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方法文章

利用连接臂上的硫鎓中心构建环状多肽

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DOI:

10.3791/64289

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2022年9月28日

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* These authors contributed equally

本文内容

摘要

本方案介绍了环状肽的合成方法 通过 半胱氨酸与甲硫氨酸之间的双烷基化反应,以及由丙炔基锍中心引发的高效硫醇-炔反应。

摘要

近年来,环肽因其优异的生物活性而在药物发现领域受到越来越多的关注,并已进入临床应用。因此,探索有效的环肽合成策略对其在药物发现领域的应用至关重要。本文报道了一种利用树脂上或分子内(分子间)双烷基化反应高效合成环肽的详细实验方案。采用该方案,通过固相肽合成技术,在树脂上同时偶联半胱氨酸(Cys)和甲硫氨酸(Met)来合成线性肽;进一步地,通过双烷基化反应合成环肽 通过 利用可调节的连接链和链上锍中心实现甲硫氨酸(Met)与半胱氨酸(Cys)之间的双烷基化。整个合成路线可分为三个主要步骤:树脂上Cys的脱保护、连接链的偶联,以及在三氟乙酸(TFA)裂解溶液中Cys与Met之间的环化反应。此外,受锍中心反应性的启发,将丙炔基引入Met以触发巯基-炔加成反应,从而形成环肽。随后,粗肽经干燥后溶于乙腈,通过高效液相色谱(HPLC)进行分离和纯化。采用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)确认环肽的分子量,并进一步通过HPLC验证环肽在还原剂存在下的稳定性。此外,通过核磁共振分析了环肽中的化学位移 1氢核磁共振(1氢核磁共振(H NMR)谱图。总体而言,本方案旨在建立一种合成环肽的有效策略。

引言

蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)1在药物研究与开发中发挥着关键作用。通过化学手段构建具有固定构象的稳定化多肽,是开发PPI模拟基序的最重要方法之一2。迄今为止,已有多种靶向PPIs的环状多肽被开发用于临床应用3。大多数多肽被限制为α-螺旋构象,以降低构象熵,并提高其代谢稳定性、靶标结合亲和力以及细胞通透性4,5。在过去20年中,研究人员已将Cys6,7、赖氨酸(lysine)8,9、色氨酸(tryptophan)10、精氨酸(arginine)11以及Met12,13的侧链引入非天然氨基酸中,以将多肽固定为环状构象。这类环状多肽可靶向独特的化学空间或特定位点,从而引发共价反应,形成蛋白质-多肽共价结合

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方案

1. 仪器设备准备

警告:吗啉、N,N-二甲基甲酰胺(DMF)、二氯甲烷(DCM)、N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、三氟乙酸(TFA)、哌啶、乙醚和甲醇具有毒性、挥发性和腐蚀性。这些试剂可通过吸入、摄入或皮肤接触对人体造成伤害。进行所有化学实验时,应使用防护装备,包括一次性手套、实验服和护目镜。

  1. 按照 图1 所示,使用 Rink-酰胺 4-甲基二苯甲基胺(MBHA)树脂,通过标准的手动 Fmoc 固相多肽合成法(SPPS)29 构建所有多肽底物。
  2. 构建线性多肽可选择以下两种方法之一:其一,使用缩合剂 2-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(HATU)和 N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)作为试剂;其二,使用 1-羟基苯并三唑(HOBT)和 N,N'-二异丙基碳二亚胺(DIC)作为酰胺缩合试剂。根据多肽序列选择合适的合成方案。
  3. 为建立手动多肽合成装置,将改装后的真空固相萃取设备置于通风橱中,并连接三通旋塞。然后将聚丙烯滤芯或玻璃反应器安装在设备上,并接入氮气(N2)气体。
    注:改装真空固相萃取设备时,需移除萃取管,保留真空密封系统。
  4. 将 MBHA 树脂装入树脂填充柱中,并用 DMF ....

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结果

所有线性肽均采用标准手动Fmoc固相合成法在Rink-酰胺MBHA树脂上合成。如图5A所述,构建了一种模型环状六肽(Ac (cyclo-I)-WMAAAC-NH2)。值得注意的是,通过甲硫氨酸烷基化反应生成了一个新的连接臂手性中心,两种差向异构体环肽(Ia、Ib)经反相HPLC确认。此外,通过反相HPLC峰面积积分确定了差向异构体的转化率及其比例。由线性六肽Ac-WMAAAC-NH2生成的环化产物Ac-(cyclo-I)-WMAAAC-NH2(1-Ia和1-Ib)表现出不同的保留时间但具有相同的分子量(图5B)。接下来,进一步测试了该环肽对不同官能团的耐受性,结果如图5C所示。使用双卤素连接子评估了10种线性肽的成环效率,结果显示所有肽均能高效生成相应的环状肽。与其他环肽相比,一种具有高转化率的模型六环环肽产生了1:1的差向异构体比例,并可通过HPLC分离。然而,在某些情况下,肽的差向异构体在H.......

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讨论

本文所述的合成方法提供了一种利用肽序列中的Cys和Met合成环肽的途径,其中基本的线性肽通过常规的固相肽合成技术构建。对于Cys与Met之间的双烷基化环肽合成,整个合成路线可分为三个主要步骤:树脂上Cys的脱保护、连接子的偶联,以及在三氟乙酸裂解溶液中Cys与Met之间的环化反应。值得注意的是,Cys保护基的去除被发现是后续成环反应的关键步骤。因此,需对Trt-Cys进行脱保护处理,直至溶液不再呈现明显的黄色为止。进一步研究表明,通过Cys与Met之间双烷基化方法开发的环肽可拓展应用于多种肽的环合,前提是该肽含有Cys和Met这两种氨基酸。此外,肽序列和连接子也可根据实验设计进一步调整(图5)。因此,有必要通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)对合成过程进行监测。

对于硫醇-炔型反应中的环状肽,首先在树脂上通过常规的固相肽合成技术构建线性肽,随后在液相溶液中进行以下反应。粗肽从树脂上裂解后,通过反相高效液相色谱法进行纯化。将肽溶液与炔丙基溴混合,加入0.2 mL的MeCN/H2O (1:1, v/v) .......

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

我们感谢国家重点项目&中国#38;D计划(2021YFC2103900);国家自然科学基金项目(21778009 和 21977010);广东省自然科学基金(2022A1515010996 和 2020A1515010521);深圳市科技创新委员会项目(RCJC20200714114433053、JCYJ201805081522131455 和 JCYJ20200109140406047);深圳-香港脑科学研究院—深圳市基础研究机构项目(2019SHIBS0004)。作者感谢期刊提供的支持 化学科学, 英国皇家化学学会,参考文献30 有机化学杂志,美国化学会,参考文献31。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
1,3-双(溴甲基)苯EnergyD0215
1,3-二甲基巴比妥酸EnergyA46873
1H NMR 和 HSQCBruker AVANCE-III 400
1-羟基苯并三唑水合物EnergyE020543
2-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(HATU)EnergyA1797
2-巯基吡啶EnergyY31130
6-氨基己酸EnergyA010678
乙酸酐EnergyA01021454
乙腈Aldrich9758
碳酸铵Energy12980
二氯甲烷(DCM)EnergyW330229
数字加热冷却干浴器 Thermo Scientific88880029
二异丙基乙胺(DIPEA)EnergyW320014
二甲基甲酰胺(DMF)EnergyB020051
二硫苏糖醇EnergyA10027
电喷雾电离质谱SHIMADZU2020 LC-MS2020
Fmoc-Ala-OH南京肽研生物科技有限公司R30101
Fmoc-Arg(Pbf)-OH南京肽研生物科技有限公司R30201
Fmoc-Cys(Trt)-OH南京肽研生物科技有限公司R30501
Fmoc-Gln(Trt)-OH南京肽研生物科技有限公司R30601
Fmoc-Glu(OtBu)-OH南京肽研生物科技有限公司R30701
Fmoc-His(Boc)-OH南京肽研生物科技有限公司R30902
Fmoc-Ile-OH南京肽研生物科技有限公司R31001
Fmoc-Lys(Boc)-OH南京肽研生物科技有限公司R31201
Fmoc-Met-OH南京肽研生物科技有限公司R31301
Fmoc-Pro-OH南京肽研生物科技有限公司R31501
Fmoc-Ser(tBu)-OH南京肽研生物科技有限公司R31601
Fmoc-Thr(tBu)-OH南京肽研生物科技有限公司R31701
Fmoc-Trp(Boc)-OH南京肽研生物科技有限公司R31801
Fmoc-Tyr(tBu)-OH南京肽研生物科技有限公司R31901
Fmoc-Val-OH南京肽研生物科技有限公司R32001
甲酸EnergyW810042
高效液相
色谱
SHIMADZULC-2030
甲醇Aldrich9758
吗啉AldrichM109062
N,N'-二异丙基碳二亚胺EnergyB010023
茚三酮试剂EnergyN7285
丙炔基溴EnergyW320293
Rink 酰胺 MBHA 树脂南京肽研生物科技有限公司
固相萃取(SPE)样品收集板 Thermo Scientific60300-403
四(三苯基膦)钯EnergyT1350
三通旋塞阀Bio-Rad7328107
三乙胺EnergyB010737
三氟乙酸(TFA)J&K101398
三异丙基硅烷(TIS)EnergyT1533

参考文献

  1. Arkin, M. R., Tang, Y. Y., Wells, J. A. Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: Progressing toward the reality. Chemistry Biology. 21 (9), 1102-1114 (2014).
  2. Shi, X. D., et al. Reversible....

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重印与许可

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