2021年7月21日
本方案介绍了一种利用与谷胱甘肽偶联的供体微珠和GST融合的TPR基序共伴侣蛋白,以及与Hsp90来源肽段偶联的受体微珠来检测蛋白质-蛋白质相互作用的技术。我们已应用该技术筛选可破坏Hsp90-FKBP51或Hsp90-FKBP52相互作用的小分子化合物,并鉴定出高效且选择性的Hsp90-FKBP51相互作用抑制剂。
我们建立了一种基于均相微球的检测方法,用于研究分子伴侣与共伴侣之间的相互作用。利用该技术,我们筛选了可抑制Hsp90与FKBP51或FKBP52之间相互作用的小分子,并鉴定出高效且具有选择性的抑制剂。该高通量筛选技术稳定可靠。
结果可在一小时内获得,且仅需少量珠蛋白和化合物。Hsp90 与这些共伴侣蛋白的相互作用与多种人类疾病相关,例如阿尔茨海默病、癌症、自身免疫性疾病。该技术为筛选具有重要医学意义的伴侣蛋白-共伴侣蛋白抑制剂提供了可能。
该检测方法的基本原理如下:当Hsp90 C端肽段与共伴侣蛋白的TPR结构域之间的相互作用使供体微珠和受体微珠彼此靠近时,会产生高度放大的信号。当加入相互作用抑制剂后,供体微珠和受体微珠无法接近,因而不会产生可检测的信号。
首先将Hsp90肽用PBS稀释至1毫克/毫升的浓度。将未偶联的受体珠用PBS稀释后,转移至1.5毫升离心管中。离心稀释后的珠子以进行洗涤,然后小心移除上清液。
进行偶联时,将受体珠与肽按10:1的比例混合。向包被肽的珠中加入磷酸盐缓冲液稀释的肽、Tween 20和氰基硼氢化钠溶液,并在旋转摇床上以翻转振荡方式孵育。为封闭未反应位点,向珠中加入20微升1摩尔pH 8.0的盐酸三羟甲基氨基甲烷(Tris-HCl)溶液,并在37摄氏度孵育1小时以终止反应。
孵育结束后,通过离心洗涤磁珠,并将磁珠沉淀重悬于1毫升三羟甲基氨基甲烷盐酸盐溶液中。重复洗涤两次。最后一次洗涤后,将磁珠重悬于储存缓冲液中,浓度为每毫升1毫克,并将偶联的受体磁珠溶液置于4摄氏度避光保存。
在 PBS 中加入谷胱甘肽供体珠,终浓度为每毫升 10 微克。加入 GSTFKBP51 至终浓度为每毫升 10 微克,并在 25 摄氏度避光孵育反应 10 分钟。用 DMSO 对待测化合物进行系列稀释。
向384孔板每个孔的角落加入0.25 µL测试化合物稀释液,并设三个复孔。阴性对照孔中加入0.25 µL DMSO,阳性对照孔中加入0.25 µL Hsp90 C端肽。向每孔加入22.5 µL含有谷胱甘肽供体珠和GST标记蛋白的溶液。
用手充分振荡酶标板,然后在25摄氏度避光孵育15分钟。将受体珠与附带的Hsp90C端肽混合,用0.5倍PBS稀释至浓度为100微克/毫升。向每孔加入2.25微升稀释后的受体珠溶液。
按照所示方法,将酶标板在避光条件下振荡并孵育15分钟。打开酶标仪,测量酶标板的信号,并按照文本稿件中的描述分析数据。在欢迎对话框中创建一个X-Y数据表,选择X为数值,Y为数据,并在并列的各列中输入三个重复值。
将浓度值导入 X 列,将信号值导入 Y 列。点击“分析”,选择“转换浓度 X”,然后选择“转换为对数”。点击“分析”,在 X-Y 分析中选择非线性回归。
打开剂量-反应抑制选项,选择“对数剂量与反应变量斜率”方程。点击确定,查看包含IC50值及图表的结果。该实验用于筛选能够抑制Hsp90与FKBP51或FKBP52之间相互作用的小分子化合物。
Z 值大于 0.8 且信号与背景比为 13.35,表明该方法适用于高通量筛选,具有良好的稳健性和可靠性。评估了小分子量测试化合物 D10 对分子伴侣-共伴侣相互作用的抑制作用,并计算了 IC50 值,结果显示 D10 呈剂量依赖性抑制。D10 对 Hsp90-GST-FKBP51 相互作用的 IC50 值为 65 纳摩尔。
对于Hsp90与GSTFKBP52的相互作用,即使在最高化合物浓度下也未实现完全抑制,这表明利用小分子选择性抑制蛋白质-蛋白质相互作用是可行的。关键步骤在于添加顺序:我们首先让小分子与其TPR靶标形成复合物。
否则需要更长的孵育时间以及更高的化合物浓度。我们可以利用该技术筛选能够破坏Hsp90与FKB51或Hsp90与FKB52之间相互作用的小分子。该方法还可拓展应用于筛选针对Hsp90、Hsp70与含TPR模体的共伴侣蛋白之间相互作用的特异性抑制剂。
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本方案描述了一种基于均相微珠的检测方法,用于研究伴侣蛋白与共伴侣蛋白之间的相互作用,特别是Hsp90与FKBP51或FKBP52之间的相互作用。该技术可用于高通量筛选小分子化合物,以鉴定这些相互作用的强效抑制剂,而这些相互作用与多种人类疾病相关。
靶向Hsp90与共伴侣蛋白的相互作用可选择性调控与疾病相关的信号通路,为癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病提供精准的治疗干预策略。基于均相微球的检测方法通过在均一体系中定量蛋白质-蛋白质相互作用的破坏,为早期靶点验证和先导化合物筛选提供了可靠且可扩展的平台。该方法有助于在机制层面降低研发风险,并提高对具有选择性抑制Hsp90-FKBP51或Hsp90-FKBP52相互作用特征的化合物系列进行优先排序的预测可信度。
该检测方法适用于早期发现阶段,可通过生化手段确认Hsp90与共伴侣蛋白相互作用的破坏,从而支持靶点验证,并可通过高通量筛选小分子化合物文库,实现先导化合物的鉴定。