2025年7月25日
本文表明,如果进行了适当的仪器O2 背景校正,0.5 mL高分辨率呼吸测量室所获得的结果与2.0 mL呼吸室的结果具有一致性。该方法所需样品量更少,对于样品来源有限或呼吸活性较低的研究具有优势。
本研究旨在探讨校准至0.5毫升的小体积腔室是否可用于呼吸测定实验,且不会影响Oroboros平台中传统2毫升体积所获得的准确性。
我们开发了小体积实验腔室,并通过高分辨率呼吸测定法结合严格的质控(采用精确的OXPHOS分析)对其进行评估,这为后续发展和新创新铺平了道路,具体包括:第一,12腔O2k呼吸仪;第二,用于复杂OXPHOS分析方案中物质自动滴定的机器人系统。这些应用将在进一步拓展线粒体分析、线粒体疾病诊断以及药物研发评估方面发挥关键作用,不仅关注药物对线粒体功能的益处,也关注其对线粒体功能的非靶向性干扰作用。当我的团队在30多年前开发高分辨率呼吸测定技术时,当时的主流观念认为线粒体就是线粒体,也许肌肉和肝脏线粒体之间存在差异,但也就仅此而已。在这些范式之外,几乎无人真正关注线粒体。通过我们为高分辨率呼吸测定所开发的实验方案,我们揭示了线粒体功能的巨大多样性。这使我们能够以全新的视角评估不同细胞类型、组织和物种中的线粒体呼吸控制。30年前,仅有大约10篇文献认识到这一点;而如今,采用我们仪器并使用这些方案的研究已超过1,500项。
与传统的两毫升样品室相比,小体积样品室所需的样品量仅为其四分之一。对于呼吸速率较低的样品,可使用相同量的样品以增加单位体积的氧通量,从而降低测量的不确定性。
我们在Oroboros研发实验室的工作重点是将仪器开发与学术研究相结合。我们通过多传感器分析来评估线粒体呼吸功能和生物发生特征,即测量呼吸作用、氧化还原电位、膜电位、钙离子摄取、过氧化氢生成以及多种其他参数,从而更深入地了解线粒体的生物发生特征及其功能与功能障碍。
[旁白] 首先,将小体积(SV) chamber 安装到 Oroboros 仪器上。然后打开 Oroboros 电源,点击“连接”以将 Oroboros 与 DatLab 软件连接。彻底干燥 chamber 后,使用移液器向 SV chamber 中加入 0.54 毫升水。随后启动搅拌器。在关闭 chamber 前,润湿密封塞的 O 型圈,同时保持毛细管部分干燥。松开体积校准环,然后将密封塞向下插入,直至液体充满密封塞毛细管,并在上端毛细管接口处形成弯月面。拧紧体积校准环以固定其位置,确保后续插入时校准体积的一致性。开始时,用呼吸介质 MiR05 填充 chamber。启动 DatLab 软件,选择适用于仪器本底测试的适当协议。将搅拌转速设为 550 RPM,chamber 体积设为 0.5 毫升,数据记录间隔设为 2 秒,实验温度设为 37 摄氏度。运行搅拌器测试和空气校准。按住 Shift 键并移动光标,在氧浓度图上设置 R1 标记。偶尔进行零氧校准。在空气校准过程中,通过将 O2-Zero Powder 溶解于 50 毫摩尔磷酸缓冲液中,配制新鲜的 2.5 毫摩尔钠连二亚硫酸盐储备液(适用于 SV)。完成空气校准后,关闭 chamber。监测氧信号约 60 至 120 分钟,使氧浓度从空气饱和状态下降至约 150 微摩尔。在氧斜率负相图上设置四个标记,分别标记为 J01 至 J04。可选地,使用 Hamilton 注射器滴加钠连二亚硫酸盐溶液,将氧浓度调节至 100 微摩尔,并设置标记 J05。在 DatLab 中计算仪器氧本底斜率时,选择“Flux Slope”。接着打开氧本底校正窗口,选择“Active file”作为氧本底数据来源。检查所有 J0 标记是否均用于线性回归计算,然后点击“Apply”进行氧本底校正。开始时,用去离子水清洗 Oroboros chamber,并向 chamber 中加入新鲜 MiR05 介质。完成仪器本底测试后,在 DatLab 中新建一个标签页,选择适用于人血小板实验的 SUIT-003 协议。通过 Protocol 侧边栏中显示的 DatLab 协议概览,选择化学储备液,然后根据所用化学品选择相应的 Hamilton 注射器。按照 SUIT 协议顺序,将注射器按标签顺序放置于注射器架上。对于部分体积更换,计算等效体积 V in,该体积应等于从开放 chamber 中实际移除的体积 V out,并计入毛细管死体积。随后取出完全插入的密封塞并置于架上。根据细胞类型和储备细胞悬液的浓度,从 chamber 中移除计算所得的 V out 体积的 MiR05。然后,用移液器向 chamber 中加入等体积、已知细胞浓度的储备细胞悬液。相比之下,对于完全体积更换,则需将 chamber 中的全部培养基虹吸移除。向 SV chamber 中加入 0.54 毫升分离的心肌线粒体储备液。关闭 chamber,并从密封塞接口处虹吸移除多余的样品溶液。开始底物-解偶联剂-抑制剂滴定(SUIT)协议时,在 DatLab 中打开“Event”窗口以可视化滴定体积。使用 Hamilton 微量注射器将化学储备液滴加至 chamber 中,然后在 DatLab 中设置事件。滴定后等待通量稳定。进行数据分析时,在图谱中具有代表性且稳定的区段上设置标记。在空气饱和条件下,0.5 毫升 chamber 的仪器本底氧通量比 2.0 毫升 chamber 高出 3.9 倍,与理论预期的体积特异性本底氧通量四倍差异一致。两种 chamber 体积下的仪器本底通量变异性几乎相同。在应用适当的本底校正后,活血小板、透化成纤维细胞和分离线粒体的呼吸速率在两种 chamber 类型中均表现出高度相关性。再氧合后,2 毫升 chamber 中的氧通量比 0.5 毫升 chamber 更快达到稳定。Complex III 抑制后的残余氧消耗在两种 chamber 之间保持一致,符合仪器检测限水平。
本研究探讨了0.5 mL样品室在高分辨率呼吸测量中的适用性,并与传统的2.0 mL样品室进行了比较。研究结果表明,在进行适当的仪器背景校正后,较小的样品室在减少样品用量的同时仍能获得准确的测量结果,有利于样品量有限的研究。
在0.5 mL的检测室中进行高分辨率呼吸测定,可在样本需求极低的情况下实现对线粒体功能的精确分析,直接应对早期发现和转化研究中样本量有限所带来的挑战。该技术通过从稀少或低呼吸活性的生物材料中生成可靠数据,提高了对代谢通路分析的预测可信度,并支持基于风险评估的研发组合决策。
这种小体积呼吸测定法贯穿早期发现、先导物识别及临床前研究,能够在整个研发过程中实现线粒体分析的一致性。