通过凝胶电泳分离与可视化轮状病毒基因组

0 次观看3:44 分钟 • July 31st, 2026

取含有轮状病毒且无碎片的细胞裂解液。
加入变性盐溶液并涡旋振荡。盐可使宿主蛋白变性,灭活RNase,并破坏病毒衣壳的稳定性。
加入氯仿并涡旋振荡,以裂解病毒衣壳,释放病毒RNA片段。
离心悬浮液。RNA聚集在水相中,而变性的衣壳蛋白则积聚在两相界面处。
转移水相,加入异丙醇,降低核酸的溶解度,使RNA沉淀。
离心以分离RNA。弃去上清液,加入乙醇。
离心使RNA成团,弃去上清液。
室温干燥以去除残留乙醇,然后将RNA溶解于无核酸酶的水中,以保持RNA完整性。
将RNA与上样缓冲液混合,加样至聚丙烯酰胺凝胶中。
进行电泳,按大小分离病毒RNA片段。
使用RNA嵌入型染料对RNA染色。
在紫外光下,出现11条清晰条带表明成功回收轮状病毒基因组。
向1.5毫升微量离心管中加入600微升澄清的感染细胞裂解液和400微升硫氰酸胍溶液。涡旋振荡30秒,在室温下孵育5分钟。
然后加入200微升氯仿,涡旋振荡30秒,孵育3分钟。在4摄氏度、13,000 × g 条件下微量离心5分钟后,将550微升上层水相转移至新管中。
加入两倍体积的预冷异丙醇,倒置混匀4至6次。室温孵育10分钟,然后在4摄氏度、13,000 × g 条件下离心10分钟。
弃去上清液,保留RNA沉淀。向管中加入1毫升75%乙醇洗涤RNA,倒置一次混匀,在4摄氏度、7,500 × g 条件下离心5分钟。小心吸除乙醇后,将RNA室温晾干5至10分钟。
然后将沉淀溶解于15微升无核酸酶的水中。取10微升溶解的RNA样品,加入2微升6X DNA上样缓冲液,混匀后加样至预制的10%聚丙烯酰胺微型凝胶中。
在Tris-甘氨酸电泳缓冲液中,以恒定16毫安电流电泳2小时,实现RNA的分离。电泳结束后,将凝胶浸入含1微克/毫升溴化乙锭的水中染色5至10分钟,使用紫外透射仪检测轮状病毒基因组片段。