本文描述了建立小鼠肺炎感染模型的方法,以及对损伤修复过程的相应表征,并介绍了细菌培养和经气管灌注的技术。文中还描述了一种利用高维流式细胞术评估免疫格局的新方法。
本文描述了建立小鼠肺炎感染模型的方法,以及对损伤修复过程的相应表征,并介绍了细菌培养和经气管灌注的技术。文中还描述了一种利用高维流式细胞术评估免疫格局的新方法。
急性呼吸窘迫综合征(ARDS)可导致急性肺损伤,其特征是肺泡迅速受损以及严重低氧血症。这进而导致高发病率和高死亡率。目前尚无能够完全模拟人类ARDS复杂性的临床前模型。然而,肺炎(PNA)的感染性模型可以复制ARDS的主要病理生理特征。本文中,我们描述了一种通过在C57BL6小鼠中经气管接种活的Streptococcus pneumoniae和Klebsiella pneumoniae诱导的PNA模型。为评估和表征该模型,在诱导肺损伤后,我们连续测量了小鼠体重并进行支气管肺泡灌洗(BAL),以检测肺损伤相关标志物。此外,我们采集肺组织用于细胞计数与分类、BAL蛋白定量、细胞离心涂片、细菌菌落形成单位计数以及组织学分析。最后,进行了高维流式细胞术检测。我们建议将该模型作为研究肺损伤早期和晚期恢复阶段免疫微环境的工具。
急性呼吸窘迫综合征(ARDS)仍是一种常见的致命性且致残的综合征,影响约10%的重症监护病房(ICU)患者以及高达23%的机械通气患者,导致住院死亡率高达35%–46%1。此外,近期的COVID-19大流行再次凸显了研究ARDS的重要性。COVID-19阳性病例导致ARDS死亡率上升,突显了药物治疗的局限性2。
在人类中,急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的特点是迅速出现低氧血症(PaO2/FiO2 < 300),并伴有因肺泡-毛细血管通透性过度增加和肺泡炎导致的非心源性双侧肺水肿证据3。尽管ARDS传统上被描述为由多种损伤继发的急性肺损伤(ALI)的一种表现形式,但细菌性和病毒性肺炎(PNA)仍是其最常见的病因之一。目前已描述了三个主要的病理生理阶段,即渗出期、增殖期和纤维化期,而ARDS的两个核心特征为炎症反应失调和肺泡-毛细血管屏障破坏4。在这些过程中,肺泡损伤由炎性细胞因子(如肿瘤坏死因子[TNF-α]、白细胞介素[IL-1β、IL-6、IL-8等])的释放、中性粒细胞和炎性巨噬细胞的浸润以及富含蛋白质的液体渗出所引起。最终,这些事件导致斑片状且双侧对称的肺泡损伤5,6,7,8。
尽管在理解早期肺损伤和炎症方面已取得显著进展,但肺炎(PNA)消退背后的机制仍知之甚少,应成为未来机制研究的重点。本文的主要目的是为研究人员提供一种可复制急性呼吸窘迫综合征(ARDS)主要病理生理特征的感染性肺炎损伤-消退模型。我们提出,该模型将有助于更深入地理解肺部炎症消退与修复背后的生物学机制,从而为挽救性治疗策略提供一个研究平台。
急性呼吸窘迫综合征(ARDS)期间发生的主要病理生理阶段可在急性肺损伤(ALI)的临床前动物模型中复制,这些模型应包括炎症反应、组织损伤、生理功能障碍、肺泡炎以及肺泡-毛细血管屏障改变的组织学证据9。诱导肺炎(PNA)和ALI的小鼠模型具有优势,因其具有高度可重复性、繁殖速度快,并且具备多种可用于开展机制和分子研究的工具。目前尚无单一模型能够完全再现人类ARDS的所有特征9。
小鼠PNA模型能够复制感染性ARDS在人体中产生的关键病理生理机制,例如快速发病、组织学上可见的组织损伤、肺泡-毛细血管屏障功能障碍、炎症反应证据以及生理功能紊乱,同时保持较低的死亡率10。感染性模型可通过局部或全身递送病原体来建立,其中鼻内、气管内和静脉注射是最常用的给药途径。气管内给药可将病原体直接接种至肺部,减少气溶胶化,并优化递送效率11,12。
本文描述了一种通过气管内滴注活的Streptococcus pneumoniae (Spn)或Klebsiella pneumoniae (Kp)建立小鼠细菌性肺炎(PNA)的临床前动物模型的方法。这些模型能够良好地模拟由细菌性肺炎引发的急性呼吸窘迫综合征(ARDS),具有多项优势,包括:所用病原体是导致人类肺炎相关ARDS的主要病因(涵盖社区获得性和医院获得性感染);模型可重复性高;可通过调节感染剂量精确控制死亡率和肺损伤程度(以模拟不同程度的肺部炎症),从而产生显著的炎症反应,引发肺泡炎和肺泡-毛细血管功能障碍;可评估肺损伤的早期与晚期阶段及其修复过程;并可在肺炎相关ARDS的不同病程阶段评价治疗策略的效果。
本研究中描述的所有动物实验方案均经约翰斯·霍普金斯大学医学院机构动物护理和使用委员会(ACUC)批准,动物实验方案编号为MO21M160。此外,实验严格遵循机构、州及联邦层面关于动物研究的相关法规进行。
警告:以下所述所有实验方案的实施均须在生物安全二级(BSL-2)柜中进行,并严格遵守机构规定的生物安全柜内BSL-2操作规范。
1. 从商用菌环接种细菌菌种
注意:本方案可用于培养肺炎链球菌(Spn,ATCC 49619)和肺炎克雷伯菌(Kpn,ATCC 43816)的菌种,起始材料为供应商提供的接种环(详见材料表)。
2. 细菌的培养与保藏以备后续使用
3. 气管内滴注用细菌的解冻
4. 气管内接种活细菌
注意:本方案已优化为经气管内接种50 µL体积。细菌储备液可保存6至9个月。为确保每管中的细菌菌落形成单位(CFU),每次实验前务必进行平板计数,按上述方法计算细菌储备液的CFU,并使用TH肉汤进行后续稀释。
警告:在生物安全柜内,使用无菌外科器械对啮齿类动物进行存活手术操作。
5. 支气管肺泡灌洗与肺组织采集
6. 支气管肺泡灌洗液处理
7. 肺组织单细胞悬液制备
上述操作步骤可在小鼠中建立由细菌性肺炎引发的肺损伤的病理生理机制模型。为开始建模,C57BL/6野生型(WT)小鼠购自杰克逊实验室,并在本机构的动物实验设施中进行繁育。8周龄的雄性WT C57BL/6小鼠分别通过气管内接种TH肉汤(对照组)、3 × 106 CFU 活体Spn或200 CFU 活体Kpn。感染后,分别对Spn和Kpn感染组小鼠进行6天和10天的观察。尽管感染组小鼠的体重低于未感染的对照组,但Spn组小鼠的体重逐渐恢复至基线水平,而Kpn感染小鼠在感染6天后体重恢复较慢(图2A)。在整个研究期间,没有任何小鼠因体重下降超过20%而需要实施安乐死,也未观察到疼痛或痛苦的迹象。
我们在不同时间间隔测量了肺损伤指标。与对照组相比,感染组的支气管肺泡灌洗液(BAL)蛋白浓度以及BAL和肺组织中的总细胞数均显著升高(图2). 在接种后第2、4和6天,分别从两种模型中获取了显示炎症过程的代表性组织学切片(图3),显示出肺泡持续性炎症的证据 Kpn-感染的小鼠(图4,即使在第10天。 Kpn-感染小鼠在第10天持续表现出损伤图2 和 图4),而 Spn-感染小鼠在第6天消除了肺部炎症(图2 和 图3).
在Spn模型中,于感染后第6天采用18色荧光激活细胞分选(FACS)高维流式细胞术分析肺组织单细胞悬液,以区分免疫微环境。通过t分布随机邻域嵌入(t-SNE)方法,可直观显示免疫细胞组成的总体差异,其中粒细胞(CD45+、CD11b+、CD24+、MHC-II-)、间质巨噬细胞(CD45+、CD11b+、MHC-II-、CD24-)、单核细胞(CD45+、CD11b+、MHC-II-、CD24-、CD64-)、B细胞(CD45+、CD19+)和T细胞(CD45+、CD3+),包括自然杀伤细胞(CD45+、CD3+、NK1.1+)的数量显著增加,如图5所示。设门策略见图6。

图1:活菌气管内滴注的手术操作流程。(A)小鼠在无菌手术区域内的位置,通过门齿悬挂固定。(B)切口位置及气管暴露。(C)使用20 G导管进行气管插管的过程。图示由Biorender.com制作。请点击此处查看该图的放大版本。

图2:肺炎模型后急性肺损伤(ALI)特征分析 (A) 与对照组相比,随时间变化的体重相对于基线的变化 Kpn 和 Spn (每组 n = 4)). (B) 通过BCA法测定BAL总蛋白含量(n = 4,每组)。C对照组(n = 3)的支气管肺泡灌洗液总细胞计数 Kpn (n = 4),以及 Spn (n = 3)。D对照组肺总细胞数(n = 3), Kpn (n = 4),以及 Spn (n = 3)。E-G对照组(n = 3)支气管肺泡灌洗液细胞离心涂片的手工组织学计数进行BAL细胞分类 Kpn (n = 4),以及 Spn (n = 3)。统计检验采用单样本 t 检验,比较未感染对照组与感染组。*p < 0.05。每个图表的数据均以标准误(SE)表示。所有图的 y 轴均为感染后天数。缩写:BAL = 支气管肺泡灌洗; Spn = Streptococcus pneumoniae;Kpn = Klebsiella pneumoniae。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图3肺组织病理学表现 Spn 感染 苏木精和伊红(H&E) 支气管肺泡灌洗液和肺组织代表性切片在经气管感染后的组织学切片染色 Spn 第2、4、6天进行BAL;BAL放大倍数 = 100倍;肺组织放大倍数 = 10倍。缩写:BAL = 支气管肺泡灌洗; Spn = Streptococcus pneumoniae。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图4:Kpn 感染期间肺组织的组织病理学发现。在气管内接种 Kpn 后第2、4、6和10天,代表性支气管肺泡灌洗液(BAL)和肺组织切片的苏木精-伊红(H&E)染色。图像显示高倍放大视野(比例尺 = 50 µm)。缩写:BAL = 支气管肺泡灌洗;Kpn = 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)。请点击此处查看该图的放大版本。

图5:肺炎链球菌(Spn)感染6天后通过多色流式细胞术分析的免疫细胞图谱。(A)采用t分布随机邻域嵌入(t-SNE)方法可视化肺组织中免疫细胞群体(CD45+),比较未感染对照组与感染组。(B)肺组织中各免疫细胞占总CD45+细胞频率的汇总。(C)各细胞亚群的总细胞数。对照组与感染组之间的统计学比较采用t检验。*p < 0.05,**p < 0.01,***p < 0.001。各图数据均以标准误(SE)表示。缩写:BAL = 支气管肺泡灌洗液;Spn = Streptococcus pneumoniae。请点击此处查看该图的高清版本。

图6:在肺炎发生前及发生后鉴定肺部免疫细胞亚群的设门策略。 支气管肺泡灌洗液(BAL)和肺组织单细胞悬液经多色流式细胞术染色。首先利用SSC-A和FSC-A排除碎片,然后通过两种策略(SSC-W vs. SSC-H 和 FSC-W vs. FSC-H)圈选单个细胞。活细胞通过活/死细胞鉴别染料与SSC-A结合进行鉴定。后续细胞亚群根据先前确定的标记物进行鉴定15。缩写:BAL = 支气管肺泡灌洗液。 请点击此处查看该图的放大版本。
肺炎(PNA)的小鼠实验模型为评估急性呼吸窘迫综合征(ARDS)发生与恢复过程中的细胞和分子机制提供了平台。可评估的病理生理学组分包括早期炎症通路、细菌清除、动态免疫微环境变化、炎症消退、纤维增殖以及上皮和血管修复16。然而,在计划复制这种肺炎诱导的肺损伤模型时,必须考虑多个因素,包括动物年龄、性别、小鼠品系、宿主内在因素(例如免疫功能低下状态)、所用特定病原体及其细菌载量,以及操作人员的技术熟练程度。
肺炎是急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的主要病因之一。我们选择使用活的Spn和Kpn ,它们分别是人类社区获得性和医院获得性肺炎(PNA)的常见致病菌17。我们建议通过滴定活菌剂量来优化PNA的细菌模型,以达到符合研究者假设的预期死亡率和损伤恢复特征。我们已优化出小鼠气管内接种剂量:Spn为3 × 106 CFU,Kpn为200 CFU,该剂量可引起肺泡炎症、肺泡-毛细血管屏障破坏及器官功能障碍(图2)。然而,即使使用相同菌株和CFU数,不同来源的细菌批次,甚至同一批次内的重复实验,也可能表现出不同程度的炎症和损伤。
因此,为了重复本文所述的实验结果,研究人员应从本文描述的细菌浓度开始;但可能需要增加或减少剂量,以获得相似的模型特征。因此,每一批新使用的细菌都需要优化其在损伤修复方面的潜在效应。我们提供了一种稳定的肺炎模型,具有两种不同的修复结局:一种为自限性修复(Spn),另一种为缓慢或非自限性修复(Kpn),可作为研究者评估免疫机制及测试治疗干预措施的平台,特别是在感染高峰时或之后(例如感染后第2天)进行研究。
年龄、性别、品系和遗传因素均会影响损伤消退过程的动力学特征16。例如,与雄性相比,雌性表现出更快的消退速度18;因此,细菌负荷增加会导致雄性比雌性出现更高的死亡率和更延迟的消退。在确定所用细菌的菌落形成单位(CFU)时,衰老是另一个需要考虑的因素。当我们使用指定剂量的Spn时,老年小鼠表现出100%的死亡率(此处未显示)。在肺炎链球菌性肺炎(PNA)模型中,最常使用的是年轻小鼠(6至14周龄),而老年小鼠(19至26月龄)则表现出改变的免疫反应,常用于研究衰老在PNA中的作用11。为了使老年动物存活,我们必须将CFU降低至原定剂量的300%以下(此处未显示)。本研究使用了雄性C57BL/6小鼠(8至12周龄),并在感染后6至10天内进行观察。不同品系之间在易感性方面也存在显著差异;例如,近交系BALB/C和C57BL/6J对感染的反应不同11,19。
通过气管内直接接种细菌可将接种物更精确地递送至肺部(递送效率高达99%)12,该方法为毒力较弱的血清型提供了一种替代方案,并可减少细菌的气溶胶化11。然而,该操作属于侵入性 procedure,可能存在争议。气管插管操作具有挑战性,需要全身麻醉,且可能导致气管损伤,继而引发气道水肿和喘鸣。小鼠可能出现血管迷走性反射,导致呼吸暂停,因此需配备小型小鼠呼吸机,以便在必要时提供通气支持。实施该操作的外科医师的技术水平是确保成功插管的关键因素之一11。在本研究中,由于实施了适当的疼痛管理,且小鼠体重减轻未超过20%,未出现需实施安乐死的情况。未观察到嗜睡、无法接触饮水或食物、呼吸困难或精神警觉性下降等疼痛与痛苦的迹象。另一种将细菌直接递送至肺部的方法是经口咽部吸入法,但肺损伤的恢复似乎更快,且部分细菌可能进入胃部和胃肠道20。
PNA 的临床前模型使研究人员能够评估免疫微环境。可对支气管肺泡腔和间质腔室中的免疫细胞动态变化进行分析。16此外,细胞可以进行培养和刺激 离体 以确定其特定细胞因子和趋化因子的产生情况。本文重点利用多色流式细胞术探讨肺组织和支气管肺泡灌洗液(BAL)中的免疫细胞图谱。此外,还可进行单细胞RNA测序,以解析损伤修复不同阶段中各类细胞特异性的转录组特征。
肺炎链球菌性PNA-ARDS模型可引发全身性效应,这些效应在疾病发展过程中通过监测体重可早期检测到10。尽管我们不直接测量ARDS的全身性效应,但可通过血液生化谱分析评估器官功能障碍,并通过采集脾脏、肾脏和肝脏等不同组织进行组织学检查。其他研究团队已使用相同菌株对肺炎链球菌性PNA-ARDS的全身性效应进行了既往报道21。
本文描述了一种实验性PNA模型,该模型模拟了人类急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中一些关键的病理生理学特征。尽管目前尚无能够完全重现人类ARDS复杂性和异质性的理想模型9,但这些模型在研究肺损伤与修复机制方面具有相关性和可重复性,同时也可作为发现新的潜在药物靶点的平台,旨在加速肺部炎症的消退并促进肺组织修复。
作者无任何利益冲突需要披露。
本研究由美国国立卫生研究院(NIH)资助,项目编号为 R01 HL131812 和 R01HL163881。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 1-200 µL 圆底 0.5 mm 厚凝胶加样吸头 | Corning | 4853 | |
| 2 mL 冻存管 | Corning Incorporated | 431420 | 2 mL 自立式,圆底,红色盖,聚丙烯材质 |
| 2 mL Eppendorf 快封盖微量离心生物纯安全锁管 | Fisherscientific | 05-402-24C | 形状: 圆形,长度(公制): 38 mm,外径(公制): 10 mm,容量(公制): 2 mL |
| 70 µm 细胞筛 | Falcon | 352350 | 白色,无菌,独立包装 |
| 96 孔透明圆底 | Falcon | 353077 | 经组织培养处理的细胞培养微孔板,带盖,独立包装,无菌 |
| 马来酸乙酰丙嗪注射液,USP 500 mg/50 mL (10 mg/mL) | Phoenix | NDC 57319-604-04 | 每毫升含:马来酸乙酰丙嗪 10 mg、柠檬酸钠 0.36%、柠檬酸 0.075%、苯甲醇 1% 及注射用水 |
| 氯化铵-氯化钾 (ACK) 裂解缓冲液 | Quality Biological | 118-156-721 | 4 × 100 mL |
| 抗小鼠 I-A/I-E 抗体 | Biolegend | 107628 | APC/Cy7 标记抗小鼠 I-A/I-E [M5/114.15.2];同型对照:大鼠 IgG2b |
| BCA 蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 | |
| BD 胰蛋白酶大豆琼脂 | BD-Biosciences | 90001-276 | 含 5% 羊血的预置培养基叠层平板,BD 诊断 |
| Biotix 一次性试剂储液槽 | Biotix | 89511-194 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrih | A4503 | |
| CD103 | Invitrogen | 509723 | 整合素 αE, Armenian Hamster 抗小鼠,FITC 标记,克隆号:2E7 |
| CD11b | Invitrogen | RM2817 | PE-Texas Red 标记,克隆号:M1/70.15,Invitrogen |
| CD11c | BD Biosciences | 565872 | 仓鼠抗小鼠,APC-R700 标记,克隆号:N418,BD Horizon |
| CD19 | Biolegend | 152410 | APC 标记抗小鼠 CD19 [1D3/CD19];同型对照:大鼠 IgG2a, κ |
| CD24 | BD Biosciences | 563450 | 大鼠抗小鼠,Brilliant Violet 711 标记,克隆号:M1/69 |
| CD4 | BD Biosciences | 563790 | BUV395 标记;克隆号:GK1.5 |
| CD45 | Biolegend | 103157 | Brilliant Violet 750 标记抗小鼠 CD45 [30-F11];同型对照:大鼠 IgG2b, κ; |
| CD8a | BD Biosciences | 612759 | 大鼠抗小鼠,Brilliant Ultraviolet 737 标记,克隆号:53-6.7 |
| 细胞计数载玻片 | Bio-rad | 1450017 | 适用于 TC20 细胞计数仪 |
| 70 µL 尼龙细胞筛 | Falcon | 198718 | 货号 352350 |
| I 型胶原酶 | Worthington Biochemical Corporation | LS004197 | |
| 肺炎链球菌接种环 | Thermo Scientific | R4609015 | ATCC 4961 |
| 牛胰脱氧核糖核酸酶 I | Sigma-Aldrih | DN25 | |
| 一次性接种环/针 | Fisherbrand | 22-363-603 | 蓝色;体积 1 µL |
| DMEM(杜氏改良伊格尔培养基)’’ | Corning | 10-014-CV | |
| Fc 封闭抗体 | BD Biosciences | 553142 | CD16/CD32 大鼠抗小鼠,未标记,克隆号:2.4G2 |
| 福尔马林溶液 | Sigma-Aldrih | HT501640 | 中性缓冲福尔马林溶液,10% |
| 纱布海绵,Covidien | Curity | 2146- | |
| gentleMACS C 管 | MACS Miltenyi Biotec | 130-093-237 | |
| gentleMACS 组织解离仪 | MACS Miltenyi Biotec | 130-093-235 | 序列号:4715 |
| Hema 3 手动染色系统及快速套装 | Thermo Scientific | 23123869 | |
| 异氟烷液体吸入剂 | Henry Schein | 1182097 | |
| 静脉导管 JELCO 20G×1.25" | Hanna Pharmaceutical Supply Co., Inc | 405611 | |
| 盐酸氯胺酮注射液 | Henry Schein | 1049007 | 盐酸氯胺酮注射液 MDV 100 mg/mL 10 mL/支,每盒 10 支 |
| 肺炎克雷伯菌 | ATCC | 43816 | 亚种:肺炎克雷伯菌 (Schroeter) Trevisan |
| Loctite 409 | Electron Microscopy Sciences | 7257009 | |
| Ly-6C | Biolegend | 128036 | Brilliant Violet 605 标记抗小鼠 Ly-6C [HK1.4];同型对照:大鼠 IgG2c |
| Ly-6G | BD Biosciences | 740157 | 大鼠抗小鼠,Brilliant Violet 510 标记,克隆号:1A8,BD Optibuild |
| MiniVent 型号 845 | Hugo Sachs Elektronik- Harvard Apparatus | 4694 | D-79232 March(德国) |
| NK-1.1 | BD Biosciences | 553165 | 小鼠抗小鼠,PE 标记,克隆号:PK136,BD |
| 相差血细胞计数板 | Hausser Scientific | 1475 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Corning | 21-040-CV | 1×,不含钙和镁 |
| 圆底管 | Sarstedt | 55.476.305 | |
| 圆底聚苯乙烯试管 | Falcon | 352235 | 带细胞筛快封盖,5 mL |
| SealRite 1.5 mL 天然微量离心管 | USA Scientific | 1615-5500 | 无 RNase、DNase、DNA 和热原检测 |
| Shandon EZ 单孔细胞离心涂片装置 | Epredia | A78710003 | |
| Siglec-F | BD Biosciences | 562681 | 抗小鼠,Brilliant Violet 421 标记,克隆号:E50-2440 |
| 黑色丝线编织缝合线 30"(75 cm),无菌,不可吸收,符合美国药典标准 | Ethicon | K-834 | 0(3.5 公制) |
| 不锈钢载玻片夹 | Epredia | 59910052 | |
| 无菌一次性真空过滤装置 | Thermo Scientific | 1660045 | |
| 无菌一次性 1 mL 注射器 | BD-Biosciences | 309628 | |
| TC20 自动细胞计数仪 | Bio-Rad | 508BR05740 | |
| TipOne 200 µL 黄色吸头补充装 | USA Scientific | 1111-0706 | |
| TODD HEWITT 肉汤 | RPI | T47500 | |
| TPX 样品室 | Epredia | A78710018 | |
| TPX 单样品室、盖子及滤纸片 | Epredia | 5991022 | |
| 台盼蓝 | Bio-rad | 1450022 | |
| U-100 胰岛素注射器 | BD-Biosciences | 329461 | |
| 防水多档电热垫 | Cullus | 型号 PR7791AB | 120 伏交流电;45 瓦;认证编号 562B/E26869 |
An erratum was issued for: Experimental Model to Evaluate Resolution of Pneumonia. A figure was updated.
Figure 2 was updated from:

to:
