这是全面的Xenopus取样方案的第一部分。所采集的组织包括心室、动脉干、左肝叶、胆囊、肺、胰腺、脾脏、喉、食管、胃、肠道、睾丸、脂肪体、输卵管、成对肾脏、坐骨神经丛、皮肤、胸腺以及完整眼球。
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这是全面的Xenopus取样方案的第一部分。所采集的组织包括心室、动脉干、左肝叶、胆囊、肺、胰腺、脾脏、喉、食管、胃、肠道、睾丸、脂肪体、输卵管、成对肾脏、坐骨神经丛、皮肤、胸腺以及完整眼球。
Xenopus 长期以来一直是研究脊椎动物发育和疾病的關鍵模式生物,為細胞過程和基因功能提供了深入的見解。儘管關於Xenopus胚胎的研究信息豐富,但在成體組織取樣的標準化方法方面仍存在顯著空白,特別是針對定量蛋白質組學等現代技術。本研究提出了一種針對成年Xenopus多組織快速、精確且高效的取樣綜合方案。該方案解決了與其他無尾目動物相比解剖結構差異細微所帶來的挑戰,即使對青蛙解剖經驗有限的研究人員也能確保實驗的可重複性。本方案通過優先保證樣本的新鮮度,以滿足高質量生化分析的需求。我們可在一小時內快速收集最多18種組織。此外,該方法適用於灌注與非灌注條件,可靈活滿足多種實驗需求。本工作不僅填補了Xenopus laevis和tropicalis在方法學上的關鍵空白,也為將技術應用於其他類似兩棲動物模型的研究人員提供了寶貴資源,從而拓展並提升了比較生物學與進化研究的範圍與可靠性。
Xenopus 在研究人类疾病方面相较于小鼠、斑马鱼及其他模式生物具有独特优势,尤其适用于发育与进化研究。其胚胎体外发育,且胚胎体积大、易于操作,可实现对组织移植、基因编辑等实验操作的实时观察,而小鼠因胚胎在体内发育,需依赖侵入性操作,难以实现类似研究。此外,Xenopus 具有三腔心脏和四足动物的四肢,为研究先天性缺陷1、肢体再生2和心脏发育3提供了更直接的进化桥梁。与小鼠不同,Xenopus 蝌蚪具备肢体和器官再生能力,可模拟哺乳动物所缺乏的再生过程;其水生生活阶段也便于非侵入性地研究环境因素或毒素的影响。结合繁殖周期短、成本低及伦理限制较少等优势,Xenopus 在器官发生和应激反应的高通量、机制性研究方面优于哺乳动物体系,而此类研究在哺乳动物系统中难以复制。
本文旨在为成年Xenopus组织提供精确且可重复的器官取样操作指南,正如已有针对Xenopus蝌蚪的类似指南4。尽管目前已可进行成年Xenopus的"数字解剖"5和“显微CT成像”6,但在缺乏如小鼠等其他成年动物模型所具备的详细操作说明的情况下7,8,9,实现成年Xenopus器官与组织取样的标准化仍具挑战性。
尽管已有六种关键组织的取样指南10,但目前尚无针对Xenopus的专门且全面的解剖与取样指南。虽然存在针对Rana属物种的完整解剖指南11,并且也有适用于其他无尾目动物的各种课堂解剖手册12,但对于缺乏取样技术或两栖动物解剖学经验的研究人员而言,Xenopus与其他无尾目动物之间存在的细微差异使得现有资源难以满足组织取样的一致性和可重复性要求。
本指南旨在优先保证蛋白质组学和免疫化学实验中组织的新鲜度。对于有经验的操作者,可在一小时内从单个个体中完成所有组织的采集。建议缺乏经验的操作者在牺牲难以替代的动物之前,先在因其他原因实施安乐死的标本上尝试本实验方案。
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所有实验均经哈佛医学院动物护理和使用委员会(IACUC,机构动物护理和使用委员会编号 IS 00001365_3)批准,并遵循其规章制度进行。若在取样前已执行灌注方案13,则跳至步骤 2.3。
1. 准备(无需灌注)
2. 取样
注意:如果动物已经灌注,请跳至步骤 2.3。所有切缘应约为 25 mm。在处理不同样本之间,应将镊子和剪刀擦拭干净或更换。所有组织应在安乐死后 1 小时内取样,以保证最大程度的新鲜度。
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通过遵循本方案的所有步骤,可在动物安乐死后一小时内完整切除心脏心室、动脉干、左肝叶、胆囊、肺、胰腺、脾脏、喉、食管、胃、肠、睾丸、脂肪体、输卵管、成对的肾脏、坐骨神经丛、皮肤、胸腺以及完整眼球(参见 图1, 图2, 图3, 图4, 图5, 图6, 图7, 图8,以及 图9在...
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本文提供的实验方案旨在为不同经验水平的使用者提供灵活性,同时确保及时高效地收集关键组织。建议新用户严格按照方案中列出的每一步操作,以系统性地完成组织采集。然而,经验较丰富的用户可根据需要选择跳过某些步骤,仅取样所需组织。例如,脾脏位于肠系膜后方,通过简单移动胃部即可暴露脾脏,无需取样胰腺。这种适应性使得取样过程可根据特定研究需求进行定制。尽管不同器官的组织降解速率和代谢活性各不相同,但快速操作并使用预冷缓冲液可最大程度减少对最终样本的影响。
本方案设计高效,可在一小时内完成多达18种组织的采集。该方法的一个局限性在于,针对特定应用可能需要进一步优化技术。例如,用户可选择将肠系膜与肠道分开取样18,或将肾上腺与肾脏独立采集。此外,胃肠道器官可进行更仔细的冲洗,以保持其完整性19。这些调整可提高数据的准确性和完整性,特别是在处理高度特化的组织时。
该方法还被开发为可与快速灌注13兼容,这对...
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作者声明无竞争利益。
本工作由美国国立卫生研究院(NIH)OD R24 资助项目 ODO31956 资助。我们还要感谢 Samantha Jalbert 和 Jill Ralston 提供的帮助与支持。
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| 一次性移液管 | VWR | 414004-036 | |
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| 带齿镊(标本镊) | VWR | 82027-442 | |
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