1. Differenzierung dopaminerger neuraler Vorläuferzellen
- Auftauen von MD-NPCs (dopaminerge neurale Vorläuferzellen des Mittelhirns)
- Bereiten Sie eine mit BMM (basische Matrixmembran) beschichtete Platte vor und erwärmen Sie das vollständige N2B27. Geben Sie 10 mL warmes DMEM/F12 in ein konisches 15-ml-Röhrchen. Legen Sie ein Kryofläschchen für 2 Minuten in einen 37 °C heißen Heizblock.
- Übertragen Sie die Zellen aus dem Kryofläschchen in das Röhrchen mit DMEM/F12. Bei 300 x g 5 min zentrifugieren.
- Aspirieren Sie den Überstand, resuspendieren Sie die Zellen in 2 ml N2B27 und geben Sie die Zellsuspension in eine Vertiefung der BMM-beschichteten Platte. Inkubieren Sie die Zellen bei 37 °C mit 5 % CO2.
2. Transduktion von MD-NPCs und die Analyse von Methylierungsänderungen
- Transduktion von MD-NPCs
- Transduktion von MD-NPCs bei 70% Konfluenz mit LV (lentiviraler Vektor)-Guide-RNA/deaktivierter Cas9-DNMT3A (DNA-Methyltransferase-Enzym 3A) Vektoren bei MOI (Multiplicity of Infection) = 2. Ersetzen Sie das Medium N2B27 16h nach der Transduktion.
- Fügen Sie N2B27 mit 5 μg/ml Puromycin 48 h nach der Transduktion hinzu. Kulturieren Sie die Zellen 3 Wochen lang in N2B27 plus Puromycin, um die stabilen MD NPC-Linien zu erhalten. Die Zellen sind bereit für Downstream-Anwendungen (DNA-, RNA-, Proteinanalysen, phänotypische Charakterisierung, Einfrieren und Passaging).