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在生物化学领域,基于色谱的分离纯化方法来隔离从复杂混合物的化合物。两个常用的生物化学家这种方法有尺寸排阻色谱法及亲和层析。在尺寸排阻色谱中,挤满了多孔珠列分隔组件基于的混合料大小。另一方面,亲和层析可允许更具体分离的生物分子所使用的固定相,其中包含特定于目标的配体组成的列。
这个视频被作为导论尺寸排阻以及亲和层析,并管理他们的概念。所述的组氨酸标签的蛋白质固定化金属离子亲和色谱纯化的分步过程。这两种色谱方法在生物化学和生物医学研究中的应用也被异形。
"色谱"指的是广泛的方法用来隔离组件从一个复杂的混合物之前可以确定生物分子的性质和活动, 的一个重要步骤。每个色谱技术具有分离,根据样本矩阵和目标化合物的不同机制。这个视频将集中原则和操作的两种方法共同的生物化学: 和亲和尺寸排阻色谱法。
尺寸排阻色谱法或 SEC 基于样品中的化合物的大小。向与多孔材料的列添加包含样品流动相: 固定相。样品中的分子可分为三个类别 1。
分子太大,无法进入毛孔旅行通过列最短的距离。以上这种"排除限制"的分子量与任何物种将在同一时间退出列。分子小到足以自由进入毛孔将最长保留,将退出列在一起。分子量允许完整孔隙条目是"渗透极限"。
只有分子之间这些限制将会彼此分开,当他们花不同数量的时间扩散和毛孔。更小的分子被保留较长时间的列上因为他们花更多时间在固定相,而较大的分子,在这些范围内较早前退出。
在 1 到 2 个数量级的分子量范围内这些限制。在心目中,选择与此列或多列可以用于系列,如果预期的化合物种类繁多。
现在,您已经看到美国证交会的理论,让我们看看它如何进行。
要开始美国证交会过程,必须与去离子的水和色谱缓冲平衡列。一旦准备好,缓冲区包含样品注入到列。缓冲区是然后在推低流量。探测器监视什么退出列来确定所需的分析物的存在。大分子分子量高于排斥限制在同一时间退出列。从列小馏分收集管。每个分数的靶分子质量测定凝胶电泳或其他分析技术。
现在让我们来看看亲和层析或交流,纯化目的蛋白的最有效途径之一。许多生物分子选择性地绑定到某些配体一属性交流利用通过遵循一种特定于目标的配体及固定相。
当混合物流经列时,靶分子将附加到配体,以及其余流过。混合物已通过列后,可以通过两种基于特异性的洗脱方法之一收集的靶分子。
可以说是特异性洗脱了"正常"或"反向作用"。在正常作用生物特异性洗脱,代理添加粘配要绑定与目标生物分子展开了竞争。
反向作用生物特异性洗脱剂与目标要绑定到粘配体竞争。第二种洗脱类型,非特异性洗脱,通过改变溶液的 ph 值、 离子强度、 或极性降低目标对配体结合。如果一种蛋白质没有绑定到可以固定的配体,可以包含一个"标签"表达蛋白: 短肽序列工程要绑定到的配体。
一个品种是固定化金属离子亲和层析,"IMAC"的简称,在那里像镍或钴,粘金属配体,将绑定到组氨酸残基被修饰蛋白上。通过分子生物学技术,目标蛋白质生成的重复组氨酸残基,称作应运而生标记,将绑定到组氨酸的咪唑侧链通过金属。绑定后,蛋白质可以收集与免费咪唑通过反向作用具体洗脱,后来用在各种各样的下游应用程序。
现在,您已经看到亲和色谱的原理,让我们看看在实验室 IMAC 过程。
在 IMAC,固定相可以直接添加到混合物的流动相和样品,允许他标记蛋白的绑定。这个浆然后倒入的列,地方非绑定化合物滴入废物,虽然浆。浆料容器冲洗才能收集树脂残留和样品,添加到列。
树脂搅拌以确保绑定的组件自由流动。添加洗缓冲区有助于用水冲掉。一旦所有的未绑定的组件已被删除,废物被替换为一个容器,以收集目标蛋白。
含咪唑的缓冲区是添加、 搅拌,和允许休息要解除绑定的靶分子。咪唑将绑定到金属,替换和释放标记的蛋白质。收集了被释放的蛋白质,和重复咪唑步骤以确保总的集合。要进一步净化样品,可以在样品分析前运行秒。
现在,我们已经看到的理论和程序的这两种技术,让我们看看一些他们在生化领域应用的方法。
纯化目的蛋白的常见原因是研究及其在疾病中的作用。囊性纤维化是由囊性纤维化跨膜电导调节因子蛋白或 CFTR 缺陷引起的。成长与酵母中的他标记蛋白以后, 亲和性和尺寸排阻色谱法允许分离蛋白质,其次是其功能的研究。
在某些情况下,应运而生的标记的存在可以改变蛋白质的结构,从而影响其功能。另一个常见的标记是麦芽糖结合蛋白或 MBP,将绑定来绑定列中的直链淀粉。麦芽糖然后用于释放复杂。MBP 可以劈开然后删除与美国证交会产生纯所需的蛋白质。
你刚看了朱庇特的视频尺寸排阻及亲和层析。它覆盖技术的理论,走过去一般程序,并涵盖了一些技术的使用。
谢谢观赏 !
"色谱法"是指用于从复杂混合物中分离成分的广泛方法,这是确定生物分子的性质和活性之前必不可少的步骤。每种色谱技术都有不同的分离机制,具体取决于样品基质和目标化合物。本视频将重点介绍生物化学中两种常见方法的原理和作:体积排阻和亲和色谱。
体积排阻色谱法 (SEC) 基于样品中化合物的大小。将含有样品的流动相添加到具有多孔材料的色谱柱中:固定相。样品中的分子属于 3 类中的 1 类。
太大而无法进入孔隙的分子在色谱柱中的行进距离最短。分子量高于此"排除限"的任何物种都将同时退出色谱柱。小到可以自由进入孔隙的分子将保留最长时间,并将一起离开色谱柱。允许完全进入孔的分子量是"渗透极限"。
只有这些限制之间的分子才会彼此分离,因为它们需要不同的时间扩散进出孔隙。较小的分子在色谱柱上的保留时间较长,因为它们在固定相中停留的时间更长,而在这些限制内的较大分子则更早退出。
1 到 2 个数量级的分子量在这些限制范围内。考虑到这一点,选择色谱柱时,如果有广泛的所需化合物,则可以串联使用多个色谱柱。
现在您已经了解了 SEC 的理论,让我们看看它是如何实现的。
要开始 SEC 程序,必须用去离子水和色谱缓冲液平衡色谱柱。制备完成后,将含有样品的缓冲液注入色谱柱。然后以低流速将缓冲液推过。检测器监测从色谱柱中流出的物质,以确定是否存在所需的分析物。分子量高于排阻极限的大分子同时从色谱柱中流出。将色谱柱中的小部分收集在试管中。通过凝胶电泳或其他分析技术测试每个馏分的目标分子的质量。
现在让我们看一下亲和层析或 AC,这是纯化蛋白质的最有效方法之一。许多生物分子选择性地与某些配体结合,AC 通过将靶标特异性配体粘附到固定相上来利用这种特性。
当混合物流经色谱柱时,目标分子附着在配体上,其余分子流过。混合物通过色谱柱后,可以根据特异性通过两种洗脱方法之一收集目标分子。
生物特异性洗脱可以说具有"正常"或"反向作用"。在正常作用的生物特异性洗脱中,添加一种与粘附的配体竞争与目标生物分子结合的试剂。
在反向作用生物特异性洗脱中,试剂与靶标竞争以结合粘附的配体。第二种洗脱类型,非特异性洗脱,通过改变溶液的 pH 值、离子强度或极性来降低靶标与配体的结合。如果蛋白质不与可固定的配体结合,则该蛋白质可以表达包含"标签"的蛋白质:经过工程改造以与配体结合的短肽序列。
一种是固定化金属离子亲和层析法,简称"IMAC",其中粘附的金属配体(如镍或钴)与修饰蛋白上的组氨酸残基结合。通过分子生物学技术,靶蛋白由重复的组氨酸残基产生,称为多聚组氨酸标签,它通过组氨酸上的咪唑侧链与金属结合。结合后,可以通过反向角色特异性洗脱用游离咪唑收集蛋白质,然后用于各种下游应用。现在您已经了解了亲和层析的理论,让我们看看实验室中的 IMAC 程序。
在 IMAC 中,固定相可以直接添加到流动相和样品的混合物中,从而允许结合 his 标记的蛋白质。然后将这些浆料倒入塔中,在那里,非结合化合物滴入废液中,而浆料则保留下来。冲洗浆料容器以收集残留树脂和样品,然后将其添加到色谱柱中。
搅拌填料以确保未结合的组分自由流动。添加的洗涤缓冲液有助于将它们冲走。去除所有未结合的组分后,用容器替换废液以收集目标蛋白。
加入含有咪唑的缓冲液,搅拌并静置以解绑目标分子。咪唑与金属结合,取代并释放标记的蛋白质。收集释放的蛋白质,并重复咪唑步骤以确保完全收集。为了进一步纯化样品,可以在分析前对样品运行 SEC。
现在我们已经了解了这两种技术的理论和过程,让我们看看它们在生化领域的一些应用方式。
纯化蛋白质的一个常见原因是研究它们在疾病中的作用。囊性纤维化是由囊性纤维化跨膜传导调节蛋白 (CFTR) 缺陷引起的。在酵母中培养带有 his 标签的蛋白质后,亲和层析和尺寸排阻层析都可以分离蛋白质,然后研究其功能。
在某些情况下,多聚组氨酸标签的存在会改变蛋白质的结构,从而影响其功能。另一个常见的标签是麦芽糖结合蛋白或 MBP,它将与柱中结合的直链淀粉结合。然后使用麦芽糖来释放复合物。然后,可以切割 MBP 并用 SEC 去除,以产生所需的纯蛋白。
您刚刚观看了 JoVE 关于体积排阻和亲和层析的视频。它涵盖了技术的理论,介绍了一般程序,并涵盖了这些技术的一些用途。
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