$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. C. elegans Liquid Toxicity Assay mit Aeromonas
HINWEIS: Um eine Verunreinigung zu vermeiden, sollten Schritte in einer laminaren Flusshaube durchgeführt werden.
- Am Tag nach dem Aussäen der L1-Würmer auf der ENGM (Enriched nematode growth medium) Platte, verteilt mit E. coli OP50, nehmen Sie jeweils eine einzelne Kolonie jeder der vier Aeromonas-Stämme und E. coli OP50 und kultivieren Sie mit jeweils 5 ml LB-Brühe bei 37 °C für 16 Stunden.
HINWEIS: Im Protokoll wurden folgende Bakterienstämme verwendet: E. coli OP50, die normale Nahrungsquelle von C. elegans. A. dhakensis AAK1, das erste vollständig sequenzierte pathogene klinische A. dhakensis-Isolat . A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 und A. caviae A2-9307121 sind repräsentativ klinische Isolate des National Cheng Kung University Hospital.
HINWEIS: Zur Herstellung eines angereicherten NGM (ENGM) lösen Sie 3 g NaCl, 5 g bakterielles Pepton, 1 g Hefeextrakt und 30 g Agar in 1 L deionisiertes Wasser. Autoklav bei 121 °C für 20 Minuten. Warte, bis es auf 55 °C in einem Wasserbad abgekühlt ist, und gib 1 ml 1 M CaCl2, 1 ml 1 M MgSO4, 1 ml 5 % Cholesterin in Ethanol und 25 ml Phosphatpuffer hinzu. Wirbeln, um gut zu mischen. - Misse die Absorption von OD600 der Bakterienbrühe.
- Zentrifugiere die bakterielle Brühe bei 3.500 x g für 15 Minuten, um die LB-Brühe zu entfernen. Die Bakterien wieder suspendieren und die Bakterienbrühe mit S-Medium auf OD600 = 3,0 anpassen. Fügen Sie 195 μL bakterielle Brühe in S-Medium zu mindestens 8 Brunnen einer 96-Well-Platte hinzu.
HINWEIS: Die Zusammensetzung des S-Mediums: Zur Herstellung eines S-Mediums wird vor der Anwendung 40 mL S-Basal, 0,4 ml 1 M Kaliumcitrat, 0,4 ml Spurmetalllösung, 0,12 ml 1 M CaCl2, 0,12 ml 1 M MgSO4, 40 μL 5 % Cholesterin in Ethanol und 1 ml 8 mM FudR vor der Verwendung gemischt. - Waschen Sie die L4-Würmer auf der ENGM-Platte mit E. coli OP5 mit M9-Medium ab. Stellen Sie die Schneckenlösung auf eine Konzentration von 5 Würmern pro μL ein und geben Sie 5 μL der Wurmlösung zu jedem Brunnen der 96-Bohrloch-Platte. Stellen Sie sicher, dass es etwa 25 Würmer pro Brunnen gibt.
- Inkubieren Sie die 96-Well-Platte auf einem Shaker bei 200 U/min bei 25 °C.
- Zähle die Anzahl der lebenden und toten Würmer nach 24, 48 und 72 Stunden. Berechnen Sie die Überlebensraten jedes Bohrlochs mit folgender Formel: (Lebende Würmer/Gesamtwürmer) × 100%.
- Zeichne ein Streudiagramm mit der täglichen Datenberechnung.