laurell Technologies | ||
| UVP 手持式紫外灯 UVGL-58 型 | VWR | 21474-622 | |
| 流变仪 | Anton Paar | MCR 302 WESP |
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