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Research Article
Alicia Masters1,2, Minjeong Kang1,3,4, Morgan McCaw1,3, Jacob D. Zobrist1,3,5, William Gordon-Kamm2, Todd Jones2, Kan Wang1,3
1Department of Agronomy,Iowa State University, 2Department of Applied Science and Technology,Corteva Agriscience, 3Crop Bioengineering Center,Iowa State University, 4Interdepartmental Plant Biology Major,Iowa State University, 5Interdepartmental Genetics and Genomics Major,Iowa State University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
植物形态基因可用于改善顽固基因型的基因转化。这里描述的是三个重要的公共玉米近亲繁殖线的农业细菌介导遗传转化(QuickCorn)协议。
这里演示了使用形态基因婴儿潮(Bbm)和Wuschel2(Wus2)的玉米近亲繁殖系的农业细菌介导基因转化的详细方案。Bbm受玉米磷脂转移酶基因(Pltp)促进剂的调控,而Wus2受玉米辅助诱导(Axig1)促进剂的控制。一种农业细菌菌株,携带这些形态基因转移DNA(T-DNA)和额外的农细菌毒性(病毒)基因,用于感染玉米未成熟的胚胎外生。体细胞胚胎在受感染胚胎的切口上形成,可以通过抗除草剂来选择并发芽到植物中。内置于DNA结构的热活化cre/loxP重组系统允许在转化过程的早期阶段从玉米基因组中去除形态基因。使用该协议,W22、B73 和 Mo17 的转化频率分别为大约 14%、4% 和 4%(每 100 个受感染胚胎的独立转基因事件数)。
转化是评估玉米中外来基因表达和生产转基因玉米系的基本工具,用于研究和商业目的。获得高通量转化可以促进对玉米分子和细胞生物学研究日益增长的需求1。转基因作物物种的能力对公共和私营实验室都至关重要。这允许对基因调控机制的基本理解,以及在全球范围内提高作物,以支持不断增长的人口。
1975年,玉米中未成熟的胚胎可用于生产可再生产的可产的可基因的卡鲁斯。自这一启示以来,大多数可扩展的玉米转化协议都要求在再生3之前形成和选择。在基因转化过程中,在培养培养胚胎诱导的培养基体感染或生物细菌轰击的未成熟胚胎。然后,在选择性介质上培养诱导的卡利(例如,含有除草剂),以便只有经过转化的卡片才能存活。这些抗除草剂的假定转基因卡利被膨胀并再生成植物。虽然这种方法是有效的,但过程漫长而耗费大量人力,完成4个工序可能需要3个月以上。更重要的是,传统的玉米转化协议具有更大的局限性,即只有有限数量的玉米基因型可以转化5,6。
Lowe等人7、8此前曾报道过一种"快速玉米"转化方法,它不仅大大缩短了转化过程的持续时间,而且扩大了可转化基因型的清单。QuickCorn方法利用阿拉伯拉多普西转录因子BABY BOOM(BBM)9和WUSCHEL(WUS)10的玉米正交法(Zm-Bbm和Zm-Wus2)。当纳入转化载体系统时,这些基因协同作用,刺激胚胎生长7。
这项工作中描述的QuickCorn协议基于Jones等人11中的协议,这是洛伊等人7、8报告的方法的进一步改进。在本研究中,一个农业细菌菌株LBA4404(Thy-)含有二进制向量结构PHP81430(图1)和附属质粒PHP7153912用于转换。PHP81430的T-DNA包含以下分子成分。(1)转化选择性标记基因Hra表达盒。玉米赫拉(Zm-Hra)基因是一种经过修饰的乙酰胺酶合成酶(ALS)基因,能耐受ALS抑制除草剂,如磺胺类和伊米达佐利诺13、14。Zm-Hra基因由高梁ALS启动子8和马铃薯蛋白酶抑制剂II(引脚II)终止剂15调节。T-DNA还含有(2)一个表达盒,具有转化可筛选的标记基因ZsGreen。这种绿色荧光蛋白基因ZsGreen来自Zoanthus sp.珊瑚礁珊瑚16是由高梁泛素促进剂/intron和大米泛素终止剂调节的。
此外,T-DNA包含(3)形态基因Bbm表达盒。Bbm是与胚胎发育有关的转录因子9,17。Bbm由玉米磷脂转移酶蛋白(Pltp)促进剂8和水稻T28终止剂18调节。Zm-Pltp是一种在胚胎上皮、丝毛和叶附属细胞(保护细胞)中具有强烈表达力的基因,在生殖器官中表达低,在根部8中没有表达。它还含有(4)形态基因Wus2表达盒。Wus2是另一个转录因子与维持的正锥形19。Zm-Wus2受玉米辅助诱导剂(Zm-Axig1)20和玉米In2-1终止器21的控制。最后, T-DNA 包含 (5)克 -loxP重组系统.克氏重组酶基因22受玉米热休克蛋白17.7(Hsp17.7)23启动子和马铃薯引脚II终止剂的控制。两个loxP位点(在相同的方向)24侧翼四个基因表达盒,包括ZsGreen,cre,Bbm和Wus2。
由于植物成熟和随后的后代不需要形态基因的存在,热诱导的cre-loxP重组系统被内置到T-DNA中,以去除玉米基因组中的形态基因,允许正常的甲酸细胞再生和植物发育。热处理后,CRE蛋白的表达除除赫拉选择基因外的所有转基因。成功的转化剂应该是抗除草剂,但ZsGreen-负。为了进一步提高转化频率,农业细菌菌株还含有一个额外的附属质粒(PHP71539),具有额外的农业细菌毒性(vir)基因12的副本。
QuickCorn 方法不同于传统的玉米转化协议,因为它在转化过程中不涉及 callus 感应步骤。在感染农业细菌后的第一周,体细胞胚胎在受感染的未成熟胚胎的上皮上形成。然后,胚胎被移植到一个培养基,激素,鼓励胚胎成熟和芽形成。迅速将体细胞胚胎转移到成熟/芽形成介质上,跳过了以前用于玉米转化的传统卡鲁斯阶段,允许直接生成T0植物8。与之前公布的玉米转化方法6相比,QuickCorn方法更快、更高效、基因型依赖性更低。使用这种方法,根植植物通常只需5-7周即可转移到土壤中,而不是传统协议要求的3个月或更长时间。本文的目的是提供该方法的深入描述和演示,以便在大多数学术机构通常的实验室环境中更容易复制。
1. 成长媒体准备
2. 种植供体植物和收获未成熟的耳朵
3. 为感染准备农业细菌悬浮培养物
注: 含有PHP81430(图1)和PHP7153912的农业细菌菌株LBA4404(Thy-)储存在-80°C处。这些材料可通过材料转移协议从科尔特瓦农业科学公司获得。LBA4404(Thy-)是一种辅助营养菌株,需要在生长介质中提供胸腺素。辅助营养农业菌株的主要用途是用于生物控制目的。它有减少农业过度生长的额外好处。辅助营养农业菌株不生长没有补充胸腺素。然而,胸腺素可以(大概)由培养中垂死的植物组织提供。因此,仍然需要在介质中提供抗生素,以完全控制辅助营养农业。然而,在缺乏胸腺素的情况下,由于辅助营养菌株的生长受损,控制起来会更容易。
4. 胚胎解剖、感染和共同培养
5. 选择、热处理和再生
6. 移植到温室和生产T1种子
这里演示的是三个公共玉米近亲繁殖系(B73、Mo17 和 W22)的农业细菌介导基因转化的分步方案,这些基因在玉米遗传学领域具有重要意义。使用传统的玉米转化协议5,无法实现三种近亲繁殖线的转化。图 1和图 2分别显示了此处使用的构造和起始材料。耳朵一般在授粉后9-12天收获。长度在 1.5-2.0 mm 之间的 IZEs 是本协议转换的最佳外植物(图 2)。
感染8天后,ZsGreen表达体细胞胚胎在荧光显微镜的GFP通道下被可视化(图3)。受感染的Izes在感染8天后接受热处理(步骤5.1和5.2)。这种治疗诱导了CRE重组酶的表达,切除了两个loxP位点之间的Bbm、Wus2、cre和ZsGreen表达盒(图1)。热处理组织随后在含有除草剂的芽形成培养基上培养,以在变形基因去除后选择转化组织。
在感染后3-4周左右观察到具有成熟胚胎或芽的增殖组织对伊马扎皮尔有抗药性(图4)。一些抗伊玛扎皮尔的对ZsGreen呈阴性,这表明在这些组织中可能发生胰部导型切除(图4)。在组织被转移到生根的中光孵化后,芽开始发展(图5)。健康和充满活力的生长芽与发达的根收获(图5)。有些组织似乎有多个芽 (图5E,F,G)。这种类型的"草"再生剂可能是由于克隆植物具有相同的转基因整合模式。分子生物学分析是需要基因型这些植物。
使用该协议以及本工作中使用的构造,所有三个公共近亲繁殖线都响应良好。W22产生的最高频率的抗伊马扎皮尔芽,频率约为14%(每100个受感染的未成熟胚胎约14个转基因芽)。B73和Mo17都产生了约4%的转基因芽。这些频率指示所有转基因芽,包括携带形态基因的植物和通过CRE介导切除的形态基因的植物。

图1:二元质粒PHP81430的T-DNA区域的原理图表示。RB = 右 T-DNA 边框;loxP = CRE 重组酶目标位点;Axig1pro:Wus2 = 玉米辅助诱导促进剂 (Zm-Axig1) = Zm-Wus2 = 玉米IN2-1终止器;Pltppro:Zm-Bbm = 玉米磷脂转移酶蛋白 (Zm-Pltp) 促进剂 + Zm-Bbm = 水稻T28终结器(Os-T28);Hsppro:cre = 玉米热休克蛋白 17.7 启动子 (Zm-Hsp17.7) + cre重组酶基因 + 马铃薯蛋白酶抑制剂 II (pinII) 终止剂;Ubipro:ZsGreen = 高梁泛素促进剂/intron(Sb-Ubi) = 绿色荧光蛋白ZsGreen基因 + 水稻泛素终止剂(Os-Ubi);Hra盒 = 高梁醋酸酯酶合成酶 (Sb-Als) 促进剂 + 玉米赫拉 (Zm-Hra) 基因 = pinII终止剂;LB = 左 T-DNA 边框;colE1, 质粒 ColE1 的复制来源25;规格R = 抗光谱霉素基因aadA1从 Tn21 用于细菌选择26;代表A,B,C = 复制起源从pRiA4的农业细菌根基基因27。请点击此处查看此图的较大版本。

图2:起始材料。B73耳朵在授粉后12天收获(A)。B73 (B)、 Mo17 (C) 和 W22 (D) 的未成熟胚胎请点击此处查看此图的较大版本。

图3:感染后1周休息介质的组织发育。在荧光显微镜(GFP过滤器)下显示GFP表达Mo17(A)和W22(B)体细胞胚胎的胚胎(感染后8天)在明场(C) 和 GFP 滤波器 (D) 下发育组织 (B73)请点击此处查看此图的较大版本。

图4:组织发育成熟介质与选择。W22成熟板 (A)在明场(B)和 GFP 过滤器 (C) 下发育组织 (Mo17, 感染后 15 天)在明场(D) 和 GFP 过滤器 (E) 下发育组织 (Mo17, 感染后 28 天)箭头指向缺乏GFP表达的再生组织,表明在热诱导的CRE蛋白活性后,loxP位点之间的ZsGreen基因被切除。请点击此处查看此图的较大版本。

图5:根培养的组织发育。W22 (A)、 B73 (B) 和 Mo17 (C,D) 的芽。B73(E) 和 W22(F,G. ) 的多个芽(草再生剂)的事件。用B73 (H) 和 W22 (I. ) 的根射门。请点击此处查看此图的较大版本。
表1:玉米转化的介质成分。请点击此处查看此表(右键单击下载)。
艾丽西娅·马斯特斯、威廉·戈登-卡姆和托德·琼斯是科尔特瓦农业科学公司的员工,他们提供本文中使用的 B73、Mo17 和 W22 的协议和玉米耳。作者康敏贞、摩根·麦考、雅各布·佐布里斯特和王康没有任何要透露的。
植物形态基因可用于改善顽固基因型的基因转化。这里描述的是三个重要的公共玉米近亲繁殖线的农业细菌介导遗传转化(QuickCorn)协议。
我们感谢科尔特瓦温室团队提供玉米不成熟的耳朵,科尔特瓦媒体准备实验室在制作媒体方面提供帮助,来自科尔特瓦的王宁(Ning Wang)为农业细菌建设提供帮助,爱荷华州立大学的Keunsub Lee提供协助。该项目部分得到国家科学基金会植物基因组研究计划赠款1725122和1917138授予K.W.,由预测植物经济学研究培训计划(国家科学基金会授予DGE-1545453)给J.Z.,由美国农业部NIFA Hatch项目#IOW04341,由爱荷华州基金,由爱荷华州立大学作物生物工程中心。
| 2,4-D | Millipore Sigma | D7299 | |
| 6-苄氨基嘌呤 (BAP) | Millipore Sigma | B3408 | |
| 乙酰丁香酮 | Millipore Sigma | D134406 | |
| 琼脂 | Millipore Sigma | A7921 | |
| 铝箔 | 盖住烧瓶 | ||
| 铵 | Millipore Sigma | A4418 | |
| 分析天平 | 称量少量化学品 | ||
| Autocalve | Primus (Omaha, NE) | PSS5-K | 高压灭菌培养基和工具 |
| 细菌培养环(10 &微量;l) | Fisher scientific | 22-363-597 | 从平板中收集农杆菌以转移到液体 |
| 细菌琼脂 | 中BD bioscience | 214030 | |
| 烧杯(1 L、2 L、4 L) | 混合培养基的化学品 | ||
| Benomyl | Millipore Sigma | #45339 | |
| 漂白剂(8.25% 次氯酸钠) | Clorox | 用于种子灭菌 | |
| 硼酸 | Millipore Sigma | B6768 | |
| 氯化钙二水 | 合物Millipore | Sigma C7902 | |
| 羧苄青霉素 | Millipore Sigma | C3416 | |
| 酪蛋白水解物 | Phytotech | C184 | |
| 头孢噻肟 | Phytotech | C380 | |
| 锥形管 (50 mL) | Fisher scientific | 06-443-19 | 包含液体培养基和农用悬浮 |
| 液 比色皿(半微量) | Fisher scientific | 14955127 | 用于容纳液体以测量外径 |
| Dicamba | Phytotech | D159 | |
| 数字湿度计 | 检查热处理的温度和湿度 | ||
| EDTA、二钠盐、二水合 | 物 Millipore Sigma | 324503 | |
| Eppendorf 管 (2.0mL) | ThermoFischer Scientific | AM12475 | |
| Eriksson's | Vitamins Phytotech | E330 | 1000x 液 |
| 乙醇 (70%) | 消毒工具和表面 | ||
| 亚铁七水合 | 物Millipore Sigma | F8263 | |
| 肥料,Osmocote Plus 15-9-12 | ICL 特种肥料(俄亥俄州都柏林A903206 | 肥 | |
| 料瓶 (2 L) | Pyrex | 10-090E | 用于高压灭菌介质和工具 |
| 平面(标准 1020,开口带孔,11 英寸宽 x 21.37 英寸长 x 2.44 英寸深) | 悍马国际(密苏里州地球城) | 11300000 | 托盘,用于存放土壤和花盆插入物,适合湿度计 |
| 镊子(细尖和大) | 精细用于处理胚胎;较大,适用于大型植物材料,可用作耳托 | ||
| 庆大霉素 | Gold Biotechnologies | G-400 | |
| 玻璃瓶 (1 L) | Pyrex | 06-414-1D | 至高压灭菌介质 |
| 量筒 | 调节 | 培养基体积 | |
| Imazapyr | Millipore Sigma | 37877 | |
| 培养箱,20 °C | Percival Scientific | 型号 I-36NL | 在农业感染期间生长母板和孵化胚胎 |
| 培养箱,27 °C | Percival Scientific | 型号 I-36NL | 用于种植共培养板和玉米胚胎培养 |
| 箱,45 °C | 热休克处理 | ||
| 插入物 TO 标准,花盆 | 悍马国际 (地球城,密苏里州) | 11030000 | 用于从根到土壤的移植植物,适合平放和加湿 |
| 层流罩 | 保持无菌条件 | ||
| L-proline | Phytotech | P698 | |
| 硫酸镁 七水合 | 物Millipore Sigma | M1880 | |
| 玉米自交种子 B73 | 美国国家植物种质 | id=47638 | |
| 玉米自交种子 Mo17 | 美国国家植物种质 | id=15785 | |
| 玉米自交种子 W22 | 美国国家植物种质 | id=61755 | |
| 硫酸锰一水合 | 物Millipore Sigma | M7899 | |
| Milli-Q 水净化系统 | Millipore sigma | MILLIQ | 用于组织培养级水 |
| MS 基础培养基 | Millipore Sigma | M5519 | |
| MS 基础盐混合物 | Millipore Sigma | M5524 | |
| N6 基础盐混合物 | Millipore Sigma | C1416 | |
| 回形针,防滑 | 固定在流苏袋 | ||
| 蛋白胨 | BD 生物科学 | 211677 | |
| 培养皿 (100x15 mm) | Fisher scientific | FB0875713 | 用于细菌培养基 |
| 培养皿 (100x25 mm) | Fisher scientific | FB0875711 | 用于植物组织培养基 |
| pH 计 | Fisher scientific | AB150 | 调节培养基的 pH |
| 值 移液器 (1 mL) | ThermoFischer Scientific | 4641100N | |
| 塑料盒 | 容器存储 | 10048430 | 用于组织培养储存和培养 |
| 塑料潮湿圆顶 (Humi-Dome) | Hummert International (密苏里州地球城) | 14385100 | 用于土壤平坦的塑料盖 |
| 碘化钾 | Millipore Sigma | 793582 | |
| 硝酸钾 | Millipore Sigma | P8291 | |
| 磷酸钾 二元 | MilliporeSigma | P5655 | |
| 秤 | 称量培养基用化学品 | ||
| 手术刀刀片(11 号,4 厘米) | Thermo Scientific | 3120030 | 去除用于胚胎解剖的核冠顶部 |
| 手术刀手柄 | 握住手术刀刀片 | ||
| Schenk &Hildebrandt 维生素 (S&H 维生素) | Phytotech | S826 | 100x 粉末 |
| 剪刀 | 剪耳芽 | ||
| 射击袋(帆布背 - 半透明) | Seedburo (伊利诺伊州德斯普兰斯) | S26 | 半透明袋盖住耳芽 |
| 酸银 | Millipore Sigma | S7276 | |
| 钼酸钠二水合 | 物 Millipore Sigma | M1651 | |
| 无索基质 LC1 | SunGro Horticulture (Agawam, 马) | #521 | 用于种植玉米植物 |
| 刮刀(双端微锥形) | Fischer Scientific | 2140110 | 从籽粒中解剖胚胎 |
| 刮刀(带勺子) | Fisher scientific | 14-375-10 | 测量培养基的化学物质 |
| 大观霉素 | Millipore Sigma | S4014 | |
| 分光光度计 (Genesys 10S UV-Vis) | Thermo Scientific | 840-300000 | 测量农业悬浮液的外径 |
| 棒 | Fisher scientific | 14-513-67 | 混合介质 |
| 加热板 | 混合介质 | ||
| 注射器(无针头,60 mL) | Fisher scientific | 14-823-43 | 用于过滤器灭菌 |
| 注射器过滤器(0.22 µm) | Fisher scientific | 09-720-004 | 用于过滤灭菌 |
| 流苏袋(帆布背 - 棕色) | Seedburo (Des Plaines, IL) | T514 | 覆盖非转基因植物流苏 |
| 的袋子 流苏袋(帆布背-绿色条纹) | Seedburo (Des Plaines, IL) | T514G | 袋子,用于覆盖转基因植物的流苏 |
| 盐酸硫胺素 | Phytotech | T390 | |
| 噻虫脲 | Phytotech | T888 | |
| 胸苷 | 米利普孔 Sigma | T1895 | |
| Timentin | Phytotech | T869 | |
| 吐温 20 | Fisher Scientific | Cas #9005-64-5 | 表面活性剂 |
| Vortex Genie 2 | Scientific Industries | SI0236 | 均质液体(农业悬浮液) |
| 水浴(大 - 精密型号 186) | Fisher scientific | 任何可以装下 4+ 2L 培养瓶并达到 55 °C | 将高压灭菌的培养基保持在最佳温度 |
| 称量皿 | Fisher scientific | 08-732-112 | 测量培养基的化学品 |
| 量纸 | Fisher scientific | 09-898-12A | 测量培养基的化学品 |
| 酵母提取物 | Fisher Scientific | BP14222 | |
| Zeatin | Millipore Sigma | Z0164 |