本方案旨在介绍一种用于制备和纯化间充质干细胞(MSC)来源的细胞外囊泡仿生体以用于基因治疗的方法。该纳米囊泡由MSC来源的脂双层构成,其腔内包裹有携带目的基因的重组腺相关病毒(AAV)。该纳米囊泡提供了一种增强型的基因递送载体 体内 基因递送
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本方案旨在介绍一种用于制备和纯化间充质干细胞(MSC)来源的细胞外囊泡仿生体以用于基因治疗的方法。该纳米囊泡由MSC来源的脂双层构成,其腔内包裹有携带目的基因的重组腺相关病毒(AAV)。该纳米囊泡提供了一种增强型的基因递送载体 体内 基因递送
间充质干细胞(MSC)来源的细胞外囊泡(EV)在治疗应用和再生医学领域具有广阔前景。EV 是由所有已知细胞类型分泌的纳米级囊泡,携带多种 cargo,包括膜锚定蛋白、可溶性因子、多种 RNA 分子以及代谢物,可调控受体细胞的生理状态和生物学行为。尽管 MSC 来源或经工程化改造的 EV 能够递送治疗性蛋白质和 RNA,但由于缺乏将 DNA 序列高效分选至囊泡内的机制,EV 介导的 DNA 递送仍面临挑战。本课题组及他人的前期研究表明,含有腺相关病毒(AAV)的 EV 可实现靶向性的细胞核递送并维持持久的基因表达。 体外 和 体内然而,其制备与分离过程受限于产量低和耗时较长的操作步骤。本文报道了一种通过尺寸限定挤出法制备的间充质干细胞(MSC)膜包被纳米囊泡,用于高效基因递送。这些囊泡直径约为200 nm,模拟天然细胞外囊泡(EVs)的特性,同时包载携带治疗性基因序列的重组腺相关病毒(AAV)载体。与传统AAV相比,经工程化改造的MSC囊泡显著提高了基因递送效率,并在产量上实现大幅提升,同时相较于天然分泌的EV-AAV,其制备时间更短、成本更低。综上所述,我们提出了一种基于MSC的膜纳米囊泡新平台,该平台结合了模拟EV结构的优势与AAV介导的基因转移能力。该策略增强了递送效率和生产可扩展性,为推动基因治疗向临床转化提供了有前景的解决方案。
基因治疗通过引入、替换或沉默特定基因以恢复正常的细胞功能,为治疗遗传性和获得性疾病提供了一种变革性的方法。在过去的二十年中,载体工程技术与递送策略的进步显著拓展了基因治疗的应用范围。在已开发的多种载体系统中,腺相关病毒(AAV)因其良好的安全性、高效的转导能力以及在分裂和非分裂细胞中实现长期基因表达的特性,已成为最成功且应用最广泛的平台之一1,2迄今为止,多种基于腺相关病毒(AAV)的治疗药物已获得监管批准用于临床,包括用于脊髓性肌萎缩症、视网膜营养不良和血友病的治疗,标志着转化医学领域的重要里程碑。3腺相关病毒载体的广泛嗜性和低免疫原性使其能够应用于多种组织,包括肝脏、肌肉、中枢神经系统和眼部。4因此,AAV 已成为基因递送的领先平台 体内 基因递送,支持针对代谢性疾病、神经系统疾病和心血管疾病的持续性临床前及临床研究。
尽管腺相关病毒(AAV)基因治疗在临床上取得了显著成功,但仍面临若干固有挑战,限制了其更广泛的应用。其中一个主要限制在于AAV衣壳的基因组包装容量有限(约4.7 kb),从而限制了其用于递送较大或多个治疗基因的能力5,6。此外,AAV载体的生物分布和细胞嗜性主要由其血清型决定,不同血清型对特定组织具有不同的亲和力。尽管已广泛采用衣壳工程改造和肽段展示策略以增强组织靶向性和转导效率,但在不同生物学背景下实现精确且可预测的嗜性仍是一项重大挑战7。另一个关键限制是人群中普遍存在针对天然AAV血清型的预存中和抗体(NAbs)。即使低滴度的中和抗体也可显著降低载体的转导效率,限制患者入组资格并使重复给药变得复杂8,9。研究人员已探索多种策略以减轻抗体介导的中和作用,包括理性设计衣壳、使用免疫抑制方案以及短暂血浆置换等10,11,但这些方法仅能提供部分或短暂的缓解。总体而言,这些限制因素降低了AAV介导的基因递送在临床应用中的整体治疗效果和可重复性。
近年来,包裹在细胞外囊泡中的腺相关病毒(EV-AAV)被探索作为一种替代性载体,有望克服传统AAV的若干关键局限性12,13,14,15。在载体包装过程中,部分AAV颗粒可通过囊泡运输途径分泌,并被包裹于细胞外囊泡内。该过程被认为涉及AAV编码的膜相关辅助蛋白(MAAP),其可促进病毒的释放并增强与膜的结合16,17。由此产生的EV-AAV颗粒相较于传统AAV表现出更高的转导效率以及更强的中和抗体抗性,这主要归因于囊泡膜可促进细胞摄取,并在一定程度上屏蔽抗体识别18。然而,尽管具备这些优势,EV-AAV的生产效率仍然较低。通常,仅有少量基因组(约0.5%–12%)以EV相关AAV的形式分泌至培养基中,而大多数颗粒仍滞留在细胞内或以游离AAV形式存在12,13。因此,需要大规模生产才能获得足够的载体产量。此外,EV-AAV的生成主要依赖于HEK293T生产细胞,而此类细胞释放的囊泡可能表现出快速的肝清除、较短的循环半衰期以及潜在的生物安全性问题。这些局限性凸显了对更高效且可定制的膜包裹策略的需求,也推动了本研究中提出的细胞膜包裹AAV(CME-AAV)平台的开发。
间充质干细胞(MSCs)及其细胞外囊泡(EVs)因其再生潜能和免疫逃逸特性已被广泛研究。除了基于细胞或天然分泌EVs的疗法外,最近的研究表明,使用包裹有MSC膜的纳米颗粒可作为增强药物递送的替代策略19,20,21。MSC膜包被赋予载体主动靶向能力,减少免疫清除并延长循环时间,这些效应可能归因于MSC来源膜固有的分子组成22,23。基于这一理念,我们利用MSC来源的膜材料构建了一种细胞膜包被的腺相关病毒(CME-AAV)纳米囊泡,用于基因递送。为实现该目标,将纯化的MSC膜片段与重组AAV颗粒混合,并经过受控挤出处理,该技术最初用于脂质体的制备24,25。通过限定尺寸的挤出过程,膜组分自发组装成可包裹AAV颗粒的纳米级囊泡。随后,利用基于密度梯度的离心法进一步纯化CME-AAV,以去除未包裹的游离AAV颗粒。该策略可高效且可重复地制备膜包被的AAV载体,其转导效率显著高于传统AAV,同时对中和抗体的抗性与EV-AAV相当。通过替换不同的目的基因,CME-AAV平台在多种遗传性和获得性疾病的治疗中具有广阔的应用前景。
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所有动物实验程序均由中国珠海北京师范大学的机构动物护理与使用委员会批准。所用试剂和设备列于材料表中。
1. 通过孔径定义的挤出法制备和形成CME-AAV via
2. 通过密度梯度离心法纯化CME-AAV
注意:该步骤描述了使用基于碘克沙醇的密度梯度超速离心法,将纯化的CME-AAV与未包封的AAV、蛋白质聚集体以及残留核酸进行分离。通过该步骤获得的纯化CME-AAV适用于以下两种用途 体外 和 体内 研究。所有操作均建议在无菌细胞培养罩内进行。
3. 使用透射电子显微镜(TEM)对CME-AAV进行表征
注意:透射电子显微镜(TEM)用于观察 CME-AAV 颗粒的形态、大小及膜结构。该操作遵循标准的负染色法流程,类似于细胞外囊泡的检测方法。除非另有说明,所有步骤均在室温下进行。
4. 使用qPCR定量CME-AAV
注意:此步骤描述了一种基于qPCR的方法,用于定量CME-AAV基因组拷贝数(g.c./µL)。该方案强调CME-AAV特异性的样品制备和数据报告。qPCR设置与扩增循环的所有其他方面应遵循实验室常规操作及所选qPCR试剂盒的制造商说明书。
或
5. CME-AAV 病毒颗粒构型的定量分析
6. 体外 CME-AAV介导的基因转导分析
注意:此步骤描述了在培养细胞中评估CME-AAV介导的基因递送和外源基因表达的方法。本实验以HEK293T细胞和CME-AAV9.EGFP为例进行演示,但可适用于其他细胞类型或报告基因构建体。常规(非膜包被)AAV9.EGFP作为阳性对照,而PBS或空载AAV颗粒作为阴性对照。

7. 在小鼠模型中评估 CME-AAV 介导的基因递送
注意:此步骤描述了CME-AAV介导的基因递送的评估 体内 使用小鼠模型。
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本研究中使用的间充质干细胞(MSCs)按照符合相关伦理指南的方案从人脐带组织中分离获得。MSC膜组分的制备按照既定方案进行。AAV9.EGFP采用瞬时双质粒转染系统在HEK293T细胞中自行制备,方法如先前报道12,26。在CME-AAV的制备过程中,将膜组分与AAV9.EGFP按每1 × 10¹⁰病毒基因组对应150 µg膜蛋白的比例共同孵育,具体操作依据既定方案。将1 mL混合液加入配备400 nm聚碳酸酯多孔膜的小型挤出器中,挤出20次,随后再通过200 nm膜挤出20次。该过程最终获得由MSC膜包裹的AAV9.EGFP(CME-AAV9.EGFP)。
纯化后,采用透射电子显微镜(TEM)观察CME-AAVs的形态(图1A)。TEM成像显示,CME-AAVs具有与细胞外囊泡(EVs)相似的尺寸范围和膜包被结构。与先前报道的EV-AAV复合物类似,单个被包裹的AAV颗粒并非始终可清晰分辨
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CME-AAV 方案的关键步骤
本方案描述了一种生成间充质干细胞(MSC)膜包被的腺相关病毒(AAV)的方法,其中多个步骤对于成功形成CME-AAV至关重要。首先,细胞膜的精细预处理是必不可少的。该步骤的目标是获得适合挤出的膜片段,同时最大限度地减少核DNA、胞质蛋白和亚细胞器的污染。此外,膜片段的大小是决定挤出效率的关键因素。过大的片段可能会堵塞聚碳酸酯挤出膜,而过度破碎的膜材料则可能在挤出诱导的形变条件下难以有效重组成稳定的纳米囊泡。在本方案中,采用逐步增加离心力的连续离心步骤去除非膜成分,随后通过基于注射器的均质化处理,生成尺寸分布适当且可重复的膜片段。
纳米囊泡形成后,将膜包被的AAV与无包膜AAV进行高效分离是另一个关键步骤。该步骤尤为重要,因为在CME-AAV制备物中存在的游离AAV可被循环中的中和抗体迅速中和 在体内 给药,从而降低有效基因递送效率8,9
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吴道品博士是广东横琴联合生命科学有限公司的员工。该公司未为本研究提供资金支持,且在研究设计、数据收集、数据分析、稿件撰写或发表决定方面均无任何参与。其余作者声明不存在竞争性经济利益。
本工作由广东省科学技术厅资助。&T 计划(2023B0303010002)对 DM 的资助,广东省基础与应用基础研究基金(2025A1515011134)以及北京师范大学艺术与科学学部交叉研究项目(12900-311324240581)对 YL 的资助。本研究还得到了北京师范大学科技仪器与服务中心提供的仪器设备和技术支持。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 生物发光成像系统 | PerkinElmer | IVIS Spectrum 光学成像系统 (Lumina III) | |
| D-荧光素钾盐 | 翊圣生物 | 40902ES03 | |
| 胎牛血清 | 翊圣生物 | 40130ES76 | |
| 荧光显微镜 | Zeiss | Axio Observer 7 | |
| 200目 Formvar/碳支持铜网 | Millipore-Sigma | TEM-FCF400CU | |
| 戊二醛 | Millipore-Sigma | 354400 | |
| HBSS | Gibco | C14175500BT | |
| Hieff Unicon qPCR TaqMan 探针预混液 | 翊圣生物 | 11205ES08 | |
| 高糖 Dulbecco 改良 Eagle 培养基 | Hyclone | SH30243 | |
| 高速离心机 | Beckman Coulter | Avanti J-E | |
| Hoechst 33342 | 碧云天 | C1022 | |
| 纳米颗粒跟踪分析仪 | Malvern Panalytical | NanoSight NS300 | |
| 超速离心用开顶薄壁超透明管 | Beckman Coulter | 344059 | |
| OptiPrep 碘克沙醇 | Millipore-Sigma | D1556 | |
| 4% 多聚甲醛 | 碧云天 | P0099 | |
| PBS | Biosharp | BL302A | |
| 青霉素-链霉素 | Millipore-Sigma | V900929 | |
| qPCR 仪器 | Applied Biosystems | QS6 实时荧光定量 PCR 系统 | |
| 高速离心机转子 | Beckman Coulter | JA-25.50 | |
| 超速离心机 SW 41 Ti 摆桶转子 | Beckman Coulter | 331362 | |
| 透射电子显微镜 | JEOL | JEM-2100F | |
| 超速离心机 | Beckman Coulter | Optima XE-100 | |
| 醋酸铀 | Electron Microscopy Sciences | NC1375332 | |
| Whatman Nuclepore 聚碳酸酯膜滤器 (200 nm) | Cytiva | 10417004 | |
| Whatman Nuclepore 聚碳酸酯膜滤器 (400 nm) | Cytiva | 10417104 |
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