Oikopleura dioica 是生物学多个领域的被囊动物模式生物。本文介绍了该生物及其藻类饲料的取样方法、物种鉴定、培养系统设置以及培养方案。我们强调了有助于增强培养体系稳定性的关键因素,并讨论了可能遇到的问题及解决方案。
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Oikopleura dioica 是生物学多个领域的被囊动物模式生物。本文介绍了该生物及其藻类饲料的取样方法、物种鉴定、培养系统设置以及培养方案。我们强调了有助于增强培养体系稳定性的关键因素,并讨论了可能遇到的问题及解决方案。
Oikopleura dioica 是一种浮游性脊索动物,具有卓越的滤食能力、快速的世代周期、保守的早期发育过程以及紧凑的基因组。由于这些特性,它被认为是开展海洋生态学、进化发育生物学和基因组学研究的有用模式生物。鉴于研究通常需要稳定的动物资源供应,建立一个可靠且易于维护的培养系统十分必要。本文介绍了一步一步建立 O. dioica 培养体系的方法,包括如何选择潜在的采样地点、采集方法、目标动物的鉴定以及培养系统的搭建。我们结合自身经验提供了常见问题的解决方案,并强调了维持健康稳定培养体系的关键因素。尽管本文所提供的培养方案是针对 O. dioica 优化设计的,但我们希望所介绍的采样技术和培养设置能够为其他脆弱的远洋无脊椎动物的保育提供新的思路。
Model organisms have been instrumental in addressing many biological questions including those relating to development, genetics, and physiology. Moreover, additional model organisms facilitate new discoveries and therefore are crucial to achieve a greater understanding of nature1,2. Marine zooplankton are diverse groups of organisms that play an important role in ocean ecosystems3,4,5,6. Despite their abundance and ecological importance, gelatinous organisms such as planktonic tunicates are often under-represented in plankton biodiversity studies because their transparency and fragility make field collection and identification challenging7,8. Adapted sampling techniques and laboratory culturing allow closer observation of the animals in vitro, which has furthered the knowledge in the biology of planktonic tunicates9,10,11,12.
Larvaceans (Appendicularians) are a class of free-swimming marine tunicates comprising around 70 described species worldwide8,13. As they are one of the most abundant groups within zooplankton communities14,15,16,17, larvaceans represent a primary food source for larger planktonic organisms such as fish larvae18,19. Unlike ascidians-the sessile tunicates-larvaceans retain a tadpole-like morphology and remain planktonic throughout their lives20. Each animal lives inside a self-built, intricate filter-feeding structure known as a house. They accumulate particulates in their houses by creating water currents through the undulating motion of their tails21. Clogged houses are discarded throughout the day, some of which form carbon aggregates and eventually sink to the seabed22; thus, larvaceans play a major role in global carbon flux23. Most species are reported to live in the pelagic zone within the upper 100 m of the water column13; however, the giant larvacean Bathochordaeus is known to inhabit the depths of 300 m24. A study on Bathochordaeus in Monterey Bay, California revealed that the animals also serve as a biological vector of microplastics, suggesting a potential importance in understanding the role of appendicularians in the vertical transport and distribution of microplastics in the oceans25.
Oikopleura dioica, a species of larvacean, has attracted attention in recent years as a model organism due to several remarkable characteristics. It is commonly reported throughout the world’s oceans. It is especially abundant in coastal waters26, which allows easy sampling from the shore. Long-term, stable culturing is possible with both natural and artificial seawater27,28,29. Temperature dependent generation times are as short as 4-9 days in laboratory conditions. It has high fecundity with each female capable of producing >300 eggs throughout the year. As a tunicate, it occupies an important phylogenetic position for understanding chordate evolution30,31. At 70 Mb, O. dioica has the smallest identified genome amongst all chordates32. Among larvaceans, O. dioica is the only described non-hermaphroditic species thus far33.
The first successful O. dioica culture with laboratory grown microalgae was reported by Paffenhöfer34. The original culture protocol using synchronous motors and paddles was developed by Fenaux and Gorsky35 and later adopted by multiple laboratories. More recently, Fujii et al.36 reported O. dioica culturing in artificial seawater, a robust culture system and field collection were described by Bouquet et al.27 and an optimized protocol for a simplified, affordable system was reported by Marti-Solans et al.29. Aside from the traditional Oikopleura culture system, a newly reported design with a double tube rearing tank also has the potential to culture Oikopleura sp.37.
We present a detailed protocol for initiating an O. dioica monoculture based on a combination of protocols developed by major Oikopleura research groups at the Sars International Centre for Marine Molecular Biology27, the University of Barcelona29, Osaka University28, and our own observations. In previously published culture protocols, detailed information regarding the composition of algal media, shore sampling techniques, and Oikopleura identification were only roughly described, leaving a lot of ambiguity. Here, with the aid of visual information in the video protocol, we have assembled all the critical information needed to set up an O. dioica culture from the ground up in a straightforward, step-by-step manner. We describe how to distinguish O. dioica from another commonly reported species, O. longicauda, which is one of the most challenging steps. Although the existing culture systems are applicable for the cultivation of O. dioica worldwide, we highlight the importance of protocol adjustment based on local environmental conditions. The presented information combines widely published data as well as knowledge gained through experience. The current protocol is ideally suited for researchers interested in establishing a culture from scratch.
1. O. dioica 培养设施
2. 微藻食物
3. 野生Oikopleura spp. 的野外采集
4. 动物的分离与鉴定(图7,图8)
5. O. dioica 的培养方案


![figure-protocol-3 藻类浓度公式 Y<sub>A</sub>=藻类浓度[细胞/mL];科学研究中的方程。](/files/ftp_upload/61279/61279equ03.jpg)
![figure-protocol-4 藻类吸收方程,x=藻类吸光度[nm],用于光谱数据分析的示意图。](/files/ftp_upload/61279/61279equ04.jpg)


![figure-protocol-7 藻类浓度公式 K=每次投喂的藻类浓度[细胞/mL],生态学研究中的方程。](/files/ftp_upload/61279/61279equ07.jpg)


可通过小船或在港口使用孔径为 100 µm 的浮游生物网并配以非过滤性网底进行缓慢轻柔拖网采集 Oikopleura(图 5)。由于该动物体质脆弱,必须避免任何可能造成物理损伤的操作,例如粗暴处理网具,或因样品瓶中残留气泡导致的溅洒。
了解当地Oikopleura种群的季节性变化模式以及采样点水体物理特性的相应波动非常重要。2015年至2019年的采样结果显示,冲绳石川港和金港的O. dioica存在一致的季节性变化(图6)。表层海水温度似乎是一个主要影响因素。当表层海水温度达到≥28 °C时,O. dioica为优势物种;在24 °C至27 °C之间,O. longicauda与O. dioica共存;然而,在低于23 °C时,O. longicauda占主导地位(图6A)。连续数天强降雨后盐度的逐渐变化与O. dioica的丰度无明显相关性(图6B)。
根据上述采样程序,我们获得的大多数 O. dioica 处于其 4 天生命周期中的第 2 至第 3 天(图 7C)。成熟雄性通过性腺呈现黄色来识别,而雌性性腺因含有直径为 70–80 µm 的卵而呈现金色光泽(图 8A,B)。未成熟 O. dioica 可通过尾部的两个脊索下细胞加以确认(图 8D)。当地海水中另一种优势物种 O. longicauda 在大小和形态上与之相似。我们采用以下标准区分 O. longicauda 与 O. dioica38,39,40:尾部缺乏脊索下细胞、躯干部具有口前庭(velum),以及存在雌雄同体性腺(图 8E,F)。尾部形态的差异也有助于区分 O. longicauda 与 O. dioica。当一只完整无 house 的裸体动物侧向摆放时,O. longicauda 的尾部更趋笔直且弯曲度较小,与 O. dioica 相比显得更为“僵硬”。
建立稳定的Oikopleura培养体系最重要的三个因素是:(i) 维持高水质,(ii) 确定最佳喂养方案,以及 (iii) 设置含有足够数量雄性和雌性个体的产卵烧杯。引入多级过滤系统(图1)显著改善了培养系统的水质和稳定性。对于人工海水而言,过滤系统并非必需;然而,由于天然海水具有成本低、易获取和使用方便等优势,因此对于位于沿海地区的实验室而言是更优选择。为了建立合适的喂养方案,我们建议测定适用于各实验室具体条件的藻类生长曲线,因为不同实验室的温度和光照条件差异较大。我们将实测的生长曲线与先前发表的喂养时间表相结合,以优化藻类饲料的浓度和组成27(图4)。此外,我们还遵循严格的藻种接种时间表,以确保藻类食物的新鲜供应(表2)。自动化喂养系统使我们能够在无人员值守的情况下维持稳定且规律的每日喂养(图2B)。
一旦达到最佳的海水和喂养条件,应通过在2.5 L fSW中放入15只雄性和30只雌性来建立新的繁殖杯,以启动新一代的繁殖。这可确保次日早晨获得足够数量的第1天个体,足以在第2天分离出150只个体,第3天120只,第4天45只成熟成体用于产卵。如果第4天成熟雄性和雌性数量不足,应尽可能多地收集并转移成熟个体至1 L fSW中,让其自然产卵,以期获得足够数量的幼体延续下一代。根据所提供的实验方案,O. dioica 在23 °C下的生活周期为4天(图7C)。我们已成功建立了六个独立的野生 O. dioica 种群,每个种群均持续超过20代。

图1:海水过滤系统的示意图。
(A 和 B)海水首先通过一个25 µm的过滤单元,然后进入储水箱(C)使用磁力驱动泵从储水箱中抽取海水。随后,海水被推送经过两个聚丙烯过滤器和一个紫外线灭菌器,再回流至储水箱。请点击此处查看该图的放大版本。

图 2:O. dioica 培养系统。
(A)培养系统概览;(B)同步电机与藻类储液器的特写图,用于自动给药泵。硅胶管 A 和 B 的内径分别为 2 mm 和 4 mm。请点击此处查看该图的放大版本。

图 3:O. dioica 的保藏培养物。
从左至右分别为 C. calcitrans、Isochrysis sp.、Synechococcus sp. 和 R. reticulata,在 17 °C 恒光照条件下培养约 10 天后的状态。请点击此处查看该图的放大版本。

图4:两种主要饵料藻类 C. calcitrans 和 Isochrysis sp. 的生长曲线。
在660 nm处测得的光密度(OD)与总细胞浓度的散点图,分别为(A)C. calcitrans 和(B)Isochrysis sp.。每个数据点代表三次测量的平均值。使用细胞计数仪测定活细胞百分比和总细胞浓度(细胞/mL)。连续记录20天的数据(n = 47)。请点击此处查看该图的放大版本。

图5:用于采集Oikopleura的改良式浮游生物网。
手持式浮游生物网(网孔尺寸100 µm)的网底端被替换为一个500 mL的洗瓶。在网底端附加一个70 g的配重。约5 m长的绳子连接在钥匙环上。另设一条安全绳以进一步固定网底端。请点击此处查看该图的放大版本。

图6:冲绳地区O. dioica的季节性分布。
2015年至2019年间,在石川港(26°25'39.3"N 127°49'56.6"E)和金港(26°26'40.2"N 127°55'00.3"E)记录的O. dioica与O. longicauda的存在与缺失情况,及其与(A)温度和(B)盐度季节性变化的关系。若人工计数超过50个个体,则记录为该物种存在。同时记录表层水的温度和盐度数据。请点击此处查看该图的放大版本。

图7:O. dioica 单培养起始流程图。
(A)从采样点采集三份500 mL的浮游生物样品(B)对每份样品瓶中的样品进行稀释,并从中分离出O. dioica,去除其他浮游生物(C)通过手动将120只第3天的个体转移至含有5 L新鲜过滤海水(fSW)的新烧杯中,启动O. dioica的单培养。准备一个产卵烧杯,其中包含30只雌性、15只雄性和2.5 L新鲜过滤海水(fSW)。产卵后第一天(第1天),小心地将产卵烧杯中的新一代个体倒入另一个含有7.5 L新鲜fSW的烧杯中。产卵后第二天(第2天),将150只个体转移至含有5 L新鲜fSW的烧杯中。产卵后第三天(第3天),将120只个体转移至含有5 L新鲜fSW的烧杯中。在最后一天(第4天),准备一个新的产卵烧杯,其中包含30只雌性、15只雄性和2.5 L新鲜fSW,以准备下一代的繁殖。在23 °C条件下,这些生物的生命周期为4天。请点击此处查看该图的放大版本。

图8:Oikopleura 属物种的鉴定(A-D:O. dioica,E 和 F:O. longicauda)。
(A)携带卵子的雌性 O. dioica(B)携带精子的雄性 O. dioica(C)未成熟 O. dioica 的侧面观(D)未成熟 O. dioica 的腹面观,白色箭头指示两个脊索下细胞(E)携带卵子(箭头1)和精子(箭头2)的成熟 O. longicauda 腹面观(F)O. longicauda 的侧面观,显示口帽结构(箭头3)。请点击此处查看该图的放大版本。
| 试剂 | 化学产品 | 用量 | 终体积 (mL) | 灭菌方式 | 储存条件 / 开启后 |
| 溶液 A | Na2EDTA | 45 g | 1000 | 高压灭菌 | -20 °C / 4 °C |
| NaNO3 | 100 g | ||||
| H3BO3 | 33.6 g | ||||
| NaH2PO4 | 20 g | ||||
| MnCl2·4H2O | 0.36 g | ||||
| FeCl3·6H2O | 1.3 g | ||||
| 溶液 B | 1.0 mL | ||||
| 溶液 B | ZnCl2 | 2.1 g | 1000 | 高压灭菌 | 4 °C / 4 °C |
| CoCl2·6H2O | 2.0 g | ||||
| (NH4)6Mo7O24·4H2O | 0.9 g | ||||
| CuSO4·5H2O | 2.0 g | ||||
| *HCl | -- mL | ||||
| 维生素 | 硫胺素 (B1) ·HCl | 200 mg | 1000 | 高压灭菌 | -20 °C / 4 °C |
| 生物素 | 1 mg | ||||
| 钴胺素 (B12) | 1 mg | ||||
| 硅酸钠 | Na2SiO3 | 5% | 1000 | 0.22 µm 滤膜过滤 | 4 °C / 4 °C |
| 链霉素 | C21H39N7O12 | 25 mg/mL | 50 | 0.22 µm 滤膜过滤 | -20 °C / -20 °C |
表1:藻类食物培养所需试剂配方。 将溶液B所列所有化学物质溶解后,加入盐酸(HCl)直至溶液澄清、无浑浊。所有试剂均通过高压灭菌(120 °C,25分钟)或使用0.22 µm滤器进行灭菌。除维生素母液外,其余试剂均在添加指定化学物质后进行灭菌。对于维生素母液,应先对水进行高压灭菌,再溶解所列化学物质。母液及已开封试剂的储存温度已在表中列出。
| 培养类型 | 藻类物种 | ASW (mL) | 维生素 | 溶液A | 硅酸钠 | 链霉素 | 藻类 (mL) / 培养类型 | 培养 / 保存 | 频率 |
| 保藏培养 | Chaeto | 60 | 1/2000 | 1/2000 | 1/4000 (仅限Chaeto) | 1/1000 (除Syn外全部) | 0.03 / 保藏 | 17°C / 4°C | 每两周一次 |
| Iso | 60 | 0.03 / 保藏 | |||||||
| Rhino | 80 | 0.06 / 保藏 | |||||||
| Syn | 60 | 0.03 / 保藏 | |||||||
| 传代培养 | Chaeto | 500 | 1/2000 | 1/2000 | 1/4000 (仅限Chaeto) | 1/1000 (除Syn外全部) | 10 / 保藏 | 17°C / 17°C | 每周一次 |
| Iso | 500 | 10 / 保藏 | |||||||
| Rhino | 500 | 20 / 保藏 | |||||||
| Syn | 500 | 10 / 保藏 | |||||||
| 工作培养 | Chaeto | 400 | 1/2000 | 1/2000 | 1/4000 (仅限Chaeto) | 1/1000 (除Syn外全部) | 100 / 传代 | RM / RM | 每4天一次 |
| Iso | 400 | 100 / 传代 | |||||||
| Rhino | 400 | 150 / 传代 | |||||||
| Syn | 400 | 100 / 传代 |
表2:三种藻类培养类型的维护说明。 将指定量的添加剂加入含有高压灭菌海水的锥形瓶中。用指定量的藻类培养物接种每瓶。在指定温度下培养并保存藻类培养物。从上一代的主培养物接种新的主培养物和传代培养物,从上一代的传代培养物接种新的工作培养物。分别每两周、每周和每四天接种一次新的主培养物、传代培养物和工作培养物。此时间安排可为约10个装有O. dioica培养物的烧杯提供充足的食物。每种藻类培养类型应保留2–3套作为备用。RM – 室温。
| 天数 | 藻类物种 | 上午9点和下午5点 | 中午12点 |
| 1 | Chaeto | — | — |
| Iso | 1000 | 2000 | |
| Syn | 20,000 | 40,000 | |
| 2 | Chaeto | 1000 | 2000 |
| Iso | 2000 | 2000 | |
| Rhino | 1000 | 1000 | |
| 3 | Chaeto | 3000 | 4000 |
| Iso | 3000 | 4000 | |
| Rhino | 1500 | 1500 | |
| 4 | Chaeto | 1000 | 2000 |
| Iso | 1000 | 2000 | |
| Rhino | 1000 | 1000 |
表3:每次喂食的藻类浓度——改编自Bouquet等27。 在冲绳O. dioica的4天生活周期中,每日喂食所用的藻类浓度(细胞数 mL-1)及藻类物种。
补充文件1:每日喂养记录表。 输入每个培养烧杯中微藻的每日吸光度(OD)、动物大小(Day)以及海水体积(SW vol.)后,系统将自动计算每个培养烧杯的每日喂养量。R. reticulata 和 Synechococcus sp. 的生长曲线改编自 Bouquet 等人27。请点击此处下载该文件。
补充文件 2:如何将同步电机连接至亚克力桨叶。 使用六角扳手将桨叶紧密地拧到电机上。 请点击此处下载该文件。
为了便于灵活建立O. dioica的培养体系,了解该动物的自然生境至关重要。季节性数据可提供物理参数范围的信息,可用于指导实验室培养条件的设置,同时有助于理解动物丰度的季节性波动。在冲绳地区,O. dioica最稳定出现的时间为每年6月至10月;然而,在东京湾,其种群数量在2月和10月达到高峰41。尽管O. dioica的培养通常在20 °C或更低温度下进行报道27,28,29,但冲绳地区的O. dioica在高于20 °C的温度下表现出更好的存活率;这可能与冲绳海域表层海水最低温度约为20 °C有关(图6)。O. dioica的丰度还可能受到浮游植物水华42以及捕食者丰度43,44的影响。无论O. dioica的采集地点为何,了解当地种群的季节性规律均可最大程度地提高采样和培养的成功率。
在合适的季节和地点,使用网具采样是一种以最小 effort 收集大量 Oikopleura 的有效方法。使用网孔更小(60–70 µm)的浮游生物网也可用于采集该动物各个发育阶段的个体。由于生命周期末期个体极为脆弱,成熟个体在网采样品中很少被发现。因此,物种鉴定需在采样后通过显微镜观察尾索细胞(subchordal cells)完成。动物在实验室中会继续生长,通常在采样后一至两天内出现成熟个体。尽管网具采样效率较高,但在不同情况下可能需要采用其他替代采样方法。例如,在城市附近进行网采时可能收集到大量浮游植物,从而难以分离出 Oikopleura。在此类情况下,建议采用简单的水桶采集表层海水,或在港湾以外区域进行船只采样。研究结果表明,连续降雨导致的盐度渐变对 O. dioica 的丰度无显著影响;然而,应避免在热带气旋等极端天气事件发生后立即进行岸边采样。此类事件会导致封闭水体中发生突然而剧烈的生物地球化学变化45,46。暴雨径流可能携带污染物、沉积物和过量营养物质,导致水体浊度升高、水质下降47。由于摄食方式特殊且运动能力有限,滤食性浮游动物(如 Oikopleura)可能对此类变化尤为敏感。在此情况下,建议将采样推迟数天,直至当地环境条件恢复正常。
引入多步过滤系统对于维持小型滤食性生物(如O. dioica)的培养至关重要。在先前的培养系统中,若使用过滤不充分的海水(例如仅用25 µm孔径的筛网),培养过程往往不稳定,尤其在夏季更为明显,这可能与浮游植物丰度较高有关。尽管某些浮游植物有助于O. dioica的生长,但另一些种类可产生生物毒素,导致O. dioica胚胎发育异常48。此外,硅藻(如Chaetoceros spp.)浓度过高也可能对O. dioica的生长造成危害,因其具有较长的刚毛,可能堵塞住囊结构,妨碍有效摄食49。我们经常观察到小型个体的住囊被C. calcitrans的刚毛堵塞;因此,目前仅在第2天及以后的个体中投喂C. calcitrans(表3)。
尽管本研究中未出现该问题,但小规模长期培养O. dioica可能因遗传瓶颈而导致种群数量突然下降;在此情况下,Martí-Solans 等人29建议每隔20代向培养群体中引入新的野生个体。
Oikopleura 培养系统具有良好的灵活性。稳定的培养可在一周内建立。利用非专用设备和较低的经费即可实现 O. dioica 的长期培养。两人每日维护 5–10 个烧杯中的 Oikopleura 培养物所需工作时间通常少于 2 小时。O. dioica 也可在人工海水中维持培养,这对无法获取天然海水的研究者尤为有利28。藻类饵料可通过固体培养和冷冻保存实现长期储存29。此外,O. dioica 的精子可进行冷冻保存,并保持超过一年的活性50。上述所有因素使得培养物能够被轻松重建。最后,以往意外成功培养 Pleurobrachia sp. 的经验表明,为 Oikopleura 所发展的培养体系未来或许可推广应用于更广泛的脆弱浮游生物群体。
O. dioica 继续为各个生物学领域提供重要的研究启示。了解当地的季节性变化、建立精细的培养体系,并依靠少数专注的研究人员,便可轻松建立高效的培养系统。Oikopleura 培养体系为研究这一独特海洋脊索动物的生态学、发育学、基因组学和进化生物学等广泛领域提供了基础资源。
我们感谢Garth Ilsley在建立培养系统过程中提供的支持。我们感谢Ritsuko Suyama和Sylvain Guillot在早期采样及物种鉴定工作中的贡献。特别感谢Hiroki Nishida、Takeshi Onuma和Tatsuya Omotezako在整个研究过程中给予的慷慨支持与指导,包括本地培养系统的初步建立以及动物和微藻培养物的共享。我们还感谢Daniel Chourrout、Jean-Marie Bouquet、Anne Aasjord、Cristian Cañestro和Alfonso Ferrández-Roldán分享他们在采样与培养方面的专业知识。Jai Denton、Charles Plessy和Jeffrey Jolly对稿件提出了宝贵的修改意见。Charlotte West提出了用于藻类计算的通用方程。最后,我们感谢OIST提供的经费支持,感谢Mary Collins及OIST野外工作安全委员会在安全采样程序方面提供的建议,感谢OIST机械车间工作人员在培养与采样设备制造方面的协助,以及感谢Koichi Toda为实验输送海水。
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| 五水合硫酸铜(II) | Wako | 039-04412 | |
| 乙二胺四乙酸二钠水合物 | Wako | 044-29525 | |
| 四水合七钼酸六铵 | Wako | 019-03212 | |
| 六角扳手 | Anex | No.6600 | |
| 盐酸 | Wako | 080-01066 | |
| 六水合氯化铁(III) | Wako | 091-00872 | |
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| TCW-5N-PPS | |||
| TCW-1N-PPS | |||
| 无螺钉接线端子块 | SATO PARTS | SL4500 | |
| 简易浮游生物网 | RIGO, Japan | 5512-C | |
| 偏硅酸钠 | Sigma | 307815-1KG | |
| 硝酸钠 | Wako | 195-02545 | |
| 无水磷酸二氢钠 | MP Biomedicals | 194740 | |
| 硫酸链霉素盐 | Sigma | S6501-25G | |
| 同步电动机 | Servo | D5N6Z15M | |
| 盐酸硫胺素 | Wako | 201-00852 | |
| 紫外灭菌器 | Iwaki | UVF-1000 | |
| 氯化锌 | MP Biomedicals | 194858 |
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