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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
这里,为胚胎的固定,免疫染色和切片提供了优化的分步方案,以检测发育中的小鼠组织中称为细胞介素的特化信号丝足类。
发育组织模式化和发育后组织稳态取决于称为形态原的细胞信号的控制传递。形态原以浓度和时间依赖性的方式起作用,以指定指示和加强细胞命运的不同转录程序。确保适当的形态原信号阈值的一种机制是通过称为细胞介素的特化丝足类传递信号蛋白。细胞内膜非常薄(直径≤200 nm),并且可以长到几百微米的长度,这使得它们用于固定图像分析的保存具有挑战性。本文描述了一种精细处理小鼠胚胎以进行固定,免疫染色和厚切片的改进方法,以允许使用标准共聚焦显微镜可视化细胞介苗。该协议已成功用于可视化在小鼠神经管发育过程中连接不同细胞信号室的细胞因子。该技术还可以用于检测各种组织类型的细胞介素,以促进以前所未有的分辨率询问发育信号传导。
胚胎发育是通过形态原信号通路的协调激活来协调的。形态原是小的分泌蛋白质,分为声波刺猬(SHH),转化生长因子β(TGF-β)/骨形态发生蛋白(BMP),无翅相关整合位点(WNT)以及成纤维细胞和表皮生长因子(FGF / EGF)家族。形态原在组织发育过程中从细胞组织中心产生和释放,并在细胞的组织场之间建立信号梯度,以告知组织形态发生1,2,3,4,5。形态原梯度的一种表征存在于发育中的神经系统中,其中假定的中枢神经系统通过形态原途径激活来模式化。这种组织称为神经管,由腹侧最切口和底板分泌的SHH的相反梯度以及从背屋顶板分泌的WNTs / BMP组成,以形成不同的神经祖细胞区域6。神经管通常用于在发育研究中询问形态原梯度的完整性。
形态原梯度的形成依赖于信号色散的严格调节7.发生这种情况的一种细胞机制是通过形成称为细胞介素的长信号丝状体,其促进形态原从信号产生细胞直接传递到特定的靶细胞群。已经观察到细胞介子延伸数百微米以在信号接收细胞膜上沉积形态原8,9。细胞介导的形态原转运的破坏导致苍蝇和脊椎动物的发育异常,突出了它们在组织模式化过程中的重要性10,11,12,13,14。
迄今为止,细胞内膜已被记录在 果蝇,雏鸡和斑马鱼模型中,但发育中的哺乳动物胚胎结构的成像仍然具有挑战性8,9,15。在复杂的哺乳动物组织中原位有效成像细胞neme 的一 个障碍是它们的薄而脆弱的性质,这使得它们容易受到常规固定方法的损害8。我们之前已经开发和优化了改良的电子显微镜固定剂(MEM-fix)的方案,以保留培养细胞中的细胞因子,并使用共聚焦显微镜进行研究16,17。
使用MEM固定技术已经允许鉴定参与SHH诱导的细胞介基因形成和功能的一些分子11,16,17。然而,在神经管模式的生理学相关背景下对这些发现的证实需要开发新的技术来固定和成像小鼠胚胎组织。这里概述了以维持细胞基线完整性并允许免疫染色和随后切片胚胎组织以进行共聚焦分析的方式固定小鼠胚胎的方案。该协议是使用膜系留的绿色荧光蛋白(GFP)来标记来自发育中的神经管中产生SHH的细胞的膜延伸而开发的。该协议的实施将解决与发育中的哺乳动物系统中细胞介素的流行率和重要性有关的未解答问题。
该协议遵循机构动物护理和使用委员会(IACUC)和圣裘德儿童研究医院批准的动物护理指南。所有菌株都与C57BL / 6J菌株进行了五代的交叉。
1. 胚胎分离和整个安装染色
2. 胚胎包埋、切片和安装
3. 成像
使用每孔2.5-3 mL琼脂糖溶液的12孔板的较大模具是在短时间内包埋和悬浮多个胚胎的理想选择(图1A)。多余的面积允许在切割琼脂糖块进行切割时正确定位。切割琼脂糖块时,重要的是要保持多余的琼脂糖沿着块的底部,在那里它将粘在物体支架上的胶带上。胚胎应位于块的上半部分(图1B)。但是,底部截面不应太大,因为当刀片在切口时推入块时,多余的块会增加改变切割角度的机会。图中显示了正确方向的部分的示例(图1C,D)。
在开发该协议时,将振动切片与低温切片进行比较。冷冻切片组织的冷冻切片很少保留细胞延伸(图2 冷冻恒温器和 图3A,B 振动组)。低温恒温切片允许检测切口和神经管细胞之间的一些GFP阳性膜片段(图2A 箭头)和相邻神经管细胞之间的一些GFP阳性膜碎片(图2B,B' 箭头)。然而,神经管周围高度丝状间充质细胞中细胞延伸的F-肌动蛋白染色在低温恒温切片中受损(图2C,C' 箭头,与 图3C,D)。这些低温恒温器结果表明,只有一些破碎的细胞延伸痕迹仍然遵循这种方法。因此,优选振动切片,以有效地保留这些精细的延伸部分以供后续分析。
对整个胚胎和单个组织切片的最小破坏对于细胞延伸的高质量成像至关重要。经历过任何折叠或屈曲的组织切片将通过没有切口或神经管的切口和腹侧底板之间的大分离(>30μm)来明显(图3B)。这通常伴随着通常围绕神经管的间充质细胞的损失(图3A,箭头)。受损的部分也将导致可见细胞膜延伸的损失在上皮细胞之间迁移(图3B与图3A相比,箭头)。即使对截面的微小扭曲也可能导致基于肌动蛋白的延伸片段化,并在细胞之间形成大间隙(图3D,箭头,与保存完好的图3C相比),强调了在所有步骤中进行精细处理的必要性。

图1:E9.5 嘘-克雷的例子;罗莎26 mTmG 染色,嵌入和切片胚胎。 (A)将单个胚胎浸入12孔板中,包埋在4%LMP琼脂糖中。(B)琼脂糖块内正确取向的胚胎的例子,切成振动筛的尺寸进行振动切片。过量的琼脂糖块沿着底部存在。(C)嵌入LMP琼脂糖中的100μm厚胚胎切片的明场图像。(D)去除琼脂糖后切片的免疫荧光成像。抗GFP染色的mGFP(绿色)代表组织中表达 Shh的细胞,其他细胞谱系表达膜番茄(红色),蓝色DAPI。神经管(支架)和 mGFP 正切口(箭头)清晰可见。比例尺 = 1 厘米 (A)、5 毫米 (B) 和 100 微米 (C,D)。缩写:LMP =低熔点;mGFP = 膜绿色荧光蛋白;嘘=索尼克刺猬;DAPI = 4',6-二氨基-2-苯基吲哚。 请点击此处查看此图的大图。

图2:低温恒温器切片神经管底板和具有碎片膜延伸的切口的例子。蔷薇 26 mTmG19,20,21 切片染色为 GFP(绿色)、F-肌动蛋白(红色)和 DAPI(蓝色)。mGFP穿刺在切口和底板(箭头)和(B,B')之间可见,在神经管的相邻细胞之间迁移。(C,C')F-肌动蛋白染色无法检测到神经管周围间充质细胞上的任何透明细胞内膜(箭头)。比例尺 = 20 μm。简称:mGFP=膜绿色荧光蛋白;嘘=索尼克刺猬;DAPI = 4',6-二氨基-2-苯基吲哚。请点击此处查看此图的大图。

图3:最佳和次优振动组组织切片的例子以及神经管底板,切口和周围细胞的染色。 精细处理切片(A,C)的例子,与(B)折叠的组织切片和(D) Shh-Cre处理不良的部分相比;罗莎26 mTmG 和一个 嘘GFP / + 胚胎19,20,21。最佳处理切片允许检测相邻定位的底板神经上皮细胞(A,箭头)之间的细胞介素。神经管邻近的切口(A,表达mGFP)和间充质细胞(A,箭头)应该是可见的。(三、四)F-肌动蛋白和DAPI染色切片应具有一致的间充质细胞间距和基于F-肌动蛋白的细胞介子(箭头)围绕神经管和切口(C)。切片的任何轻微折叠或破坏都可能导致间隙和F-肌动蛋白碎片(D,箭头)断裂。比例尺 = 10 μm。简称:mGFP=膜绿色荧光蛋白;嘘=索尼克刺猬;DAPI = 4',6-二氨基-2-苯基吲哚。 请点击此处查看此图的大图。
作者没有竞争利益需要声明。
这里,为胚胎的固定,免疫染色和切片提供了优化的分步方案,以检测发育中的小鼠组织中称为细胞介素的特化信号丝足类。
使用圣裘德儿童研究医院细胞和分子生物学成像核心维护的显微镜获取图像。从JAX获得小鼠品系。这项工作得到了美国国立卫生研究院拨款R35GM122546(SKO)和圣裘德儿童研究医院ALSAC的支持。
| 12 孔板;经 Nunc 细胞培养处理 | Thermo Scientific | 150628 (Fisher Scientific 12-565-321) | |
| 24 孔板,圆形 Nunc | Thermo Fisher Scientific | 142475 | |
| 60 mm 培养皿 | 康宁,猎鹰 | 353004 (Fisher Scientific 08772F) | |
| 吸水毛巾 (Professional Kimtech Science Kimwipes) | Kimberly-Clark KIMTECH | 34155 (Fisher Scientific 06666A) | |
| 肌动蛋白红 555 ReadyProbes 试剂 | Invitrogen | R37112 | |
| Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 片段 抗鸡 IgY (IgG) (H+L) | Jackson Immunoresearch Lab Inc | 703-546-155 | 1:1,000 工作浓度 |
| 珠浴 6L 230V | 实验室装甲 | 项目 #12L048 (制造商型号 #74220-706) | 设置为 55 °C |
| 鸡抗GFP | Aves Labs | SKU GFP-1020 | 1:250工作浓度 |
| CO2室 | 有机玻璃室连接到CO2排放线。 | ||
| 共聚焦激光扫描显微镜 | 徕卡显微系统 | 型号:徕卡 TCS SP8 | |
| DAPI 溶液 (1 mg/mL) | Thermo Fisher Scientific | 62248 | |
| 解剖剪刀(Vannas 剪刀) | World Precision Instruments | 14003 | |
| Dulbecco's 改良 Eagle 培养基,高葡萄糖,无谷氨酰胺 | Thermo Fisher Scientific,Gibco | 11960044 | |
| Eppendorf Research Plus 单通道移液器, 0.1-2.5 µL | Eppendorf | 3123000012 | |
| Eppendorf Research Plus 单通道移液器,0.5-10 µL | Eppendorf | 3123000020 | |
| Eppendorf Research Plus 单通道移液器, 100-1,000 µL | Eppendorf | 3123000063 | |
| Eppendorf Research Plus 单通道移液器,20-200 µL | Eppendorf | 3123000055 | |
| 羽毛一次性手术刀 #10 | Fisher Scientific | 货号 NC9999403 | |
| 胎牛血清,认证,美国 | Thermo Fisher Scientific,Gibco | 16000044 | |
| Fisherbrand Fine Point 高精度镊子 | Fisher Scientific | 22-327379 | |
| Fisherbrand 标签胶带 | Fisher Scientific | 15-954 | |
| 甲醛,16%,不含甲醇,超纯 EM 级 | Polysciences | 18814-10 | |
| Hank's 平衡盐溶液 (HBSS) | Thermo Fisher Scientific, Gibco | 14025 | |
| ImmEdge 疏水屏障涂纸笔 | Vector laboratories | H-4000 | |
| Leica Application Suite X (LAS X) 与 LIGHTNING | Leica Microsystems | 显微镜软件 | |
| L-谷氨酰胺 (200 mM) | Thermo Fisher Scientific, Gibco | 25030081 | |
| 低熔点琼脂糖 - UltraPure | Invitrogen | 16520 | |
| MEM 非必需氨基酸溶液 (100x) | Thermo Fisher Scientific, Gibco | 11140050 | |
| Moria MC 17 BIS 穿孔勺 | 精细科学工具 | 1037018 | |
| 封片剂(ProLong Diamond 抗淬灭封片剂) | Thermo Fisher Scientific,Invitrogen | P36961 | |
| 小鼠:B6.129X1(Cg)-shhtm6Amc/J (shhGFP/+) | 杰克逊实验室 | 菌株 #:008466 | |
| 小鼠:B6。Cg-shhtm1(EGFP/cre)Cjt/J (shh-cre) | 杰克逊实验室 | 菌株 #:005622 | |
| 小鼠:C57BL/6J (B6) | 杰克逊实验室 | 菌株 #:000664 | |
| 小鼠:Gt(ROSA)26Sortm4(ACTB-tdTomato,-EGFP)Luo/J (Rosa26 mTmG) | 杰克逊实验室 | 菌株 #:007576 | |
| 正常山羊血清 | 杰克逊免疫研究 | 005-000-121 (Fisher Scientific NC9660079) | |
| PBS + Ca2+ + Mg2+ | Thermo Fisher Scientific, Gibco | 14040133 | |
| Premium 微量离心管:1.5 mL | Fisher Scientific | 05-408-129 | |
| SHARP 精密防护吸头,超长型 P-10 和 Eppendorf 10 µL | Denville Scientific | P1096-FR | |
| SHARP 精密屏障吸头, 适用于 P-1000 和 Eppendorf 1,000、1,250 和微量;L | Denville Scientific | P1126 | |
| SHARP 精密屏障吸头, 适用于 P-20 和 Eppendorf 20 µL | Denville Scientific | P1121 | |
| SHARP 精密屏障吸头, 适用于 P-200 和 Eppendorf 200 µL | Denville Scientific | P1122 | |
| 叠氮化钠 | Sigma-Aldrich | S8032 | |
| 丙酮酸钠 (100 mM) (100x) | Thermo Fisher Scientific, Gibco | 11360070 | |
| Super Glue | Gorilla | ||
| SuperFrost Plus 显微镜载玻片 | 费舍尔科技 | 12-550-15 | |
| TPP 离心管,容量 15 mL,聚丙烯 | TPP Techno Plastic Products | 91015 | |
| TPP 离心管,容量 50 mL,聚丙烯 | TPP Techno Plastic Products | 91050 | |
| 移液管,聚乙烯 | Millipore Sigma | Z135003 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T9284 | |
| 吐温-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
| Vari-Mix 平台摇杆 | Thermo Fisher Scientific | 09-047-113Q | 设置为 20 RPM |
| 振动切片机 | Leica Biosytems | VT1000 S |