Mehrspezies-konservierte Sequenzen

Nukleotidsequenzen, die zwischen vielen verschiedenen Spezies konserviert sind, werden als multispezies konservierte Sequenzen bezeichnet.

Zum Beispiel gibt es Tausende von DNA-Abschnitten zwischen Menschen, Ratten und Mäusen, die seit der Abspaltung dieser drei Spezies von ihrem gemeinsamen Säugetier-Vorfahren unverändert geblieben sind.

Während ein kleiner Teil dieser konservierten Sequenzen für RNA oder Proteine kodiert, handelt es sich bei der Mehrheit um nicht-kodierende DNA-Sequenzen, die auch als konservierte nicht-gene Sequenzen oder CNGs bezeichnet werden. Unter den konservierten Sequenzen des Genoms von Mensch und Maus produziert beispielsweise nur ein Drittel ein funktionelles Transkript, während die restlichen zwei Drittel CNGs sind.

CNGs sind etwa 50 bis 200 Nukleotide lang und können in intergenen Regionen im Genom, Introns innerhalb eines Gens oder in untranslatierten Regionen des RNA-Transkripts gefunden werden.

Einige dieser Sequenzen sind über Abstammungslinien hinweg extrem konserviert und werden daher als ultrakonservierte Sequenzen bezeichnet. Es gibt mehr als 5000 ultrakonservierte Sequenzen zwischen Genomen von Menschen, Ratten und Mäusen, die jeweils etwa 10