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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
在这里,我们提出了一种协议,使用桌面工艺切割机在内部制造的微通道使泰勒分散实验适应微尺度。该实验平台可用于计算单种被动示踪剂的扩散系数,并可视化多种离子相互作用和分离。
微流体领域变得越来越突出,因为它可以快速、精确地控制流体和颗粒,从而更容易合成化合物和分离混合物。我们使用桌面工艺切割机内部制造的微通道完善了泰勒色散实验的可访问、可重复的微尺度改编。这种快速且易于使用的微流体光刻技术的启动成本约为 300 美元,比典型的光刻方法低几个数量级。来自可编程注射泵的压力驱动层流将注入的示踪剂溶液输送到微通道的下游,其中带有微距镜头的数字单反 (D-SLR) 相机在固定位置捕捉示踪剂浓度随时间的变化。利用这个实验平台,我们可以计算出单种无源示踪剂在不同实验条件下的扩散系数。然后,我们将该协议扩展到电解质混合物,观察非平凡的离子-离子耦合效应引起的扩散率变化的初步证据。这种易于使用的实验方法为探测多物种运输提供了实用工具,并提供了对控制离子迁移率的复杂相互作用的见解。
近年来,重要的研究工作集中在研究和开发具有成本效益的微流体装置上,这些装置可以精确控制流动、颗粒和溶质传输。多物种电解质解决方案在从储能和生物医学诊断到环境监测和水净化的广泛应用中发挥着关键作用。了解不同离子种类如何在这些系统中扩散和相互作用对于优化电化学和传输驱动过程的性能和稳定性至关重要。
当电解质溶液含有具有不同扩散系数的离子时,即使没有外部施加电压,它们的不均匀迁移也会感应出内部电场。扩散速度较快的离子往往会与较慢的离子分离,从而暂时造成电荷不平衡。为了保持电中性,系统产生扩散诱导电势。该场减慢较快的离子并加速较慢的离子。由此产生的电势取决于相对离子迁移率和浓度梯度,在电中性约束下用能斯特-普朗克方程很好地描述了这一点。经典电化学模型,例如亨德森方程和能斯特方程,通过将其与离子传输数和浓度差1 联系起来来量化这种现象。
长期以来,泰勒色散分析一直是一种强大的技术,通过观察溶质如何通过直通道在压力驱动的层流中扩散2,3来测量分子扩散率。它考虑了平流和扩散之间的相互作用,并能够根据有效扩散率准确推断分子扩散系数。这种方法特别有吸引力,因为它结合了精度、最低的样品要求和快速的数据采集。传统上用于单物种示踪剂,最近的理论扩展现在使其能够应用于多物种系统,使研究人员能够根据耦合的传输行为从理论上推断单个离子扩散率4。
然而,传统微流控装置(通常基于洁净室依赖的光刻)的高成本和技术复杂性对这种方法的更广泛采用构成了重大障碍。在这项工作中,我们提出了一种低成本、可访问且可重复的泰勒分散技术的改编,该技术采用通过桌面工艺切割机通过xurography制造的微通道。这种方法的启动成本约为 300 美元,无需昂贵的专业设施即可实现快速原型设计和一致的通道制造5。该协议通过D-SLR相机和微距镜头进行明场成像,在注射部位6下游的固定捕获点建立了示踪剂浓度演变的时间序列。我们证明了该平台可以准确测量单物种无源示踪剂的扩散系数,并将该方法扩展到分析多物种电解质系统。结果揭示了离子-离子耦合效应引起的扩散率变化的明显特征。这种易于使用且经济高效的方法为研究复杂电解质混合物中的离子传输现象提供了实用的工具。例如,所提出的实验装置可以很容易地适应为用作微量混合器,以评估多物种溶质7的混合效率,或通过计算机控制的管式流动反应器8设计所需的聚合物分子量分布。
1、材料准备
注意:在本报告中,微流控芯片是通过在宽度w = 2.54 cm、厚度h = 100 μm的单层聚酰亚胺胶带中切割微通道设计来构建的,然后将其密封在两片聚酯片之间。微通道的纵横比(λ = h/w)取决于聚酰亚胺的厚度;通道的宽度(W)是该协议中唯一可修改的横截面特征。
2. 实验装置的组装
3. 实验运行
4. 数据处理
(1)微流控芯片制造步骤如 图1所示。我们在 图 2 中包括了将 PTFE 管连接到注射器尖端的建议步骤,该注射器尖端用于通过可编程注射泵将去离子水 (DI) 的背景流注入微流控芯片中。 图 3 包括完整实验装置的标记照片。 图 4 包括实验装置的不缩放俯视图(图 4A)和侧视图(图 4B)图,突出显示了相对的微流控芯片和相机定位。 图5 报告了在协议的数据处理阶段应用于实验图像的作顺序。在 图5A 中,我们展示了代码如何水平对齐微通道(如果需要),然后 图5B 显示了以捕获点为中心的方形感兴趣区域的裁剪,边长由微通道宽度设置,w。 图5C 将蓝色通道与裁剪感兴趣区域中的完整RGB图像隔离开来, 最后, 图5D 显示了从255(每个颜色通道的最大强度)中减去得到的裁剪区域的蓝色通道的倒置强度值。
图 6 将一次实验运行的结果(虚线)与相应的外推拟合(实心)叠加在一起。在这里,每个实验数据点都是通过图5所示的数据处理步骤计算出的平均倒置蓝色通道强度值。在示踪剂入口下游的固定捕获点,泰勒色散理论 2,5,9 预测示踪剂浓度随时间的变化描述为:
(2)
其中C(t)是横截面平均示踪剂浓度(g/L),已被证实与示踪剂的测量强度呈线性关系;C0 是初始示踪剂浓度 (g/L),U 是流速 (cm/s),t 是时间 (s),x (cm) 是通道中相对于示踪剂注入位置的轴向坐标。K 是示踪剂由于平流和分子扩散相互作用而增强的色散系数 (cm2/s)。我们输入实验参数,并使用代码的非线性曲线拟合应用程序(curveFitter)找到K的最佳拟合值。在长度为18.77 cm、纵横比λ = 1/4的微通道中,以流速U = 0.1 cm / s为一次实验运行生成的实验(虚线)和拟合(实心)曲线显示了时间t = 140 s,150 s和200 s的三个实验框;这对应于 Péclet 编号 Pe
88。在这里,示踪剂由在去离子水中稀释的 0.6 g/L 荧光素钠盐组成,分子扩散系数在文献10,11 中报道为 κ = 5.70 x 10-6 cm2/s。本手稿中报告的所有实验均在 22 °C 的室温下进行。
实验增强色散系数 K 可用于通过计算相关量(色散因子 2,5,9,12,f)来衡量我们的实验设置和协议的有效性。 该参数取决于通道的几何形状,计算为 5,12,13:
(3)
其中 κ 是示踪剂的分子扩散系数 (cm2/s),h/2 是选择的特征长度。佩克莱数是一个量化平流效应与扩散效应之比的无量纲参数,Pe = Uh/(2κ)。图7显示了在具有三种不同纵横比和流速的矩形横截面的微通道中进行实验运行的分散因子结果与理论色散因子行为5,12,13之间的良好一致性。

图 1:微流控芯片制造。 (A) 21 x 5 cm 芯片的顶部聚酯片设计。台式工艺切割机从左到右切割三个孔,分别用作流量入口、示踪剂入口和流量出口。(B)设计一个18.77 cm的聚酰亚胺微通道,捕获点位于示踪剂入口下游15 cm处。(C)微流控芯片组件分解图,从下到上:底部聚酯层、聚酰亚胺微通道层、顶部聚酯层,带有聚酰亚胺垫片和3D打印端口。 请点击此处查看此图的大图。

图 2:显示如何将 PTFE 管连接到注射器吸头的图表。 管路内径为 0.3048 mm,27-G 注射器尖端外径为 0.4064 mm,因此进行大约 1 mm(左)的小切口有助于提供更宽的开口区域来引导注射器尖端(中心)。使用镊子将管子插入注射器尖端并向下拉(右)。 请点击此处查看此图的大图。

图 3:实验装置的标记照片。 从左到右:带有 20 mm f/2 微距镜头的 D-SLR 相机面朝下安装在三脚架上,以捕捉粘在照明灯面板上的微通道。在可编程注射泵上设置一个通过 PTFE 管连接到微通道的 0.5 mL 玻璃注射器。远程触发器用于在实验运行期间激活相机。微量移液器用于生成示踪剂初始条件,如协议的步骤3.2中所述。 请点击此处查看此图的大图。

图 4:实验设置的图表(不按比例计算)。 (A)俯视图,从左到右:安装有0.5 mL玻璃注射器的可编程注射泵;PTFE管连接注射泵到微流控芯片;微流控芯片贴在距离边缘 1 厘米的灯板上;用于通过示踪剂进料孔注射示踪剂溶液的微量移液器;D-SLR 相机将微距镜头面朝下安装在三脚架上,以构图拍摄点。(B)侧视图,从左到右:连接注射泵到微流控芯片的PTFE管;注射器尖端和微流控芯片上的 3D 打印端口;用于通过示踪剂进料孔注射示踪剂溶液的微量移液器;微距镜头面朝下安装在拍摄点上方 1 厘米处的 D-SLR 相机。 请点击此处查看此图的大图。

图5:所提供代码中的图像处理步骤(参见补充文件5)。 (A)旋转实验图像,使微通道水平。比例尺:1000μm。(B)要裁剪的感兴趣区域(ROI)的正方形选择,边长与微通道壁之间的距离相匹配;这里,400 μm。(C)裁剪的ROI,其中蓝色通道是从完整的红色、绿色和蓝色(RGB)图像中选择的。比例尺:200 μm。(D)裁剪ROI的倒蓝色通道。 请点击此处查看此图的大图。

图 6:荧光素示踪剂(虚线)与外推曲线拟合(实线)叠加的荧光素示踪剂的横截面平均示踪剂强度与相机捕获点时间的关系。该试验在长 18.77 cm、纵横比 λ = 1/4 的微通道上以 0.1 cm/s 和 Pe
88 的微通道在去离子水示踪剂中使用 0.6 g/L 荧光素钠盐进行。图上方显示了三个实验帧在 140 秒(蓝色)、150 秒(橙色)和 200 秒(绿色)时的倒蓝色通道强度,亮度加倍以提高清晰度。请点击此处查看此图的大图。

图 7:色散因子与微通道纵横比的关系。色散因子 f 的理论值(蓝色曲线)和实验值(黑色数据点)的比较。理论曲线是使用Wolfram Mathematica(NDSolve)12中内置的有限元方法偏微分方程求解器获得的。我们显示了实验数据的平均值和标准差:四项试验,λ = 0.1,流速0.02 cm/s;12 次试验,λ = 0.25,流速为 0.05 cm/s(四次)、0.1 cm/s(四次)和 0.2 cm/s(四次);λ = 0.5 且流速为 0.1 cm/s 的四项试验。所有实验均在长度为6.07 cm的微通道上进行(捕获点位于示踪剂入口下游3 cm);然后在 18.77 厘米微通道上对结果进行基准测试。请点击此处查看此图的大图。
补充文件 1:端口的 .sdlprt 文件 请单击此处下载此文件。
补充文件 2:。芯片顶层的DXF模板文件。请点击此处下载此文件。
补充文件 3:。切屑垫片的 DXF 模板文件。请点击此处下载此文件。
补充文件 4:。芯片微通道的DXF模板文件。请点击此处下载此文件。
补充文件 5:用于数据处理的 MATLAB 代码文件。请点击此处下载此文件。
作者没有什么可透露的。
在这里,我们提出了一种协议,使用桌面工艺切割机在内部制造的微通道使泰勒分散实验适应微尺度。该实验平台可用于计算单种被动示踪剂的扩散系数,并可视化多种离子相互作用和分离。
Bernardi 和 Teague 希望感谢伍斯特理工学院教育与应用原型实验室 (LEAP) 的支持,以及西蒙斯基金会通过数学家旅行支持(奖项编号 963534)提供的资助。Bernardi 和 Teague 还感谢 Geneva Isaacson、Justin Shen 和 Tom Kohen 在实验设置方面的早期工作,感谢伍斯特理工学院的 Remy Kaplinsky 和学术与研究计算部门提供 3D 打印支持,以及 Daniel M. Harris、Eli Silver 和布朗大学哈里斯实验室的其他成员在伍斯特理工学院设置第一个实验时提供的见解和有用的建议。
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| 浮雕切割垫,12 x 12 英寸 | 剪影美国 | 8.19177E+11 | 在表中使用了 aphabetize 函数 |
| 相机插入式电池 | 尼尔 | B0B5WY8T96 | 移除的 3D 打印端口 |
| 相机三脚架 | 先锋 | B00CCA1Y3S | 添加了 Form 2 3D 打印机 添加了 Form 2 3D 打印机 |
| 透明树脂 V5 | Formlabs | https://formlabs.com/store/materials/clear-resin/ | 3D打印树脂 |
| 氰基丙烯酸酯 (CA) 胶促进剂 | 星际邦德 | B00BUVAZ5S | 还添加了树脂 |
| D-SLR 相机 | 尼康 | D500型 | 添加了打印机软件 |
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