2009年8月21日
我们描述了一个新的定量确定使用调查的扫描电喷雾电离质谱(ESI / MS)酵母大量的脂质物种lipidomics方法。这种方法超过目前可用的方法脂质识别和量化的能力来解决血脂,灵敏度和速度不同的分子形式。
该协议允许人们快速分析酵母脂质的主要成分。它从收获和洗涤酵母细胞开始。将洗涤后的细胞置于 1 至 2 氯仿、甲醇混合物中,并用玻璃珠裂解。
添加氯仿和水可分离两相。收集有机相,干燥,然后将脂质膜溶解在氯仿中,以便在质谱分析前储存。将提取的脂质用氯仿和甲醇与氢氧化铵稀释,并加入内标混合物。
脂质溶液现在可以直接注入质谱仪中。大家好,我是来自康考迪亚大学生物系 Vladimir Teco 实验室的 Simon Bork。今天,我将向您展示一种使用质谱法定量酵母脂质的方法。
我们在实验室中使用该程序来研究不同生长条件下酵母脂质的变化。那么让我们开始吧。要开始此过程,将先前制备的冷冻酵母沉淀悬浮在 1.6 毫升冰、冷蒸馏水中,并将 1.6 毫升细胞悬液转移到高速玻璃离心管中。
请注意,在整个过程中,所有提取脂质的作均使用玻璃移液器或注射器完成。由于塑料会产生较大的背景信号,因此如果它们与氯仿接触,则通过以 1 比 2 的比例加入 6 毫升氯仿甲醇混合物和 0.8 毫升在精英管中测量的玻璃珠到细胞悬液中来开始脂质提取。只要保持悬浮在水中的氯仿、甲醇和酵母的 1 比 2 比 0.8 的比例,确切的体积并不重要。旋涡。
细胞悬液和玻璃珠混合 2 次,每次 1 分钟,继续加入 2 毫升氯仿并轻轻混合,然后在室温下孵育 5 分钟,偶尔混合。孵育 5 分钟后,加入 2 毫升蒸馏水并轻轻混合。然后,在室温下孵育 5 分钟,偶尔混合。
在这里,对于氯仿、甲醇和水保持 2 比 2 比 1.8 的比例,而不是特定体积,更为重要。第二次孵化完成后。在室温下以 3000 Gs 离心 5 分钟,将第一次提取的所有上清液收集到新的高速玻璃离心管中,并向剩余的细胞沉淀中加入 3.2 mL氯仿,进行第二次脂质提取。
用添加的氯仿涡旋细胞沉淀两次,每次 1 分钟。然后在室温下以 3000 Gs 离心 5 分钟,将第二次提取的上清液添加到第一次提取后收集的上清液中。接下来,将收集的上清液离心 5 分钟。
在室温下 3000 Gs 时,提取的脂质现在溶解在较低的有机相中。弃去上层水相,将下层相转移到新的高速玻璃离心管中。为了在质谱离心机上产生更清晰的光谱,有机相在室温下以 3000 Gs 反应 5 分钟,然后将整个上清液转移到玻璃样品瓶中。
在氮气下干燥溶解的脂质,将干燥的脂质膜溶解在 500 微升氯仿中,并在零下 20 摄氏度下储存,直到准备好通过质谱分析样品。首先在氯仿中制备脂质的标准混合物,如随附的书面方案中的表 1 所示。每种脂质代表不同的类别。
该溶液可以储存在零下 20 摄氏度,以备后在将提取的脂质注入质谱仪之前使用。将 10 μL 样品与 10 μL 脂质标准混合物混合。请注意,标准品与样品的比率可以根据需要更改。
使用微量 Q 到 F 2 质谱仪分离样品和标准脂质混合物,该质谱仪配备以每分钟 1 微升的流速运行的纳离子电喷雾源。这些设置在随附的书面协议的表 2 中详细说明。尽管使用 Q 到 F 质谱仪的高分辨率是有利的,但这不是强制性要求。
确切的仪器参数因质谱仪而异。数据采集后,对质谱进行平滑处理,减去背景,使峰居中。最后,将峰列表导出到 excel。
然后将每个脂质玻璃的峰归一化为内标。根据应用的不同,可能需要执行进一步的后处理,例如 de isotope 和 deconvolution。该方法允许快速深入测定酵母脂质的主要成分。
在这里,我们重点介绍了一种脂质,它已被 de isotope de convoluted 并归一化为其内标。我们刚刚向您展示了如何分离酵母脂质,以及如何使用电显示电离质谱法测定酵母脂质。执行此程序时,请务必记住避免使用塑料,并将样品保持在线性浓度范围内。
这种方法非常灵活,并且在许多卷中可以根据需要进行更改。该萃取方案也适用于其他脂质分析方法,例如薄层色谱和多维质谱。就是这样。
感谢您的观看,祝您的实验好运。
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本文介绍了一种利用全扫描电喷雾电离质谱法(ESI/MS)鉴定酵母中多种脂质种类的新型定量脂质组学方法。该方法在脂质鉴定、定量、灵敏度和检测速度方面显著优于现有技术。
采用电喷雾电离质谱法(ESI/MS)进行定量脂质组学分析,能够快速、高灵敏度地对酵母脂质组进行谱型分析,支持早期发现阶段的机制性风险评估和靶点验证。该工作流程可加速脂质的鉴定与定量,为通路解析和功能研究提供可靠的数据支持。该方法对于致力于开展可扩展、可重复脂质组学分析以指导发现阶段决策的生物制药团队具有直接应用价值。
这种ESI/MS脂质组学方法适用于从早期发现到先导物鉴定的全过程,支持基于假设的研究和筛选工作流程。