本研究报道了一种基于流式细胞术和两种荧光报告分子或抗体双重染色的新型方法,用于测量多种线粒体功能参数,以检测线粒体体积、线粒体膜电位、活性氧水平、线粒体呼吸链组成以及线粒体DNA的变化。
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本研究报道了一种基于流式细胞术和两种荧光报告分子或抗体双重染色的新型方法,用于测量多种线粒体功能参数,以检测线粒体体积、线粒体膜电位、活性氧水平、线粒体呼吸链组成以及线粒体DNA的变化。
线粒体在多种神经退行性疾病的病理生理过程中具有重要作用。线粒体体积、线粒体膜电位(MMP)、活性氧(ROS)的线粒体生成以及线粒体DNA(mtDNA)拷贝数的变化,通常是这些过程的特征。本报告详细介绍了一种基于流式细胞术的新方法,用于在不同细胞类型(包括人诱导性多能干细胞(iPSCs)以及iPSC来源的神经细胞和胶质细胞)中同时检测多个线粒体参数。该基于流式细胞术的策略利用活细胞检测线粒体体积、MMP和ROS水平,同时利用固定细胞评估线粒体呼吸链(MRC)组分以及与mtDNA相关的蛋白(如线粒体转录因子A(TFAM))。
通过与荧光报告分子共染色,包括MitoTracker Green(MTG)、四甲基罗丹明乙酯(TMRE)和MitoSox Red,可定量分析线粒体体积、线粒体膜电位(MMP)以及线粒体活性氧(ROS)的变化,并将其与线粒体含量相关联。使用针对线粒体呼吸链(MRC)复合物亚基和外膜转位酶20(TOMM20)的抗体进行双重染色,可评估MRC亚基的表达水平。由于TFAM的含量与线粒体DNA(mtDNA)拷贝数成正比,因此通过测定单位TOMM20所对应的TFAM含量,可间接反映单位线粒体体积内的mtDNA含量。整个实验流程可在2–3小时内完成。重要的是,这些实验方案可通过流式细胞术,对线粒体参数在总体水平以及单位线粒体体积的特异性水平上进行定量检测。
线粒体是几乎存在于所有真核细胞中的重要细胞器。线粒体通过氧化磷酸化产生三磷酸腺苷(ATP),为细胞提供能量,并作为生物合成和代谢过程中的代谢中间体。线粒体还深度参与多种其他重要的细胞过程,例如活性氧(ROS)的生成、细胞死亡以及细胞内 Ca2+ 的调节。线粒体功能障碍与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病(PD)、阿尔茨海默病(AD)、亨廷顿病(HD)、弗里德赖希共济失调(FRDA)以及肌萎缩侧索硬化症(ALS)1。线粒体功能障碍加剧以及线粒体DNA(mtDNA)异常也被认为是人类衰老的重要促成因素2,3。
神经退行性疾病中存在多种类型的线粒体功能障碍,线粒体体积改变、线粒体膜电位(MMP)去极化、活性氧(ROS)产生以及线粒体DNA拷贝数变化均较为常见4,5,6,7。因此,在研究疾病机制和测试潜在治疗药物时,能够检测这些及其他线粒体功能指标具有重要意义。此外,鉴于目前尚缺乏能真实模拟人类神经退行性疾病的动物模型,建立能够在脑细胞中重现人类疾病特征的合适体外(in vitro)模型系统,是深入理解这些疾病并开发新疗法的重要步骤2,3,8,9。
人类诱导多能干细胞可用于生成多种脑细胞,包括神经元和非神经元细胞(即胶质细胞),且在两类细胞中均发现与神经退行性疾病相关的线粒体损伤3,10,11,12,13. 存在将iPSC分化为神经和胶质细胞谱系的适当方法14,15,16这些细胞为人类/患者提供了一个独特的研究平台 体外 疾病建模与药物筛选。此外,由于这些细胞来源于患者,由诱导多能干细胞(iPSC)分化而来的神经元和胶质细胞能够更准确地反映人体内实际发生的疾病状况。
迄今为止,可用于测量诱导多能干细胞(iPSCs)中多个线粒体功能参数的便捷且可靠的方法仍然较少,尤其是在活神经元和胶质细胞中的应用。流式细胞术为科研人员提供了一种强大的工具,可用于在单细胞水平上检测包括线粒体功能在内的多种生物学参数。本实验方案详细介绍了如何从iPSCs诱导生成多种类型的脑细胞,包括神经干细胞(NSCs)、神经元以及胶质星形细胞,并介绍了基于流式细胞术的新型方法,用于在不同细胞类型(包括iPSCs及其衍生的神经细胞和胶质细胞)中同时检测多个线粒体功能参数。该方案还提供了一种共染色策略,可通过流式细胞术检测线粒体体积、线粒体膜电位(MMP)、线粒体活性氧(ROS)水平、线粒体呼吸链(MRC)复合物以及线粒体转录因子A(TFAM)。通过引入线粒体体积或质量的测量,这些方法还可分别评估线粒体功能参数的总量水平以及单位线粒体的特异性水平。
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注意:本方案中使用的所有培养基和溶液的配方,请参见材料表和补充表 S1。
1. 将人iPSCs分化为NCSs、多巴胺能(DA)神经元和星形胶质细胞
2. 通过免疫细胞化学和免疫荧光染色对细胞进行表征
3. 活细胞中线粒体体积、线粒体膜电位(MMP)及线粒体活性氧的流式细胞术检测
4. 固定细胞中MRC复合物亚基和TFAM的流式细胞术检测
5. 流式细胞术数据采集与分析
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分化方法及流式细胞术策略的示意图见图3。人iPSCs被分化为神经玫瑰花结,随后转移至悬浮培养中进一步分化为神经球。神经球进一步分化并成熟为多巴胺能(DA)神经元。将神经球解离为单细胞,用于生成胶质星形胶质细胞,或以神经干细胞(NSCs)形式重铺为单层培养,再进一步分化为星形胶质细胞。本方案提供了通过流式细胞术获取和分析样本所需的方法,用于检测线粒体膜电位(MMP)、线粒体体积、线粒体活性氧(ROS)水平、MRC复合物亚基及TFAM(作为线粒体DNA拷贝数的间接指标)的表达水平。具体而言,采用荧光探针TMRE与MTG共染色,以检测和定量MMP及线粒体体积的变化;利用MitoSox Red与MTG共染色,可在活细胞中测量线粒体ROS的生成。使用针对MRC复合物亚基的抗体与TOMM20联合染色,可评估MRC的表达情况;而TFAM与TOMM20的染色则可用于间接评估mtDNA拷贝数。重要的是,MTG与TOMM20可用于基于单位线粒体体积的标准化测量,从而消除线粒体体积变化对这些参数的影响。
多巴胺能神经元通过双SMAD抑制法从诱导...
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本文提供了诱导多能干细胞(iPSC)来源的神经元和星形胶质细胞的生成方法,以及利用流式细胞术评估线粒体功能多个方面的实验方案。这些方案可高效地将人iPSC定向分化为神经元和胶质源性星形胶质细胞,并对线粒体功能进行详细表征,主要在活细胞中完成。该方案还提供了一种基于共染色流式细胞术的策略,用于获取和分析多种线粒体功能参数,包括活细胞中的线粒体体积、线粒体膜电位(MMP)和线粒体活性氧(ROS) 水平,以及固定细胞中的线粒体呼吸链(MRC)复合物和线粒体转录因子A(TFAM)。具体而言,该方法可估算每单位线粒体体积内的总水平和特异性水平。尽管该策略已用于检测多巴胺能(DA)神经元和星形胶质细胞中已知线粒体疾病(POLG)的线粒体功能障碍,但这些技术适用于任何类型的细胞和疾病研究。此外,该方案具有良好的稳健性和可重复性。已有多个先前研究成功应用此方案分析成纤维细胞、iPSC、神经前体细胞(NSC)、DA神经元和星形胶质细胞中的线粒体变化2,3,13...
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作者声明无利益冲突。
我们谨向挪威卑尔根大学分子影像中心和流式细胞术核心设施表示感谢。本工作获得了挪威研究理事会(资助编号:229652)、Rakel og Otto Kr. Bruuns 奖学金以及中国国家留学基金管理委员会(项目编号:201906220275)的资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 抗-Oct4 | Abcam | ab19857, RRID:AB_445175 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008)。 |
| 抗-SSEA4 | Abcam | ab16287, RRID:AB_778073 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 594 标记山羊抗小鼠 IgG(1:800,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11005)。 |
| 抗-Sox2 | Abcam | ab97959, RRID:AB_2341193 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008)。 |
| 抗-Pax6 | Abcam | ab5790, RRID:AB_305110 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008)。 |
| 抗-Nestin | Santa Cruz Biotechnology | sc-23927, RRID:AB_627994 | 一抗;使用比例为1:50,20 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 594 标记山羊抗小鼠 IgG(1:800,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11005)。 |
| 抗-GFAP | Abcam | ab4674, RRID:AB_304558 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中; 二抗使用 Alexa Fluor ® 594 标记山羊抗鸡 IgG(1:800,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11042)。 |
| 抗-S100β 偶联 Alexa Fluor 488 | Abcam | ab196442, RRID:AB_2722596 | 一抗;使用比例为1:400,2.5 μL 加入 1000 μL 染色液中; |
| 抗-TH | Abcam | ab75875, RRID:AB_1310786 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008)。 |
| 抗-Tuj 1 | Abcam | ab78078, RRID:AB_2256751 | 一抗;使用比例为1:1000,1 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 594 标记山羊抗小鼠 IgG(1:800,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11005)。 |
| 抗-Synaptophysin | Abcam | ab32127, RRID:AB_2286949 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008)。 |
| 抗-PSD-95 | Abcam | ab2723, RRID:AB_303248 | 一抗;使用比例为1:100,10 μL 加入 1000 μL 染色液中; 二抗使用 Alexa Fluor ® 594 标记山羊抗鸡 IgG(1:800,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11042)。 |
| 抗-TFAM 偶联 Alexa Fluor 488 | Abcam | ab198308 | 一抗;使用比例为1:400,2.5 μL 加入 1000 μL 染色液中;使用小鼠单克隆 IgG2b Alexa Fluor® 488 作为同型对照。 |
| 抗-TOMM20 偶联 Alexa Fluor 488 | Santa Cruz Biotechnology | 货号 sc-17764 RRID:AB_628381 | 一抗;使用比例为1:400,2.5 μL 加入 1000 μL 染色液中;使用小鼠单克隆 IgG2a Alexa Fluor® 488 作为同型对照。 |
| 抗-NDUFB10 | Abcam | ab196019 | 一抗;使用比例为1:1000,1 μL 加入 1000 μL 染色液中;二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008);使用兔单克隆 IgG 作为同型对照。 |
| 抗-SDHA | Abcam | ab137040 | 一抗;使用比例为1:1000,1 μL 加入 1000 μL 染色液中; 二抗使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗兔 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11008);使用兔单克隆 IgG 作为同型对照。 |
| 抗-COX IV | Abcam | ab14744, RRID:AB_301443 | 一抗;使用比例为1:1000,1 μL 加入 1000 μL 染色液中;使用 Alexa Fluor ® 488 标记山羊抗小鼠 IgG (1:400,Thermo Fisher Scientific,货号 # A-11001)作为二抗;使用小鼠单克隆 IgG 作为同型对照。 |
| 激活素 A | PeproTech | 120-14E | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| ABM 基础培养基 | Lonza | CC-3187 | 星形胶质细胞培养的基础培养基 |
| AGM SingleQuots 补充剂套装 | Lonza | CC-4123 | 星形胶质细胞培养补充剂 |
| 抗生素-抗真菌剂 | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | CDM 成分 |
| 高级 DMEM/F-12 | Thermo Fisher Scientific | 12634010 | 稀释 Geltrex 的基础培养基 |
| 牛血清白蛋白 | Europa Bioproducts | EQBAH62-1000 | 免疫染色实验中防止抗体非特异性结合的封闭剂,以及 CDM 成分 |
| BDNF | PeproTech | 450-02 | 多巴胺能神经元培养基成分 |
| B-27 补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| BD Accuri C6 Plus 流式细胞仪 | BD Biosciences, 美国 | ||
| 化学成分确定脂质浓缩液 | Thermo Fisher Scientific | 11905031 | CDM 成分 |
| 胶原酶 IV | Thermo Fisher Scientific | 17104019 | 温和解离人诱导多能干细胞(iPSCs)的试剂 |
| CCD 显微镜相机 Leica DFC3000 G | Leica Microsystems, 德国 | ||
| Corning 未处理培养皿 | Sigma-Aldrich | CLS430589 | 悬浮培养 |
| DPBS | Thermo Fisher Scientific | 14190250 | 用于多种细胞培养洗涤 |
| DMEM/F-12,含 GlutaMAX 补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 10565018 | 星形胶质细胞分化基础培养基 |
| EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | 温和解离人 iPSCs 的试剂 |
| Essential 8 基础培养基 | Thermo Fisher Scientific | A1516901 | iPSC 培养的基础培养基 |
| Essential 8 补充剂(50X) | Thermo Fisher Scientific | A1517101 | iPSC 培养补充剂 |
| EGF 重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PHG0314 | 神经干细胞(NSC)培养补充剂 |
| FGF-basic(AA 10–155)重组人蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PHG0024 | NSC 培养补充剂 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | 12103C | 培养基成分 |
| FGF-basic | PeproTech | 100-18B | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| FCCP | Abcam | ab120081 | 消除线粒体膜电位及 TMRE 染色 |
| 液体抽吸系统 BVC 控制器 | Vacuubrand, 德国 | ||
| 甲醛(PFA)16% | Thermo Fisher Scientific | 28908 | 细胞固定 |
| Geltrex | Thermo Fisher Scientific | A1413302 | 用于人 iPSCs 的贴壁与维持 |
| GlutaMAX 补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | NSC 培养补充剂 |
| GDNF | Peprotech | 450-10 | 多巴胺能神经元培养基成分 |
| 甘氨酸 | Sigma-Aldrich | G8898 | 用于封闭缓冲液 |
| Ham's F-12 营养混合物 | Thermo Fisher Scientific | 31765027 | CDM 的基础培养基 |
| 人 Heregulin beta-1 | Sigma-Aldrich | SRP3055 | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H1399 | 共聚焦成像中用于细胞核染色 |
| Heracell 150i CO2 培养箱 | Fisher Scientific, 美国 | ||
| IMDM | Thermo Fisher Scientific | 21980032 | CDM 的基础培养基 |
| 胰岛素 | Roche | 1376497 | CDM 成分 |
| InSolution AMPK 抑制剂 | Sigma-Aldrich | 171261 | 神经诱导培养基成分 |
| 胰岛素样生长因子-I 人源 | Sigma-Aldrich | I3769 | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| KnockOut DMEM/F-12 培养基 | Thermo Fisher Scientific | 12660012 | NSC 培养的基础培养基 |
| 层粘连蛋白 | Sigma-Aldrich | L2020 | 促进体外神经细胞的贴壁与生长 |
| Leica TCS SP8 STED 共聚焦显微镜 | Leica Microsystems, 德国 | ||
| 巯基甘油 | Sigma-Aldrich | M6145 | CDM 成分 |
| MitoTracker Green FM | Thermo Fisher Scientific | M7514 | 用于线粒体体积指示 |
| MitoSox Red | Thermo Fisher Scientific | M36008 | 用于线粒体活性氧(ROS)指示 |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A7250 | 神经诱导培养基成分 |
| N-2 补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 17502048 | 星形胶质细胞分化培养基成分 |
| 正常山羊血清 | Thermo Fisher Scientific | PCN5000 | 用于封闭缓冲液 |
| 轨道摇床 - SSM1 | Stuart Equipment, 英国 | ||
| 多聚-L-鸟氨酸溶液 | Sigma-Aldrich | P4957 | 促进体外神经细胞的贴壁与生长 |
| 多聚-D-赖氨酸盐酸盐 | Sigma-Aldrich | P7405 | 促进体外神经细胞的贴壁与生长 |
| 普莫瑞胺 | STEMCELL Technologies | 72204 | 促进多巴胺能神经元分化 |
| ProLong Gold 抗荧光淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36930 | 共聚焦成像中用于盖玻片封片 |
| PBS 1x | Thermo Fisher Scientific | 18912014 | 用于多种洗涤步骤 |
| 重组人/小鼠 FGF-8b 蛋白 | R&D Systems | 423-F8-025/CF | 促进多巴胺能神经元分化 |
| SB 431542 | Tocris Bioscience | TB1614-GMP | 神经诱导培养基成分 |
| StemPro 神经补充剂 | Thermo Fisher Scientific | A10508-01 | NSC 培养补充剂 |
| TrypLE Express 酶 | Thermo Fisher Scientific | 12604013 | 细胞解离试剂 |
| 转铁蛋白 | Roche | 652202 | CDM 成分 |
| TRITON X-100 | VWR International | 9002-93-1 | 用于免疫染色实验中细胞的通透处理 |
| TMRE | Abcam | ab113852 | 用于线粒体膜电位染色 |
| 水浴锅 Jb Academy Basic Jba5 JBA5 Grant Instruments | Grant Instruments, 美国 |
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