这种高通量、遥测式、全植株水分关系的称重表型分析方法,能够直接、同步地进行实时测量,并分析参与动态植物-环境相互作用的多种与产量相关的生理性状。
这种高通量、遥测式、全植株水分关系的称重表型分析方法,能够直接、同步地进行实时测量,并分析参与动态植物-环境相互作用的多种与产量相关的生理性状。
不断增长的全球人口的粮食安全是一个重大关切。基因组工具所提供的数据远远超过了表型数据的供应,从而造成了知识鸿沟。为了应对改善作物以养活不断增长的全球人口这一挑战,必须弥合这一差距。
生理特征被认为是生物对环境条件响应性或敏感性的关键功能特征。近年来引入的许多高通量(HTP)表型分析技术基于遥感或成像,能够直接测量形态特征,但主要通过间接方式测量生理参数。
本文介绍了一种直接进行生理表型分析的方法,该方法在植物-环境互作的功能性表型分析中具有多项优势。该方法帮助使用者克服在使用称重式称重传感器系统和盆栽实验中遇到的诸多挑战。所建议的技术可使使用者区分土壤重量、植物重量和土壤含水量,从而实现对动态的土壤、植物和大气条件进行连续且同步的测量,同时测量关键的生理性状。该方法使研究人员能够在充分考虑环境对植物生理影响的前提下,高度模拟田间胁迫情景。该方法还最小化了盆栽效应,而盆栽效应是田间前表型分析中的主要问题之一。该系统包含一个反馈式施肥灌溉系统,可在类似田间的种植密度下实现真正随机的实验设计。该系统能够检测土壤含水量的限制阈值(θ),并通过实时分析工具和在线统计资源,将数据转化为知识。这种对多种植物在动态环境中生理响应进行快速、直接测量的方法,在田间前育种和作物改良背景下,具有广泛应用于筛选与非生物胁迫响应相关优良性状的巨大潜力。
在环境条件日益恶化的背景下,保障全球不断增长人口的粮食安全,目前已成为农业研究的主要目标之一1,2,3。新型分子工具的出现极大地推动了作物改良计划的发展。然而,尽管基因组学工具能够提供海量数据,但人们对实际表型性状的理解仍十分有限,从而造成了显著的知识鸿沟。弥合这一鸿沟是现代植物科学面临的最大挑战之一4,5,6。为了应对作物改良过程中出现的挑战,并最大限度地缩小基因型–表型之间的知识差距,我们必须将基因型研究方法与以表型为中心的方法相结合7,8。
近年来,各种高通量表型分析(HTP)平台使得对大量植物群体进行随时间推移的非破坏性表型分析成为可能,这些平台有助于缩小基因型与表型之间的知识鸿沟6,8,9,10。得益于机器人技术以及用于移动植物或传感器(分别对应)的传送带或龙门架系统,HTP筛选技术能够在相对较短的时间内对大量植物的性状进行测量,相较于基于气体交换或摄影的人工操作技术具有显著优势。然而,HTP系统产生的海量数据也带来了额外的数据处理和分析挑战11,12。
这些高通量平台大多通过电子传感器或自动图像采集来评估表型性状13,14。先进的田间表型组学包括在田间部署近感传感器和成像技术,以及实现高分辨率、高精度和大群体规模的测量15。传感器和图像数据需要与其他多组学数据整合,以建立一个整体性的第二代表型组学方法16。然而,随着植物表型组学研究初期对将传感器信息转化为知识所面临挑战的严重低估,数据获取、处理和分析的方法学进展正变得愈发重要13。此外,目前可用的成像技术在深入表征基因型–环境动态互作及植物胁迫响应方面的可靠性和准确性仍存疑17,18。而且,受控环境下的研究结果往往与田间观察结果存在显著差异,尤其是在干旱胁迫表型分析方面。这主要是由于在干旱胁迫期间,植物所经历的土壤体积、土壤环境以及因土壤水分减少导致的机械阻力存在差异。因此,受控环境下的结果难以外推至田间条件19。最后,基于图像的高通量表型系统入门成本非常高,不仅因为传感器本身价格昂贵,还因为所需的机器人系统、传送带和龙门架等设备,同时这些系统对生长设施基础设施的要求更高,并需要大量维护(许多活动部件在温室环境中运行)。
本文介绍了一种高通量遥测表型分析平台,旨在解决上述诸多问题。遥测技术能够实现从远程源自动测量并传输数据至接收站,以供记录和分析。本文展示了一种非破坏性的高通量遥测平台,该平台包含多个称重式蒸渗仪(一种重量测定系统)以及环境传感器。该系统可用于采集并即时计算多种数据(无需图像分析),例如整株植物生物量增量、蒸腾速率、气孔导度、根系液流以及水分利用效率(WUE)。系统控制器将大量数据直接输入软件并进行实时分析,这是将数据转化为知识的重要一步14,对于实际决策具有重要价值,显著拓展了一般受控环境下的表型分析实验、尤其是干旱胁迫温室研究中所能获得的知识范围。
遥测平台的其他优势包括其可扩展性、安装简便以及对植物生长设施基础设施要求极低(即,可轻松安装于大多数生长设施中)。此外,由于该传感器系统无任何活动部件,其维护成本相对较低,包括初始购置成本和长期维护成本。例如,一套包含20个单元的称重式系统,配备每株植物的反馈式灌溉施肥系统、气象站及软件,其价格将与一个主流品牌的便携式气体交换系统的售价相当。
水稻(Oryza sativa L.)被用作模式作物,干旱作为研究的处理条件。选择水稻是因为它是一种具有广泛遗传多样性的主要谷类作物,且是全球超过一半人口的主食20。干旱是一种重要的环境非生物胁迫因素,会损害植物的生长和发育,导致作物产量下降21。本研究采用该作物–处理组合来展示该平台的功能及其所能产生的数据量和数据质量。有关该方法理论背景的更多信息,请参见22。
在本实验方案中,我们使用了放置在20 cm × 20 cm称重台上的4 L花盆,每个花盆中种植一株植物。该方案易于扩展,也可用于更大的花盆(最大可达25 L,放置在40 cm × 40 cm称重台上),每盆可种植多株植物,仅需对方案中的参数进行线性调整即可。因此,该方案可轻松适用于多种类型和尺寸的植物。有关系统组件,请参见图1和图2。
1. 为实验准备花盆
2. 培养植物
3. 提高信噪比
注意:以下步骤可提高测量质量并降低噪声水平。
4. 实验设置
注意:实验设置过程需考虑系统各部分的重量,即盆栽基质的重量(包括盆容量时的土壤-水重量)以及幼苗的初始重量。请遵循以下步骤:
5. 开始实验
注意:此阶段收集的数据将作为后续实验的参考值。因此,必须仔细执行以下步骤。
6. 修改植物表格
7. 运行实验

8. 使用数据分析软件分析数据
实验持续了29天,于8月份进行,此时当地气候温暖稳定,日照时间较长。采用两种不同的灌溉方案,以展示表型分析平台在干旱胁迫条件下比较三种不同水稻品种(即籼稻、Karla和Risotto)生理行为的能力。实验设置了两种干旱胁迫处理:(i)最优灌溉(每次灌溉后直至每盆达到夜间盆容量,作为对照);(ii)干旱处理从实验开始后第5天启动,持续14天,随后进行为期10天的恢复期(即第19–29天恢复为最优灌溉)。为简化起见,此处展示的图中并未包含所有品种和分组。结果表明,高通量表型遥测系统能够高效地监测大气条件、土壤状况以及植物生理状态的变化。
环境条件
通过大气探针在整个实验过程中监测环境条件[光合有效辐射(PAR)和蒸气压亏缺(VPD)]。收集的数据表明,PAR 和 VPD 在不同天之间以及每日过程中均保持相似(图 4)。
在实验期间,使用土壤探针测量了干旱处理组花盆的体积含水量(VWC)。来自一株干旱处理的籼稻品种(cv. Indica)的VWC数据如图5所示。
生理参数
在实验的第一阶段,所有四个处理组(Karla-对照、Karla-干旱、Risotto-对照和Risotto-干旱)的日蒸腾量均逐渐增加,此阶段所有植株均得到充分灌溉。随后,在水分亏缺处理组中,从第5天到第18天的干旱期间,蒸腾量出现下降。之后,在恢复期(从第18天开始),两个水分亏缺组的日蒸腾量再次上升,但仍远低于干旱处理前的水平(补充图9B)。
在实验的第一阶段(第1–5天),所有植株均接受相似的灌溉条件,此时Karla-对照组和Karla干旱处理组的平均计算植株重量(即植株增重速率)均持续增加。当对Karla品种植株施加干旱处理后(第5–18天),这些植株停止增重,并一直未恢复增重,直至进入恢复阶段。此时,其重量开始增加,但增速较对照组缓慢。相比之下,Karla-对照组植株的重量在整个实验期间持续稳定增加(图6)。

图1:重量法表型分析系统的组件与设置
(A称重式蒸渗仪。该蒸渗仪包含一个将物体机械负荷转换为电信号的称重传感器,以及覆盖在称重传感器上下部分的金属平台,以确保准确测量物体重量。B) 装置用聚苯乙烯块和塑料盖覆盖以隔热。C) 称量部件。将一个储水器(绿色容器)放置在称重式蒸渗仪盖子上,用于收集从花盆中渗出的液体。绿色容器连接一个带有大圆形开口的绿色盖子,花盆由此开口插入。绿色盖子的一侧附有一个黑色橡胶垫圈环,花盆则固定在另一侧,以尽量减少容器中水分通过蒸发流失。绿色盖子在排水延伸部分上方设有两个取样孔(一大一小),并用橡胶塞密封。D) 塞子。容器具有一段带排水孔的延伸部分,其上有四个位于不同高度的孔(配有塞子),当水通过某一特定孔排水停止后,可通过打开相应塞子调节容器内的水位(即储备水量)。所需水量取决于植物种类、所用栽培基质类型以及植物的需水特性(例如,估算的日蒸腾量)。E控制单元由一个绿色矩形盒组成,盒内包含电子控制器和电磁阀。盒体上设有孔洞,用于肥液进入和流出花盆,同时还设有接口,用于连接称重传感器及各类传感器。可通过肥液施加不同处理,如不同盐分浓度或不同矿物质组成。控制器连接一个金属支架,用于固定管道和电缆,防止其接触花盆并增加额外重量。. 所需的其他组分包括(F)土壤探针(例如:水分、温度和电导率传感器 - 5TE),可选(G多出口滴头(用于施肥灌溉和/或处理应用)以及(H)大气探针(用于测量蒸气压差(VPD)和辐射)。I) 配置齐全的单阵列。J温室中配备齐全的装置阵列,黄色箭头指向大气探头,该探头可基于局部大气条件实现气孔导度的标准化。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图2:单个花盆装置所需的组件。
(A–C) 所需组件如下:一个4 L的花盆,一个无底的4 L花盆用作网架,一个圆形尼龙网片(孔径 = 60目),其直径为花盆底部直径的两倍,一个带有指定植物栽植孔和滴灌头孔位的盖板,一根60 cm长的白色玻璃纤维杆(支柱),以及一个黑色垫圈环。(D) 花盆随机排列的台面布局表示例。在温室中,每个台面有1–18列和四行,本实验使用了24个位置。然而,阵列结构可根据实际温室大小灵活调整为任意形状。请点击此处查看该图的放大版本。

图3:盆栽装置设置。
(A) 在穴盘中生长的植物。(此处展示的番茄幼苗仅为示例;许多其他植物物种也可采用相同方式培养)。B模具的铸型C在培养基中创建孔洞,以紧密适配幼苗的根-土团,确保幼苗成功移栽至花盆中。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图4:实验期间的大气条件。
右侧y轴显示实验连续29天内的每日蒸气压差(VPD),左侧y轴显示光合有效辐射(PAR)。该图表由数据分析软件生成。请点击此处查看此图的放大版本。

图5:通过土壤探针在整个实验过程中测得的体积含水量(VWC)。
数据代表一株经历整个实验周期(包括恢复期)干旱处理的籼稻品种(cv. Indica)的VWC值。该图表由数据分析软件生成。请点击此处查看此图的放大版本。

图6:在充分灌溉(对照)和干旱条件下,品种Karla在整个实验期间的整株植物重量(均值 ± 标准误)。
采用方差分析(ANOVA,Tukey’s HSD;p < 0.05)对组间进行比较。每个均值 ± 标准误代表至少四株植物。图表和统计分析由数据分析软件生成。请点击此处查看此图的放大版本。
补充图1:设置实验的配套软件操作界面。 请点击此处下载该图。
补充图2:以电子表格形式呈现的“植物”表格;操作软件。 请点击此处下载该图。
补充图3:用于计算土壤干重的软件窗口;操作软件。 请点击此处下载该图。
补充图4:设置灌溉处理的软件窗口;操作软件。 请点击此处下载该图。
补充图5:数据分析图表查看器窗口。 在本实验中,我们使用了三种水稻品种(即籼稻、Karla和Risotto)以及两种不同的灌溉条件:充分灌溉(对照)和干旱。原始数据显示,在实验过程中植株重量存在变化。每条曲线代表一株植物/一个花盆。白天植物进行蒸腾作用,因此系统重量下降,这可以从每日曲线的斜率中看出。每个夜晚都会将花盆重新灌溉至饱和,这在曲线上表现为峰值。在基质达到饱和后,多余的水分会被排出。实验初期,所有植株均处于充分灌溉状态(对照)。从2018年8月7日起,一半的植株开始接受干旱处理,而其余植株则继续维持最佳灌溉条件。从2018年8月20日开始,对经历干旱处理的植株恢复灌溉,实现差异性恢复,以确保每株植物经历相似程度的胁迫,并持续至实验结束。请点击此处下载该图。
该系统的反馈式灌溉工具可让用户根据时间、花盆重量、土壤传感器数据(例如体积含水量 VWC)或植物前一天的蒸腾量,为每个单独的花盆设计灌溉程序。每株植物均可根据其自身表现进行个性化单独灌溉。这种差异性灌溉可最大限度减少各植株间土壤含水量的差异,从而使所有植株均处于受控的干旱处理条件下,而无需考虑其各自的需水量。
补充图6:数据分析的数据分析窗口。 请点击此处下载该图。
补充图7:数据分析直方图窗口。 该图展示了在充分灌溉(对照)条件下,三种不同水稻品种(即籼稻、Karla和Risotto)每日蒸腾值分布的图形化表示。下方图示为基于花盆在台面上物理位置的植物日蒸腾量热图可视化。 请点击此处下载该图。
补充图8:数据分析T检验窗口。 线条表示在充分灌溉(对照)条件下两种水稻品种(即 Karla 和 Risotto)之间每日蒸腾作用(一种基本且重要的生理特性)的差异。窗口显示了单株植物的每日蒸腾量(右上角),以及使用 Student’s t 检验对每组均值 ± 标准误进行的比较 t-检验(右下角)。统计分析由软件自动完成。根据学生氏t检验,红色圆点表示处理间的显著差异 t-测试; p < 0.05. 请点击此处下载该图片。
补充图9:数据分析ANOVA窗口。(A) 两种水稻品种(即Karla和Risotto)在充分灌溉(对照)和干旱条件下整个实验期间每日蒸腾作用差异的图示。干旱处理从实验开始后第5天起实施。点击任意一天可显示(B)基于ANOVA(Tukey’s HSD;p < 0.05)的组间比较结果,此处为8月12日的数据。每个均值±标准误(SE)代表至少四株植物。相同的数据组也可呈现为(C)整个实验期间连续的整株植物蒸腾速率(均值±SE)。图表与统计分析均由数据分析软件生成。请点击此处下载该图。
补充图10:数据分析分段线性曲线窗口。 该窗口显示了三种水稻品种(即籼稻、Karla和Risotto)在干旱条件下的分段线性曲线。该软件可对任何生理参数(此处为每日蒸腾量)与经干旱处理植株的计算体积含水量(VWC)之间的关系进行分段线性拟合分析。请点击此处下载该图。
补充材料。请点击此处下载这些材料。
| 培养基质 | 描述 | |
| 粗砂 | 石英砂 20-30(砂粒通过的上下层筛网孔径分别为:0.841 和 0.595 mm) | |
| 细砂 | 石英砂 75-90(砂粒通过的上下层筛网孔径分别为:0.291 和 0.163 mm) | |
| 泥炭基土壤 | Klasmann 686 | |
| 壤土(天然土壤) | 取自以色列雷霍沃特农业、食品与环境学院实验农场地块表层的砂壤土 | |
| 蛭石 | 蛭石 3G | |
| 珍珠岩 | 珍珠岩 212(粒径范围:0.5–2.5 mm) | |
| 堆肥 | Bental 11 育苗土 | |
| 多孔陶瓷小粒径基质 | Profile Porous Ceramic 20-50(研磨陶瓷通过的上下层筛网孔径分别为:0.841 和 0.297 mm) | |
| 多孔陶瓷混合粒径基质 | Profile Porous Ceramic 50% 20-50 目和 50% 20-6 目,粒径范围 0.841–3.36 mm | |
表1:盆栽培养基。
| 土壤介质类型 / 参数 | 粗砂 | 细砂 | 壤土 | 珍珠岩 | 蛭石 | 多孔陶瓷混合粒径 | 多孔陶瓷小粒径 | 泥炭基土壤 | 堆肥 |
| 总含水量(TW,ml) | 860 ± 7.2 (F) | 883.1 ± 24 (F) | 1076.3 ± 35.9 (E) | 1119.9 ± 8.5 (E) | 1286 ± 22.4 (D) | 1503.6 ± 15.4 (C) | 1713 ± 25.9 (B) | 1744.3 ± 8.2 (B) | 2089.6 ± 61.6 (A) |
| 体积含水量(VWC,ml3/ml3) | 0.26 (F) | 0.27 (F) | 0.33 (E) | 0.35 (E) | 0.4 (D) | 0.46 (C) | 0.53 (B) | 0.54 (B) | 0.65 (A) |
| 容重(BD,g/cm3) | 1.7 (A) | 1.6 (B) | 1.5(C) | 0.1 (H) | 0.2 (F) | 0.8 (D) | 0.7 (E) | 0.2 (G) | 0.1 (G) |
| 土壤重量稳定性(SWS,g/d) | ±2.3 ± 0.3 (B) | ±4.3 ± 0.3 (B) | ±2.9 ± 0.9 (B) | ±14.9 ± 0.7 (A) | ±7.6 ± 2.8 (B) | ±1.3 ± 0.1 (B) | ±1.9 ± 0.4 (B) | ±6.7 ± 0.8 (B) | ±4.3 ± 1.2 (B) |
| 浸水条件下保留水分的土壤重量稳定性(g/天;详见第6.14节) | 3 ± 0.4 (B) | 3.3 ± 0.4 (B) | 3.2 ± 1.2 (B) | 6.3 ± 0.5 (A) | 2.7 ± 0.8 (B) | 1.6 ± 0.3 (B) | 1.9 ± 0.3 (B) | 10.6 ± 3 (A) | 1.5 ± 0.3 (B) |
| 盆栽持水能力重力含水量(SWC;详见第8.2节) | 0.18 (G) | 0.23 (G) | 0.23 (G) | 3.79 (C) | 3.0 (D) | 0.74 (F) | 0.99 (E) | 4.25 (B) | 6.13 (A) |
| 相对排水能力 | 极佳 | 中等 | 中等偏低 | 极佳 | 极佳 | 极佳 | 极佳 | 低 | 中等 |
| 达到盆栽持水能力所需相对时间 | 快 | 快 | 快 | 慢 | 慢 | 快 | 快 | 慢 | 慢 |
| 相对阳离子交换能力(CEC) | 低 | 低 | 低 | 低 | 高 | 高 | 高 | 高 | 高 |
| 与以下操作的兼容性: | |||||||||
| 根系清洗(实验结束时) | ++ | ++ | + | ++ | + | ++ | ++ | - | - |
| 营养/生物刺激剂处理 | ++ | ++ | - | ++ | + | + | + | - | - |
| 盐胁迫处理 | ++ | ++ | + | ++ | + | ++ | ++ | + | - |
| 生长速率的精确测量 | ++ | ++ | + | -,+ | + | ++ | +++ | + | + |
| 干旱后土壤物理结构的恢复能力 | +++ | +++ | ++ | + | - | +++ | +++ | -,+ | - |
| * 总含水量(TW,ml)= 土壤饱和湿重 – 土壤干重。体积含水量(VWC)= TW / 土壤体积。 | |||||||||
| 容重(BD)= 土壤干重 / 土壤体积。土壤重量稳定性(SWS)= 连续4天土壤湿重的平均变化量(介质达到盆栽持水能力后无植物条件下,最后一次灌溉后的变化)。 | |||||||||
| 盆栽持水能力重力含水量(SWC);计算方法详见第7.2节。 | |||||||||
表2:9种不同盆栽基质的一般特性及其与称重平台的兼容性。 测量使用4 L的花盆,装入3.2 L基质至田间持水量(花盆容量)。数据以平均值±标准误表示。根据Tukey HSD检验(P < 0.05;3 ≤ n ≤ 5),表中各列中不同字母表示基质间差异显著。
| 灌溉施肥组分 | 最终浓度(ppm) | 最终浓度(mM) |
| NaNO3 | 195.8 | 2.3 |
| H3PO4 | 209 | 0.000969 |
| KNO3 | 271.4 | 2.685 |
| MgSO4 | 75 | 0.623 |
| ZnSO4 | 0.748 | 0.0025 |
| CuSO4 | 0.496 | 0.00198 |
| MoO3 | 0.131 | 0.00081 |
| MnSO4 | 3.441 | 0.0154 |
| 硼砂 | 0.3 | 0.00078 |
| C10H12N2NaFeO8 (Fe) | 8.66 | 0.0204 |
| 滴灌器流出的最终灌溉溶液(与自来水稀释后)pH 值在 6.5 至 7 之间波动。 | ||
表3:灌溉施肥组分。
基因型与表型之间的知识鸿沟反映了基因型与环境相互作用的复杂性(详见文献18,24)。通过采用高分辨率、高通量遥测诊断与表型筛选平台,有可能弥合这一鸿沟,此类平台可用于研究整株植物的生理表现及水分关系动力学8,9。基因型与环境相互作用的复杂性使得表型鉴定面临挑战,尤其考虑到植物对不断变化的环境所作出的快速响应。尽管目前已有多种表型分析系统,但大多数系统依赖于遥感与先进成像技术。尽管这些系统可在一定程度上实现同步测量,但其测量结果主要局限于形态学和间接的生理特征25。生理特征在植物对环境条件的响应性或敏感性方面具有重要意义26。因此,以极高时间分辨率(例如每3分钟一次)连续且同步进行的直接测量,能够对植物的生理行为提供极为精确的描述。尽管重力测定系统具有上述显著优势,但也必须考虑其潜在的若干缺点。主要缺点源于需使用花盆并在温室条件下操作,这可能在处理调控(特别是干旱处理的调控)和实验可重复性方面带来重大挑战。
为了解决这些问题,应标准化施加的胁迫条件,建立真正随机化的实验设计,尽量减少花盆效应,并在短时间内比较植物在变化环境条件下的多种动态行为。本文所述的高通量遥测功能表型分析方法即针对上述问题,具体如下所述。
为了将植物的动态响应与其动态环境相关联,并全面揭示复杂的植物-环境相互作用的整体图景,必须持续测量环境条件(图4)和植物响应(补充图9B)。该方法能够连续且同步地测量盆栽介质和大气中的物理变化,同时监测植物性状(土壤-植物-大气连续体,SPAC)。
为了最准确地预测植物在田间环境中的表现,重要的是在尽可能接近田间条件的环境下进行表型分析过程18。我们在温室中进行实验,采用半控制条件,以尽可能模拟田间环境。其中最重要的条件之一是栽培基质或盆栽介质。为称重法系统实验选择最合适的盆栽介质至关重要。建议选用排水迅速、能够快速达到盆容量且盆容量高度稳定的土壤介质,因为这些特性有助于称重系统获得更精确的测量结果。此外,还需考虑实验中将施加的不同处理方式。例如,涉及盐分、肥料或化学物质的处理应使用惰性盆栽介质,最好选择阳离子交换能力较低的介质。对低蒸腾作用植物施加干旱处理时,应选用相对体积含水量(VWC)较低的盆栽介质效果最佳。相反,对高蒸腾作用植物进行缓慢干旱处理时,则应选用相对VWC较高的盆栽介质效果最佳。如果实验后需要对根系进行分析(如根系形态、干重等),建议使用有机质含量相对较低的介质(例如沙子、多孔陶瓷或珍珠岩),以便在不损伤根系的情况下更容易清洗根部。对于持续时间较长的实验,应避免使用富含有机质的介质,因为有机质可能随时间推移而分解。有关此主题的更详细信息,请参见表1和表2。
田间表型分析和温室表型分析(田间前)各有其研究目标,且需要不同的实验设计。田间前表型分析有助于筛选出在田间表现潜力较高的候选基因型,从而提高田间试验的针对性和成本效益。然而,田间前表型分析存在若干局限性(例如盆器效应),可能导致植物表现与田间条件下的实际情况不同18,27。小尺寸花盆、水分蒸发损失以及称重式蒸渗仪秤体受热等因素,均是温室实验中可能引起盆器效应的例子18。本文所述方法旨在通过以下方式最大限度地减少这些潜在影响:
(a) 根据待测基因型选择花盆尺寸。该系统可支持多种花盆尺寸(最大至 25 L)和灌溉处理,从而能够研究任何类型的作物植物。
(b) 花盆和溶渗计秤台均经过隔热处理,以防止热量传递及花盆升温。
(c) 该系统包含一个精心设计的灌溉与排水系统。
(d) 每个花盆均配有独立控制器,以实现自灌溉和自监测处理的真正随机化。
(e) 软件在计算冠层气孔导度时会考虑植物所处的局部 VPD。请参见图 1J中多个 VPD 测站的分布位置。
该系统可在类似田间种植密度的条件下进行直接的生理测量,从而无需在植株之间预留较大空间,也无需移动植株以进行基于图像的表型分析。该系统包含实时数据分析功能,并能够准确检测每株植物的生理胁迫临界点(θ)。这使得研究人员能够监测植株生长状况,并在实验过程中就实验操作方式及样品采集策略做出决策。该系统简便的重量校准功能有助于实现高效的校准。高通量系统会产生海量数据,带来额外的数据处理与分析挑战11,12。将直接从控制器传输至软件的大量数据进行实时分析,是将数据转化为具有重要实用价值的知识的关键步骤14。
这种高通量遥测生理表型分析方法可能有助于在接近田间条件的温室实验中开展研究。该系统能够测量并直接计算植物对其动态环境的水分相关生理响应,同时有效克服与花盆效应相关的大多数问题。该系统的这些能力在田间前表型分析阶段极为重要,因为它提供了在植物生长早期预测产量损失的可能性。
作者无任何利益冲突需要披露。
本工作由以色列科学基金会(ISF)与国家自然科学基金委员会(NSFC)联合研究项目(资助号:2436/18)支持,并部分得到以色列农业与农村发展部(Eugene Kandel 知识中心)的支持,属于“问题之本——现代农艺利用根区知识中心”项目的一部分。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 大气探针 | SpectrumTech/Meter group | 3686WD | Watchdog 2475 |
| 40027 | VP4 | ||
| 阵列随机化工具 | 无 | 软件 "Array Randomizer" 可用于创建随机区组设计或完全随机设计的实验方案。该软件的开发旨在更好地控制实验样本(植物)的随机分布,以校正温室内部的大气微环境变异。 | |
| 免费下载及更多信息,请点击以下链接:https://drive.google.com/open?id=1y4QbTpxRK5Lx430xzu1RFdrlcL8pz_1q | |||
| 穴盘 | 丹麦规格,带弧形边缘,适用于苗圃 | 30162 | 4×4×7 孔,每盘 84 穴 https://desch.nl/en/products/seed_propagation_trays/danish-size-with-curved-rim-for-nursery~p92 |
| 粗砂 | Negev Industrial Minerals Ltd., 以色列 | ||
| 堆肥 | Tuff Marom Golan, 以色列 | ||
| 数据分析软件 | Plant-Ditech Ltd., 以色列 | SPAC Analytics | |
| 滴头 | Netafim | 21500-001520 | PCJ 8L/h |
| 细砂 | Negev Industrial Minerals Ltd., 以色列 | ||
| 壤土(天然土壤) | |||
| 尼龙网 | 不适用(通用产品) | ||
| 操作软件 | Plant-Ditech Ltd., 以色列 | Plantarray Feedback Control (PFC) | |
| 泥炭基质土 | Klasmann-Deilmann GmbH, 德国 | ||
| 珍珠岩 | Agrekal , 以色列 | ||
| Plantarray 3.0 系统 | Plant-Ditech Ltd., 以色列 | SCA400s | 称重式蒸渗仪 |
| PLA300S | 种植单元容器 | ||
| CON100 | 控制单元 | ||
| 种植单元组件之一 | 玻璃纤维棒 | ||
| 种植单元组件之一 | 密封圈 | ||
| 操作软件 | |||
| SPAC Analytics 软件 | |||
| 多孔陶瓷混合粒径介质 | Greens Grade, PROFILE Products LLC., 美国 | ||
| 多孔陶瓷小粒径介质 | Greens Grade, PROFILE Products LLC., 美国 | ||
| 花盆 | 不适用(通用产品) | ||
| 土壤 | Tuff Marom Golan 生产的 Bental 11 | ||
| 土壤探针 | Meter group | 40567 | 5TE |
| 40636 | 5TM | ||
| 40478 | GS3 | ||
| 蛭石 | Agrekal , 以色列 |