本文介绍一种新型的流式细胞术方法,可直接从新鲜的小鼠骨髓和脾脏中前瞻性分离早期红系爆式集落形成单位(BFU-e)和红系集落形成单位(CFU-e)前体细胞。该实验方案基于单细胞转录组数据开发,是首个能够以高纯度分离出全部组织中红系前体细胞的方法。
本文介绍一种新型的流式细胞术方法,可直接从新鲜的小鼠骨髓和脾脏中前瞻性分离早期红系爆式集落形成单位(BFU-e)和红系集落形成单位(CFU-e)前体细胞。该实验方案基于单细胞转录组数据开发,是首个能够以高纯度分离出全部组织中红系前体细胞的方法。
早期红系祖细胞最初是根据其集落形成潜能定义的 体外 并分为爆式集落形成和集落形成 "单位" 称为BFU-e和CFU-e。直到最近,仍缺乏能够直接、前瞻性地从新鲜分离的成年小鼠骨髓中完整分离出纯BFU-e和CFU-e前体细胞的方法。为填补这一空白,研究人员分析了小鼠骨髓的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,筛选编码细胞表面标志物的基因表达情况。该分析结合细胞命运测定实验,从而建立了一种新型流式细胞术方法,可识别并分离小鼠骨髓或脾脏中完整且纯净的BFU-e和CFU-e前体细胞亚群。该方法还可识别其他前体细胞亚群,包括富含嗜碱性粒细胞/肥大细胞潜能和巨核细胞潜能的亚群。该方法包括使用靶向Kit和CD55的抗体标记新鲜骨髓或脾脏细胞。表达这两种标志物的前体细胞进一步被划分为五个主要群体:群体1(P1或CFU-e,Kit+ CD55+ CD49f医学/低 CD105中/高 CD71中/高) 包含所有CFU-e祖细胞,可进一步细分为P1-低(CD71医学 CD150高)以及 P1-hi(CD71高 CD150低),分别对应早期和晚期CFU-e;群体2(P2或BFU-e,Kit+ CD55+ CD49f中/低 CD105中/高 CD71低 CD150高) 包含所有的BFU-e祖细胞;P3群(P3,Kit+ CD55+ CD49f中/高 CD105医学/低 CD150低 CD41低) 富含嗜碱性粒细胞/肥大细胞祖细胞;群体4(P4,Kit+ CD55+ CD49f中/高 CD105中/低 CD150高 CD41+) 富含巨核细胞祖细胞;而群体5(P5,Kit+ CD55+ CD49f中/高 CD105中/低 CD150高 CD41-) 包含具有红系、嗜碱性粒细胞/肥大细胞和巨核细胞潜能的前体细胞(EBMP),以及红系/巨核细胞/嗜碱性粒细胞偏向的多能前体细胞(MPPs)。这一新方法在分析红系及其他造血前体细胞时具有更高的精确性,并可对每一流式细胞术定义的细胞群体进行转录组信息的比对与参考。
红细胞生成可分为两个主要阶段:早期红细胞生成和红系终末分化(图1)1,2,3在早期红细胞生成过程中,造血干细胞定向分化为红系谱系,并产生早期红系祖细胞,这些祖细胞于20世纪70年代首次被鉴定,其依据是在半固体培养基中形成集落的能力。4,5,6,7,8,9一般来说,红系祖细胞分为两类:较早期的祖细胞,每个都能产生一个 "爆发" (由多个较小的红系细胞簇聚集而成的大团块),称为 "红系爆式集落形成单位" 或BFU-e4,5,6;及其子代,每个子代形成一个单一的小型红系细胞簇或集落,称为 "红系集落形成单位" 或CFU-e7,8,9BFU-e 和 CFU-e 尚未表达终末红系基因,且在形态上无法识别。经过若干次自我更新或扩增性细胞分裂后,CFU-e 发生转录转换,诱导血红蛋白等红系基因表达,从而进入红系终末分化(ETD)。1,10在红系终末分化过程中,成红细胞会经历三到五次成熟性细胞分裂,随后脱核形成网织红细胞,后者进一步成熟为红细胞。
终末分化过程中的成红细胞最初根据形态学特征被分为原成红细胞、嗜碱性成红细胞、多色性成红细胞和正色性成红细胞。流式细胞术的出现使得能够基于细胞大小(通过前向散射光,FSC测定)以及两种细胞表面标志物CD71和Ter119对这些细胞进行前瞻性分选与分离。11,12,13 (图1)。此类及类似的流式细胞术方法14 极大地推动了对红系终末分化(ETD)分子与细胞层面的研究,使得能够针对红细胞发育的特定阶段对成红细胞进行分析 体内 和 体外10,15,16,17,18,19,20CD71/Ter119 方法现已被常规用于红系前体细胞的分析。
直到最近,研究人员仍缺乏一种类似的、易于操作的流式细胞术方法,以直接、高纯度地前瞻性分离小鼠组织中的CFU-e和BFU-e。此前,研究人员所采用的流式细胞术策略仅能分离出这些前体细胞中的一部分,且常常伴随非红系细胞的共纯化,这些非红系细胞存在于相同的流式细胞术分群中。21因此,对BFU-e和CFU-e的研究仅限于 体外 从早期骨髓祖细胞中诱导并扩增BFU-e和CFU-e的分化系统。随后可在这些富集红系祖细胞的培养物中应用流式细胞术策略,以区分CFU-e与BFU-e22,23另一种方法利用胎儿期CFU-e和BFU-e,这些细胞在妊娠中期小鼠胎儿肝脏的Ter119阴性组分中高度富集10,24,25然而,这两种方法均无法对成人BFU-e和CFU-e在其生理状态下的特性进行研究 体内当回想起基于集落形成实验的结果时,便可理解这一挑战的难度:这些细胞在成年骨髓中的频率分别仅为0.025%和0.3%6.
本文所述方案是一种基于新鲜分离的小鼠骨髓Kit+细胞单细胞转录组分析的新型流式细胞术方法(Kit在骨髓所有早期前体细胞群体中均有表达)1。我们的方法包含了一些Pronk等人此前已使用过的细胞表面标志物21,26。通过单细胞转录组数据确定了能够识别红系及其他早期造血前体细胞的细胞表面标志物组合(图2)。具体而言,谱系阴性(Lin-)Kit+细胞中的CD55+组分可进一步划分为五个群体,其中三个群体对应红系发育轨迹的连续阶段(图2)。每个群体的转录组特征通过分选后进行单细胞RNA测序(scRNAseq),并将分选后的单细胞转录组数据投影回原始转录组图谱加以验证(可在 https://kleintools.hms.harvard.edu/paper_websites/tusi_et_al/index.html 查阅这五个群体及整个骨髓数据集中各基因的表达情况)1。 各群体的细胞命运潜能通过传统的集落形成实验(图2)以及一种新型高通量单细胞命运检测方法进行了验证1,27。这些分析表明,该新型流式细胞术方法可实现对新鲜成年小鼠骨髓和脾脏中所有BFU-e和CFU-e前体细胞的高纯度分离。具体而言,群体1(P1)仅包含CFU-e,不含其他造血前体细胞;群体2(P2)包含骨髓中全部的BFU-e前体细胞以及少量CFU-e,但无其他前体细胞1。下文详述的实验方案还以小鼠为例进行了说明,这些小鼠分别被注射了生理盐水或促红细胞生成素(Epo)。
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所有实验均按照马萨诸塞大学陈医学院机构动物照护与使用委员会批准的动物实验方案 A-1586 和 202200017 进行。
注意:本文详细介绍了两种实验方案:首先为流式细胞术分析(第1部分),随后为流式细胞分选的方案调整(第2部分)。以下方案使用具有10个通道的流式细胞仪/分选仪。步骤1.14.5中参考了表1提供的示例设置。本方案也可使用9个通道完成;详见表2中的图注。
1. 流式细胞术分析
2. 流式细胞分选的实验方案调整
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本方案描述了一种通过流式细胞术鉴定 freshly harvested 骨髓和脾脏细胞中 BFU-es 和 CFU-es 的方法。首先从实验小鼠中获取新鲜的骨髓(BM)和脾脏组织,并立即将组织置于冰上。所有操作均在低温条件下进行,以保持细胞活性。细胞使用“谱系”(lineage)抗体混合物进行标记,从而排除表达已分化血液谱系标志物的所有细胞(在流式细胞术分析中使用 FITC 标记的 Lin 抗体混合物,见表3;或使用磁珠富集法获取谱系阴性细胞,见表4)。同时,细胞还使用针对特定标志物的抗体进行标记,以便在谱系阴性细胞组分中区分多种早期前体细胞群体。标记完成后,进行流式细胞术分选或分析。流式分选的操作流程与流式分析相似,但需先通过磁珠富集 Lin- 细胞组分,以减少分选大量细胞所需的时间和成本。在分选前体细胞时,骨髓样本通常来自多只小鼠,具体数量取决于后续实验应用。一般而言,来自总共10只小鼠的骨髓(约 1 × 109 个细胞)可分别获得至少 50,000–100,000 个 P1-hi、P1-low 和 P2 群体细胞,细胞活...
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此前,研究人员一直难以直接从新鲜组织中前瞻性地分离出高纯度的BFU-e和CFU-e祖细胞。我们提出的新方法已通过单细胞RNA测序(scRNAseq)和细胞命运检测验证1,27,现在提供了实现这一目标的工具。
成功执行分选和分析方案的关键要点有若干。首先,细胞需以 900 x g 离心,以防止低密度细胞丢失。处于 CFU-e 阶段的许多细胞体积较大且密度较低,若不采取此措施则容易丢失。其次,在移液操作中上下吹打时,必须使用大孔径吸头,以帮助打散细胞聚集体,并防止脆弱的 P1 和 P2 细胞丢失。此步骤至关重要,因为许多 CFU-e 祖细胞与红细胞岛巨噬细胞(EBIs)相关联,若未能有效解离则会导致细胞丢失。第三,在染色前需用含 EDTA 的缓冲液("SB5")孵育细胞,以促进 EBIs 的解离。第四,在流式细胞术数据采集过程中,采集速率不应超过每秒 7,000 个事件,或不应超过所用流式细胞仪推荐的最大采集速率。
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作者声明无任何利益冲突。
本工作由美国国立卫生研究院(NIH)资助,资助项目编号为 R01DK130498、R01DK120639 和 R01HL141402
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 0.5 M EDTA,pH 8.0 | Life Technologies | 15575020 | |
| 1000 µL型大孔吸头 | 美国科学公司 | 1011-9000 | |
| Alexa Fluor 647 标记抗小鼠 CD55(DAF)抗体 | BioLegend | 131806 | |
| APC/Cyanine7 标记抗小鼠 CD117(c-kit)抗体 | BioLegend | 105826 | |
| 生物素-CD11b | BD 生物科学 | 557395 | M1/70(克隆) |
| 生物素-CD19 | BD 生物科学 | 553784 | 1D3(克隆) |
| 生物素-CD4 | BD 生物科学 | BDB553045 | RM4-5(克隆) |
| 生物素-CD8a | BD 生物科学 | BDB553029 | 53-6.7(克隆) |
| 生物素-F4/80 | Biolegend | 123106 | BM8(克隆) |
| Biotin-Ly-6G 和 Ly-6C | BD 生物科学 | 553125 | RB6-8C5(克隆) |
| Biotin-TER-119 | BD 生物科学 | 553672 | TER-119(克隆) |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1470 | |
| Brilliant Violet 421 抗人/小鼠 CD49f 抗体 | BioLegend | 313624 | |
| Brilliant Violet 605 抗小鼠 CD41 抗体 | BioLegend | 133921 | |
| Brilliant Violet 650 抗小鼠 CD150(SLAM)抗体 | BioLegend | 115931 | |
| BUV395 大鼠抗小鼠 TER-119/红系细胞 | BD 生物科学 | 563827 | |
| ChromPure 兔 IgG,全分子 | 杰克逊免疫研究实验室 | 011-000-003 | |
| DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚,盐酸盐) | Life Technologies | D1306 | |
| 用于 LSR II 的 Digital DIVA 硬件和软件 | BD 生物科学 | ||
| FITC 标记的抗小鼠 F4/80 抗体 | BioLegend | 123108 | |
| FITC 标记大鼠抗 CD11b | BD 生物科学 | 557396 | |
| FITC 标记大鼠抗小鼠 CD19 | BD 生物科学 | 553785 | |
| FITC 标记大鼠抗小鼠 CD4 | BD 生物科学 | 553047 | |
| FITC 标记大鼠抗小鼠 CD8a | BD 生物科学 | 553031 | |
| FITC 标记大鼠抗小鼠 Ly-6G 和 LY-6C | BD 生物科学 | 553127 | |
| FlowJo 软件 | FlowJo | 版本 10 | 流式细胞仪分析软件 |
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| PE 抗小鼠 CD105 抗体 | BioLegend | 120408 | |
| PE/Cy7 抗小鼠 CD71 抗体 | BioLegend | 113812 | |
| 磷酸盐缓冲液,10倍浓缩液 | Fisher Scientific | BP3994 | |
| 链霉亲和素纳米珠 | BioLegend | 480016 | 磁珠 |
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