2013年11月21日
本文描述了通过自组装这一自发过程形成高度有序的肽基结构的方法。该方法利用 commercially available peptides 和常见的实验设备。该技术可应用于多种不同的肽,并可能促进新型肽基组装体的发现。
本实验的总体目标是生成以生物分子项链形式存在的多肽组装体。首先,通过将二苯丙氨酸及其Bach保护类似物分别溶解于适量的六氟丙醇(HFP)中,配制储备溶液,终浓度为100毫克/毫升。第二步,按5:3的比例混合多肽储备溶液,即将10微升的二苯丙氨酸多肽溶液与6微升的Bach保护二苯丙氨酸多肽溶液混合。
接下来,将混合的肽类储备液加入新配制的50%乙醇中,使苯丙氨酸的终浓度为每毫升5毫克,而Bach保护的苯丙氨酸为每毫升3毫克。最终通过扫描电子显微镜观察显示,这两种肽共同组装形成了生物分子项链结构。采用此类自组装过程的主要优势在于,通过自发进行的反应,即可生成复杂的结构。
体外实验在此处指多肽的自组装过程,具体为二肽的共组装。演示该实验步骤的人员为Nuran,一位来自前实验室的研究生。开始苯丙氨酸二肽自组装形成管状结构的实验时,需通过将苯丙氨酸二肽溶解于HFP中,配制浓度为100毫克/毫升的多肽储备溶液。为确保溶液均匀,使用涡旋振荡器混合数秒,并在实验台上静置数分钟,直至多肽完全溶解,溶液澄清透明。
将肽储备液用三蒸水稀释至终浓度为每毫升2毫克。室温下放置24小时。对于共组装步骤,分别将2毫克二苯丙氨酸肽和1毫克Bach保护的二苯丙氨酸肽溶于六氟丙醇(HFP),配制成浓度为每毫升100毫克的溶液。
然后使用涡旋振荡器将溶液混合数秒钟,并在实验台上静置几分钟,直至多肽完全溶解且溶液澄清。按照5比3的比例混合多肽储备液,即取10微升二苯丙氨酸多肽溶液与6微升Bach保护的二苯丙氨酸多肽溶液混合。随后使用涡旋振荡器将溶液充分混匀。
随后,取 8 微升混合的肽类储备溶液,加入到 92 微升新配制的 50% 乙醇中,使二苯丙氨酸的终浓度为 5 毫克/毫升,Bach 保护的二苯丙氨酸为 3 毫克/毫升。使用移液器轻轻混匀溶液。
在室温下孵育24小时后,取10微升肽溶液滴加到玻璃盖玻片上,并在室温下使其自然干燥。使用溅射镀膜仪在玻璃盖玻片样品表面镀上一层薄金,镀膜时间为90秒。完成后,采用扫描电子显微镜(SEM)在10至20千伏电压下对组装结构进行成像。
进行透射电镜分析时,将10微升肽溶液滴加到覆盖有碳膜并由聚合物薄膜支撑稳定的200目铜网上。一分钟后,用滤纸吸去多余液体。接着,将2%醋酸铀溶液转移至注射器中,并使用0.22微米滤器进行过滤。
在载网上滴加10 µL醋酸铀溶液以保持样品状态。30秒后,用滤纸吸去多余液体,并在120 kV的透射电子显微镜(TEM)下对载网上的样品进行成像。进行傅里叶变换红外光谱(FTIR)分析时,将30 µL肽溶液滴加到氟化钙窗片上。
将溶液在室温下晾干,以抑制傅里叶变换红外光谱(FTIR)中的水信号。在干燥的肽样品上滴加一滴重水(deuterium oxide)。将样品在真空干燥器中干燥后,重复前述步骤两次,以确保氢原子与氘原子的交换达到最大程度。
最后,使用氘化三甘氨酸硫酸盐检测器记录傅里叶变换红外(FTIR)光谱。利用仪器配套软件确定透射率最低值,以证明肽分子通过自组装形成了有序结构。两种简单的芳香族肽共组装产物通过扫描电镜(SEM)和透射电镜(TEM)分析进行制备与表征。
这些混合肽形成了球形组装结构,其直径为几微米,通过直径数百纳米的伸长结构相互连接,由于形态上与琴弦高度相似而得名。这些结构被称为分子项链。对这些结构的原子力显微镜分析清楚地展示了它们的三维排列方式。
此外,对各种样品不同区域的扫描电镜分析表明,该过程具有很高的产率。傅里叶变换红外光谱分析提供了肽组装体二级结构的信息。酰胺的吸收光谱。
苯丙氨酸二肽在乙醇中形成的球形组装体的一条谱带在1,657 cm⁻¹处显示单一的酰胺峰,表明其具有α-螺旋构象。苯丙氨酸二肽在乙醇中形成的管状结构在1,613 cm⁻¹和1,682 cm⁻¹处显示出两个明显的峰,对应于β-折叠二级结构。两种肽共组装形成的生物分子项链的傅里叶变换红外光谱(FTIR)与其各自单独肽的峰归属不同。
在 1,653 个倒数厘米处的第一个峰对应于α螺旋结构,而在 1,684 个倒数厘米处的第二个峰则与β转角构象相关。不同光谱之间的差异表明生物分子项链具有独特的结构。观看本视频后,您应该能够很好地理解如何通过染料肽生成基于肽的组装体。
该方法可轻松应用于其他生物分子,以形成复杂的结构。请务必注意,接触有机溶剂可能具有极高危险性。进行此操作时,应始终佩戴手套、实验服和护目镜。
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本研究聚焦于利用市售多肽进行基于多肽结构的自组装,特别是生物分子项链结构的构建。该方法简便易行,有助于发现新的多肽组装体。
多肽自组装能够在温和条件下形成复杂的生物分子结构,为药物递送和纳米医学领域的生物材料提供了一种可扩展且易于实现的途径。该方法通过提供可重复、可量化的组装结构,支持早期靶点验证,并可通过显微镜和光谱学手段进行表征。该策略减少了基于多肽系统的机制不确定性,从而加速从发现到临床前评估的转化进程。
该方法适用于从早期发现到先导化合物优化的阶段,其中肽的组装行为可揭示结构-功能关系及材料特性。