该协议旨在提供收集,固定和维护霉菌异养植物样品的详细程序,应用不同的显微镜技术,例如扫描和透射电子显微镜,光学,共聚焦和荧光显微镜,以研究植物组织和种子中的真菌定植与菌根真菌发芽。
方法文章
该协议旨在提供收集,固定和维护霉菌异养植物样品的详细程序,应用不同的显微镜技术,例如扫描和透射电子显微镜,光学,共聚焦和荧光显微镜,以研究植物组织和种子中的真菌定植与菌根真菌发芽。
结构植物学是充分了解植物生态、生理、发育和进化不可或缺的视角。在研究霉菌异养植物(即从真菌中获取碳的植物)时,它们的结构适应、真菌组织定植模式以及地下器官的形态解剖学的显着方面可以启发它们的发育策略以及它们与营养来源菌丝的关系。共生真菌的另一个重要作用与兰花种子的发芽有关;所有兰科物种在发芽和幼苗阶段(初始分枝异养)都是分枝异养的,即使是在成虫阶段进行光合作用的物种。由于兰花种子缺乏营养储备,真菌共生体对于提供基质和发芽至关重要。从结构角度分析发芽阶段也可以回答有关真菌与种子相互作用的重要问题。正如本文所提出的,可以应用不同的成像技术来揭示植物组织中的真菌内生菌。可以对植物器官的手绘和薄片进行染色,然后使用光学显微镜观察。与小麦胚芽凝集素偶联的荧光染料可以应用于真菌,并与Calcofluor White共同孵育,以在共聚焦显微镜中突出显示植物细胞壁。此外,还详细介绍了分生异养兰花的扫描和透射电子显微镜方法,并探讨了在相关植物中应用此类方案的可能性。协议中详细描述了兰花种子的共生发芽(即,在菌根真菌存在下),以及制备从不同发芽阶段获得的结构以用光学,共聚焦和电子显微镜进行分析的可能性。
植物学的结构研究,涵盖植物形态学和解剖学,是理解整个生物体的基础1,2,并为整合和促进有关植物的生态学,生理学,发育和进化的知识提供了不可或缺的视角3。植物形态学和解剖学方法目前包括最近以及一个多世纪前开发的协议、设备和知识2.经典方法(例如光学显微镜)与最新技术(例如共聚焦显微镜,X射线显微断层扫描)的连续执行和调整具有相同的基本基础:能够开发方法的理论知识。
植物解剖学和形态学的主要工具是图像。尽管误解这种分析是简单的观察,但给主观解释留出了空间2,但分析和理解该领域的图像需要了解应用的方法(设备,分析类型,方法程序),细胞成分,组织化学和植物体(组织组织和功能,个体发生,形态适应)。解释通过各种方法 获得 的图像可以导致关联形式和功能,破译结构的化学成分,证实描述分类群,了解植物病原体感染以及其他此类评估。
在研究霉菌异养(MH)植物(即从菌根真菌4,5中获取碳的非光合植物)时,其结构适应的显着方面,真菌组织定植的模式以及地下器官的形态解剖学可以启发它们的发展战略以及与菌丝的关系,菌丝是营养的来源。MH植物的地下器官通常显示出与其与土壤真菌相关的重要适应性,因此必须进行这些解剖学和形态学研究6。MH物种的气生器官不应被忽视,因为内生菌也可以存在于这些组织中,即使它们不是菌根真菌(个人观察,尚未发表)。
除了菌根真菌在其整个生命周期中与MH物种相关的既定必要性7外,每种兰花物种,甚至是自养兰花物种,在自然环境中都具有初始专性霉菌异养阶段。这是因为兰花的胚胎未分化并且缺乏胚乳或子叶,因此在没有真菌伴侣的营养支持的情况下,它们无法在自然环境中发育和建立自己4,8。考虑到共生发芽方案不仅可以应用于MH物种,还可以应用于光合作用兰花,旨在研究兰花真菌在发芽和原球茎发育中的特异性,这是一种广泛应用的方法保护受威胁物种9,10,11。
在该方法组装中,我们描述了收集,固定和储存MH植物样品以进行解剖学研究(第1节),表面分析和样品选择(第2节),切片方法(徒手:第3节,切片术:第4节,冷冻切片术:第5节),染色和镶嵌(第6节),真菌内生菌的荧光和共聚焦显微镜(第7节),扫描电子显微镜(第8节), 和透射电子显微镜(第9节)。此外,我们描述了兰花种子的共生发芽方法(MH和自养,第10节),因为前面提到的成像方法可以成功地应用于分析种子,原球茎和幼苗在发芽过程中的真菌定植。

图 1:成像方法的示意图摘要。 原理图提供了详细协议步骤的指示。缩写:GMA = 甲基丙烯酸乙二醇酯,OCT = 最佳切割温度化合物,SEM = 扫描电子显微镜。 请点击此处查看此图的大图。
此处详细描述的显微镜技术(图1)之前有以下基本步骤:收集、固定、脱水、包埋和切片样品。由于步骤因所选技术而异(图 1),因此提前考虑要制备和运输到收集部位的固定剂、固定前必须如何制备样品、要使用的脱水过程(第 1 节)以及不同的包埋可能性和切片方法(第 4、5、5、 和 9)。 图1 依次总结了下面详细描述的每种显微镜技术所需的所有步骤。
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1. 收集、固定和维护样品
注意:完全MH植物通常可以在黑暗的森林下找到12,13,主要在潮湿和垃圾丰富的地区,而部分MH植物可以在更开阔的森林中找到12,13。MH植物通常具有各种形状和大小的发达地下器官。
| 10% 中性缓冲福尔马林 (NBF)14 | |
| 步骤 1 | 在80 mL蒸馏水中加入10 mL 37-40%甲醛溶液 |
| 步骤 2 | 加入0.4克磷酸钠一水合物(NaH2PO4·H2O) 到溶液 |
| 步骤 3 | 加入0.65克磷酸二钠,无水(Na2HPO4) |
| 步骤 4 | 将体积补足至 100 mL |
表1:10%中性缓冲福尔马林配方14。
| 卡尔诺夫斯基的解决方案 (修改15) | |
| 步骤 1 | 在 60-70 °C 的 20 mL 蒸馏水中 |
| 步骤 2 | 加入0.8g多聚甲醛(得到4%w/v),搅拌 |
| 步骤 3 | 加入1-4滴40%NaOH并搅拌直至溶液变澄清 |
| 步骤 4 | 冷却并加入 30 mL pH 7.2 的 0.2 M 磷酸盐缓冲液(表 3) |
| 步骤 5 | 在 0.1 M PB (pH 7.2) 中稀释 25% 戊二醛,得到 1% 戊二醛(最终体积:~60 mL) |
| 步骤 6 | 向步骤4中获得的溶液中加入1%戊二醛(步骤5),直到补充至100 mL固定剂 |
表2:卡尔诺夫斯基溶液配方 (修改15)。
| 0.2 M 磷酸盐缓冲液 (PB) pH 7.2 | |
| 步骤 1 | 将 14.196 g 无水磷酸二钠 (Na2HPO4) 加入 400 mL 蒸馏水中 |
| 步骤 2 | 加入磷酸钠一水合物13.8克(NaH2PO4·H2O) |
| 步骤 3 | 搅拌直至溶液澄清 |
| 步骤 4 | 用蒸馏水将最终体积调节至 500 mL |
| 步骤 5 | 调节pH值至7.2 |
| 步骤 6 | 对于 0.1 M PB,以 1:1 稀释 |
表3:0.2 M磷酸盐缓冲液配方。
| 3%戊二醛0.2 M二甲胂酸钠缓冲液 (改性16) | |
| 步骤 1 | 0.2 M 二甲胂酸钠缓冲液:在 100 mL 蒸馏水中加入 4.28 g 二甲胂酸钠三水合物 |
| 步骤 2 | 调节pH值至7.2 |
| 步骤 3 | 在步骤 2 的 25 mL 溶液中加入 12 mL 的 25% 戊二醛(0.2 M 二甲胂酸缓冲液 pH 7.2) |
| 步骤 4 | 用蒸馏水补足体积至 100 mL |
表4:3%戊二醛0.2 M二甲胂酸钠缓冲液配方 (修改16)。
2. 固定和非固定材料中器官的表面分析
3.植物器官的手绘切片
注意:植物器官的徒手切片可能具有挑战性,特别是对于小而薄的结构。然而,与薄切片相比,这些具有真菌内生菌的组织切片在某些情况下可以更好地显示菌丝和其他特征。
4. 将植物样品嵌入树脂中并切片
5. 冷冻植物样品并用低温恒温器切片
注意:冷冻生物组织的基本考虑因素是减少冷冻样品时冰晶形成造成的损害。冷冻保护通常通过注入化学惰性溶液(如甘油或蔗糖19,20)来完成。
6. 用于光学显微镜的植物切片和内生菌染色
注意:许多类型的污渍可用于植物部分。对内生真菌和植物组织进行差异染色具有挑战性。虽然不是染色程序,但标记真菌结构的方法在第7节(用小麦胚芽凝集素偶联物荧光)中介绍。手绘切片(在第 3 节中解释)、树脂切片(第 4 节)和冷冻切片(第 5 节)可以染色,尽管苯酚和醇基染色对于这些样品具有挑战性,因为在这些情况下 GMA 树脂和 OCT 会失去对载玻片的粘附。
7. 与小麦胚芽凝集素偶联的荧光染料在荧光和共聚焦显微镜中的应用
注意:此方法可应用于手绘切片(在第 3 节中解释)、树脂切片(第 4 节)和冷冻切片(第 5 节)。冷冻切片足以用于共聚焦显微镜目的,因为与树脂切片相比,可以提供更厚的样品,但不如徒手切片那么厚。与小麦胚芽凝集素(WGA,参见 材料表)偶联的荧光染料应用于荧光显微镜中的真菌成像26。共聚焦显微镜不是必需的,尽管它可以提供植物结构的清晰三维图像27。

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在固定植物组织的基本阶段之后,考虑到细胞成分和组织的形态、体积和空间组织,产生尽可能与活态相似的细胞结构16。化学固定后观察样品中的这些特征(图4)。图4C-F表示光学显微镜下充分固定的样品。遵循所描述的固定程序并熟悉样品结构有助于分析固定成功与否。

图4:丝状根表面MH兰花Wullschlaegelia aphylla (Sw.) Rchb.f.(A和<...
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植物解剖学和形态学中的图像分析具有实现目标的重要潜力,并有助于理解分枝异养植物与其不可或缺的真菌内生菌之间的关系,如地下器官研究6,40,种子共生发芽的结构分析39以及地上和生殖结构41所证明的那样.结构植物学尽管在过去十年中失去了对植物科学其他领域的声望和空间1,但在回答问题和帮助揭示与发展、生态学、生理学和进化相关的新奇事物和基本植物性状方面仍然很突出。这些方法共同构成了植物结构研究的基础,考虑了MH植物分析的重要方面。
提供基本信息以仔细收集MH植物,否则发育良好的地下器官可能会损坏而无法完全收集。在收集和保存地下结构时,应考虑这些结构6的显着适应性以及与土壤中真菌的密切接触,与自养植物42或分解的落叶
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作者没有什么可透露的。
作者感谢FAEPEX和FAPESP的资助(2015/26479-6)。MPP 感谢 Capes 的硕士学位奖学金(流程 88887.600591/2021-00)和 CNPq。 JLSM 感谢 CNPq 的生产力补助金 (303664/2020-7)。作者还感谢LME(电子显微镜实验室 - IB / Unicamp),INFABiC(国家应用于细胞生物学的光子学科学技术研究所 - Unicamp)和LaBiVasc(血管生物学实验室 - DBEF / IB / Unicamp)提供的设备和帮助;LAMEB(UFSC)和Eliana de Medeiros Oliveira(UFSC)对冷冻保护方案的贡献;LME对TEM协议的贡献。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 丙酮 | Sigma-Aldrich | 179124 | (用于 SEM 存根安装) |
| 琼脂 (AA) | Sigma-Aldrich | A1296 | (用于种子发芽测试) |
| 钙氟白色染色 | Sigma-Aldrich | 18909 | 荧光染料(检测纤维素) |
| 柠檬酸盐缓冲溶液,0.09M pH 4.8 | Sigma-Aldrich | C2488 | (用于甲苯胺蓝 O 染色) |
| 导电双面碳胶带 | Fisher Scientific | 50-285-81 | (用于 SEM) |
| 共聚焦显微镜 | 蔡司 | (任何型号) | |
| 铜网格 | Sigma-Aldrich | G4776 | (用于 TEM) |
| 临界点干燥机 | Balzers | (任何型号) | |
| 低温恒温 | Leica Biosystems | (任何型号) | |
| 解剖显微镜 | Leica Biosystems | (= 立体显微镜,任何型号) | |
| Entellan | Sigma-Aldrich | 107960 | 显微镜快速封片剂 |
| ,纯 (≥99.5%) | Sigma-Aldrich | 459836 | (= 乙醇,用于脱水过程) |
| 甲醛溶液,37% | Sigma-Aldrich | 252549 | (用于 NBF 溶液制备) |
| 福尔马林溶液,中性缓冲,10% | Sigma-Aldrich | HT501128 | 组织学组织固定 |
| 明胶胶囊,用于 TEM | Fisher Scientific | 50-248-71 | (用于 TEM 中的树脂聚合) |
| 明胶溶液,2% H2O 中 | Sigma-Aldrich | G1393 | (稀释用于玻片制备 - OCT 粘附性) |
| 戊二醛溶液,25% | Sigma-Aldrich | G6257 | (用于 Karnovsky's 溶液制备) |
| HistoResin | Leica Biosystems | 14702231731 | 丙烯酸乙二醇酯 (GMA) 包埋试剂盒 |
| Sigma-Aldrich | 207772 | (用于 Lugol 溶液制备) | |
| 硝酸铅 (II) | Sigma-Aldrich | 228621 | Pb(NO3)2(用于 TEM 造影剂染色) |
| 林巴斯 | 光学显微镜 | (任何型号) | |
| LR 白色丙烯酸树脂 | Sigma-Aldrich | L9774 | 用于 TEM 的亲水性丙烯酸树脂 |
| Lugol 溶液 | Sigma-Aldrich | 62650 | (用于染色) |
| 用于标本安装的金属存根 | Rave Scientific | (用于 SEM,不同型号) | |
| 切片机 | Leica Biosystems | 手动轮转切片机或其他型号 | |
| 燕麦琼脂 (OMA) | Millipore | O3506 | (用于种子发芽试验) |
| OCT 化合物,组织-Tek | Sakura Finetek USA | 4583 | 包埋培养基 |
| Sigma-Aldrich | 201030 | OsO4(用于 TEM 后固定) | |
| 封口膜 M | Sigma-Aldrich | P7793 | 密封热塑性薄膜 |
| 多聚甲醛 | Sigma-Aldrich | 158127 | (for Karnovsky's 溶液制备) |
| 聚-L-赖氨酸溶液,0.1% H2O 中 | Sigma-Aldrich | P8920 | (用于载玻片制备 - OCT 粘附性) |
| Poly-Prep 载玻片 | Sigma-Aldrich | P0425 | 聚-L-赖氨酸涂层载玻片 |
| 聚乙烯成型杯托盘 | Polysciences | 17177A-3 | (6x8x5 mm,用于将样品嵌入 GMA 树脂中) |
| 聚乙烯成型杯盘 | Polysciences | 17177C-3 | (13x19x5 mm,用于将样品包埋在 GMA 树脂中) |
| 碘化钾 | Sigma-Aldrich | 221945 | (用于 Lugol 溶液制备) |
| 马铃薯葡萄糖琼脂 (PDA) | Millipore | 70139 | (用于种子发芽测试) |
| 扫描电子显微镜 | Jeol | (任何型号) | |
| 硅烷 [(3-氨丙基)三乙氧基硅烷] | Sigma-Aldrich | A3648 | (用于载玻片制备 - OCT 粘附性) |
| 硅烷制备载玻片 | Sigma-Aldrich | S4651 | 载玻片涂有硅烷 |
| 硅胶橙,颗粒状 | Supelco | 10087 | (用于干燥过程) |
| 二甲胂酸钠三水合物 | Sigma-Aldrich | C0250 | (用于戊二醛-二甲胂酸钠缓冲液) |
| 氢氧化钠 | Sigma-Aldrich | S5881 | NaOH(用于 Karnovsky'的溶液制备和 TEM 造影剂染色) |
| 次氯酸钠溶液 | Sigma-Aldrich | 425044 | NaClO(用于种子表面消毒) |
| 磷酸氢二钠,无水 | Sigma-Aldrich | 71640 | Na2HPO4(用于 NBF 溶液和 PB 制备) |
| 磷酸二氢钠一水合 | Sigma-Aldrich | S9638 | NaH2PO4·H2O(用于NBF和PB) |
| 溅射镀膜机 | 巴尔查斯 | (任何型号) | |
| 蔗糖 | Sigma-Aldrich | S0389 | C12H22O11(用于冷冻保护和发芽测试) |
| Sudan III | Sigma-Aldrich | S4131 | (用于染色) |
| Sudan IV | Sigma-Aldrich | 198102 | (用于染色) |
| 苏丹黑 B | Sigma-Aldrich | 199664 | (染色用) |
| 注射器 | (3 mL,任何品牌,用于 TEM 造影剂染色) | ||
| 针头过滤装置,Millex-GV 0.22 µm | Millipore | SLGV033R | PVDF,33 mm,γ 灭菌(用于 TEM 造影剂染色) |
| Tek Bond Super Glue 793 | Tek Bond Saint-Gobain | 78072720018 | 液体氰基丙烯酸酯胶粘剂,中等粘度甲 |
| 苯胺蓝 O | Sigma-Aldrich | T3260 | (用于染色) |
| 透射电子显微镜 | Jeol | (任何型号) | |
| 三苯基四唑氯化物 | Sigma-Aldrich | T8877 | (用于种子发芽中的四唑试验) |
| 酸三钠二水合 | Sigma-Aldrich | S1804 | Na3(C6H5O7)·2H2O(用于 TEM 造影剂染色) |
| 超薄切片机 | Leica Biosystems | (任何型号) | |
| 乙酸铀酰 | Fisher Scientific | 18-607-645 | UO2(CH3COO)2(用于 TEM 造影剂染色) |
| 真空泵 | (任何型号) | ||
| 小麦胚芽凝集素, Alexa Fluor 488 偶联物 | TermoFisher Scientific | W11261 | 荧光染料偶联凝集素(检测唾液酸和 N-乙酰葡糖胺残基) |
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