2021年6月30日
本文旨在介绍一种利用蔗糖密度梯度超速离心法从哺乳动物细胞中制备循环内体的实验方案。
本方案有助于从转染的哺乳动物细胞中分离含有循环内体的组分,从而促进通过内吞运输途径对蛋白质转运进行研究。该技术操作简便,适用于组织和细胞样本。本实验操作将由劳博士实验室的博士研究生翟雨琪小姐进行演示。
首先,在100毫米培养皿中接种2×10⁶个细胞。次日,根据制造商说明书,使用Lipofectamine对细胞进行转染。收集细胞时,转染48小时后弃去培养基,并用预冷的PBS洗涤细胞两次。
然后向每块培养皿中加入1毫升预冷的PBS,其中添加有0.5X蛋白酶抑制剂混合物和0.5X磷酸酶抑制剂混合物。接着,使用细胞刮刀收集细胞,并将细胞悬液转移至15毫升离心管中。使用水平转子离心机对细胞进行离心。
弃去上清液,将细胞沉淀用五毫升匀浆缓冲液轻轻重悬。通过离心再次收集细胞,然后将细胞沉淀用一毫升匀浆缓冲液重悬。使用Dounce匀浆器,以15至20次冲程匀浆细胞。
然后将匀浆液转移至一个2毫升的离心管中。向匀浆液中加入700微升匀浆缓冲液。随后离心稀释后的匀浆液,并收集1.5毫升上清液。
将收集的上清液再次离心,然后收集1.4毫升上清液,并标记为去核上清液。为制备密度梯度柱,将1.2毫升去核上清液转移至超速离心管中。然后向样品中加入1毫升62%蔗糖溶液,通过轻柔吹打充分混匀。
接下来,小心地将 3.3 毫升 35% 蔗糖溶液加在样品上方,然后在 35% 蔗糖溶液上层加入 2.2 毫升 25% 蔗糖溶液。最后,用匀浆缓冲液将超速离心管加满至顶部。对密度梯度柱进行离心,并从梯度顶部开始,小心收集 12 个 1 毫升的组分。
接下来,用一毫升稀释缓冲液稀释所有组分,并对稀释后的样品进行离心。离心后,吸除上清液,并加入50微升1X上样缓冲液以收集各组分。在第七组分中检测到循环内体标志物Rab11。
还检测了其他亚细胞标志物,包括 beta COP、COX IV、GAPDH、EEA1、Rab 7 和 Lamp1。在第七组分中也检测到 EEA1 的阳性信号。此处展示了第七组分及去核上清液中 GAPDH、Cox IV 和 Rab11 的测定条带强度。
在用 ELMO1、ELMO1 ARF6Q67L 或 ELMO1 ARF6Q67L FE65 转染 HEC293 细胞后,ELMO1 在细胞内的分布未因 ARF6Q67L 和 FE65 的过表达而发生改变。比较不同转染条件下第七组分中的 ELMO1 水平,发现共转染 ARF6Q67L 后其水平升高;当同时共表达 ARF6Q67L 和 FE65 时,ELMO1 水平进一步增加。
相反,敲除 FE65 会减弱 ARF6 介导的 Elmo1 在第七组分中的富集。所获得的组分可用于后续分析,例如通过蛋白质印迹检测该组分中蛋白质水平的变化。
查看完整文字稿并访问数千部科学视频
本文介绍了一种利用蔗糖密度梯度超速离心法从哺乳动物细胞中制备再循环内体的实验方案。该技术旨在促进通过内吞途径进行蛋白质转运的研究。
分离再循环内体可通过提供定量的亚细胞分级数据,实现对内吞运输靶点的机制性风险评估。该方法通过将蛋白质定位与功能性再循环通路相关联,有助于对调控膜蛋白再循环的蛋白质(如ARF6效应分子)进行靶点验证和检测方法开发,从而提高先导化合物筛选的预测可信度。
该方法通过分离亚细胞组分,为靶点验证和先导化合物筛选决策提供依据,从而整合到早期发现工作流程中。