2023年11月17日
微管是由微管蛋白聚合而成的结构,在真核细胞中作为细胞骨架的重要组分发挥关键作用,并以其动态不稳定性而著称。本研究建立了一种微管分级分离方法,可将微管分离为稳定微管、不稳定微管和游离微管蛋白,以评估微管在多种小鼠组织中的稳定性。
我们的新方案有助于区分和定量动物组织中微管环的三种状态,即稳定微管、不稳定微管和游离微管。该技术由简单的步骤组成,能够评估微管的结构稳定性,而这种稳定性无法通过微管翻译后修饰的定量分析来检测。该方法对于微管稳定性至关重要的疾病(如阿尔茨海默病和癌症)的治疗策略研发具有重要意义。
开始实验前,准备好用于组织解剖的实验防护装备。取一个容器装入碎冰,并将两个培养皿置于冰上。其中一个培养皿中加入冰冷的磷酸盐缓冲液(PBS),用于组织样本的短暂清洗和临时保存。
将用 PBS 润湿的滤纸铺在第二个培养皿上。接着,称量装有 PBS 的 1.5 毫升离心管,用于存放解剖所得组织。从小鼠体内取出组织后,立即将其转移至离心管中,并重新称量每个离心管。
将组织转移至含有冰冻微管稳定缓冲液或MSB+培养基的玻璃匀浆器中,并立即使用预冷的匀浆器匀浆组织。随后用巴斯德吸管将组织匀浆液转移至2毫升微量离心管中,在2°C条件下以2,400 G离心3分钟。将上清液转移至新的1.5毫升微量离心管中,以去除碎片杂质。
将上清液或S1组分在新的1.5毫升微量离心管中涡旋混匀。立即用移液器吸取200微升S1组分至离心微量管中,在2摄氏度条件下使用TLA-55转子以100,000 G离心20分钟。第二次离心后,将S2上清液与P2沉淀分离。
立即将S2上清液的全部组分转移至离心微量管中,使用TLA-120.2转子在2°C条件下以500,000 G离心60分钟。第三次离心后,分离S3上清液与P3沉淀。将全部S3组分溶解于200 µL的2X十二烷基硫酸钠(SDS)样品缓冲液中。
将剩余的S1组分与等体积的2X SDS上样缓冲液混合,用于制备蛋白质印迹实验的标准曲线。接着,向P2和P3组分的离心管中各加入400微升SDS上样缓冲液。然后,对溶液进行短时间超声处理,以溶解沉淀物,再将样品转移至新的1.5毫升微量离心管中,并置于冰盒中保存。
将所有样品在 100 摄氏度下煮沸三分钟。小鼠脑组织中 P2 组分的微管占总 α-微管蛋白的 34.86%,而 P3 和 S3 组分中的微管分别占 56.13% 和 9.01%。P2、P3 和 S3 组分中 β-3 微管蛋白的比例与 α-微管蛋白相比无显著差异。
S2组分中微管蛋白通过300千道尔顿超滤离心柱的透过有限,而S3组分则允许微管蛋白复合物完全透过。层析分离得到S3微管蛋白在100千道尔顿处洗脱。每个组分中回收的α-和β-微管蛋白比例相等。
P2组分中乙酰化α-微管蛋白显著富集,而P3组分中以酪氨酸化α-微管蛋白为主。在匀浆前对脑组织进行冷冻,会导致P2组分中α-微管蛋白浓度降低,但P3组分中的α-微管蛋白则有所增加。
冷冻还降低了P2组分中α-微管蛋白的乙酰化水平,并增加了其酪氨酸化水平。诺考达唑处理减少了P2组分中的α-微管蛋白含量。与冷冻不同,诺考达唑对P2组分微管蛋白的翻译后修饰没有影响。
脑组织中P2微管蛋白的浓度显著较高,而P3微管蛋白则集中在增殖组织中。Western印迹结果显示,神经系统中特异性存在的P2微管蛋白来源于稳定的微管,而P3微管蛋白则来源于不稳定的微管。微管的稳定性具有高度动态性。
必须在低温环境中快速且不间断地完成本实验方案。同时确保组织和各组分在溶解于SDS样品缓冲液之前始终未被冷冻。通过将各组分的免疫印迹分析与蛋白质组学相结合,有望鉴定出参与微管动态调控的相关因子。
利用该方法,我们揭示了正常tau蛋白在微管上的存在形式。该方法还可用于研究tau蛋白在衰老大脑中如何发生异常,从而识别出痴呆症新的药物靶点。
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本研究提出了一种用于区分和定量动物组织中稳定微管、不稳定微管以及游离微管蛋白的新方案。该方法可评估微管的结构稳定性,对于理解阿尔茨海默病和癌症等疾病具有重要意义。
准确评估微管稳定性对于神经退行性疾病和癌症中治疗机制的评价至关重要,因为在这些疾病中,细胞骨架动力学影响药物反应。该分步提取技术能够直接定量天然组织中稳定、不稳定和游离微管蛋白池,提供一种生化读数,可与成像技术及特异性修饰检测方法相互补充。通过解析功能性微管状态,该方法可支持针对微管调节剂的早期发现项目中的靶点验证和机制性风险评估。
该方法适用于从靶点验证到先导化合物优化的整个发现过程,其中微管稳定性作为药效动力学生物标志物,用于确认作用机制。