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Methodenartikel

TALEN-vermittelte gezielte Genintegration: Verwendung von sequenzspezifischen Nukleasen für die präzise Insertion von fluoreszierenden Proteingen in hiPSCs

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8. Juli 2025

In diesem Artikel

Zusammenfassung

Quelle: Cerbini, T. et al. Transfektion, Selektion und Kolonie-Picking von humanen induzierten pluripotenten Stammzellen, die TALEN-targeted mit einem GFP-Gen in den AAVS1 Safe Harbor sind. J. Vis. Exp. (2015)

Dieses Video beschreibt eine präzise Genom-Editing-Technik in humanen induzierten pluripotenten Stammzellen oder hiPSCs, bei der TALENs verwendet werden, um doppelsträngige Brüche an einem Zielort zu erzeugen, die eine homologiegerichtete Reparatur für die Genintegration von Fluoreszenzproteinen induzieren.

Protokoll

>1. Vorbereitung der Basalmembranmatrix und Beschichtung von Kunststoffen

  1. Legen Sie das gefrorene Basalmembran-Matrixmaterial von -20 °C auf Eis und tauen Sie es über Nacht bei 4 °C auf.
  2. Nach dem Auftauen werden 2 mg Aliquots der Basalmembranmatrix in vorgekühlte Eppendorf-Röhrchen pipettiert. Lagern Sie diese bis zur Verwendung bei -20 °C.
  3. Um Basalmembran-Matrix-beschichtete Platten herzustellen, tauen Sie ein Aliquot auf Eis auf, bis das letzte Stück Eis in der Eppendorf-Röhre verschwunden ist (normalerweise innerhalb von ~2 Stunden).
  4. Nach dem Auftauen Basalmembranmatrix auf 12 ml kaltes (4 °C) DMEM/F12 geben, um eine Basalmembranmatrix-Beschichtungslösung herzustellen.
  5. Geben Sie die Basalmembranmatrixlösung in das entsprechende Kulturgefäß. Für eine 6-Well-Platte geben Sie 1 ml pro Well ab. Schwenken Sie die Platte, um sicherzustellen, dass die Basalmembran-Matrixlösung jede Vertiefung vollständig bedeckt.
  6. Parafilm versiegeln Sie die mit der Basalmembranmatrix beschichtete Platte/Schale und inkubieren Sie sie vor der Verwendung 1 Stunde lang bei Raumtemperatur. Alternativ können mit der Basalmembranmatrix beschichtete Platten/Schalen bei 4 °C gelagert und innerhalb von 2 Wochen nach dem Beschichten verwendet werden.
    Anmerkung: Geben Sie zusätzliches DMEM/F12 in die mit der Basenmembranmatrix beschichtete Platte/Schale, um ein Austrocknen zu verhindern. Bevor Sie eine 4 °C gelagerte Basalmembran-Matrix-beschichtete Platte/Schale verwenden, stellen Sie sie in eine biologische Sicherheitswerkbank und lassen Sie sie mindestens 30 Minuten lang auf Raumtemperatur kommen.
  7. Die Basalmembranmatrix vor der Zugabe von Medium und Zellen vollständig aspirieren.

>2. Vorbereitung des E8-Mediums

  1. Bereiten Sie das E8-Nährmedium vor, indem Sie das E8-Präparat über Nacht bei 4 °C auftauen.
  2. 10 ml E8-Basalmedium aus dem 500-ml-Vorrat nehmen und entsorgen.
  3. Pipettieren Sie die gesamte 10-ml-Durchstechflasche mit E8-Präparat direkt in 490 ml E8-Basalmedium. Vollständiges E8-Medium nicht in einem 37 °C warmen Wasserbad erwärmen, da wiederholte Temperaturschwankungen das bFGF im gesamten E8-Medium abbauen können.
  4. Verwenden Sie das komplette E8-Medium innerhalb von 2 Wochen nach Zugabe des Nahrungsergänzungsmittels.

>3. Auftauen von iPSCs

  1. Nehmen Sie ein Fläschchen mit gefrorenen iPS-Zellen aus flüssigem Stickstoff und legen Sie es auf Trockeneis.
  2. Tauen Sie das Fläschchen in einem 37 °C warmen Wasserbad schnell auf und schwenken Sie das Fläschchen im Wasserbad, bis nur noch ein winziges Eisfragment übrig ist.
  3. Besprühen Sie das Fläschchen mit 70% Ethanol und stellen Sie es in eine biologische Sicherheitswerkbank.
  4. 1 ml E8-Medium bei Raumtemperatur tropfenweise direkt in die Durchstechflasche geben.
  5. Die Zellsuspension wird mit einer 2-ml-Pipette tropfenweise in 9 ml E8-Medium in einem konischen 15-ml-Röhrchen überführt. Schwenken Sie das Röhrchen häufig, um sicherzustellen, dass sich die Zellen und das Medium schnell gut vermischen.
  6. Zentrifugieren Sie die Zellen bei 200 x g für 5 min.
  7. Der Überstand wird aspiriert und das Zellpellet in einem geeigneten Volumen von E8, ergänzt mit 10 μM Y-27632, resuspendiert.
  8. Geben Sie die Zellen in eine entsprechende Anzahl von mit Basalmembranmatrix beschichteten Vertiefungen und stellen Sie sie über Nacht in einen 37 °C heißen Inkubator mit 5 % CO₂. Es wird empfohlen, mindestens 0,2 x 10⁶ iPSC pro Vertiefung einer 6-Well-Platte zu plättieren, um eine schnelle Erholung nach dem Auftauen zu ermöglichen.

>4. Wartung und routinemäßiges Passaging von iPSCs

  1. Refresh E8 medium täglich.
  2. Überwachen Sie die Morphologie und Konfluenz von Zellen mit einem inversen Mikroskop. iPSCs von hoher Qualität wachsen in flachen Kolonien mit unterschiedlichen Grenzen; einzelne Kolonien haben ein "kopfsteinpflasterartiges" Aussehen.
  3. Passieren Sie die iPS-Zellen, wenn sie eine Konfluenz von ~70% erreichen.
  4. Bereiten Sie eine EDTA-Passaging-Lösung vor, indem Sie 0,9 g NaCl und 500 μl 0,5 M EDTA zu 500 ml DPBS hinzufügen. Gut mischen, um NaCl aufzulösen, und zum Sterilisieren mit einem Vakuumfilter versehen. Vor der Übergabe wird ein Aliquot der Lebloslösung in einem 37 °C warmen Wasserbad erwärmt.
  5. Zum Durchgang aspirieren Sie verbrauchtes Kulturmedium und waschen die Zellen einmal mit einem gleichen Volumen warmer Passierlösung. Aspirieren und pipettieren Sie genügend EDTA-Passierlösung, um die Zellen zu beschichten (1 ml pro Vertiefung einer 6-Well-Platte).
  6. Legen Sie die Zellen unter ein inverses Mikroskop und beobachten Sie die iPS-Kolonien. Das Auftreten von Löchern innerhalb von Kolonien und erhöhten Rabatten sollte innerhalb von 2 bis 5 Minuten sichtbar werden.
  7. Saugen Sie die EDTA-Passagelösung vorsichtig an.
  8. Geben
  9. Sie mit einer 10-ml-Pipette 4 ml E8-Medium (bei Verwendung einer 6-Well-Platte) unter hohem Druck direkt in jede Vertiefung ab, die durchgelassen werden soll.
  10. Sammeln Sie die iPSC-Klumpen und teilen Sie sie in eine entsprechende Anzahl von Vertiefungen auf, abhängig vom Teilungsverhältnis von 1:8 bis 1:12. Überpipettieren Sie nicht, da die Disaggregation von Zellklumpen zu einer schlechten Lebensfähigkeit führt.
  11. Stellen Sie die Platte in einen Inkubator und bewegen Sie die Platte mehrmals hin und her und von einer Seite zur anderen, um die Zellen zu verteilen.

>5. Vorbereitung von MEFs und iPSCs für die Transfektion

  1. 48 Stunden vor der Transfektion werden iPS-Zellen im Verhältnis ~1:6 in vier oder mehr Vertiefungen einer mit Basalmembranmatrix beschichteten 6-Well-Platte passageiert, so dass sie nach zwei Tagen zu 70 % konfluent sind.
  2. Am nächsten Tag tauen Sie DR4 MEFs in MEF-Medium auf, das aus DMEM (hoher Glukose) besteht, ergänzt mit 10% FBS und 1x MEM-NEAA.
  3. DR4 MEFs in zwei 10-cm-Schalen bei ~ 2 x 10⁴ Zellen/cm² geben und über Nacht bei 37 °C inkubieren.
  4. Am Tag der Transfektion ist das MEF-Medium 30 Minuten vor der Transfektion an iPS-Zellen auf E8 zu ändern, das mit 10 μM Y-27632 ergänzt wurde.
  5. Optional: 4 Stunden vor der Transfektion, ergänzen Sie die iPSC-Kultur vor der Transfektion mit Y-27632 bei einer Endkonzentration von 10 μM.

>6. Behandlung und Transfektion von iPSCs mit sanfter Zelldissoziation unter Verwendung eines Elektroporationssystems

  1. Entfernen Sie die P3-Primärzelltransfektionslösung aus 4 °C und lassen Sie sie ~30 Minuten lang auf Raumtemperatur kommen. Geben Sie die gesamte Zugabe von 100 μl vor der Verwendung zur Transfektionslösung.
  2. Warmes Reagenz für sanftzellige Dissoziation in einem 37 °C warmen Wasserbad.
  3. Gewinnung von AAVS1-TALENs (pZT-AAVS1-L1 und pZT-AAVS1-R1) und AAVS1-CAG-EGFP-Spender ab -20 °C.
  4. Nehmen Sie iPSCs aus dem Inkubator und waschen Sie sie einmal mit DPBS.
  5. Geben Sie 1 ml Reagenz für die sanfte Zelldissoziation pro Vertiefung hinzu und inkubieren Sie die iPSCs 5 Minuten lang bei 37 °C oder bis mehr als 50 % der Zellen aus dem Kulturgefäß dissoziiert sind.
  6. Pipettieren Sie die Zellen einige Male mit einer p1000-Pipette auf und ab, um alle verbleibenden Zellen aus dem Kulturgefäß zu dissoziieren und iPS-Klumpen aufzubrechen.
  7. Geben Sie 2 ml E8-Medium in jede Vertiefung und pipettieren Sie mit einer 10-ml-Pipette mehrmals auf und ab, um die Zellklumpen weiter in einzelne Zellen zu zerlegen.
    Anmerkung: Die Effizienz der Transfektion nimmt deutlich ab, wenn die Zellklumpen nicht ausreichend disaggregiert werden.
  8. Sammeln Sie iPS-Zellen in einem konischen 15-ml-Röhrchen und zentrifugieren Sie sie 3 Minuten lang bei 100 x g.
  9. Aspirieren Sie den Überstand und resuspendieren Sie die Zellen in einer minimalen Menge E8-Medium.
  10. Zählen Sie die Zellen mit einem Hämozytometer nach dem Auftragen eines vitalen Farbstoffs wie 0,4 % Trypanblau. Stellen Sie sicher, dass die Zellen während der Zählung ausreichend dissoziiert sind (1-3 Zellen pro "Klumpen").
  11. Geben Sie je 3 x 10⁶ Zellen in zwei konische 15-ml-Röhrchen und schleudern Sie sie erneut bei 100 x g für 3 min.
    Anmerkung: Die Zentrifugation mit niedriger Geschwindigkeit reduziert die Zellspannung und ermöglicht eine einfache Resuspension von iPSCs vor der Elektroporation.
  12. Stellen Sie das Elektroporationssystem auf das zelltypspezifische Programm für die humane embryonale Stammzelllinie H9 (Programm CB-150) ein.
  13. Nach der Zentrifugation wird der Überstand aus den Zellpellets abgesaugt. Zu einem Pellet geben Sie 10 μg des HR-Donors als Kontrollprobe. Dem anderen Pellet werden 10 μg des HR-Donors zusammen mit 5 μg von jedem TALEN (pZT-AAVS1-L1 und pZT-AAVS1-R1) als Versuchsprobe zugesetzt.
  14. Jedes Zellpellet wird in 100 μl P3-Primärzelltransfektionslösung resuspendiert und in eine Küvette überführt.
  15. Die Transfektion wird durchgeführt und sofort 500 μl E8-Medium bei Raumtemperatur in jede Küvette gegeben.
  16. Übertragen Sie die transfizierten iPSCs tropfenweise in eine 10-cm-Schale mit DR4 MEFs, die in Schritt 5.4 hergestellt wurden.

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Offenlegungen

Es wurden keine Interessenkonflikte angegeben.

Materialien

Liste der in diesem Artikel verwendeten Materialien
NameUnternehmenKatalognummerKommentare
Matrigel Wachstumsfaktor reduziert (GFR) Basalmembran-Matrix, *LDEV-frei, 10 mlCorningArtikel-Nr.: 354230Bei -20 °C lagern.
DMEM/F-12LebenstechnologienArtikel-Nr.: 11320-033Bei 4 °C lagern.
Costar 6 Well Klare, TC-behandelte Mehrfach-Well-PlattenCorning3506
Essential 8 MediumLebenstechnologienA1517001Basalmedium bei 4 °C lagern. Supplement bei -20 °C lagern.
Y-27632 DihydrochloridTocrisNr. 1254Bei Raumtemperatur lagern. Nach dem Auflösen in H2O bei -20 °C lagern.
NatriumchloridSigmaNr. S5886-500G
UltraPure 0,5 M EDTA, pH 8,0LebenstechnologienArtikel-Nr.: 15575-020
DPBS, kein Kalzium, kein MagnesiumLebenstechnologienNr. 14190-250
100 mm TC-behandelte KulturschaleCorning430167
DR4 MEF 2M IRR - AkademischGlobalStemGSC-6204GIn flüssigem Stickstoff lagern.
DMEM, hoher Glukosegehalt, PyruvatLebenstechnologienNr. 11995-040Bei 4 °C lagern.
Definiertes fötales Rinderserum, US-HerkunftHyCloneSH30070.03Bei -20 °C lagern. Über Nacht bei 4 °C auftauen und aliquotieren. Aliquote bis zur Verwendung bei -20 °C lagern.
MEM Lösung für nicht-essentielle Aminosäuren (100X)LebenstechnologienTel.: 11140-050Bei 4 °C lagern.
4D-Nukleofector Core UnitLonzaAAF-1001BTeil des Elektroporationssystems.
4D-Nucleofector X EinheitLonzaAAF-1001XTeil des Elektroporationssystems.
P3 Primärzelle 4D-Nucleofector X Kit L (24 RCT)LonzaV4XP-3024Bei der Ankunft die Primärzelllösung entfernen und ergänzen und bei 4 °C lagern.
StemPro Accutase Reagenz zur ZelldissoziationLebenstechnologienA1110501Bei -20 °C lagern. Über Nacht bei 4 °C auftauen und vor Gebrauch ein Aliquot in einem 37 °C warmen Wasserbad erwärmen.
NutriStem XF/FF NährmediumStemgent01-2005Bei -20 °C lagern. Über Nacht bei 4 °C auftauen
AAVS1-TALENs (pZT-AAVS1-L1 und pZT-AAVS1-R1)Addgene52637 und 52638
AAVS1-CAG-EGFP Spender mit homologer RekombinationAddgeneArtikel-Nr.: 22212
Puromycin-DihydrochloridLebenstechnologienNr. A11138-03Bei -20 °C lagern. Arbeitsaliquoten von 1 mg/ml in ddH2°C herstellen.
Einweg-Pasteur-Pipetten aus BorosilikatglasFisher Scientific13-678-20A
Sorvall Legend XTR (gekühlt), 120 V 60 HzThermo ScientificTel.: 75-004-521
TX-750 4 × 750 ml SchwingrotorThermo Scientific75003607
Trypanblau-Lösung, 0,4 %LebenstechnologienTel.: 15250-061

Tags

TALEN-vermittelte Genintegrationhumane induzierte pluripotente StammzellenErzeugung von DoppelstrandbrüchenHomologie-gerichtete ReparaturInsertion eines Fluoreszenzprotein-GensTargeting des AAVS1-Safe-Harbor-LocusPlasmidübertragung durch ElektroporationSelektion mittels AntibiotikaresistenzTALEN-Plasmid-TransfektionHomologiearme des Donor-Plasmids