肌动球蛋白束的形成 体外 并介绍了使用光镊测量肌球蛋白集合力生成的方法,同时对此进行了讨论。
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肌动球蛋白束的形成 体外 并介绍了使用光镊测量肌球蛋白集合力生成的方法,同时对此进行了讨论。
肌球蛋白是一类运动蛋白,可通过水解ATP沿肌动蛋白丝(AF)轨道行进,在细胞运动和肌肉收缩等细胞过程中发挥关键作用。为了理解其产生力的机制,肌球蛋白II已在单分子(SM)水平以及多分子协同作用的层面得到研究。 体外 使用光镊等生物物理方法。
这些研究表明,当从三珠结构中的单分子水平研究转变为刚性珠或盖玻片表面滑动结构中多个马达蛋白协同工作时,肌球蛋白产生力的行为可能存在显著差异。然而,这些检测方法无法评估肌球蛋白在类似于细胞内的黏弹性结构层级中所表现出的群体动力学行为。我们开发了一种利用光镊的方法,用于研究肌球蛋白群体与多条肌动蛋白丝相互作用时产生力的力学机制。
这些肌动蛋白-肌球蛋白束可在分层且具有顺应性的环境中促进对马达蛋白间通信及整体力输出的研究。该检测方法具有可定制性,允许改变实验条件,以理解对肌球蛋白整体、肌动蛋白丝束或周围环境的修饰如何导致不同的力输出结果。
分子马达对生命至关重要,可将化学能转化为机械功1,2,3。肌球蛋白马达通过在肌动蛋白丝上类似轨道行走的方式与之相互作用,肌动蛋白-肌球蛋白网络的动力学过程执行肌肉收缩、细胞运动、胞质分裂过程中的收缩环以及细胞内物质运输等关键功能3,4,5,6,7,8。由于肌球蛋白具有多种关键功能,其与肌动蛋白网络的功能障碍可能导致疾病发生,例如肌球蛋白重链的突变可导致肥厚型心肌病(HCM)中的心脏过度收缩9,10,11,12,13,14。在肌肉收缩过程中,单个肌球蛋白马达通过协同工作形成集合体,提供实现肌动蛋白丝(AFs)相对滑动所需的机械能4,15,16,17,18。肌球蛋白马达在肌动蛋白丝之间形成横桥,并利用其机械化学循环引起的构象变化,共同向排列整齐的肌动蛋白丝的尖端方向移动17,18,19,20,21。
定量方法的开发 体外 使用光镊等技术在单分子水平上进行运动性分析,已促进获取关于单个肌球蛋白马达功能的前所未有的细节信息,包括测量单分子力的产生和步长大小22,23,24,25,26,27,28,29,30. Finer 等人开发了 "三珠" 或 "哑铃" 利用光镊实验探究单个肌球蛋白II分子产生力的力学机制23,31由于肌球蛋白II在肌动纤维(AFs)收缩过程中以协作团队形式发挥作用,但在单分子(SM)水平上不具备持续性,因此必须将光镊实验的取向从经典的马达蛋白结合小球方法重新调整。32为了构建哑铃型实验装置,使用两个光镊捕获一段AF,并将其置于固定在盖玻片上的珠粒所结合的肌球蛋白马达上方,通过测量AF在光阱中的运动来检测单个马达产生的力输出。23.
然而,单分子力测量以及使用单一马达蛋白/单一细丝的实验构型并不能全面反映系统层面的力生成机制,因为许多马达蛋白(包括肌球蛋白II)并非孤立工作,其功能也通常并非各部分功能的简单加和15,16,17,32,33,34,35,36。要更深入理解肌球蛋白与肌动蛋白细丝网络之间的协同作用,需要构建更为复杂的结构,使多个马达蛋白与多根细丝相互作用15,32。哑铃式实验构型已被用于研究小规模马达蛋白群体的力生成,其方法包括将多个肌球蛋白连接至微球,或在表面固定肌球蛋白粗丝,使其与悬浮的肌动蛋白细丝发生相互作用4,23,34,37,38,39,40。
其他小型集合体检测方法包括一种体外(in vitro)细丝滑动实验,其中肌球蛋白马达被包被在盖玻片表面,利用与肌动蛋白细丝(AF)结合的微珠来探测一组马达所产生的力4,35,36,38,39,40,41,42,43。在这两类实验中,肌球蛋白均被固定于刚性表面——微珠或盖玻片——并仅使用一条肌动蛋白细丝。在这些情况下,马达无法自由移动或彼此间进行通信,且将肌球蛋白刚性固定也无法模拟其在肌节中协同工作的顺应性、层级化环境32。先前的研究表明,肌球蛋白II能够感知其所处环境,并通过调节诸如力生成能力和占空比等特性,适应变化的黏弹性或马达浓度条件41,44,45。因此,有必要开发一种光镊捕获实验,以促进并捕捉马达间的通信以及系统的顺应性,从而更真实地揭示肌球蛋白II集合体力生成的机制基础。
在此,我们开发了一种耦合分层结构的方法 体外 通过形成肌动蛋白-肌球蛋白束或“三明治”结构,其中多个肌球蛋白马达在两根肌动蛋白丝之间相互作用,结合光镊技术进行检测。这种模块化的检测构型能够直接探究分子和环境因素如何影响肌球蛋白群体的力生成。此外,通过研究这些肌动蛋白-肌球蛋白复合体的力生成机制,有望帮助建立模型并深入理解大规模细胞活动(如肌肉收缩)如何从分子水平逐级放大并实现。9,10,13.
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1. 蚀刻盖玻片
2. 肌动蛋白丝的聚合
3. 肌球蛋白和微珠的制备
4. 流通池制备
5. 肌动球蛋白束的制备
6. 使用光镊(NT2 Nanotracker2)进行力测量
注意:尽管以下方案专门针对 NT2 系统,但该检测也可用于其他具备荧光功能的光镊系统,包括自行搭建的系统。其总体工作流程保持一致,即先将载玻片表面调至焦平面,进行微球校准,然后通过寻找荧光标记的肌动蛋白束来采集数据。对于 NT2 系统,补充图 S1、补充图 S2、补充图 S3、补充图 S4、补充图 S5、补充图 S6 和补充图 S7 提供了光镊系统及软件界面的详细信息。
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含有肌动球蛋白束系统的流动池采用标准设计,由显微镜载玻片和蚀刻盖玻片组成,二者之间通过双面胶带形成的通道隔开(图1)。实验体系自盖玻片开始,按照方案中所述的分步添加方式进行构建。最终的实验体系包含作为模板的罗丹明标记肌动蛋白丝;所需浓度的肌球蛋白(代表性结果中使用了1 μM,见图2和图3);生物素化、Alexa Fluor 488标记的肌动蛋白丝;1 μm链霉亲和素磁珠;氧气清除系统;ATP;以及APB缓冲液。每个流动池中会形成多个束状结构,上述肌动蛋白浓度可使各束之间保持足够的间距,避免发生非预期的相互作用。这也有利于在单个流动池内获取多个力测量数据,从而提高数据采集效率。力谱在同一个流动池内以及不同流动池之间应具有良好的可重复性。
尽管上述方案主要针对商用光镊装置,但本文所介绍的流动池及实验方法也可轻松应用于其他商用仪器或自制的光镊系统,只要该系统配备显微镜或显微镜载物台,并具备荧光成像能力即可。按照...
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一个 体外 使用光镊结合荧光成像的研究方法,用于探究肌球蛋白复合体与肌动蛋白丝相互作用的动力学过程。通过肌肉肌球蛋白II构建肌动蛋白-肌球蛋白-肌动蛋白束结构,其中束底部及盖玻片表面使用罗丹明标记的肌动蛋白,束顶部则使用488标记且生物素化的肌动蛋白丝。兔骨骼肌来源的肌动蛋白在通用肌动蛋白缓冲液(GAB)和肌动蛋白聚合缓冲液(APB)中进行聚合与稳定。GAB与APB必须每日在实验室内使用ATP、FC缓冲液和TC缓冲液新鲜配制。肌肉肌球蛋白II用于形成肌动蛋白-肌球蛋白-肌动蛋白三明治结构。鬼笔环肽用于肌动蛋白丝的荧光染色及稳定性维持。 体外.
肌球蛋白活性可通过标准的滑动微丝实验进行验证,该方法此前已有报道46,47。肌球蛋白II及其亚片段可以多种取向结合到盖玻片表面,且与使用重酶解肌球蛋白的实验相比,尾部结构域的存在可能会减缓微丝的滑动速度46,
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作者声明无利益冲突。
本工作部分由密西西比大学研究生理事会研究奖学金(OA)、密西西比大学莎莉·麦克唐纳-巴克斯代尔荣誉学院(JCW、JER)、密西西比空间资助联盟(资助编号 NNX15AH78H,JCW、DNR)以及美国心脏协会(资助编号 848586,DNR)提供支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 肌动蛋白(生物素标记):骨骼肌 | 细胞骨架 | AB07-A | 生物素标记的肌动蛋白 |
| 肌动蛋白,兔骨骼肌来源 | 细胞骨架 | AKL99-A | 肌动蛋白 |
| Alexa Fluor 488 鬼笔环肽 | Invitrogen | A12379 | 肌动蛋白稳定剂及 Alexa Fluor 488 荧光染料 |
| ATP | Fisher scientific | BP413-25 | 用于肌动蛋白组装和肌球蛋白运动 |
| β-D-葡萄糖 | Fisher scientific | MP218069110 | 用于减少荧光成像过程中光漂白的氧气清除系统组分 |
| 印迹级封闭剂(酪蛋白) | Biorad | 1706404 | 用于阻断表面非特异性结合 |
| CaCl2 | Fisher scientific | C79500 | 氯化钙,用于调控肌动蛋白-肌球蛋白网络的动力学 |
| 过氧化氢酶 | Fisher scientific | ICN10040280 | 用于减少荧光成像过程中光漂白的氧气清除系统组分 |
| 盖玻片 | Fisher scientific | 12544C | 用于构建流动池 |
| DTT | Fisher scientific | AC327190010 | 用于缓冲液配制 |
| 乙醇 | Fisher scientific | A4094 | 用于清洗盖玻片的试剂 |
| 葡萄糖氧化酶 | Fisher scientific | 34-538-610KU | 用于减少荧光成像过程中光漂白的氧气清除系统组分 |
| KCl | Fisher scientific | P217-500 | 用于缓冲液配制 |
| KOH | Fisher scientific | P250-1 | 用于蚀刻盖玻片及调节缓冲液 pH |
| MgCl2 | Fisher scientific | M33-500 | 用于缓冲液配制 |
| 显微镜载玻片 | Fisher scientific | 12-544-2 | 用于构建流动池 |
| 肌球蛋白 II 蛋白:兔骨骼肌来源 | 细胞骨架 | MY02 | 从兔骨骼肌中分离的全长肌球蛋白马达蛋白 |
| Nanotracker2 | Bruker/JPK | NT2 | 光镊仪器 |
| 聚-L-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P8920 | 促进肌动蛋白丝在盖玻片玻璃表面的黏附 |
| 罗丹明鬼笔环肽 | 细胞骨架 | PHDR1 | 肌动蛋白稳定剂及罗丹明荧光染料 |
| 链霉亲和素磁珠,1 μm | Spherotech | SVP-10-5 | 光镊操作手柄 |
| Tris-HCl | Fisher scientific | PR H5121 | 用于缓冲液配制 |
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