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ヒト脳組織からのタンパク質の多発反応モニタリングを用いた定量的プロテオミクスワークフロー

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生物学
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JoVE 杂志生物学

Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue

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ヒト脳組織からのタンパク質の多発反応モニタリングを用いた定量的プロテオミクスワークフロー

DOI:

10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

Saicharan Ghantasala*¹, Medha Gayathri J Pai*², Sanjeeva Srivastava

¹Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, ²Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Chapters

00:05Introduction
00:49Protein Extraction from Brain Tissue
02:04Protein Quantification and Quality Check
02:32Protein Digestion
03:58Desalting and Peptide Quantification
05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
07:30LC Parameters
08:03MS Parameters
08:25Run Sequence and Instrument QC
09:08Method Refinement
10:58Results and Conclusions

Summary

自动翻译

このプロトコルは、臨床サンプルからのタンパク質の多重反応モニタリング(MRM)のための三重四重極質量分析計の使用を導入することを目的としています。我々は、サンプル調製から臨床サンプルのデータ分析に始まる体系的なワークフローを提供し、必要な予防措置をすべて講じています。

Tags

Quantitative Proteomics Multiple Reaction Monitoring Targeted Proteomics Protein Detection Sample Preparation Protein Extraction Protein Digestion Peptide Cleanup Mass Spectrometry

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