本实验方案描述了如何测量埃及伊蚊(Aedes aegypti)的常见生命参数数据,包括繁殖力、翅长、生育力、性别比例、存活力、发育时间、雄蚊贡献率以及成虫寿命。这些测量指标可用于评估转基因蚊虫的适合度。
本实验方案描述了如何测量埃及伊蚊(Aedes aegypti)的常见生命参数数据,包括繁殖力、翅长、生育力、性别比例、存活力、发育时间、雄蚊贡献率以及成虫寿命。这些测量指标可用于评估转基因蚊虫的适合度。
转基因蚊子与野生型蚊子相比通常表现出适合度代价。在此类研究中,适合度代价的评估涉及采集转基因蚊子的生命参数数据,并与具有相同遗传背景但不含转基因的蚊子进行比较。本文详细说明了如何测定蚊子常见的生活史性状 埃及伊蚊包括繁殖力、翅的大小与形态、生育力、性别比例、存活率、发育时间、雄性贡献以及成虫寿命。选择这些参数是因为它们能够反映生殖成功率,易于测量,且在文献中常被报道。代表性结果量化了基因敲除或单次插入基因驱动元件所导致的适合度代价。标准化生命参数数据的收集方法非常重要,因为此类数据可用于比较不同研究中产生的转基因蚊虫的健康状况,或用于模拟野生型蚊虫群体中转基因的固定速率。尽管本方案专门针对转基因 埃及伊蚊该方案也可用于其他蚊种或其他实验处理条件,但需注意某些生物学背景可能需要进行特殊调整。
“适者生存”是达尔文提出的观点,即拥有最适应其生存环境基因的个体将把这些基因传递给后代1。这意味着,正是适应度决定了其基因能否得以延续。这一已有150多年历史的概念,或许是设计转基因蚊子中成功基因驱动系统最关键的决定因素。基因驱动是指自私遗传因子以超越孟德尔遗传规律的方式在种群中扩散的现象2,目前正被探索用于遗传性害虫治理3。在媒介控制背景下,该策略旨在用对病原体具有抗性的个体取代野生型(WT)节肢动物(种群修饰),或彻底清除整个种群(种群压制)4。然而,与野生型同类相比,转基因蚊子通常表现出适应度代价(也称为遗传负荷),这意味着在竞争能力更强的种群中,外源基因将逐渐丢失。因此,必须将外源基因与基因驱动系统相结合,以抵消任何适应度代价,并推动外源基因在种群中的传播水平超过典型的孟德尔遗传预期4。
跨蚊媒种类的实验室研究表明,转基因通常表现出适合度代价5,6,7例如,Irvin 等 测量了多种生命参数 埃及伊蚊(Aedes (Ae.) aegypti) 在增强型绿色荧光蛋白(eGFP)或转座酶基因表达调控下构建 果蝇 actin 5C 或合成的 3XP3 启动子,并将其与野生型 Orlando 品系(即它们所来源的相同遗传背景)进行比较5最显著的是,他们发现所有转基因品系的繁殖适合度均显著降低5. 根据转基因的不同,某些 按蚊属(Anopheles) 表达抑制性转基因的蚊子 疟原虫 寄生虫发育也表现出适应性代价6具体而言, An. stephensi 在组成型或血餐诱导型启动子下表达蜜蜂毒液磷脂酶(PLA2)的个体,其产卵数显著少于对照组6。这些作者还发现,转基因 按蚊属 表达不同转基因时,SM1十二肽四聚体未表现出适合度代价,因此他们得出结论:转基因赋予的适合度代价至少在部分程度上取决于所表达转基因蛋白的作用效果6确实,适合度代价可能源于转基因产物、位置效应、脱靶效应、插入突变或实验室培育品系中的近交效应7因此,基因驱动必须具备足够的鲁棒性,以抵消这些由转基因引起的适应性代价,同时避免产生阻碍基因驱动本身的插入和缺失(indels)。
发育或生殖适合度代价可在实验室或笼养研究中进行测量7,但需注意的是,野外环境中未知因素也可能产生影响。尽管如此,在规划或评估转基因蚊子释放(例如基因驱动项目)时,受控的适合度研究是确定转基因品系能否在后续世代中持续存在的一个重要初步步骤。例如,Hammond et al. 评估了基于CRISPR/Cas9的An. gambiae基因驱动系统,该系统旨在破坏雌性生育力所必需的基因8。通过持续至少25代的笼养研究,作者发现蚊子产生了对基因驱动具有抗性的等位基因,这些等位基因阻断了CRISPR靶向切割并恢复了雌性生育力8。他们的建模分析表明,在模拟条件下,杂合子雌性中基因驱动相关的生育力变化对基因驱动的固定具有最显著的影响8。类似地,经过改造以在不同启动子控制下或在不同基因间位点表达自主基因驱动盒的Ae. aegypti(Higgs' White Eye品系,HWE),在模拟种群中表现出不同的基因驱动固定速率9。结合MGDrivE建模10、插入缺失(indel)形成率、母体效应以及实验室收集的生命参数数据,作者发现蚊子的适合度在模拟条件下对基因驱动的持续性影响最为显著9。最可能削弱基因驱动效率的适合度代价主要来源于体细胞中Cas9的(过量)表达或所靶向基因本身,尤其是在杂合子中,而非基因驱动机制的内在特性所致11,12,13,14,15,16,17。
鉴于其重要性,适合度是转基因品系在后续世代中持续存在的关键因素,也可作为评估转基因相关生理效应的指标。例如,脱靶效应可能与适合度代价相关。在此情况下,建议将转基因品系连续回交多代。此外,将转基因品系与代表野外种群的品系杂交,可能也有必要,以评估转基因种群在真实环境中的竞争能力。为了量化适合度代价并使其具有可比性,本文提供了测量埃及伊蚊(Ae. aegypti)常见生活史性状的简易实验方案,特别侧重于与转基因相关的适合度代价,以便此类研究更易于重复。所包括的实验方案涵盖繁殖力、生育力、性别比例、存活力、发育时间、雄性贡献以及成虫寿命。此外,选择测量翅长和翅面积作为适合度指标,因其与胸部长度18,19及体型大小相关,而体型大小又直接关联于血餐量、繁殖力和免疫力20,21。尽管评估适合度的方法众多,但本文选择这些参数是因为它们能够反映繁殖成功率,测量简便,且在文献中广泛报道。
注意:本方案适用于已验证并建立的转基因和野生型Ae. aegypti品系。有关生成转基因Ae. aegypti的更多信息,请参见 Kistler et al.22 和 Coates et al.23 。以下所述的所有实验均在标准的Ae. aegypti饲养条件下进行。蚊子饲养环境为28 °C,相对湿度75%–80%,光照周期为12小时光照/12小时黑暗。出于统计学考虑,强烈建议每种蚊株至少使用100张单独的产卵纸。全面的适合度研究大约需要3个月完成(图1)。
1. 雌性蚊虫繁殖力的测定
2. 测量翅长、翅面积和质心大小
3. 评估卵子受精能力
4. 蛹的性别比例测定
5. 幼虫存活力的测定
6. 幼虫至蛹发育时间的测定
7. 雄性贡献的测定
8. 蚊虫寿命的测定
根据上述方案,评估了两种蚊虫品系的适合度:(1)通过CRISPR/Cas9介导敲除埃及伊蚊(Ae. aegypti)D7L1(AAEL006424)唾液蛋白基因;(2)表达自主性CRISPR/Cas9基因驱动系统的埃及伊蚊(Ae. aegypti)品系9。对于前者,通过显微注射针对D7L1基因的特异性sgRNA至胚胎中,利用非同源末端连接(NHEJ)途径产生基因断裂,从而建立纯合D7L1基因敲除品系。为消除潜在的脱靶效应,将杂合D7L1-KO蚊虫与野生型(WT)回交四代后,获得稳定的纯合品系。对于后者,将一个基因驱动盒(gene drive cassette)敲入Carb109位点(Chr3:409699138),该盒在nanos(AAEL012107)或innexin-4(AAEL006726)启动子驱动下表达Cas9核糖核蛋白复合物(本方案中分别称为GD1和GD2),显微注射所用为CRISPR/Cas9注射混合物,操作如前所述9。阳性G1幼虫至少与野生型(WT)杂交两次以建立转基因品系,并通过PCR扩增及桑格测序对蚊虫基因组DNA进行检测,验证转基因的正确整合9。
在建立转基因/突变蚊株后,按照上述方案进行适合度研究。将纯合子D7L1-KO Ae. aegypti 的适合度与野生型(WT)Ae. aegypti 利物浦株(LVP株)进行比较,而将通过将纯合子品系与野生型回交获得的携带单拷贝基因驱动盒的半合子 Ae. aegypti 的适合度与HWE株进行比较。选择这些对照组是因为它们与其对应的转基因品系具有相同的遗传背景,但不携带转基因。从繁殖力研究(第1节)中每品系选取至少150–200只雌蚊,使其产卵以用于后续实验,以确保获得至少100份独立的F1代卵纸,满足统计学要求。下述生命参数的定义如下:(1)繁殖力:单只雌蚊在第一个 gonotrophic 周期中产卵的数量;(2)翅长、翅面积和重心尺寸:翅端到端的距离、翅的表面积,以及一种不受翅形变异影响的翅尺寸测量指标;(3)生育力:一个 gonotrophic 周期后产下的卵中发育出的幼虫总数除以该周期内产卵总数;(4)性别比例:雌性或雄性蛹的总数除以蛹的总数;(5)幼虫存活率:蛹的总数除以幼虫总数;(6)幼虫至蛹的发育时间:卵孵化后至发育为蛹所需的时间;(7)雄性贡献率:转基因阳性的F2代幼虫数除以幼虫总数;(8)寿命:成蚊在仅提供糖源条件下存活的天数。
缺乏D7L1蛋白的雄性蚊子表现出显著延迟的幼虫到蛹期以及蛹期到成虫的发育时间(图8)以及生存时间缩短(图9) 与 LVP WT 相比 埃及伊蚊此外, 埃及伊蚊 D7L1基因敲除蚊子的翅面积显著小于野生型个体,但翅大小或质心大小无显著差异图10)。该分析表明,基因改造并未改变蚊虫的体型,但可能诱发了发育压力,从而导致翅膀形态发生变化。另一方面,携带一个在表达调控下的基因驱动盒拷贝的蚊虫 纳米颗粒 (GD1)或 zpg (GD2)启动子与HWE品系相比,在适合度方面没有显著差异,但幼虫存活力除外表1). 埃及伊蚊 在基因驱动盒表达下 纳米颗粒 启动子表现出显著较低的幼虫存活率(p = 0.035).

图 1:适合度研究时间线。完成本文所述所有适合度研究方案所需的预计时间。每个生活史参数以红色突出显示。缩写:TG = 转基因型;WT = 野生型;O/N = 过夜。本图由 Biorender.com 制作。 请点击此处查看此图的放大版本。

图 2:通过生殖节叶区分雌性和雄性蛹。 雌性蛹在生殖节叶后方具有延伸的鳍状结构(黑色箭头),而雄性蛹则无此特征。请点击此处查看该图的放大版本。

图3:50 mL锥形管用作单个产卵室。 50 mL锥形管内衬白色滤纸(由红箭头指示),滤纸被裁成矩形后卷起,并用铅笔预先标记,可作为独立的产卵室。管口覆盖网膜,用两个橡皮圈固定,可在其上提供糖源。每个管中加入近5 mL水,作为水源。请点击此处查看该图的放大版本。

图 4:白色滤纸作为单只雌虫的产卵纸。 将裁成矩形的白色滤纸从单个产卵室中取出,并肉眼检查是否有卵,如此处所示。用铅笔在纸张左上角标记,有助于识别亲代雌虫。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 5:Aedes aegypti 翅片标志点。 共使用 14 个标志点(以红色显示),用于在 tpsDig 软件中进行翅片数字化,以生成二维笛卡尔坐标。在对所有图像进行坐标数字化的过程中,必须始终保持翅片坐标的顺序。请点击此处查看该图的放大版本。

图6:转基因幼虫筛选。 经基因工程改造后,在光感受器特异性启动子(3XP3)驱动下表达mCherry的转基因幼虫,可通过其眼部是否存在阳性荧光进行筛选(左图),而在非转基因幼虫中则无此荧光信号(右图)。使用体视显微镜观察,放大倍数为0.5x–4x。 请点击此处查看该图的放大版本。

图 7:用于寿命测定的蚊虫 containment 装置。 一个 64 盎司的纸盒,其顶部开口处覆盖丝袜材料,扭紧并打结封闭,可在实验过程中方便地接触和操作蚊虫,是进行寿命测定实验时理想的蚊虫 containment 装置。请点击此处查看该图的放大版本。

图8:雄性D7L1基因敲除型埃及伊蚊(Ae. aegypti)的幼虫至蛹期及蛹至成虫期发育时间延长。 幼虫至蛹期和蛹至成虫期的发育时间通过Kruskal-Wallis方差分析及Dunn's事后检验进行评估。野生型雄蚊化蛹所需时间短于野生型雌蚊(Dunn's检验,p < 0.05),而D7L1基因敲除型雄蚊与其雌性个体在化蛹时间上无显著差异(Dunn's检验,p > 0.05)。D7L1基因敲除型雌蚊达到化蛹的时间长于野生型雌蚊(Dunn's检验,p < 0.05),D7L1基因敲除型雄蚊也长于野生型雄蚊(Dunn's检验,p < 0.05)。在蛹至成虫发育时间方面,野生型与D7L1基因敲除型雌蚊之间无显著差异。野生型雄蚊化蛹速度较野生型雌蚊更快(p < 0.05),也快于D7L1基因敲除型雄蚊(p < 0.05)。D7L1基因敲除型雄蚊与雌蚊之间无显著差异(p > 0.05)。然而,D7L1基因敲除型雌蚊的发育速度慢于野生型雌蚊(p < 0.05)。缩写:WT = 野生型利物浦品系;F = 雌性;M = 雄性;D7L1 KO = D7L1基因敲除型Ae. aegypti。每种蚊株使用25只年龄匹配的雄性和25只雌性,N = 25。* = p < 0.05,Dunn's事后检验,Kruskal-Wallis方差分析;ns = 无显著性差异。柱状图表示均值 ± 标准误。请点击此处查看该图的放大版本。

图 9:野生型(利物浦品系)与 D7L1 基因敲除的埃及伊蚊(Aedes aegypti)雌雄个体在生存率上存在显著差异。 在研究期间,野生型雌蚊从未达到其中位生存时间:第 40 天时的生存概率 p(survival) = 0.83。其余各组均在 40 天前达到中位生存时间,且中位生存时间表现出明显的时间差异(野生型雄蚊 ≈ 33 天,D7L1 雌蚊 ≈ 39 天,D7L1 雄蚊 ≈ 22 天)。采用 Kaplan-Meier 法生成生存曲线,以模拟各品系随时间推移的生存情况并估算中位生存时间,同时考虑删失数据和非正态生存分布。通过 Log-Rank 检验评估组间差异。Log-Rank 检验假设删失为非信息性删失且风险成比例。随后使用 Cox 比例风险模型评估风险比,即在时间 t 时(在死亡尚未发生的情况下)每组相对于其他组的瞬时死亡风险。模型的比例风险假设成立,经 Schoenfeld 残差检验验证(通过 cox.zph 函数验证;性别和品系的 p > 0.05)。每种 Ae. aegypti 品系包含 50 只雄性和 50 只年龄匹配、未吸血的雌性蚊虫。 请点击此处查看该图的放大版本。

图10野生型(利物浦品系)和 D7L1 基因敲除 埃及伊蚊 雌性个体在翅面积上存在显著差异,但在翅长或重心大小上无显著差异。 通过成像翅膀并数字化标志点来测量翅长、翅面积和重心大小,以评估其大小和形状的变化。野生型与D7L1基因敲除型之间的翅面积存在差异,表明该基因敲除并未影响个体体型,但可能引发发育压力,从而改变翅的形态。A长度:野生型平均值 = 2.4 mm,σ = 0.21;D7L1 平均值 = 2.498 mm,σ = 0.35;差异无统计学意义(Mann-Whitney T 检验, p = 0.6370). (B面积:野生型均值 = 529,740 像素/平方毫米,σ = 58,852;D7L1 均值 = 457,879 像素/平方毫米,σ = 143,633。差异具有统计学意义(Mann-Whitney T检验,p = 0.0158)。C)质心尺寸:野生型均值 = 2,321 像素,σ = 61.08;D7L1 均值 = 2,296 像素,σ = 76.77,排除两个离群值。差异无统计学意义(Mann-Whitney T检验, p = 0.2993). 请点击此处以查看此图的放大版本。
| 组别 | 野生型(HWE) | GD1 | GD2 |
| 幼虫至蛹发育时间(天) | 9.8 ± 4.3 | 9.5 ± 5.6 | 9.5 ± 7.0 |
| 幼虫存活率(%存活) | 44.2 ± 7.3 | 30.9 ± 2.9* | 44.8 ± 2.5 |
| 成虫中雌性比例(%) | 45.4 ± 1.6 | 47.8 ± 1.5 | 48.2 ± 1.1 |
| 成虫中雄性比例(%) | 54.6 ± 1.7 | 52.2 ± 1.5 | 51.8 ± 1.1 |
| 50%雌性存活时间(天) | 34 ± 6.2 | 44.5 | 41.5 |
| 50%雄性存活时间(天) | 20.7 ± 3.3 | 16 ± 1.6 | 18 ± 4.5 |
| 繁殖力(产卵数) | 62.6 ± 2.8 | 57.6 ± 2.6 | 64.6 ± 2.0 |
| 生育力(卵孵化率,%) | 49.2 ± 8.2 | 44.0 ± 3.6 | 58.3 ± 3.4 |
| 雄性贡献率 | 35.3 ± 1.02 (1931/5447) | 25.6 (1035/4049) | |
表1:两种生物的生命参数数据 埃及伊蚊 与Higgs' White Eye(HWE)对照品系相比,携带基因驱动盒(gene drive cassettes)的半合子品系(GD1和GD2)。 来自半合子雄性或允许与野生型雌性交配的HWE雄性所得的数据。* = 0.01 < p < 0.05,采用单尾t检验。无星号表示单因素方差分析无显著性差异。数据以均值±标准误表示。本表格经修改自9.
补充文件 1:用于计算翅长和翅面积的 R 代码。代码文件名为:Supplemental_File_R_Winglengtharea.R。 请点击此处下载该文件。
补充文件 2:用于确定翅形质心大小和平均标志点的 R 代码。代码文件名为:Supplemental_File_R_Wingcentroidsize_meanlandmarks.R。请点击此处下载该文件。
Ae. aegypti 的适合度研究通常在实验室中进行,以评估与转基因载荷(例如, 基因驱动元件)或基因敲除相关的适合度代价,如本文所述;然而,这些研究也可用于多种其他目的——任何旨在评估 Ae. aegypti 群体健康状况的研究,例如感染 Wolbachia 的蚊株30,31、具有杀虫剂抗性的蚊株32,33,或感染节肢动物病毒的蚊株34。因此,由于这些实验可应用于广泛的目的,相关实验方案被设计为简单、高效且可重复。
研究人员在将实验室收集的适合度数据外推至野外蚊虫时应谨慎。在本方案中,对照组应为具有相同遗传背景但不含转基因(或处理条件)的蚊虫。然而,实验室中常用的野生型Ae. aegypti品系已近交繁殖多代,因此可能无法准确代表来自野外的蚊虫。例如,常用的实验室品系洛克菲勒(Rockefeller,ROCK)被认为最早于1881年从古巴采集的Ae. aegypti建立35。研究表明,洛克菲勒品系雌蚊在实验室中的寿命显著长于野外蚊虫36。另一个常用于转基因研究的实验室品系是希格斯白眼(Higgs' White Eye,HWE),该品系以Stephen Higgs博士命名,因其具有白眼突变表型而被选育37。由于这些蚊虫缺乏眼色素,相较于具有黑眼的野生型Ae. aegypti,其转基因表达的荧光标记更容易被检测 。然而,这些蚊虫的适合度显著低于野外来源的蚊虫38。此外,实验室中的适合度研究也不能完全反映蚊虫在野外所经历的环境条件。尽管如此,受控的实验室适合度研究仍能较好地反映一些在自然条件下难以测量的生命参数。在完成实验室适合度研究后,可能还需进行更大规模的笼养实验,以评估蚊虫在半野外条件下的适合度。
尽管本手稿主要针对埃及伊蚊(Ae. aegypti),但其中许多实验方案可经适当调整后适用于其他物种;然而,我们建议研究人员充分考虑目标物种的生物学特性,因为这些特性可能存在差异,从而需要对方案进行细微修改。例如,我们发现将干燥的单份卵纸进行两次孵化——即先将卵纸在水中孵化一次,随后将卵纸过夜干燥,再对同一批卵纸进行第二次水中孵化——相较于仅进行一次孵化,能更高效地反映实际的孵化率。但需要注意的是,埃及伊蚊(Ae. aegypti)的卵具有较强的抗干燥能力39,40,而其他蚊种可能不耐干燥,包括按蚊属(Anopheles)的大多数物种。
这些实验方案中最关键且耗时的步骤,可能是准确区分雄性和雌性蛹的性别。成虫在羽化后36-48小时交配41,因此必须正确鉴定蛹的性别,以确保后续杂交实验中使用的是处女蝇。雌性果蝇为一夫一妻制,而雄性为一夫多妻制,一只雄蝇可有效使至少五只雌蝇受精41,42,43。这意味着,若一只基因型错误的雄蝇被放入饲养笼中,可能会使至少五只雌蝇受精,导致该饲养笼在后续实验中基本失去价值;而单只基因型错误的雌蝇对一群雄蝇的影响则相对较小。
总之,我们概述了测量埃及伊蚊(Ae. aegypti)常见生活史性状的基本实验方案。这类研究在评估转基因蚊虫中与外源基因相关的适合度代价时具有极其重要的意义,因为这些数据可用于后续应用,例如建模分析。对于评估新型遗传控制策略的研究,在实际应用之前,还需在半野外条件下进行更大规模的笼养实验。
作者无任何利益冲突需要披露。
作者感谢密苏里大学的 Bill Reid 博士和 Alexander Franz 博士在本实验方案中提供的支持。作者还感谢美国国立卫生研究院/国家过敏与传染病研究所(NIH/NIAID)的 Benjamin Krajacich 博士在 R 分析方面提供的支持。本研究由美国国立卫生研究院资助,项目编号为 R01 AI130085(KEO),以及美国国立卫生研究院/国家过敏与传染病研究所内部研究计划项目编号 AI001246(EC)。
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