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Research Article
Xing Fu1, Yuan Pan1, Yili Wang1, Zhaoqing Pei1, Binjie Xu1, Jing Zhang2, Jinsong Su1
1State Key Laboratory of Southwestern Chinese Medicine Resources, Innovative Institute of Chinese Medicine and Pharmacy,Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, 2School of Ethnic Medicine,Chengdu University of Traditional Chinese Medicine
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里,我们描述了一种通用方案和设计,可用于鉴定藏药中复杂的天然产物制剂(基质)中的痕量和微量成分。
藏药复杂,含有许多未知化合物,因此对其分子结构的深入研究至关重要。液相色谱-电喷雾电离飞行时间质谱(LC-ESI-TOF-MS)常用于提取藏药;然而,在使用光谱数据库后,仍然存在许多不可预测的未知化合物。本文开发了一种使用离子阱质谱(IT-MS)鉴定藏药成分的通用方法。该方法包括用于样品制备、MS设置、LC预运行、方法建立、MS采集、多阶段MS操作和手动数据分析的标准化和编程方案。采用多阶段碎裂法鉴定藏药 Abelmoschus 种子中的两种代表性化合物,并对典型化合物结构进行了详细分析。此外,本文还讨论了离子模式选择、流动相位调整、扫描范围优化、碰撞能量控制、碰撞模式切换、碎片因素和方法局限性等方面。所开发的标准化分析方法是通用的,可以应用于藏药中的未知化合物。
中药微量成分的定性分析已成为研究中的重要课题。由于中药中的化合物数量众多,很难将其分离出来用于核磁共振波谱仪(NMR)或X射线衍射仪(XRD)分析,这使得只需要低样品量的质谱(MS)方法越来越受欢迎。此外,液相色谱(LC)与MS联用近年来已广泛应用于中药研究中,用于改进复杂样品的分离和化合物的定性分析1。一种常用的方法是液相色谱-电喷雾电离飞行时间质谱(LC-ESI-TOF-MS),广泛用于藏药的定性研究2。使用这种方法,复杂组分在LC色谱柱中富集和分离,并使用MS检测器观察加合物离子的质荷比(m / z)。搜索串联 MS(MS/MS 或 MS2)数据库是目前使用四极杆飞行时间 (Q-TOF) MS 和 Orbitrap MS3 进行小分子分析中可靠化合物注释的最快方法。然而,数据库质量差和各种异构体的存在阻碍了未知化合物的鉴定。此外,MS/MS数据库提供的信息仅限于4,5,6,7。使用可广泛应用于其他中药的通用方案研究每种中药中的化合物具有重要意义。
IT-MS通过向环形电极施加不同的射频(RF)电压来捕获各种离子8。IT-MS可以按不同的时间顺序进行时间序列多阶段MS扫描,提供成分多阶段MS(MS n)碎片,其中n是产物离子级数9。线性IT-MS被认为是结构识别的最佳选择,因为它可用于顺序MSn 实验10。目标离子可以分离并积累在线性IT-MS 1中。IT-MS中的MSn (n ≥ 3)比Q-TOF-MS中的MS/MS提供更多的片段信息。由于IT-MS不能锁定目标离子及其碎片离子,因此它是阐明未知化合物(包括异构体1)结构的有力工具。MSn 技术已广泛应用于未知蛋白、多肽和多糖的结构分析11,12。MSn 中碎片离子的丰度水平比Q-TOF-MS中的MS/MS提供更多的复杂样品中靶向化合物的分子碎片信息。因此,将MSn 技术应用于中医的结构鉴定至关重要。
藏医药是中医13的重要组成部分,这些药物主要来源于高原地区14发现的动物、植物和矿物质。藏药Abelmoschus manihot种子(AMS)是Abelmoschus manihot(linn.medicus)的种子。AMS 是一种传统草药,用于治疗特应性皮炎、风湿病和麻风病等疾病。它含有查耳酮,具有抗菌,抗真菌,抗癌,抗氧化和抗炎作用15。本研究改进了MS n程序,并开发了一种使用IT-MS和MSn鉴定藏药AMS化合物结构的详细方法。优化了某些MS参数,包括离子模式、扫描范围和碰撞模式,以克服鉴定痕量化合物的问题。本研究旨在促进中药微量化合物的标准化结构鉴定。
1. 样品制备
2. 质谱设置
3. 液相色谱预运行、方法建立和MS采集
4. 操作多级质谱
5. 手动MSn 数据分析
以玻璃二糖为模型,验证了MSn在正离子模式下的可行性。如图2A所示,纤维二糖[C 12 H22O11]+的ESI-MS(正离子模式)在m / z 365处产生质子化分子[M + H]+。[M+H]+ 在 m/z 365 处的产物离子扫描 (CID-MS/MS) 在 m/z 305 处产生第二个碎片离子(图 2B),并使用 MS3 和 MS4 分析对其进行进一步分析(图 2C,D)。MS3 分析在 m/z 254 处产生第三个碎片离子,MS4 分析在 m/z 185 处产生第四个碎片离子。MS/MS分析(图2E)显示,m/z 60处丢失的碎片离子表明m/z 365处的离子碎裂序列,即开环水解(蓝色标记)、C-C键裂解(红色标记)和脱水(绿色标记)。同样,MS3分析显示,m/z 60处丢失的碎片离子表明m/z 305处离子的C-C键裂解(标记为红色)。MS4分析表明,在m/z 60处丢失的碎片离子意味着水解(蓝色标记)和脱水(绿色标记),导致离子与m / z 245裂解为具有m / z 185的离子。MSn分析中的阶梯断裂表明该方法可用于研究碳水化合物的结构。
使用LC-Q-TOF-MS对AMS进行的初步定性分析揭示了许多未知化合物的存在。其中一种是m/z 617处的离子,被选中在负模式下进行MSn分析。在AMS中m/z 617处的[M-H]−的产物离子扫描(CID-MS/MS)在m/z 571处产生了第二个碎片离子。该碎片离子的MS3分析在m / z 525处产生第三个碎片离子,MS4分析在m / z 345和273处产生第四个碎片离子(图3A-D)。m/z 571的MS3在m/z 525处通过CH2OH部分作为甲醇(-32 Da)和OH部分(-18 Da)作为水的损失而产生碎片离子。这些MS4结果用于手动鉴定化合物的"核心"结构,并通过比较离子及其碎片离子的m / z值来确定其原始结构。化合物在m / z 617处的分子结构及其在MSn中的裂解路径如图3E所示。使用MSn在阳性模式下分析m / z 365处的另一种未知化合物。在AMS中m/z 365处的[M+H]+离子的产物离子扫描(CID-MS/MS)在m/z 299、m/z 329和m/z 347处产生第二个碎片离子。对这些碎片离子的MS3分析在m / z 231处产生了第三个碎片离子(图4A-C)。化合物在m/z 365处的分子结构和裂解机理如图4E所示。

图1:使用IT-MS和多级质谱分析鉴定藏药中的未知化合物结构 。 (A)液相色谱用流动相。(二)液相色谱泵。(三)样板室。(D) MS 的离子源。 (E) MS 中离子阱模块的内部结构。 (F) MS4 光谱。(G)来自MS4 结果的分子结构信息。 请点击此处查看此图的大图。

图 2:正离子模式下 通过 IT-MS 对纤维二糖进行多级碎裂 。 (A)纤维二糖的原始质谱。(B) MS/MS光谱中的碎片离子。(C) MS3 光谱中的碎片离子。(D) MS4 光谱中的碎片离子。(五)纤维二糖的裂解机理和分子结构。 请点击此处查看此图的大图。

图 3:在负离子模式下 通过 IT-MS 对 m/z 617 处未知 AMS 化合物离子的多级碎裂和结构分析 。 (A) AMS的部分质谱。(B) MS/MS光谱中的碎片离子。(C) MS3 光谱中的碎片离子。(D) MS4 光谱中的碎片离子。(E)ams化合物离子在m/z 617处的切割机理和分子结构。 请点击此处查看此图的大图。

图 4:在正离子模式下 通过 IT-MS 在 m/z 365 处对未知 AMS 化合物离子进行多级碎裂结构分析 。 (A) AMS的部分质谱。(B) MS/MS光谱中的碎片离子。(C) MS3 光谱中的碎片离子。(D)ams化合物离子在m/z 365处的裂解机理和分子结构。 请点击此处查看此图的大图。
作者声明没有相互竞争的经济利益。
在这里,我们描述了一种通用方案和设计,可用于鉴定藏药中复杂的天然产物制剂(基质)中的痕量和微量成分。
这项工作由成都中医药大学杏林人才计划(030058191号)、四川省自然科学基金(2022NSFSC1470)和国家自然科学基金(82204765)资助。
| 乙腈 | Thermo Scientific | CAS 75-05-8 | LC-MS 级 |
| 甲酸 | Knowles | CAS 64-18-6 | HPLC 级 |
| 线性离子阱质谱仪 | Thermo Scientific | LTQ XL | |
| 液相色谱仪 | Thermo Scientific | U3000 | |
| LTQ Tune | Thermo Scientific | 2.8.0 | 版 MS 对照软件 |
| 甲醇 | Thermo Scientific | CAS 67-56-1 | LC-MS 级 |
| 纯水 | Thermo Scientific | CAS 7732-18-5 | LC-MS 级 |
| Xcalibur | Thermo Scientific | 2.0 版 | LC-IT-MS作软件 |