Alle Verfahren, die die Probenentnahme beinhalten, wurden in Übereinstimmung mit den IRB-Richtlinien des Instituts durchgeführt. Der Verfahrensablauf für das Protokoll ist in Abbildung 1 dargestellt.
>1. Einrichtung für die Prozedur
- Bereiten Sie den Mikrogefäßpuffer (BMB) des Gehirns vor. Beginnen Sie mit dem Wiegen von 54,66 g D-Mannitol, 1,90 g EGTA (Ethylenglykol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N′,N′-TETRAESSIGSÄURE) UND 1,46 g 2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propandiol (d. h. Tris) Base in ein sauberes Becherglas. Fügen Sie 1,0 l entionisiertes Wasser hinzu. Mischen Sie die Bestandteile des BMB-Puffers mit einem Magnetrührer. Nachdem die Lösung gründlich gemischt wurde, stellen Sie den pH-Wert mit 1,0 M HCl auf 7,4 ein.
- Bereiten Sie eine 26%ige Dextranlösung (MW 75.000) (w/v) vor, bevor Sie die Tiere betäuben. Führen Sie die folgenden Schritte aus, um die Dextranlösung vorzubereiten.
Anmerkung: Es ist von entscheidender Bedeutung, diese Lösung im Voraus vorzubereiten, da es etwa 1,5 bis 2 Stunden dauern kann, bis sich Dextran in einem wässrigen Puffer aufgelöst hat.
- Das pulverisierte Dextran (26 g pro 100 ml Puffer) wird in ein sauberes Becherglas gewogen.
- Messen Sie das entsprechende Volumen BMB ab und geben Sie es in ein separates, sauberes Becherglas.
- Gießen Sie BMB langsam in das Becherglas mit dem Dextranpulver. Während des Aufgießens von BMB das pulverförmige Dextran mit einem Glasrührstab manuell mischen.
- Stellen Sie den pH-Wert unmittelbar vor der Verwendung auf 7,4 mit 1,0 M HCl ein.
Anmerkung: Eine typische Isolierung von Hirnmikrogefäßen von 12 einzelnen Sprague-Dawley-Ratten (männlich oder weiblich; im Alter von 3 Monaten; jeweils 200-250 g) erfordert 200 ml Dextranlösung (d. h. 52 g Dextran in 200 ml BMB).
>2. Extraktion von Hirngewebe aus Sprague-Dawley-Ratten
- Nach der gewünschten experimentellen Behandlung anästhesieren Sie Sprague-Dawley-Ratten mit Ketamin (50 mg/kg; 2,5 ml/kg i.p.) und Xylazin (10 mg/ml; 2,5 mL/kg i.p.). Verdünnen Sie Ketamin und Xylazin in 0,9 % Kochsalzlösung auf Endkonzentrationen von 20 mg/ml bzw. 4,0 mg/ml. Tiere durch Enthauptung mit einer geschärften Guillotine gemäß den Richtlinien des IACUC (Institutional Animal Care & Use Committee) einschläfern. Wenden Sie das gleiche Verfahren für männliche und weibliche Sprague-Dawley-Ratten an.
- Trennen Sie die Haut vom Rattenschädel, indem Sie mit einer chirurgischen Schere einen einzigen Querschnitt machen.
- Entfernen Sie mit Rongeur vorsichtig die Schädelplatte und legen Sie das Gehirn frei.
- Entferne das Gehirn mit einem Spatel. Entfernen Sie das Großhirn und geben Sie das isolierte Hirngewebe in ein konisches 50-ml-Röhrchen, das 5 mL BMB enthält. Unmittelbar vor der Anwendung 1,0 μl Proteaseinhibitor-Cocktail pro 1,0 ml BMB-Puffer hinzufügen.
>3. Verarbeitung des Gehirns
- Übertragen Sie das Hirngewebe aus dem konischen 50-ml-Röhrchen in eine saubere Petrischale.
- Rollen Sie das Gehirn mit einer Pinzette vorsichtig auf Filterpapier mit einem Durchmesser von 12,5 cm, um die äußeren Hirnhäute zu entfernen, die lose an der Großhirnrinde haften. Drücken Sie das Gehirngewebe vorsichtig gegen das Filterpapier und rollen Sie das Taschentuch erneut auf. Drehen Sie das Filterpapier während dieses Schritts häufig.
- Trennen Sie den Plexus choroideus mit einer Pinzette von den Gehirnhälften.
Anmerkung: Der Plexus choroideus erscheint als klares membranöses Gewebe, das an der Oberfläche der Hirnventrikel lokalisiert ist.
- Glätten Sie das Hirngewebe sanft und entfernen Sie die restlichen Hirnhäute und Riechkolben mit einer Pinzette.
- Legen Sie das kortikale Hirngewebe in einen gekühlten Glasmörser. Geben Sie 5,0 ml BMB-haltigen Proteasehemmer-Cocktail in den Mörser.
- Homogenisieren Sie das Hirngewebe mit einem Überkopf-Leistungshomogenisator mit 15 Auf- und Abbewegungen bei 3.700 U/min. Führen Sie die Homogenisierung mit einem 10-ml-Mörser und einer Stößelmühle durch. Zwischen der Homogenisierung jeder einzelnen Probe den Stößel mit 70 % Ethanol reinigen.
Anmerkung: Die Homogenisierungshübe sollten in Bezug auf Tempo und Größe konsistent sein.
- Gießen Sie das Homogenat in beschriftete Zentrifugenröhrchen.
>4. Zentrifugationsschritte
- Geben Sie 8,0 ml 26%ige Dextranlösung in jedes markierte Zentrifugenröhrchen, das das Gehirnhomogenat enthält.
- Drehen Sie das Röhrchen zweimal um und wirbeln Sie die Probe dann gründlich durch. Führen Sie das Vortexen jeder Probe aus mehreren Winkeln durch, um ein gründliches Mischen der Gehirnhomogenatlösung mit 26 % iger Dextranlösung zu gewährleisten.
- Zentrifugieren Sie Proben bei 5.000 x g für 15 min bei 4 °C.
Anmerkung: Für einige Analysen ist es nützlich, die Mikrogefäße des Gehirns mit dem Hirnparenchym zu vergleichen. Sollte die Beurteilung der Proteinexpression im Hirnparenchym erforderlich sein, kann der Überstand aus diesem Zentrifugationsschritt (d. h. die Hirnparenchymfraktion) entnommen und bei -80 °C für die zukünftige Verwendung gelagert werden.
- Entfernen Sie den Überstand mit einem Vakuumsauger und einer Pasteurpipette aus Glas.
Anmerkung: Es ist darauf zu achten, dass das Pellet nicht gestört wird. Andernfalls wird die Menge der gesammelten Mikrogefäße des Gehirns reduziert, was die Proteinausbeute aus diesem Verfahren erheblich verringert.
- Resuspendieren Sie das Pellet in 5,0 ml BMB-haltigem Proteaseinhibitor-Cocktail (d. h. 1,0 μl Proteaseinhibitor-Cocktail pro 1,0 ml BMB-Puffer). Wirbeln Sie das Pellet vor, um eine gründliche Durchmischung zu gewährleisten.
- Geben Sie 8,0 ml 26 % Dextran in jedes Zentrifugenröhrchen und wirbeln Sie es auf, wie in den Schritten 4.1 bis 4.2 dieses Protokolls beschrieben.
- Zentrifugieren Sie Proben bei 5.000 x g für 15 min bei 4 °C.
- Mit einem Isolierkolben und einer Glaspipette den Überstand absaugen und sicherstellen, dass das Pellet, das das Mikrogefäß des Gehirns enthält, nicht zerstört wird.
Anmerkung: Überschüssiges Material, das an der Rohrwand haftet, enthält keine Mikrogefäße und sollte sorgfältig gereinigt und entfernt werden.
- Wiederholen Sie die Schritte 4.5 bis 4.8 noch zwei weitere Male.
- Sobald 4 Dextran-Zentrifugationsschritte abgeschlossen sind, fügen Sie 5,0 mL BMB zu jedem Pellet und Vortex hinzu, um die Probe wieder zu suspendieren.
Anmerkung: Nach Abschluss von Schritt 4.10 können ganze Mikrogefäße für die Analyse der Proteinlokalisation entnommen werden. Dies kann erreicht werden, indem ein 50-μl-Aliquot aus resuspendiertem Mikrogefäßpellet entnommen und auf einen Glasobjektträger geschmiert wird. Anschließend werden die Mikrogefäße für 10 min bei 95 °C auf einem Heizblock hitzefixiert und anschließend für weitere 10 min in eiskaltem Ethanol fixiert. Die Objektträger können dann bei 4 °C gelagert werden, bis sie für bildgebende Untersuchungen benötigt werden.