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Research Article
Maria del Pilar Quintana1, Nsoh Godwin Anabire1,2,3, Lars Hviid1,4
1Centre for Medical Parasitology, Department of Immunology and Microbiology, Faculty of Health and Medical Sciences,University of Copenhagen, 2West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, Department of Biochemistry, Cell and Molecular Biology,University of Ghana, 3Department of Immunology,Noguchi Memorial Institute for Medical Research, 4Centre for Medical Parasitology, Department of Infectious Diseases,Rigshospitalet
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
该协议的总体目标是指导如何测量自然接触恶性疟原虫感染的血清或血浆中的抗体的能力,以对抗和诱导寄生虫感染的红细胞(IEs)的噬菌体。 Plasmodium falciparum
该协议描述了如何建立和运行一个流细胞学为基础的噬菌体噬菌体测定恶性疟原虫 - 感染红细胞 (IE) 由自然获得的IgG抗体特异性VAR2CSA。VAR2CSA是一种寄生虫抗原,它调解胎盘中可引起严重疟疾的胎盘内 IEs 的选择性固原,称为胎盘疟疾 (PM)。防止PM由VAR2CSA特异性抗体进行调解,这些抗体被认为通过抑制地盘固存和/或通过治疗吞咽病的性病来发挥作用。该检测采用体外选择的晚期同步性,以表达VAR2CSA、in vitro具有自然获得PM特异性免疫力的妇女的血浆/血清抗体,以及噬菌体细胞系THP-1。然而,该协议可以很容易地修改,以检测抗体的功能,任何寄生虫抗原存在于国际化学品表面,无论是由自然接触或接种疫苗引起的。该测定方法对疟疾抗体中量免疫的一个重要功能方面进行了简单、高通量的评价,具有良好的可重复性。因此,在评估恶性疟原虫疟疾的临床免疫力时,它很有用,恶性疟原虫是热带地区,特别是撒哈拉以南非洲地区发病率和死亡率的主要原因。
疟疾是一种病媒传播的疾病,在感染五种不同种类的疟原虫时,由人类引起。最常见的物种是恶性疟原虫,它也负责发病率和死亡率1。疟疾临床表现从无症状或良性感染到复杂/严重疾病,后者主要发生在五岁以下儿童中。接触恶性疟原虫不会诱发无菌免疫,但生活在流行地区的个体对临床疾病的免疫力会慢慢发展。保护是年龄/暴露依赖和免疫力通常获得在生命的前5-10年2。成年妇女是一个重要的例外,因为严重的疟疾可能发生在怀孕期间,在临床介绍称为胎儿素疟疾(PM)。PM 是流产、死产、早产、低出生体重、胎儿死亡和产妇贫血的重要原因。对PM的耐药性在连续怀孕时发展 3。防止PM与获得抗体对VAR2CSA型PfEMP14,5,受感染的红细胞(IE)表面抗原,结合到软体素硫酸盐A(CSA),使国际在胎盘中固有。4,抗体调解保护执行各种功能活动(审查在,6,7),包括E的异化,以诱导吞噬。早期的体外研究表明,抗体可以通过,噬菌体8,9来限制单细胞的存在。9最近的研究表明,高浓度的噬菌体诱导抗体与更好的妊娠结果(在HIV共感染的情况下)10,11,,11表明这种效应功能在自然获得的免疫反应的相关性。
在这里,我们提出了一个协议,测量存在于人类血浆/血清中的抗体的这一功能in vitro,使用体外培养的IES表达VAR2CSA与单细胞线THP-1。与早期的显微镜方案8相比,,,该测定方法以前曾使用过,,,11、12、13、14、15、16、17、18,被认为是一种改进12和更容易的方法,因为它允许使用较小的抗体体积在一次运行中测试更多的抗体样本,并避免繁琐和偏颇的18显微镜计数。17,1113141516尽管该测定方法已被多个实验室使用,而且执行过程非常简单,但它需要仔细规划和准备,因此,详细的协议将允许缺乏经验的实验室和研究人员应用该测定。例如,我们使用表示 VAR2CSA 的后期同步 IE 与从自然获得 PM 特异性免疫力的妇女收集的血清中存在的抗体进行结果化。然而,该协议可以很容易地修改,以检测抗体的功能,任何寄生虫抗原存在于国际化学品表面,无论是由自然接触或接种疫苗引起的。
用于此处结果的人体血清样本在另外一项研究19中收集。馆藏由加纳大学野口医学研究所机构审查委员会(研究报告038/10-11)和丹麦首都大区区域研究伦理委员会(协议H-4-2013-083)批准。
1. 寄生虫文化
注:遵守当地有关人类病原体处理的规定。
2. THP-1细胞
注:THP-1细胞系用于此测定。此单细胞细胞系来自单细胞白血病28 患者,可从 ATCC 购买。根据 THP-1 培养介质中的提供者说明维护单元系( 参见材料表)。
3. 噬菌体测定(图S1)
在这里,我们详细介绍了一个协议,以前描述31,并使用11,12,13,14,15,16,17,18,14,15,16,17,1811,12,测量抗体的能力,目标为P.恶性疟原虫的表,诱导蛋白石化和吞噬的THP-1细胞。
该检测专门测量抗体中量的噬菌体,因此,需要与THP-1细胞表面的适当FC受体相互作用。因此,如协议所述,我们建议通过流式细胞仪定期检查THP-1细胞表面的Fc+受体的表达。细胞对于CD16(图1A)应该是阴性,对于CD32和CD64(图1B,C)为正数。
对于检测,纯化的晚期 IE 与 EtBr 标记,然后使用存在于疟疾天真或疟疾暴露个体的血浆/血清中的抗体进行结果化。通过流细胞学测量噬菌体,在与EtBr标记 和抗体-同源性E共同孵育40分钟后,量化EtBr+THP-1细胞的百分比。最初,THP-1细胞使用FSC与SSC密度图进行门控(图2A)。然后,使用 THP-1 单元上的 FL3 直方图和未结果的 IE 创建 EtBr+ 标记(图 2B)。然后,这些门用于分析所有其他控件和测试样本。
阴性对照(包括单例包括THP-1细胞、未结果的 IE 控制,以及疟疾和疟疾暴露的男性的对照)都应该在FL3通道中产生一个负峰(图3A),EtBr+标记中只有几个事件。因此,平均噬菌体值作为绝对的 EtBr+ THP-1 细胞和相对吞噬百分比应非常低(图 3B,C,通常低于 2%的所有病例)。相比之下,阳性对比(包括兔子抗人红细胞抗体和疟疾暴露的女性池)应产生两个峰值的痕迹(图3A):负对(基本上与所有阴性对联产生的对联重叠)和位于EtBr+标记内的明显阳性和分离良好的光斑。正样本,如介绍的例子(来自疟疾暴露的多重力妇女/NF20的样本)应产生与阳性对数类似的轮廓。平均噬菌体值,以绝对 EtBr+ THP-1 细胞和相对噬菌体测量,通常为阳性控制最高(58%/100%),其次是疟疾暴露女性池(29%/53%),然后是疟疾暴露妇女(23%/40%)。如图3B,C所示,其中提出了三个独立的实验,实验之间有相当大的差异,因此,我们建议运行样本,以进行比较的同一实验。在我们手中,至少有四个完整的96孔板可以由一个有经验的研究人员处理。同时进行了两次相同的实验,对疟疾暴露妇女的几种血清样本进行了两次相同的实验,也清楚地观察到了测定之间的变异性。使用相同的寄生虫制剂(在后期 IE 的磁纯化后)和血清稀释。THP-1细胞保存在两个独立的烧瓶中,但从同一个初始烧瓶中播种,实验由两个不同的研究人员进行。尽管测定在单独执行时似乎会产生一致的结果,但两个实验中测量的邻苯三代值之间的线性相关性(绝对值和相对邻源数为 r>0.9),调整后的线的斜率系数与一个值不同,表明不同实验中生成的值并不相同。与相对值(斜率系数置信区间 0.68-1)相比,绝对值(斜率系数置信区间 0.55-0.72)的此偏差更为明显(图 4)。因此,我们建议使用相对值,特别是当由于某种原因(例如,纯化的 Ie 不够充分、超过 4 个完整板等)时,不可能在单个实验中运行所有样本。我们还建议在最短的时间内运行用于比较分析的实验,以避免由于PfEMP1表达(以及其他抗原)的漂移以及培养时间延长时THP-1细胞的细微差异而引入额外的变异。

图1:THP-1细胞表面表达的Fc受体。
(A) Fc+ 受体 III/CD16 (红色)。(B) Fc+ 受体 II/CD32 (绿色)。 C. Fc+ 受体 I/CD64(橙色)。未标记的单元格以蓝色显示。 请单击此处查看此图的较大版本。

图2:流式细胞仪浇注策略。
(A) THP-1细胞在FSC/SSC. ( B )溴化铀阳性 (EtBr+)THP-1细胞在FL3直方图中。.显示仅 THP-1 细胞/未添加 IEs(蓝色)、使用未结果 IEs 孵育的 THP-1 细胞(绿色)和 THP-1 细胞,使用正对照(红色)对的 I 进行孵育的 THP-1 细胞。请单击此处查看此图的较大版本。

图3:IT4VAR04-IEs由THP-1细胞引起的噬菌体。
(A) B 中提出的一个实验的代表性流式细胞式直方图(由较大的符号标识)。(B) EtBr= THP-1 细胞的百分比(三个独立实验的平均值和标准偏差)。(C) 与 B 中的数据相同,对相应的正控进行规范化后。所有面板的颜色编码都相同:THP单独(黑色)、未结果/无抗体控制(蓝色)、疟疾天真控制(青色)、疟疾暴露的男性池(绿色)、疟疾暴露的女性池(橙色)、疟疾暴露的女性捐赠者(粉红色)和阳性控制/兔子抗人类红细胞(红色)。显示均值和标准偏差。 请单击此处查看此图的较大版本。

图4:THP-1细胞与10名疟疾暴露妇女的血清进行手术后,IT4VAR04 IEs的噬菌体病。
这些图对当天进行的两项相同实验进行了线性回归分析,但由不同的研究人员进行。(A) 数据以绝对值和 (B) 相对噬菌体值表示.使用统计分析软件执行的分析。 请单击此处查看此图的较大版本。
图S1:噬菌体测定流程图。 描述分析主要步骤的流程图。 请点击这里下载此图。
图S2:96井板实验布局。 (A) IES EtBr 标签的布局。(B) 供问题化布局;6 孔始终保留用于控制。(C) THP细胞电镀的布局。(D)吞噬的布局。 请点击这里下载此图。
图 S3:颜色编码,如图 3 所示。(A) 一个实验的流式细胞直方图覆盖,在4°C储存后立即和(B)储存12小时。(C) 储存前和储存后测量的EtBr +THP-1细胞的百分比。+NF#代表不同的疟疾暴露女性捐赠者。请点击这里下载此图。
作者没有什么可透露的。
该协议的总体目标是指导如何测量自然接触恶性疟原虫感染的血清或血浆中的抗体的能力,以对抗和诱导寄生虫感染的红细胞(IEs)的噬菌体。 Plasmodium falciparum
迈肯·维斯蒂感谢出色的技术援助。这项工作部分由丹麦外交部的赠款(MAVARECA II;17-02-KU)供资,由丹妮达研究金中心管理。资助者在研究设计、数据收集和分析、决定出版或准备手稿方面没有作用。
| 96 孔细胞培养板,圆底带盖 | Corning | 3799 | 可以使用任何类似的板,确保它与您打算使用的流式细胞仪仪器兼容 |
| AlbuMAX-II | Gibco | 11021-037 | |
| AlbuMAX-II (5%) | - | - | 5% AlbuMAX-II (Gibco, 11021-037),0.2g/L 次黄嘌呤 (Sigma, H9377) 溶于 RPMI1640 (Sigma, R5886) 中抗 |
| 红细胞抗体 | Abcam | ab34858 | Prepare 2μl 等分试样并冷冻 -20&°C。每个实验使用一份等分试样。 |
| DPBS | Sigma | P8622 | |
| Dynabeads 蛋白 G | Invitrogen | 10003D | |
| 溴化乙锭溶液 | Sigma | E1510 | 在 RPMI1640 (R5886) 中制备 0.1 mg/mL 的储备液。避光存放 |
| FC500 流式细胞仪 | Beckman Coulter | 可以使用任何支持 96 孔板格式并具有适当激光器/滤光片来测量 EtBr 荧光的流式细胞仪。 | |
| 胎牛血清 (FBS) | Gibco | 10099-141 | 使用前热灭活。 |
| FITC 小鼠抗人 CD16 | BD Biosciences | 555406 或 556618 | |
| FITC 小鼠抗人 CD32 | BD Biosciences | 552883 | |
| FITC 小鼠抗人 CD64 | BD Biosciences | 555527 | |
| FlowLogic 软件 | Inivai 技术 | 可以使用任何流式细胞术分析,例如 FlowJo 或 Winlist | |
| 庆大霉素 (10mg/mL)Sigma | G1272 | ||
| 次黄嘌 | 呤 Sigma | H9377 | |
| L-谷氨酰胺 (200mM) | Sigma | G7513 | |
| 裂解液 | - | - | 15 mM NH4Cl、10mM NaHCO3、1 mM EDTA |
| MACS CS 色谱柱和附件 | Miltenyi Biotec | 130-041-305 | |
| 寄生虫培养基 | - | - | 2 mM L-谷氨酰胺 (Sigma, G7513), 50µg/mL 庆大霉素(Sigma,G1272),0.5% AlbuMAX-II(AlbuMAX-II 5%)RPMI1640(Sigma,R5886) |
| 青霉素/链霉素(10000U 和 10mg/mL) | Sigma | P0781 | |
| RPMI-1640 培养基 | Sigma | R5886 | |
| THP-1 培养基 | - | - | 10% FBS(Gibco,10099-141),2mM L-谷氨酰胺(Sigma,G7513),100U/mL 青霉素,0.1mg/mL 链霉素(Sigma,P0781)RPMI1640(Sigma,R5886) |
| Vario MACS 磁力架 | Miltenyi Biotec |