FFPE-Tumorgewebe-Makrodissektion: Eine Technik zur Gewinnung von spezifischem Tumorgewebe aus ungefärbten Proben

Zusammenfassung

Quelle: Sugimoto, K. et al. Genomweite Analyse der DNA-Methylierung bei Magen-Darm-Krebs. J. Vis. Exp. (2020)

Dieses Video beschreibt eine Methode zur manuellen Makrodissektion von Krebsgewebe aus ungefärbten Gewebeproben, um ein spezifisches Krebsgewebe zu erhalten. Der Gewebeschnitt kann weiterverarbeitet werden, um DNA für genomweite Studien zu Magen-Darm-Krebs zu erhalten.

Protokoll

>1. Scrapen der Folien

1. Bereiten Sie einen Aufschluss-/Lysepuffer mit 650 ml mit Diethylpyrocarbonat (DEPC) behandeltem Wasser, 100 ml Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA), 50 ml Trishydrochlorid (Tris-HCL) 2 M pH 8,8 und 200 ml 10 % Natriumdodecylsulfat (SDS) vor (siehe Materialtabelle).
2. Füllen Sie ein 1,5-ml-Einwegröhrchen aus Polypropylen mit 80 μl Aufschluss-/Lysepuffer (siehe Materialtabelle).
3. Legen Sie eine saubere Pipettenspitze in den Puffer.
4. Identifizieren Sie Krebsgewebe des Tumorbereichs, die für die Makrodissektion am besten geeignet sind, entsprechend dem en....

Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien

Name	Unternehmen	Katalognummer	Kommentare
10% Natriumdodecylsulfat (SDS)	Qualität Biologisch	351-032-721 EA
DEPC-behandeltes Wasser	Qualität Biologisch	Tel.: 351-068-131
Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA)	Corning	Artikel-Nr.: 46-034-CL
Trishydrochlorid (Tris-HCL) 2 M pH 8,8	Qualität Biologisch	Artikel-Nr.: 351-092-101
Proteinase K	Neuengland Biolabore	Nr. P8107S
Einweg-Tube aus Polypropylen (Eppendorf)	Eppendorf	24533495