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方法文章

从无管螠(Sipunculus nudus)中亲和纯化纤溶酶

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DOI:

10.3791/65631

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2023年6月2日

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本文内容

摘要

本文介绍一种从无疣星虫(Sipunculus nudus)中分离纤溶酶的亲和纯化方法,该方法简便、经济且高效。

摘要

Sipunculus nudus来源的纤溶酶(sFE)是一种新型纤溶剂,既能将纤溶酶原激活为纤溶酶,又能直接降解纤维蛋白,相较于传统溶栓药物具有显著优势。然而,由于缺乏结构信息,目前所有sFE的纯化方案均依赖多步层析纯化,过程过于复杂且成本较高。本文首次基于sFE的晶体结构开发了一种亲和纯化方案,包括粗提样品的制备、赖氨酸/精氨酸-琼脂糖凝胶亲和层析柱的制备、亲和纯化及纯化后sFE的表征。按照本方案,可在1天内完成一批sFE的纯化。此外,纯化后sFE的纯度和活性分别达到92%和 19,200 U/mL 。因此,该方法是一种简便、经济且高效的sFE纯化策略。本方案的建立对于sFE及其他类似药物的进一步应用具有重要意义。

引言

血栓形成是公共卫生的主要威胁,尤其是在全球新冠疫情之后1,2临床上,许多纤溶酶原激活剂(PAs),如组织型纤溶酶原激活剂(tPA)和尿激酶(UK),已被广泛用作溶栓药物。PAs 可将患者体内的纤溶酶原激活为具有活性的纤溶酶,从而降解纤维蛋白。因此,其溶栓效率在很大程度上受限于患者的纤溶酶原状态3,4纤溶药物,如金属蛋白酶纤溶酶和丝氨酸纤溶酶,是另一类临床溶栓药物,还包括纤溶酶类(FE)如纤溶酶,可直接溶解血栓,但会迅速被多种纤溶酶抑制剂失活5随后,有研究报道了一种新型溶栓剂,其不仅可通过激活纤溶酶原转化为纤溶酶来溶解血栓,还能直接降解纤维蛋白6- 来自远古花生虫的纤溶酶 Sipunculus nudus (sFE)6这种双功能特性使sFE相较于传统溶栓药物具有其他优势,尤其是在异常纤溶酶原状态下。与其他双功能纤溶剂相比7,8,9,与非食品来源的药物开发试剂....

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方案

1. 准备

  1. 样品处理
    1. 仔细解剖新鲜的 S. nudus(100 g),收集肠道及其内部液体。
    2. 加入 300 mL Tris-HCl 缓冲液(0.02 M,pH 7.4)进行匀浆(1,000 rpm,60 s)。
    3. 反复冻融匀浆液 3 次。
    4. 离心样品(10,956 × g,0.5 h,4 °C),收集上清液。将样品置于 4 °C 保存,待后续使用。
  2. 蛋白质沉淀
    1. 将上清液与饱和硫酸铵溶液(九倍体积)混合,并于 4 °C 静置 12 h。
      注意:本步骤可在此暂停,后续继续操作。
    2. 离心(10,956 × g,0.5 h,4 °C)以获得蛋白质沉淀;将其在 4 °C 保存,供后续使用。
  3. 蛋白质重悬
    1. 用 30 mL Tris-HCl 缓冲液(0.02 M,pH 7.4)重悬蛋白质沉淀。将此粗蛋白溶液在 4 °C 保存,供后续使用。

2. 亲和层析

  1. 溶液过滤
    1. 将粗蛋白溶液通过 0.22 µm ....

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结果

按照本方案,提取了粗组织裂解液,构建了精氨酸-琼脂糖凝胶亲和层析柱和赖氨酸-琼脂糖凝胶亲和层析柱,获得了纯化的sFE,并分别通过SDS-PAGE和纤维蛋白平板法检测了纯化sFE的纯度和纤溶活性。

离心后,收集的上清液为透明的浅褐色黏稠液体。当该上清液与饱和硫酸铵溶液(九倍体积)混合时开始出现沉淀。静置12小时后,试管底部形成大量沉淀。将沉淀用Tris-HCl缓冲液重悬时,蛋白质沉淀迅速消失并溶解于缓冲液中,呈现为透明的淡黄色液体。

当蛋白溶液上样至精氨酸-琼脂糖亲和层析柱时,约40分钟时出现一个明显的峰(峰1,穿流峰),至约66分钟时停止洗脱。在梯度洗脱阶段,使用0.15 M NaCl洗脱时,约94分钟时出现一个明显的峰(峰2,洗脱峰),至约110分钟时停止洗脱。在后续的洗脱阶段(0.25 M、0.35 M、0.45 M、0.55 M和0.65 M NaCl)中未出现明显的洗脱峰(图1A)。本研究中,我们重复使用精氨酸-琼脂糖亲和层析柱多达10次,发现柱子的性能未发生.......

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讨论

由于无法获得sFE的精确基因序列,目前使用的sFE是从新鲜的S. nudus14中提取的。此外,文献中报道的sFE纯化流程较为复杂且成本较高,这些方法基于sFE的一些通用特性,如分子量、等电点、离子强度和极性15,16。迄今为止,尚未有sFE的亲和纯化方案被报道。在本研究中,基于sFE晶体结构的知识,成功开发了一种亲和纯化方案。与已报道的纯化方法相比,该亲和纯化方法操作简便、成本低廉且易于使用。此外,采用该方法可显著提高活性sFE的回收率。

尽管已有多种纤溶酶亲和纯化方法的报道,但这些方法均基于抗体17、抑制剂18、配体和受体16。这些抗体、抑制剂、配体和受体的制备在技术上具有挑战性且费时费力。此外,还需额外步骤将这些分子偶联到基质上。相比之下,精氨酸-琼脂糖.......

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披露

作者声明无利益冲突。

致谢

本研究由厦门市科学技术局(3502Z20227197)和福建省科学技术厅(编号:2019J01070,编号:2021Y0027)资助。

....

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
30% 丙烯酰胺-双丙烯酰胺(29:1)Biosharp
2-巯基乙醇Solarbio
琼脂糖 G-10Biowest
过硫酸铵SINOPHARM
硫酸铵SINOPHARM
精氨酸-Sepharose 4BSolarbio精氨酸-琼脂糖基质
溴酚蓝(BPB)Solarbio
快速银染试剂盒Beyotime
纤维蛋白原Merck
甘氨酸Solarbio
盐酸SINOPHARM
激酶RHAWN
赖氨酸-Sepharose 4BSolarbio赖氨酸-琼脂糖基质
N,N,N',N'-四甲基乙二胺(TEMED)Sigma-Aldrich
预染彩色蛋白质 Marker(10–170 kD)Beyotime
氯化钠SINOPHARM
十二烷基磺酸钠(SDS)Sigma-Aldrich
氢氧化钠SINOPHARM
凝血酶Meilunbio
三(羟甲基)氨基甲烷Solarbio
三(羟甲基)氨基甲烷盐酸盐Solarbio
仪器
AKT Aprotein 纯化系统 pureGE
MLS-3750 自动立式压力蒸汽灭菌器SANYO
化学发光成像系统GE
BT-100 恒流泵QITE
恒温培养箱JINGHONG
3-30KS 台式冷冻离心机SIGMA
DGG-9140AD DHG 系列加热干燥烘箱SENXIN
DY89-II 电动玻璃匀浆器SCIENTZ
电子分析天平DENVER
DK-S12 电热恒温水浴锅SENXIN
水平脱色摇床Kylin-Bell
AF 103 制冰机Scotsman
KQ-500E 超声波清洗机ShuMei
磁力搅拌器Zhi wei
H1650-W 微型冷冻离心机Cence
微波炉Galanz
Milli-Q ReferenceMillipore
移液器Thermo Fisher Scientific
精密台式 pH 计Sartorious
小型旋涡振荡器Kylin-Bell
垂直电泳系统Bio-Rad
耗材 
200 µL PCR 管(200 µL)Axygene
离心管(1.5 mL)Biosharp
离心管(5 mL)Biosharp
离心管(50 mL)NEST
离心管(7 mL)Biosharp
培养皿(60 mm)NEST
滤膜(0.22 µm)Millex GP
封口膜(Parafilm)Bemis
移液器吸头(1 mL)KIRGEN
移液器吸头(10 µL)Axygene
移液器吸头(200 µL)Axygene
专用指示试纸TZAKZY
超滤离心管(15 mL,3 KDa)Millipore
超滤离心管(4 mL,3 KDa)Millipore
通用 pH 指示剂SSS Reagent

参考文献

  1. Rosell, A., et al. Patients with COVID-19 have elevated levels of circulating extracellular vesicle tissue factor activity that is associated with severity and mortality-brief report. Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 41 (2), 878-882 (2021).
  2. Schultz, N. H., et al.

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