这是一种常用的方法 秀丽隐杆线虫 性腺解剖结合冷冻裂解,用于制备生殖系样本以进行免疫荧光分析 通过 抗体染色,或仅使用DAPI染色以观察DNA。该方案已成功应用于科研实验室中的本科生,以及基于课程的本科生科研实践教学中。
方法文章
* These authors contributed equally
这是一种常用的方法 秀丽隐杆线虫 性腺解剖结合冷冻裂解,用于制备生殖系样本以进行免疫荧光分析 通过 抗体染色,或仅使用DAPI染色以观察DNA。该方案已成功应用于科研实验室中的本科生,以及基于课程的本科生科研实践教学中。
C. elegans 的生殖系是研究减数分裂的优良模型,部分原因在于对解剖后的动物进行细胞学分析十分简便。整体封片标本能够保持减数分裂细胞核的结构,更重要的是,每条性腺臂均按时间-空间顺序排列着减数分裂的所有阶段,便于识别处于不同阶段的细胞核。成年雌雄同体线虫具有两条性腺臂,每条均为封闭的管状结构,远端闭合处为增殖的生殖系干细胞,近端开口处为已细胞化的卵母细胞,两条性腺臂在中央汇入子宫。通过解剖可将一条或两条性腺臂从体腔中释放出来,从而实现对整个减数分裂过程的观察。本文介绍了一种针对目标蛋白的常用免疫荧光染色方案,并结合 DAPI 染色以标记所有染色体。选取年轻成虫,用左旋咪唑固定后,迅速使用两根注射器针头进行解剖。在生殖系组织挤出后,样品先经固定,随后在液氮中进行冷冻裂解,以增强角质层及其他组织的通透性。之后,样品可依次经乙醇脱水、再水化,并与一抗和二抗孵育。DAPI 在封片介质中加入,有助于 DNA 的可靠观察,并便于在荧光显微镜下定位待成像的个体。对于熟悉 C. elegans 操作的研究者而言,仅需数小时练习解剖技术即可掌握该方法。该方案已被用于培训高中生及科研实验室中的本科生,并已纳入一所文理学院的课程化本科科研实践课程中。
减数分裂是所有有性生殖生物用于产生配子(卵细胞和精子/花粉)的特殊细胞分裂方式1,2。交叉重组是指同源染色体之间发生的DNA片段互换,对减数分裂至关重要,既为遗传多样性提供了重要来源,也有助于维持世代间的基因组稳定性。在减数分裂过程中未能形成至少一个交叉的染色体将随机分离,可能导致染色体不分离,产生染色体数目异常的配子——这种情况通常会导致子代无法存活3。在减数分裂中,交叉由程序化的DNA双链断裂诱发4。其中一部分断裂会以交叉的方式被修复,形成称为交叉点(chiasmata)的DNA物理连接结构,有助于同源染色体在细胞分裂前正确排列5。减数分裂的各个阶段在所有真核生物中高度保守,其染色体构象特征明显,易于识别。
减数分裂是生物学中的一个基本概念,学生会在不同的生物学课程中多次接触到这一主题。通常在高中阶段,学生会初步学习减数分裂过程中染色体分离的机制;而在大学阶段的课程中,则更侧重于染色体分离的细胞生物学机制以及交换重组对遗传的影响。然而,对许多学生而言,减数分裂是一个 notoriously 难以掌握的概念1。如果学生未能理解基因、DNA、染色体与减数分裂之间的关系,就容易产生误解,并在知识理解上留下空白,从而阻碍其对遗传规律的全面掌握6,7。提高学生对抽象概念理解的一种有效方法是提供具体、动手参与的实践活动。例如,在讲授减数分裂时,教师可以选择模拟分子分析的活动8、使用允许学生操作分子结构的三维模型9,或通过角色扮演让学生亲自演绎分子层面的动态过程1。引入具有未知结果的研究是一种特别有效的教学策略。这种教学实践被称为基于课程的本科生科研经历(course-based undergraduate research experience, CURE),不仅能加深学生的理解,还有助于增强其科学态度和自主性,尤其对那些在科学、技术、工程和数学(STEM)领域中代表性不足群体的学生更为有益10,11。线虫 Caenorhabditis elegans 因其在行为、繁殖力和遗传杂交方面的研究适宜性,非常适用于课堂教学,是向学生介绍生物学研究的高效模式生物12。
C. elegans 将分子遗传学与简单的细胞学分析相结合,成为细胞生物学研究中一种强大的模式生物。它也特别适合用于生物学课堂教学13,14,15。在实验室中,它们易于培养且成本低廉,在标准室温或最常用的20 °C培养条件下,每3天即可产生数百个子代。重要的是,它们可以以甘油菌种的形式冷冻保存于-80 °C冰箱中,这意味着新手研究人员在饲养过程中出现的任何失误都可轻易纠正16。此外,其基因组注释完善,可支持正向和反向遗传学技术的应用17,18,使得C. elegans 能够用于回答从分子水平到进化水平的各类生物学问题。最后,C. elegans 研究领域已形成一个富有支持性的科研社区,通常乐于为初出茅庐的科学家提供帮助与建议19。这些优势促使C. elegans 被广泛应用于多种类型教育机构开设的课程整合科研项目(CUREs)中12,19,20,21,22,23。
除了在研究和教学中的优势外,C. elegans 已成为研究减数分裂和生殖系发育的常用模型24,25,26。这些动物具有光学透明性,便于进行细胞学研究27,且在成体中,性腺几乎占动物总体积的一半,提供了大量可用于研究的减数分裂细胞。在性腺中,减数分裂的生殖系细胞核呈流水线式排列(图1);有丝分裂发生在性腺远端末端,细胞核随着向性腺近端移动而逐步经历减数分裂各阶段,最终受精胚胎从阴门产出。由于这种高度保守的空间排列也反映了减数分裂的时间进程,因此可根据染色体结构和在性腺中的位置,轻松识别不同阶段的细胞。最后,任何干扰减数分裂并导致非整倍体的异常过程都会产生易于鉴定的表型,即使初学者也能识别:如不育、胚胎致死,或雄性子代高发(Him 表型)28。
这是一种用于可视化减数分裂染色体的简单方案 秀丽隐杆线虫将固定、解剖、固定和抗体染色步骤均在同一块显微镜载玻片上进行,简化了实验流程,并实现了近乎完全的样品回收。该方法适用于简单的DAPI染色以观察染色体,也可用于免疫荧光染色以观察蛋白质在性腺中的定位。学生使用常规解剖显微镜解剖性腺,制备整体封片样本用于DNA或免疫荧光观察,并在复式荧光显微镜下成像。本实验方案已应用于高中生及本科学生科研教学中 秀丽隐杆线虫 研究实验室并整合到一所文理学院的课程型本科科研项目(CURE)中12尽管CURE课程的班级规模相对较小,但由于线虫品系和试剂的成本相对较低,该方案适用于各类教学机构的课程。教师主要受限于可用解剖显微镜的数量。此前的课程实施中,学生三人一组共用一台显微镜,整个实验分为三次90分钟的课时:第一次课练习解剖操作,第二次课进行解剖与DAPI染色,第三次课在宽场荧光显微镜下对玻片进行成像。本科生参与科研可为学生带来诸多益处11,29,包括学术和个人方面。将研究融入课程中 通过 CUREs 使学生能够在正常上课时间内参与科研活动11,30,31,这使得人们能够更便捷、公平地获得这些益处。
1. C. elegans 培养
注意:更多细节请参见 C. elegans 培养方案16 以及 Elgin 等人32 的文献。C. elegans 菌株可从 Caenorhabditis 遗传中心(https://cgc.umn.edu)轻松获取,并通过普通邮件寄送至美国任何地点。每株菌株费用为 10 美元,每个实验室或用户需支付每年 30 美元的费用。
2. 性腺解剖
3. 抗体染色
4. 封片与成像
DAPI 与 DNA 结合能力强,即使在多种条件下染色效果依然稳定(图 3A,B)。它应存在于所有细胞核中,因此可作为有效阳性对照,用于确认载玻片上是否存在线虫组织以及显微镜是否具备荧光检测能力。当抗体存在于减数分裂细胞核内时,染色效果良好(图 3A,B)。例如,图 3A,B 显示了用 DAPI 和靶向 RAD-51 的抗体对中期粗线期细胞核进行染色的结果,其中 RAD-51 是双链断裂的标志物。KLE-2 是凝缩蛋白(condensin)的一个组分,凝缩蛋白是一种高度保守的蛋白质复合物,在有丝分裂和减数分裂前参与染色体结构的构建。kle-2/+ 突变体在染色体结构上存在轻微缺陷,表现为 DAPI 染色略微紊乱,并且双链断裂数量增加,反映为 RAD-51 焦点数量增多(图 3B)。免疫荧光实验中的一个常见错误是将样品在固定液中放置时间过长。过度固定可能导致染色失败,因为它通常会阻碍抗体扩散进入细胞核。当抗体出现在性腺的细胞质区域,但被排除在细胞核之外时,即可识别出该错误。
在生殖系中(图1),细胞核在远端末端进行有丝分裂增殖,进入过渡区后开始减数分裂,并经过粗线期(通常根据细胞核排数分为三个相等的阶段),随后进入双线期,最终到达终变期。终变期的卵母细胞根据其与受精囊的相对位置进行编号,其中-1号卵母细胞最靠近受精囊,-2号卵母细胞次之,依此类推。C. elegans 具有六条染色体,在终变期的细胞核中表现为紧凑的椭圆形结构。每一条代表一对由交叉(chiasma)连接的姐妹染色单体,也称为二价体(bivalent)(图3C)。像 spo-11 这类破坏交换(crossover)形成的突变体,无法形成交叉结构,因此终变期的细胞核中会出现12个独立的DAPI染色信号(也称为单价体,univalents),每个信号对应一条姐妹染色单体(图3D)。

图1:生殖系细胞核以时空有序的方式排列,反映了其在减数分裂过程中的进展。(A)经DAPI染色的整装年轻成虫雌雄同体。图中勾画出性腺及减数分裂各阶段,从远端顶端(星号)至近端区域(箭头所示的-1卵母细胞),后者包含受精囊(三角形)。比例尺为100 µm。(B)经DAPI染色的分离雌雄同体性腺的投影荧光图像。图中标注了减数分裂各阶段,插图中展示了代表性细胞核(所有插图彼此按相同比例显示)。根据细胞核在生殖系中的位置及其特征性的染色体形态,可清晰判断其阶段,依次从远端顶端(星号)的有丝分裂区,经过渡区,至粗线期、双线期和终变期。受精囊以三角形标记。本图经许可改编自Hillers等人的研究,采用CC BY 3.0许可协议28。请点击此处查看本图的放大版本。

图 2:解剖操作设置示意图。(A)解剖过程中的显微镜载物台。将线虫置于载片上盖玻片中的 4 µL 解剖液内进行解剖,通过移动载片使盖玻片进入视野。图中显示了持针的理想位置。持针时针尖斜面朝下,在咽部区域上方交叉,粉红色箭头表示针的剪切样运动。粉红色虚线表示理想的切割位置。(B)解剖后线虫的图像,展示了一例完整外翻和一例不完全外翻的情况。图中外翻的性腺和肠道部分已作标注。(C)展示冷冻裂解步骤的图像。一只手应牢固握住载玻片,使盖玻片一侧背离身体,另一侧边缘抵住实验台。另一只手握住剃刀。粉红色箭头指示剃刀移动方向,以轻弹方式将盖玻片从载玻片上弹离,同时稍作扭转,使盖玻片远离身体方向飞出。注意盖玻片应放置成一角悬于载玻片长边之外。(D)在玻璃胚胎染色皿中进行解剖练习的装置示意图。将线虫置于 50–200 µL 解剖液中,可避免蒸发问题并延长解剖操作时间。请点击此处查看此图的放大版本。

图3:生殖系细胞核的代表性荧光结果。(A,B)晚期粗线期细胞核的Z轴投影图像,使用RAD-51抗体(绿色)和DAPI(红色)染色,其中(A)为野生型,(B)为kle-2/+杂合子。(C,D)单个终变期细胞核的Z轴投影图像,使用DAPI染色,其中(C)为野生型(显示六个DAPI染色结构),(D)为spo-11突变体(显示12个DAPI染色结构)。比例尺表示5 µm。请点击此处查看该图的放大版本。
有性生殖需要产生单倍体配子,这些配子是通过减数分裂形成的 通过 减数分裂这一特殊形式的细胞分裂。 秀丽隐杆线虫 因其光学透明性、便于观察的生殖系统结构以及强大的遗传学工具,已成为减数分裂细胞学研究的常用模型28通过将简单的生物体实验(如评估生育力和胚胎致死率)与分子遗传学方法相结合,可以在实验室或课堂教学中解答多种科学问题。例如,由于交叉互换对染色体正确分离至关重要,任何干扰其形成或解析过程的机制都会导致非整倍体配子的产生。而非整倍体将进一步引发无法存活的子代,这一现象可通过统计子代数量,或采用稍复杂的胚胎致死率测定方法进行简便评估。在细胞学层面,交叉互换的缺失会影响终变期(diakinesis)观察到的DAPI染色体结构数目。由于DAPI染色信号强且易于计数,该实验非常适于教授细胞学技术。雌雄同体生殖系中细胞核具有时空上的有序排列,可在单一时间点呈现减数分裂各阶段的完整图景。细胞核从生殖腺远端的有丝分裂区向近端移动并完成发育,整个过程约需54小时(实例参见Jaramillo-Lambert et al.)。33,Stamper 等34 和 Libuda 等人35这一成熟的减数分裂进程时间框架使得脉冲-追踪标记或DNA损伤实验得以顺利进行。
由于DAPI染色几乎总是有效,因此可作为荧光显微镜实验的一项有用的技术对照(并能为正在接受培训的显微镜操作人员带来成就感)。抗体染色结果可能更具变异性,因此可用于评估重复样本之间的可重复性。C.elegans的性腺在固定时往往难以保持一致性,因为该步骤需要在维持染色体结构完整性和允许足够抗体渗透之间取得平衡。使用甲醛固定最有利于保持染色体形态,而通过多聚甲醛安瓿新鲜配制的甲醛溶液可获得最可重复的结果。也可使用由福尔马林(37%水溶液甲醛与甲醇)配制的甲醛溶液。每种抗体所需的固定强度和时间可能需要通过实验经验来确定。替代方法包括在步骤2.4中省略甲醛固定,在冻裂后,将样品浸入-20 °C的100%乙醇中,或先在100%甲醇中浸润10分钟,再于-20 °C下浸入100%丙酮10分钟。这些固定条件有利于抗体更好地渗透,但会对组织形态产生不利影响(染色体会显得膨胀、松散)。
步骤2中所述的解剖和固定步骤的时间控制非常重要。由于解剖液的体积非常小,蒸发会影响最终的固定浓度,从而导致抗体染色结果不稳定。一位经验丰富的秀丽隐杆线虫(C. elegans)操作人员从开始(步骤2.3)到完成固定(步骤2.4)可在不到2分钟内制备好一张载玻片样品。主要的技术难点在于能否将线虫准确挑入解剖液滴中并迅速完成解剖。在较大体积液体中学习解剖操作可能更为容易。初学者可首先将线虫挑入玻璃胚胎染色皿中的50–200 µL解剖液内(图2D);较宽广的液面提供了更大的操作空间,便于确定针头的理想位置以获得良好的性腺外翻效果,同时较大的液体体积也减轻了蒸发带来的影响。在熟练掌握解剖动作后,学习者可先尝试在染色皿中使用50 µL液体进行解剖,然后过渡到在载玻片上使用20 µL液体进行操作。一旦能够在载玻片上顺利操作,学习者便可逐步减少液体用量,直至能够在4 µL的极小体积下快速完成操作,使蒸发效应可忽略不计。
如果解剖时机难以把握,学员可在步骤 2.3 中使用 8 µL 解剖液进行解剖。随后在步骤 2.4 中加入 8 µL 固定液,轻轻吹打混匀(需密切观察,确保尸体未被破坏或吸走),并从混合液中移除 8 µL。这种替代方法将获得相同的最终体积(8 µL)和相同的最终固定浓度;该体积对于确保在步骤 2.5 的冷冻裂解过程中尸体能够同时接触盖玻片和载玻片表面至关重要。如果即使在较大体积解剖液中操作,制备每张载玻片的时机仍存在问题,Gervaise 和 Arur26 已描述了一种用于生殖系免疫荧光实验的悬浮法。
使用免疫荧光技术观察蛋白质的主要局限性 原位 获得针对特定目标蛋白的一抗是本实验的关键。然而,如果已构建了带有标签的蛋白版本,则可调整本方案以检测该标签。针对常见标签(如 FLAG、HA 或 GFP)的一抗通常易于获取。对于 GFP 等荧光标签,其荧光信号常在固定步骤中被淬灭,因此建议使用抗 GFP 的一抗进行检测,而非依赖其自身的荧光信号。本方案的另一局限性在于,它仅能捕捉某一时间点的生殖系状态(尽管样本中将包含卵子发生的所有阶段)。因此,该技术可能遗漏卵母细胞在卵子发生过程中发生的动态变化。然而,配子发生的时间进程已在模式生物中得到深入研究。 秀丽隐杆线虫;在野生型年轻成虫中,卵母细胞从生殖系远端末端(有丝分裂区)发育至双线期约需60小时33因此,通过脉冲追踪实验或照射等特定干预措施,再结合时间进程分析,可观察减数分裂不同阶段的影响。
综上所述,本实验方案描述了秀丽隐杆线虫(C. elegans)性腺解剖及随后的DAPI与抗体染色,用于荧光显微镜观察。解剖与固定(步骤2)耗时60至90分钟,具体时间取决于制备的载玻片数量。抗体染色(步骤3)主要为非操作时间,最短约7小时,最长可达1.5天,具体取决于抗体孵育时间。封片(步骤4.1–4.7)约需15分钟。该可视化生殖系染色体与性腺的通用方法,只要存在相应的抗体或荧光标记试剂,即可用于任何蛋白质的细胞学研究。在最简单的应用中,通过DAPI染色双线期细胞核,可用于筛选影响减数分裂重组的因子。当结合对后代数量、雄性子代发生率(Him表型)以及胚胎致死率等个体水平的分析时,该细胞学方法可为基于群体的分析提供单细胞层面的对应验证。
作者声明无利益冲突需要披露。本稿件中的内容完全由作者负责,不一定代表美国国立卫生研究院或美国国家科学基金会的官方观点。
Lee 实验室的工作由美国国立卫生研究院下属的国家普通医学科学研究所(资助号 1R15GM144861)和国家儿童健康与人类发展研究所(资助号 1R15HD104115)提供支持。DA 受马萨诸塞大学洛威尔分校肯尼迪科学学院科学学者项目资助。NW 受马萨诸塞大学洛威尔分校荣誉学院奖学金及马萨诸塞大学洛威尔分校 STEM 人才拓展项目(UMLSAMP)奖学金资助(美国国家科学基金会资助号 HRD-1712771)。我们感谢 A. Gartner 提供 RAD-51 抗体。所有 C. elegans 菌株均由 Caenorhabditis 遗传学中心提供,该中心由美国国立卫生研究院研究基础设施项目办公室资助(资助号 P40 OD010440)。
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| C. elegans spo-11 (me44) 突变体 | Caenorhabditis 遗传中心 | TY4342 | 该品系的完整基因型为:spo-11(me44) IV / nT1[qIs51] (IV:V)。该品系中 spo-11 基因由一条带有咽部 GFP 标记的平衡染色体维持。挑选非绿色个体以获得纯合的 spo-11 突变体。 |
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