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Methodenartikel

Identifizieren Dysregulated Gene von Kaposi-Sarkom-assoziierten Herpesvirus (KSHV) Induced

12.2K Ansichten

DOI:

10.3791/2078

14. September 2010

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Wirtszelle Faktoren spielen eine entscheidende Rolle bei der Errichtung und Wartung von Kaposi-Sarkom (KS). Wir skizzieren Methoden zur Wirtszelle Faktoren in KSHV-infizierten DMVEC Zellen verändert zu identifizieren und in KS Tumorgewebe. Zellulären Genen durch Viren verändert wird als potenzielles Ziel (e) für neuartige Therapeutika dienen.

Zusammenfassung

Derzeit KS ist die vorherrschende HIV / AIDS-Malignome im südlichen Afrika und damit die Welt. 1,2 Es wird als angioproliferative Tumor des vaskulären endothelialen Zellen charakterisiert und produziert seltenen B-Zell-lymphoproliferativen Erkrankungen in Form von Pleuraerguss Lymphome (PEL) und einige Formen der multizentrischen Castleman-Krankheit. 3-5 Nur 1-5% der Zellen in KS-Läsionen aktiv unterstützen lytischen Replikation des Kaposi-Sarkoms-assoziierten Herpesvirus (KSHV), die als Erreger mit KS verbunden, und es ist klar, dass zelluläre Faktoren müssen Interaktion mit viralen Faktoren in den Prozess der Onkogenese und Tumorprogression. 6,7 Identifizierung neuartiger Host-Faktor Determinanten, die KS Pathologie beitragen wird für die Entwicklung prognostischer Marker für Tumorprogression und Metastasierung sowie bei der Entwicklung neuartiger Therapeutika zur Behandlung von KS wesentliche . 8 Das dazugehörige Video Details der Methoden, die wir verwenden, um Wirtszelle Genexpression Programme in dermalen mikrovaskulären Endothelzellen (DMVEC) nach KSHV Infektion und in KS Tumorgewebe verändert zu identifizieren. 9 Sobald dysregulierten Gene durch Microarray-Analyse identifiziert werden, sind Veränderungen in der Proteinexpression bestätigt durch Immunoblot-und Dual gekennzeichnet Immunfluoreszenz. Änderungen in transkriptionelle Expression von dysregulierten Gene sind in vitro durch quantitative real-time Polymerase-Kettenreaktion (qRT-PCR) bestätigt. Validierung von in vitro-Ergebnisse mit Hilfe von Archivierungs KS Tumorgewebe wird auch durch dual bezeichnet Immunchemie und Tissue Microarrays durchgeführt. 8,10 Unser Ansatz zur Identifizierung dysregulierten Gene in den KS Tumorgewebe Mikroumgebung ermöglichen die Entwicklung von in vitro und anschließend in vivo-Modell für Entdeckung und Bewertung potenzieller neuer therapeutischer für die Behandlung von KS.

Protokoll

1. KSVH Kultivierung und Infektion des DMVEC

  1. Die BCBL-1-Zelllinie, die ursprünglich aus einem menschlichen Körper Hohlraum Basis Lymphom isoliert, ist in komplettem RPMI 1640 Medium (Gibco, Grand Island, NY) kultiviert. BCBL-1-Zellen werden aus flüssigem Stickstoff entfernt, in Trockeneis transportiert und schnell für 1 Minute aufgetaut bei 37 ° C. Eine 50 ul-Aliquot der BCBL-1-Zellen bei einer Dichte 1x10 4 Zellen / ml auf 500 ml RPMI 1640-Medium mit 10% fötalem Kälberserum, 1x Penicillin / Streptomycin ergänzt und verteilt in 175 cm-Kolben hinzugefügt, bei 50 ml / Flasche .
  2. Die Kolben des BCBL-1 Zellen werden dann bei 37 ° C in einer....

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Diskussion

Die Methoden in diesem Bericht verwendet werden kann in einer Vielzahl von Labor-Einstellungen vorgenommen werden. Sie erfordern eine spezielle Ausrüstung oder den Zugang zu zentralen Einrichtungen. Die entsprechenden Vorsichtsmaßnahmen zu treffen, wenn dabei Experimente mit infektiösen viralen Krankheitserreger wie KSHV, die den Einsatz einer mit Gentechnik-Stufe 3 (BSL-3) Einrichtungen erfordern kann. Tissue Akquisitionen müssen auch von den entsprechenden Institutional Review Boards (Ethikkommissionen) genehmigt werd.......

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Offenlegungen

Keine Interessenskonflikte erklärt.

Danksagungen

Wir danken James EK Hildreth, Meharry Medical College, für seine Beratung und Überprüfung des Manuskripts. Wir danken auch Diana Marver für die Bearbeitung des Manuskripts. Zentrum für AIDS Gesundheit Disparitäten Forschung, NIH 5U54 RR019192-05;; die Meharry Zentrum für Klinische Forschung, NIH Grant P20RR011792; Diese Arbeit wurde von der Vanderbilt Meharry Center for AIDS Research (NIH P30 AI054999-05) unterstützt und von NIH gewähren P01 CA113239. DJA wurde teilweise durch Piloten Zuschüsse aus dem Vanderbilt-Meharry Center for AIDS Research (CFAR) und die Meharry Zentrum für Klinische Forschung (CRC) finanziert.

....

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Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
RPMI 1640Invitrogen05-0001DJ
TPASigma-AldrichP1585
PBS pH 7,4Invitrogen10010-023
NatriumbutyratSigma-Aldrich19364 (FLUKA)
EBM-2-MedienLonza Inc.CC-3156+ Ergänzung mit Bullet-Kits
DMVEC-Zellen (HMVEC)Lonza Inc.CC2543
FetalkalbserumHycloneSH30066.03
Penicillin/StreptomycinInvitrogen15140-122
KammerobjektträgerNalge Nunc international154461
KSHV-LANA-MabVector LaboratoriesVP-H9131:50 Verdünnung/IFA
Galectin-3 Ziegen-pAbR&D SystemsAF1154
Esel-anti-Ziege FITCJackson ImmunoResearch705-095-1
Esel-anti-Ziege RhoJackson ImmunoResearch705-295-0031:100 Verdünnung/IFA
EinbettmediumVector LaboratoriesH 1500Vectashield mit DAPI
BCA-Protein-Assay-KitPierce, Thermo Scientific23235
NitrocelluloseBio-Rad161-0112
Esel-anti-Ziege-konjugiertSanta Cruz Biotechnology, Inc.SC 2020
Western-SubstratPierce, Thermo Scientific34075
Biotin-Kaninchen-anti-ZiegeDako305-065-045
AP-Streptavidin-KonjugatDakoK 0492 (Kit)
DNase-freies RNase-SetQiagen79254
MJ Mini CyclerBio-RadPTC-1148C
Bio-PhotometerEppendorf952000006
RC 6 Plus ZentrifugeSorvall, Thermo Scientific46910
Coulter Optima L-90K UltrazentrifugeBeckman Coulter Inc.392052
MYiQ iCycler Echtzeit-PCR-DetektionssystemBio-Rad170-9770
TE 2000S FluoreszenzmikroskopNikon InstrumentsTE2000S
2100 BioanalyzerAgilent TechnologiesG2938C
Eclipse E 200Nikon InstrumentsE 200
Sorvall Legend RT ZentrifugeThermo Fisher Scientific, Inc.75004377

Referenzen

  1. Sitas, F., Newton, R. Kaposi's sarcoma in South Africa. J Natl Cancer Inst Monogr. 28, 1-4 (2001).
  2. Moore, P. S., Chang, Y. Kaposi's sarcoma associated herpesvirus. Field's Virology. Knipe, D. M., Howley, P. M. , Lippincott Williams and Wilkins. Philadelphia, PA. 2803-2833 (2002).
  3. Chang, Y., Cesarman, E., Pessin, M. S., Lee, F., Culpepper, J.....

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Nachdrucke und Genehmigungen

Schlagwörter

Kaposi SarkomKSHV Infektionduale ImmunhistochemieGewebe MicroarrayAntigen Retrievalvirale WirtsproteineImmunfluoreszenzf rbungqRT PCR ValidierungMicroarray AnalyseEndothelzellen