空间分辨的、整合式单细胞多组学分析：在冷冻组织切片中对转录组与表观基因组靶标进行联合检测

行业重要性概述

空间分辨的单细胞多组学分析使生物制药团队能够以前所未有的精度解析复杂组织的分子结构。通过将空间条形码技术与转录组和表观基因组的同步分析相结合，可提高细胞类型鉴定和调控通路图谱构建的预测可靠性。该技术通过揭示具有空间组织特征的调控程序及细胞间相互作用，为目标验证和转化医学研究中的关键节点提供支持。

生物制药研发中的战略应用

早期发现与靶点验证

• 能够在解剖学背景下实现调控元件和基因表达的高分辨率定位。
• 通过将表观基因组状态与空间定义的细胞群体关联，支持功能靶点的验证。
• 通过对同一细胞核的整合多组学数据，促进机制层面的风险评估。
• 基于空间调控程序，提高靶点优先排序的预测可信度。

筛选与检测方法开发

• 为下游筛选工作流程提供经过验证的、具有空间注释的生物系统。
• 通过在冷冻组织切片中整合空间条形码和分子条形码，实现检测方法的标准化。
• 提供可重复、定量的多组学输出结果，用于可靠的化合物评估。
• 支持在多种组织类型和疾病模型中实现平台的可扩展性和重复使用。

转化与临床前研究

• 将分子谱分析与疾病相关的解剖学坐标对齐，以促进转化生物标志物的发现。
• 通过整合空间与分子数据，确保从发现到临床前验证的连续性。
• 基于空间解析的调控机制，支持进行风险调整后的研发推进决策。
• 揭示对临床前模型选择至关重要的细胞间相互作用和组织结构特征。

流程与工作流整合

这一空间多组学工作流程通过提供来自冷冻组织切片的整合性、空间分辨的分子数据，将早期发现、先导物鉴定和转化研究连接起来。

• Discovery Biology：通过将调控修饰和基因表达映射到解剖结构，支持假设验证和通路解析。
• Screening：提供可直接用于检测且具有空间注释的细胞核，实现可重复且定量的下游分析。
• Analytics：生成高通量的多组学数据输出，能够直接比较空间上不同的细胞群体。
• Translational Research：通过空间组织化的分子洞察，促进生物标志物的比对和疾病模型的验证。
• Enterprise Reuse：建立可重复使用的流程，适用于多种组织类型和研究项目。

运营与企业影响

• 科学价值：提高靶点验证中预测的可信度，降低机制上的模糊性。
• 操作价值：标准化空间多组学分析流程，实现跨项目的可重复性和可扩展性。
• 战略价值：支持基于证据的立项或终止决策，实现资本高效的投资组合管理。
• 组合影响：支持基于风险调整的高可信度靶点优先排序与推进。

实施注意事项

• 需要具备空间条形码技术、单细胞多组学和测序技术方面的专业知识。
• 需要具备冰冻切片设备、空间条形码试剂以及高通量测序基础设施的使用权限。
• 需要跨团队对样本制备和数据整合流程进行标准化。
• 适用于包埋于OCT中并制备成冰冻切片的各种组织类型。
• 依赖于稳健的分析流程，以实现空间分辨多组学数据的解析。

生物制药常见问题