本文介绍了一种从黑色素瘤相关软脑膜病(M-LMD)患者脑脊液中分离循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)并进行扩增的实验方案,旨在建立用于研究M-LMD的临床前模型。
方法文章
本文介绍了一种从黑色素瘤相关软脑膜病(M-LMD)患者脑脊液中分离循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)并进行扩增的实验方案,旨在建立用于研究M-LMD的临床前模型。
黑色素瘤相关性软脑膜病(M-LMD)是指循环肿瘤细胞(CTCs)进入脑脊液(CSF),并在保护脑和脊髓的膜层——脑膜中定植所致。一旦发病,M-LMD患者的预后极差,总体生存期仅为数周至数月。这主要归因于对疾病机制的认识不足,进而导致有效治疗手段极为有限。明确M-LMD的潜在生物学机制将显著提升我们针对该致命性疾病调整现有疗法或设计新型抑制剂的能力。然而,一个主要障碍在于难以从患者来源的脑脊液(CSF-CTCs)中获取足够数量的CTCs,以开展分子表征、功能分析等临床前实验研究。 体内 疗效研究。脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)的培养 离体 也已被证明具有挑战性。为解决这一问题,本文提出了一种新型的患者来源M-LMD CSF-CTCs培养方案 离体 和 体内 已开发出该方法。研究发现,加入人脑膜细胞(HMCs)产生的条件培养基对该实验步骤至关重要。细胞因子阵列分析显示,HMCs分泌的因子,如胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)和血管内皮生长因子A(VEGF-A),在支持脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTC)存活方面具有重要作用。 离体在此,通过使用分离得到的患者来源的脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTC)细胞系,验证了其在评估靶向胰岛素样生长因子(IGF)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路抑制剂疗效方面的实用性。此外,这些细胞还可用于鞘内接种 体内 建立可用于已批准或新型疗法临床前测试的小鼠M-LMD模型。这些工具有助于揭示驱动脑膜中CSF-CTC形成的潜在生物学机制,并识别可降低M-LMD相关发病率和死亡率的新型治疗方法。
软脑膜疾病(LMD)是指循环肿瘤细胞(CTCs)播散至脑脊液(CSF)中,并在包绕大脑和脊髓的脑膜中定植所致1,2。LMD 可发生于多种癌症,但在黑色素瘤中尤为常见。在黑色素瘤的晚期阶段,约有 5% 的患者会发展为黑色素瘤相关的 M-LMD2,3。尽管与其他转移部位相比发生率相对较低,但 M-LMD 的后果极为严重,患者总体生存期仅为数周至数月,且是导致患者发病的重要因素1,3,4。这主要归因于目前缺乏有效的治疗手段,同时对黑色素瘤细胞如何定植软脑膜仍存在重大知识空白2。因此,深入理解 M-LMD 的生物学机制将有助于设计新的治疗方法,以改善临床预后。
近期研究报告揭示了循环肿瘤细胞(CTCs)定植于独特的脑脊液微环境的机制。例如,补体C3可促进肿瘤细胞侵入脑脊液 通过 脉络丛,位于脑室每个脑室中的一团复杂血管网络5此外,为了应对脑脊液中微量营养素的匮乏,循环肿瘤细胞可上调铁螯合蛋白脂质运载蛋白-2(lipocalin-2)及其受体SLC22A17,以增强其存活能力。6使用 基于组学的 脑脊液分析显示,我们研究团队还发现脑脊液富含调控胰岛素样生长因子(IGF)信号通路以及先天免疫的蛋白质3上述数据共同强调了液体活检中脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)在研究软脑膜转移瘤(M-LMD)中的重要价值。
尽管脑脊液中的循环肿瘤细胞有时可通过采集患者的脑脊液样本进行识别 通过 腰椎穿刺、Ommaya 储液囊或快速尸检,一个主要的局限在于获取足够数量的这些稀有且脆弱的细胞1,7例如,使用CTC计数技术,每例患者的脑脊液样本中仅可识别出数百至数千个肿瘤细胞7,这使得进行分子和功能分析变得困难 体外 或 体内尽管已有短暂培养CTCs成功的报道 离体 来自外周血(即乳腺癌循环肿瘤细胞)8,9,10这些细胞通常只能短期培养,且目前尚无成功培养脑脊液中黑色素瘤循环肿瘤细胞(CTCs)的报道。因此,探索黑色素瘤脑脊液-CTCs或广义CTCs的扩增方法,将对M-LMD的生物学研究具有重要意义7,11.
首次建立一种从M-LMD患者中扩增CSF-CTCs的新技术 离体 在此报告中,我们建立了一种详细的方案,可用于培养和扩增来自软脑膜转移(M-LMD)患者的脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)。由于脑膜会分泌多种生长因子,如FGF、IGF、VEGF-A和IGFBPs,这些因子可支持其周围环境中的细胞生长12,13,14,15,16,可以合理推断脑脊液中的循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)生长可能需要这些组分 离体 条件。因此,本方案采用通过培养人脑膜细胞(HMCs)获得的条件培养基 体外。对于 体内 接种,将患者来源的细胞接种至免疫缺陷小鼠体内以建立患者来源的脑脊液循环肿瘤细胞(PD-CSF-CTCs)系。患者来源的软脑膜转移癌(M-LMD)细胞的获得将支持开展细胞、分子及功能学检测,用于研究M-LMD并为这一致命性疾病提出新的治疗策略。
去标识化的患者脑脊液标本采集已获得南佛罗里达大学机构审查委员会(IRB)(MCC 50103、50172 和 19332)的批准。M-LMD 患者的诊断可通过多种方式进行,包括脑脊液细胞学阳性、具有特征性的脑部和/或脊髓磁共振成像(MRI),或临床表现与提示性 MRI 发现相结合。这些 M-LMD 患者的脑脊液作为其标准临床护理的一部分被常规采集。除非存在临床指征,否则不进行任何操作。已从患者处获得知情同意,允许采集样本并将其用于科研和发表。该研究的生成过程 体内 小鼠-LMD模型已获得南佛罗里达大学机构动物护理和使用委员会(IACUC# IS00010398)的批准。本方案的整体流程总结如下 图1研究中所用试剂与设备的详细信息列于下文 材料表.
1. HMC 条件培养基的制备
2. 脑脊液采集与样本处理
3. 体外 脑脊液循环肿瘤细胞的培养与扩增
4. 在体 将脑脊液循环肿瘤细胞接种以建立细胞系来源的异种移植模型(CDX)或患者来源的异种移植模型(PDX)
注意:PDX 模型涉及将癌细胞直接从癌症患者(未经 离体 培养),而CDX模型则使用癌细胞系,或在本例中,使用已扩增并永生化的循环肿瘤细胞(CTCs)18.
5. 通过激光显微切割从大鼠脑脊液中收集样本以进行后续克隆扩增
了解成功培养脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)的条件 离体 是一项持续进行的工作。为此,提供能够模拟脑脊液微环境的关键因子被认为至关重要22人脑膜细胞(HMCs)可向脑脊液(CSF)中分泌多种生长因子,包括FGF-2、EGF、IGFBP2和IGFBP6,已知可支持循环肿瘤细胞(CTC)的生长12,13,14,23,24因此,对HMC条件培养基进行了人细胞因子阵列分析,以鉴定可能对CTC存活至关重要的成分。事实上,在HMC培养的培养基中,多种生长因子表达上调图 3A例如,粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)、VEGF-A 和胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP2、3、4 和 6)。
患者的脑脊液细胞成分可能包含多种细胞类型,例如循环肿瘤细胞(CTC)、免疫细胞和成纤维细胞。非CTC细胞最终会随着时间推移而停止传代。通常,能够成功增殖并持续处于增殖状态的细胞为癌细胞(M-LMD细胞)。培养中生长的细胞确为M-LMD细胞的验证可通过IF检测MLANA表达以及转录组学分析完成,此前已有研究证实7。
作为概念验证,以展示已建立方法的潜在用途和应用 体外 和 体内 PD-CSF-CTC细胞系采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,结果显示多个基因在未培养的患者脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)中富集并保留7其中两种为受体酪氨酸蛋白激酶ErbB3和IGF-1R,它们在黑色素瘤进展及化疗耐药中具有重要意义25,26,27.
为了检测IGFBP2和IGF-1R是否在CSF-CTC存活中发挥作用,对PD-CSF-CTC细胞使用美国食品药品监督管理局(FDA)批准的药物图卡替尼(tucatinib)和色瑞替尼(ceritinib)进行结晶紫增殖实验,这两种药物分别靶向ErbB28和IGF-1R7,29。实验中将抗IGFBP2抗体作为阳性对照,预期其会抑制PD-CSF-CTC细胞培养物的生长。结果显示,缺失IGFBP2或IGF-1R均能有效抑制PD-CSF-CTC的增殖(图3B)。鉴于MAPK信号通路位于IGF-1R的下游,研究人员还对三个M-LMD来源的PD-CSF-CTC细胞系进行了钙黄绿素-AM活细胞染色和MTT细胞存活实验,分别用色瑞替尼、MAPK抑制剂达拉非尼(dabrafenib)和曲美替尼(trametinib),或三者联合处理。实验数据显示,色瑞替尼显著降低了三个细胞系的细胞活力,而达拉非尼和曲美替尼则表现出不一致的效果(图3C)。达拉非尼和曲美替尼的处理结果令人意外。这三个PD-CSF-CTC细胞系均来源于携带BRAFV600E突变的M-LMD患者7。该结果可能提示CSF-CTC具有获得性化疗耐药效应,这有待未来进一步研究。
接下来,以PD-CSF-CTCs的应用为例说明其用途 体内,通过鞘内注射不同数量的PD-CSF-CTC建立小鼠M-LMD模型,并测定小鼠的中位生存时间(图3D)。为了可视化M-LMD进展,使用生物发光标记物(如NL报告系统)对PD-CSF-CTC细胞系进行标记21,由BLI捕获(图2C)。LMD转移灶的位置还通过黑色素-A蛋白(MLANA)的免疫组织化学染色得以证实30 作为黑色素瘤细胞的标记物(图3E)。作为概念验证,用于测试针对M-LMD的治疗策略 体内,小鼠M-LMD队列每日接受口服单药治疗,药物为色瑞替尼或曲美替尼,或联合使用达拉非尼与曲美替尼,或色瑞替尼与曲美替尼。对照(未治疗)队列口服生理盐水作为比较。结果显示显著延长的生存期(图3F)以及疾病检测的延迟(图 3G) 在接受色瑞替尼和曲美替尼治疗的队列中(未经治疗的M-LMD中位生存期:28.5天 与色瑞替尼和曲美替尼治疗的M-LMD中位生存期:38.5天; P 值 = 0.0052)。这些数据凸显了所建立的 M-LMD PD-CSF-CTC 细胞系在开展临床前研究以评估新型治疗药物疗效方面的潜在应用价值。

图1建立患者来源的脑脊液循环肿瘤细胞(PD-CSF-CTCs)的流程示意图。 可采集患者的脑脊液 通过 腰椎穿刺、Ommaya 储液囊或快速尸检。通过一系列 体外 和 体内 传代,每一步均产生一个中间的脑脊液-循环肿瘤细胞培养物(即患者脑脊液-循环肿瘤细胞, 体外 培养 体内 培养)直至建立 PD-CSF-CTC 细胞系。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图2:示例 体外 和 体内 源自M-LMD患者的脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)培养 (A代表性明场图像显示 体外 M-LMD CSF-CTC 细胞集落在 HMC 条件培养基中培养 6 周和 9 周的生长情况。比例尺: 1000 µm. (B) 注射PD-CSF-CTCs后4周和8周的小鼠MRI图像;成功建立了小鼠M-LMD模型。黄色箭头指示该M-LMD小鼠脑室扩大及可能存在的脑积水。C小鼠M-LMD发育的代表性BLI可视化图像。该图改编自Law等人的研究。7. 请点击此处以查看此图的放大版本。

图3PD-CSF-CTC细胞系被用于多种临床前实验以研究M-LMD。 (A人脑膜细胞(HMCs)存在下,培养基(MenCM)中多种分泌型生长因子(如IGFBPs、VEGF-A和GM-CSF)水平升高的细胞因子阵列结果。B) 通过结晶紫细胞增殖实验的扫描图像,评估抗IGFBP2抗体、图卡替尼和色瑞替尼对一条PD-CSF-CTC细胞系的抑制效果。对照组给予溶剂处理。实验重复三次。C三种已建立的PD-CSF-CTC细胞系(来自患者09、12和16)的细胞存活率检测 体外细胞经ceritinib(cer)、dabrafenib(dab)与trametinib(tra)联用、cer与tra联用,或三者联合处理。处理72小时后收集细胞。采用Calcein-AM染色法观察细胞活力,并通过MTT法检测细胞存活率。配对样本 t-test 用于统计分析。比例尺: 20 µm. (D) 小鼠M-LMD模型的生存曲线。NSG小鼠通过鞘内接种(通过 小脑延髓池)分别接种10,000、20,000和50,000个PD-CSF-CTC细胞系细胞。测定M-LMD小鼠的中位生存期。(E) M-LMD 小鼠脑组织切片中黑色素瘤标志物 MLANA 的免疫组化检测。MLANA 阳性信号位于脑膜(红色染色,黄色箭头指示),而正常(健康)脑组织未见肿瘤生长(MLANA 阴性)。比例尺: 200 µm. (F) 对给予每日口服生理盐水、cer、tra、dab/tra 或 cer/tra 的小鼠 M-LMD 队列进行的代表性疗效实验。通过测定小鼠存活率评估疗效,统计分析采用 log-rank(Mantel-Cox)检验。G5周内M-LMD进展的代表性BLI图像,比较对照组(生理盐水)处理 与经cer/tra处理的小鼠M-LMD队列。图(C图的该部分改编自 Law 等人。7. 请点击此处查看此图的放大版本。
表1:临床脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)获取情况汇总 离体 M-LMD 患者的培养 11例M-LMD患者的汇总表,这些患者的脑脊液CTC已尝试进行扩增。表中患者此前已在Law等人的研究中进行过特征描述。7. 请点击此处下载此表格。
M-LMD 是一种破坏性极强且 invariably 致命的疾病,迫切需要寻找更有效的治疗策略。研究 M-LMD 的主要障碍之一是无法获取足够的脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)以开展分子和功能研究。1,7尽管已有从外周血和其它癌症类型(如乳腺癌和卵巢癌)的脑脊液中培养循环肿瘤细胞(CTCs)的方法11,31,32这些CTC扩增方法通常为短期培养,且目前尚未见成功培养黑色素瘤脑脊液CTC(CSF-CTCs)的报道。此外,现有的CTC扩增技术均局限于短期培养 离体 设置,但尚未产生 体内 源自患者LMD细胞的LMD模型。本文介绍了一种培养这些细胞的新方案 体外 和 体内,从而获得独特的患者来源细胞系。目前,在该研究的11例M-LMD患者中,成功扩增M-LMD脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)的概率约为60%(7/11) 体外 并且这一比例降至约20%(11例中的2例) 体内 使用 CDX 方法7.
显然 体外 条件无法重现脑脊液的微环境。然而,此前已有研究采用蛋白质组学方法分析脑脊液中的蛋白质成分,并揭示了支持循环肿瘤细胞生长所需的一些关键因子 离体3例如,研究发现,在M-LMD患者中促进CTC存活的主要通路之一与IGF相关活性的增强有关3,7此外,研究表明,软脑膜会向脑脊液中分泌多种细胞因子和生长因子,包括FGF-2、EGF、GM-CSF以及与IGF信号通路相关的蛋白质。12事实上,这在与HMCs共培养的培养基中得到了重现,支持这些生长因子在促进CSF-CTC生长中的潜在作用。
建立PDX(或CDX)模型的一个主要优势在于能够更深入地了解疾病的病理学特征,这一点是 体外 条件不足。理想情况下,首选PDX方法,因为CSF-CTCs可直接来源于患者,无需 离体 培养。最初曾尝试采用此方法建立M-LMD模型,但迄今为止尚未成功。PDX小鼠模型构建困难可能与起始材料的数量和完整性有关(即临床常规采集的患者脑脊液中可存活的CTC数量极少)。这或许可以解释为何我们从尸检时采集的脑脊液中培养CTC获得了更高的成功率。7. 为提高概率 体内 扩增,本方案经过修改以提供一种替代的CDX方法。首先可对CSF-CTCs进行扩增 体外 (步骤3)以生成具有长期性和更强生长潜力的PD-CSF-CTC细胞系。随后将这些细胞接种至小鼠体内以建立M-LMD模型。尽管当前方法仅获得了有限数量的 体内 CDX M-LMD(约20%)模型的成功率可能反映了CSF-CTCs的转录多样性、脑脊液微环境的复杂性,以及总体上培养这些细胞的困难。我们认为,未来开发人源化小鼠模型可能有助于提高移植成功率,鉴于微环境在支持癌细胞存活方面具有重要作用。33.
CDX 方法的一个局限性在于,仅从患者样本中筛选出特定的克隆,且癌细胞在传代过程中可能发生遗传漂变 离体 培养后可能不再反映原始来源的转录谱。然而,已有报道指出,尽管如此 体外 培养的PD-CSF-CTC细胞系与分离的未经培养的患者CSF-CTC在基因表达上保持约97%的相似性7在该研究中,单细胞RNA测序分析揭示了未经培养的样本之间存在重叠的富集基因特征, 体外 PD-CSF-CTCs 和 体内 PD-CSF-CTCs,例如 SOX9、ErbB3 和 IGF-1R7,表明这些基因可能是潜在的治疗靶点。此外,这些共同富集的基因参与了与转录调控和代谢相关的生物通路7综上所述,这凸显了PD-CSF-CTC培养物在深入理解M-LMD生物学特性、鉴定可靶向的驱动疾病进展的分子机制与通路,以及在未来研究中设计合理治疗策略方面的转化价值。
尽管目前的方法学仍不完善,因为无法预先确定M-LMD患者脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)的状态和存活能力,但已有一些观察结果可提高实验成功率,尤其是考虑到这些CTCs数量稀少且极为脆弱。关键步骤包括:与临床团队协调,确保脑脊液样本采集后立即置于冰上,并迅速转运至实验室,以维持细胞完整性;随后应立即处理CSF-CTCs,可通过将其接种于培养体系中或进行细胞冻存来实现。
总体而言,脑脊液循环肿瘤细胞(CSF-CTCs)的培养与扩增是一个反复试验的过程,但本实验方案的建立使得研究人员能够获得源自患者的M-LMD细胞,从而具备了利用患者样本开展此前无法实施的实验研究的资源。未来的主要目标之一是利用M-LMD来源的PD-CSF-CTCs进行分子特征分析、高通量药物筛选以及 在体内 药物疗效研究旨在设计合理的治疗方案以治疗M-LMD。该方法有望显著降低与晚期转移性黑色素瘤这一目前致命性并发症相关的发病率和死亡率。
Peter Forsyth 在提交本研究之外,担任 Abbvie Inc、Bayer、Bristol Meyers Squib、BTG、Inovio、Novocure、Tocagen 和 Ziopharm 的咨询委员会成员。其余所有作者均无任何利益冲突可披露。
我们衷心感谢患者及其家属为本项科学研究慷慨捐赠组织样本。本研究得到了美国国立卫生研究院基金 P50 CA168536、R21 CA256289、R21 CA216756(资助对象:KSMS 和 PAF)以及 K99 CA226679(资助对象:IS)的资助。此外,还获得了莫菲特基金会研究加速基金(资助对象:BC 和 PAF)以及莫菲特化学生物学项目的支持。 & 分子医学项目(PAF 和 DD),莫菲特基金会(PAF)。分子基因组学、组织与生物信息学 & 莫菲特生物统计学共享资源中心部分由美国国家癌症研究所通过癌症中心支持拨款(P30-CA076292)和莫菲特基金会资助。
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