2022年1月31日
本实验方案描述了一种可靠且简便的Ditylenchus dipsaci培养、收集与筛选方法。
本方案通过培养技术和中等通量化学筛选,可用于发现能够防治茎线虫(Ditylenchus dipsaci)的新型杀线虫剂。该技术操作简便,每周可筛选数千种化合物,以鉴定具有杀线虫潜力的候选分子。该方法可识别出能够杀灭农作物寄生性线虫的新化合物,从而有助于提高全球粮食供应。
首先,准备 500 毫升营养琼脂(NA 培养基),每升含 23 克 NA 和超纯水。采用无菌操作技术,将 25 毫升经高压灭菌的 NA 培养基倒入 20 个一次性直径 100 毫米、深度 15 毫米的培养皿中。另准备 500 毫升 Gamborg B5(GA 培养基),其中包含每升 3.2 克 GA 基本培养基(含最低量有机成分)、20 克蔗糖、15 克琼脂和蒸馏水。
采用无菌操作技术,将50毫升经高压灭菌的GA培养基倒入10个一次性培养皿中。进行种子灭菌时,在实验台上的本生灯火焰附近,将150粒豌豆种子倒入含搅拌子的无菌2升烧杯中。向种子中加入200毫升95%乙醇,并在搅拌器上剧烈搅拌5分钟。
然后,将乙醇倒入废液容器中。将次氯酸钠溶液倒入烧杯,完全浸没种子。在摇床中剧烈搅拌20分钟。
然后,将次氯酸钠溶液倒入废液容器中。向烧杯中加入蒸馏水以浸没种子,并在摇床上剧烈搅拌20分钟。最后一次水洗后,将已灭菌的种子倒入玻璃培养皿中。
为检测污染,使用灭菌镊子在超净工作台中将六粒种子转移至每个10厘米的NA培养基平板上。将种子沿平板边缘均匀排列。用实验室封口膜逐个包裹平板,并在26摄氏度避光条件下培养三天。
在超净工作台中,使用灭菌镊子将两粒无污染的种子接种到每个 GA 培养基平板上。于室温下培养 7 至 10 天,使种子发芽。配制 50 毫升浓度为 20 克/升的蔗糖溶液。
将蔗糖溶液过滤除菌,备用。在超净工作台中,从现有的培养皿中切取含有根组织的一小块琼脂。用移液器吸取500 µL蔗糖溶液,滴加到含有豌豆幼苗的新制GA培养基平板上,然后将琼脂块置于蔗糖溶液上方。
将培养物置于室温下、内衬铝箔的盒子中进行保存。为维持培养物,每八到九周需将线虫转接至新的GA平板上进行传代培养。线虫培养约八周后即可进行提取。
在超净工作台中,使用无菌解剖刀将琼脂和根组织切成一厘米见方的小块。将琼脂块转移至铺有咖啡滤纸的漏斗中,并缓慢倒入蒸馏水润湿咖啡滤纸。将铺有咖啡滤纸的漏斗从烧杯中取出,向烧杯中加入蒸馏水,直至重新放回漏斗后,液面刚好接触滤纸底部。
用铝箔覆盖装有咖啡滤纸的漏斗和烧杯。为收集线虫,取下装有咖啡滤纸的漏斗,并用移液器吸取收集烧杯中上层40毫升的水,注意不要扰动已沉淀的线虫。使用10毫升塑料刻度移液管将剩余液体收集至15毫升锥形离心管中。
为准备检测板,将经高压灭菌的蒸馏水倒入无菌槽中,使用多通道移液器从槽中向平底96孔板的每个孔内加入40 µL蒸馏水。通过将金属针在96孔化学储存板中浸入三次,将化学品添加至检测板中,随后将金属针在检测板中转移十次。
将样品点在清洁溶液前方的纸面上。为统计收集到的线虫数量,首先重新悬浮收集的样品,然后使用低吸附枪头吸取5 µL溶液,滴加到载玻片上。利用解剖显微镜计数5 µL溶液中的线虫数量。
然后,使用无菌蒸馏水将浓度调整为每微升含两个线虫。接着,用多通道移液器和储液槽向96孔板的每个孔中加入10微升样品。用湿润的纸巾包裹96孔板,并将其放入盒中。
然后,添加一张额外的湿润滤纸,以稳定并尽量减少培养板的移动,并将其固定在20°C、200 rpm的摇床培养箱中的粘性垫上。在第5天于解剖显微镜下观察培养板。计数DMSO溶剂对照组和药物处理孔中移动的和总的D. dipsaci数量。
如果线虫不移动,向孔中加入两微升一摩尔的氢氧化钠,使其终浓度达到40毫摩尔,以刺激其运动。计算可移动线虫的比例。在D.dipsaci筛选中,重复实验中始终产生0%可移动线虫的孔被归类为强阳性结果。
在60微摩尔浓度下筛选了三种不同的药物板,每种药物板均包含三个生物学重复。所有三个药物板均含有6%的DMSO溶剂对照。许多含有小分子文库药物的药物板中,未发现任何对D.dipsaci具有可观察生物活性的分子。
一些培养皿中的结果完全可重复,而另一些含有已知杀线虫剂的培养皿则表现出不同的活性。误差线代表平均值的标准误差。此处,氟吡菌酰胺在该检测中表现出显著的活性。
氟吡菌酰胺对D. dipsaci的活动性表现出明显的剂量依赖性效应,其EC50为9.3 µM。截至120 µM浓度,灭线磷对活动性无显著影响。截至120 µM浓度,灭线磷对活动性无显著影响。
加入氢氧化钠提高了检测不动线虫的检测灵敏度。使用40毫摩尔的氢氧化钠作为检测终点,以刺激尚有活动能力的个体产生运动,从而区分处于静止状态的线虫与病态线虫。该方案已成功用于鉴定针对D.dipsaci及其他物种具有新颖作用机制的化合物。
本方案描述了一种用于培养、收集和筛选植物寄生性线虫 Ditylenchus dipsaci 的方法。该技术可通过中等通量的化学筛选鉴定新型杀线虫剂,有望通过靶向危害农作物的线虫,从而提高全球粮食供应。
中等通量培养与Ditylenchus dipsaci的筛选可快速鉴定新型杀线虫化合物,直接应对选择性农作物保护剂的迫切需求。该工作流程通过提供针对一种抗性强且具有重要经济影响的害虫的化合物功效的可靠、可重复的数据,支持农业化学品研发的早期发现。将这些能力整合到研发管线中,可提高对新型杀线虫剂候选物的预测可信度和项目优先级评估。
该方法可整合到从早期化合物筛选到先导化合物鉴定及临床前验证的整个农用化学品发现流程中。