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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该协议的目标是建立一个3D体外模型,以研究肿瘤状环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的分化,可在免疫荧光、转录等不同分析系统中解决。分析和生命细胞成像。
确定体外研究的理想模型至关重要,主要是研究细胞分化等生理过程。在肿瘤频闪中,宿主成纤维细胞受到癌细胞的刺激以分化。因此,他们获得一个表型,有助于肿瘤微环境,并支持肿瘤进展。通过使用球体模型,我们建立了这样的3D体外模型系统,其中我们分析了层蛋白-332及其受体一体体[3]1在分化过程中的作用。这种球形模型系统不仅以更准确的方式再现肿瘤微环境条件,而且是一个非常通用的模型,因为它允许不同的下游研究,如细胞内和细胞外免疫荧光染色标记,以及沉积的细胞外基质蛋白。此外,还可以用该模型对qPCR、流式细胞测定和细胞入侵进行转录分析。在这里,我们描述了一个球形模型的协议,以评估CAF的整数α3+1及其异位沉积配体,拉米宁-332,在分化和支持胰腺癌细胞入侵中的作用。
肿瘤微环境是一个非常复杂的利基,对于肿瘤细胞的维持和进展极为重要。它不仅由癌细胞形成,而且由基质成纤维细胞形成。肿瘤细胞被一个频闪包围,它特异性,不同于正常组织的频闪2。拉米宁-332是一种细胞外基质蛋白,在不同肿瘤的频闪中异位表达,如胰腺腺癌3。此外,ECM的生化成分及其生物物理特性,如刚度和张力,在肿瘤体积4内发生变化。这种肿瘤频闪,或"反应频闪",是由成纤维细胞适应邻近的癌细胞和招募其他重要的玩家,为肿瘤进展发展一个有利和支持的环境造成的。基质成纤维细胞的分化导致癌症相关成纤维细胞(CAF)。这些细胞可以使用不同的标记物进行识别,如β-平滑肌活动(βSMA)5或神经/胶质抗原2(NG2)6。
最合适的体外模型,以CAFs重述肿瘤微环境(TME)是难以选择的。对于这种模型系统,必须考虑以经济高效和可重现的方式模拟TME生理参数的方法。在TME中,不同的过程,如增殖、分化、迁移和入侵不同的细胞类型发生。这些细胞过程可以单独使用不同的方法执行。然而,实验条件必须考虑细胞与肿瘤频闪ECM的相互作用,因为基底的刚度会影响CAF分化过程。R.G. Wells评论了基质刚度对细胞行为的影响,并强调在体外培养细胞中观察到的细胞骨骼组织和分化状态可能是技术事实7。不同的刺激似乎涉及CAF分化,包括机械张力5,7。为了避免这种情况,2D 软基板可能是分化研究的可能方法,因为它们避免了硬培养盘塑料的问题。可以种植成纤维细胞的软二维表面可以是胶原蛋白-I涂层聚丙烯酰胺凝胶,据此,通过聚丙烯酰胺和凝胶交联结剂的浓度来操纵凝胶刚度。富_SMA富应力纤维的附着力和形成在成纤维细胞中随着凝胶刚度8而增强。这些结果强调了软基体支架对于更多生理体外分化模型的重要性。然而,在我们手中,这些凝胶的实验重现性和成像是具有挑战性的。为了克服这些缺点,我们改变了2D软基板系统为3D球形模型进行分化和入侵研究。该模型在临床上更相关,类似于体外有机体,在体内细胞-细胞相互作用、ECM生产和沉积以及细胞行为9中重述。
当细胞缺乏附着基板时,形成球形。当细胞没有粘合表面时,它们聚合成或多或少的球形结构。如果球体由一种类型的细胞组成,它们称为同源体;如果由两种或两种以上的不同细胞类型组成,它们就形成杂血球体。
在球体制备的不同方法中,我们使用非粘附圆底96孔板执行协议。它在费用方面非常有效。在这里,我们生产成纤维细胞的同源体,CAF 或 CAF 缺乏集成 _3 亚单位来检查 CAF 或整数 #3 KO CAF 和胰腺管癌细胞(AsPC-I 和 PANC-I)的分化过程和杂物类,以研究入侵到周围的矩阵。
这些研究的目的是使用从人类胰腺癌活检中分离的原发性CAF。然而,获得细胞的活检很少,因此,这些研究中使用的CAF已经使用含有HTERT的扁豆病毒永生。它们被称为iCAF,它们的正常对应物,即原发性人类胰纤维细胞,被称为iNF。人类胰纤维细胞和胰腺管癌细胞AsPC-I和PANC-I已上市。
该协议用于研究拉明宁-332-一元相互作用在CAF分化过程中的影响。为了证明这种相互作用的特异性及其功能,使用了抑制剂化合物:BM2,一种单克隆抗体,它阻断了结合位点层的层素-332+3链10,或lebein 1,一种蛇毒衍生化合物,可阻断拉米宁结合一元,[3]1,#6+1和#7+111,12。
对于入侵测定,细胞被转用于含有cDNA编码的慢病毒,其中mCherry(iCAFs和integrin+3 KO iCAFs)或GFP(AsPC-I和PANC-I)用于区分杂血球体中不同的细胞类型。细胞转导使其永生和/或用荧光蛋白(mCherry和GFP)表达标记,在先前的研究13中进行了描述,应查阅,以了解更多信息。
1. 3D球体作为体外模型,用于使用细胞基质相互作用的不同TGF-#1抑制化合物进行成纤维细胞/CAF分化
2. 球体的免疫荧光染色


这一实验设计的结果发表在马丁斯·卡瓦科等人13号上,建议进一步阅读从这些实验中得出的结论。
图1,免疫荧光球体的代表性图像,显示了不朽正常成纤维细胞和永垂的CAF的整数+3亚单位的免疫染色(图1A),以及免疫荧光qPCR 的定量 (图 1B) 和整数 -3 亚单位基因的转录水平 (图 1C)。该组结果表明,与正常对应物相比,iCAF 中集成 #3 处于向上调节状态。这证明,整数#3_1可被视为胰腺成纤维细胞分化的标记物。流量细胞学研究13也证明了这一点。

图 1.iN 和 iCAFs 表示的整数 =3 子单位。iCAF 对整数 #3 子单元进行调节,反映了其作为胰腺 CAF 的分化标记的潜力。(A) 与 iCAF 的同源类相比,正常胰纤维细胞 (iNFS) 同源体 (iNFS) 的免疫荧光染色显示分化细胞中 integrin _3 亚单位的信号增加。(B) 使用 ImageJ 软件,用 3D 球体的 Z 堆栈图像对球体中细胞的荧光信号进行量化。均值 = 三个独立实验的 SEM 通过 t 检验(*、p < 0.1)进行显示和比较。(C) 分析从分离球体中获得的细胞,其转录水平为一体组+3亚单位。均值 =Ct 值的 SEM 作为两个独立实验的折叠变化,通过 t 检验显示和比较。虽然没有达到显著性水平0.1,但iCAF中整数=3编码mRNA的转录水平高于iNF。请点击此处查看此图的较大版本。
| 赫罗斯菲奥地 | ||
| 单元格类型(通道最多 25 个) | 单元格数 | 中等(1部分甲基纤维素 +...) |
| mCherry-iCAFs = GFP-AsPC-I | 400 个 CAF = 400 胰腺癌细胞 | 1,5 个零件 MEM,具有 10% 的 FBS 和 1% 的笔/链环 = 1,5 部分 RPMI,10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 |
| mCherry-#3KO-iCAFs = GFP-AsPC-I | ||
| mCherry-iCAFs = GFP-PANC-I | 1,5 个零件 MEM,包含 10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 = 1,5 部分 DMEM,10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 | |
| mCherry-#3KO-iCAFs = GFP-PANC-I | ||
| 同源体 | ||
| 细胞类型(通道最多 25 个) | 单元格数 | 中等(1部分甲基纤维素 +...) |
| mCherry-iCAFs | 400 个单元格 | 3 部分 MEM 辅以 10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 |
| mCherry-#3KO-iCAFs | ||
| GFP-AsPC-I | 3 个零件 RPMI,具有 10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 | |
| GFP-PANC-I | 3 个零件 DMEM,具有 10% 的 FBS 和 1% 的笔/链球菌 |
表 1.异体和同源体的细胞组成。下表总结了组装异体体和同源体所需的细胞数量以及应用于球形形成溶液的相应介质。
补充图1。使用 ImageJ 对球体中感兴趣的蛋白质的免疫荧光染色进行定量的连续步骤。请点击此处下载此文件。
补充图2。使用 ImageJ 定量入侵测定中入侵癌细胞数量的顺序步骤。请点击此处下载此文件。
提交人声明没有利益冲突。本材料仅反映提交人的意见,欧洲联盟对可能使用其中所载资料概不负责。
该协议的目标是建立一个3D体外模型,以研究肿瘤状环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的分化,可在免疫荧光、转录等不同分析系统中解决。分析和生命细胞成像。
我们感谢芭芭拉·斯考丁在准备BM2和Lebein-1方面的帮助。我们感谢奥格内斯·诺埃尔分享了她在球形测定方面的专长。我们感谢索尼娅·舍尔哈斯和迈克尔·舍弗斯在S2条件下处理慢病毒转染方面的帮助。我们感谢萨宾·冯·吕登在准备胰腺癌组织CAF方面所助一的协助。
根据REA赠款协议(316610)向J.A.E.提供的成果,导致这些结果的研究得到了欧洲联盟第七框架方案FP7/2007-2013/的人民方案(玛丽·居里行动)的资助。此外,J.A.E.和A.C.M.C.在卓越细胞集群(EXC 1003-CiM)内由德国基金会(DFG)提供财政支持。该项目还得到了威廉·桑德·斯蒂夫通的支持(授予:2016.113.1 至 J.A.E.)。
| 4',6-二脒基-2-苯吲哚,二盐酸盐 (DAPI) | SIGMA-ALDRICH | D9542-10 | |
| 6F12 抗层粘连蛋白 &β;3 亚基小鼠 (单克隆) | 自制 | ||
| A3IIF5 抗 -&α;3 个整合素亚基 小鼠(单克隆) | 由波士顿 Dana Faber 癌症研究所的 M. Hemler 教授友情提供 | ||
| 酮 | SIGMA-ALDRICH | 32201 | |
| 白蛋白组分 V - BSA | AppliChem | A1391 | |
| Alexa fluor 488 山羊(多克隆)抗小鼠 | Invitrogen | A11029 | |
| Alexa fluor 488 山羊(多克隆)兔 | Invitrogen | A11034 | |
| 抗层粘连蛋白 &γ;2 亚基小鼠(单克隆) | Santa Cruz | sc-28330 | |
| 抗 NG2 兔(多克隆)Millipore,AB5320 | Millipore | AB5320 | |
| 抗-&α;-SMA-Cy3 小鼠(单克隆) | SIGMA-ALDRICH | C6198 | |
| AsPC-1 细胞系 | ATCC | 由 Jorg Haier 教授的实验室 | |
| 工作台离心机 | Fisher Scientific | 友情提供50-589-620 | Sprout |
| BM2 抗层粘连蛋白 &α;3 亚基小鼠(单克隆) | 由 Patricia Rousselle 教授提供,CNRS,里昂 | ||
| 氯化钙 (CaCl2) | Fluka | 21074 | |
| 离心机 | Thermo Scientific | Multifuge 1S-R | |
| 离心管 50 mL | 康宁 | 430290 | |
| 胶原酶 B | 罗氏 | 11088831001 | |
| 胶原蛋白-I,大鼠尾 | 巴Gibco | A10483-01 | |
| 共聚焦显微镜 | 蔡司 | LSM 700 和 800 | |
| DMEM(高葡萄糖 4.5 g/L) | Lonza | BE12-604F | |
| 脱氨酸酶 I | 罗氏 | 10104159001 | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | FACSCaliburTM | |
| 凝胶化基质 | ThermoFisher Scientific | A1413202 | Matrigel、Geltrex |
| 山羊 IgG、同种型 | DAKO | X 0907 | |
| 马血清 | SIGMA-ALDRICH | 12449-C | |
| 人原代胰腺成纤维细胞 | PELOBiotech | PB-H-6201 | |
| 培养箱 | Heraeus | B6060 | |
| 层粘连蛋白-332 | 生物层粘连 | 蛋白LN332 | |
| MEM | SIGMA-ALDRICH | M4655 | |
| 微孔板,96 孔,U 型底 | Greiner Bio-One | 650101 | |
| 显微镜载玻片 | Thermo Scientific | J1800AMNZ | |
| 小鼠 IgG,同种型 | SIGMA-ALDRICH | I8765 | |
| 多轴旋转混合器 | CAT | RM5 80V | |
| PANC-I | ATCC | Jorg 教授友情提供海尔实验室 | |
| 多聚甲醛 | Riedel-de Haën | 16005 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| QuantiTect 逆转录试剂盒 | Qiagen | 205310 | |
| 大鼠 IgG,同种型 | Invitrogen | 10700 | |
| 反应管,1.5 mL | Greiner Bio-One | 616201 | |
| 实时荧光定量 PCR 循环仪 | Qiagen | Rotor-Gene Q | |
| RNeasy Mini Kit | Qiagen | 74104 | |
| 转子基因 SYBR Green PCR 试剂盒 | Qiagen | 204074 | |
| RPMI | Lonza | BE12-702F | 将葡萄糖加入 4.5 g(0.2 um 过滤器)和 1% 丙酮酸钠 |
| TritonX-100 | SIGMA-ALDRICH | X100RS | |
| Vórtex | Scientific Industries | Vortex-Genie 2 | |
| μ-玻片血管生成,未包被 | Ibidi | 81501 |